• 제목/요약/키워드: GGI

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HisCoM-GGI: Software for Hierarchical Structural Component Analysis of Gene-Gene Interactions

  • Choi, Sungkyoung;Lee, Sungyoung;Park, Taesung
    • Genomics & Informatics
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    • 제16권4호
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    • pp.38.1-38.3
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    • 2018
  • Gene-gene interaction (GGI) analysis is known to play an important role in explaining missing heritability. Many previous studies have already proposed software to analyze GGI, but most methods focus on a binary phenotype in a case-control design. In this study, we developed "Hierarchical structural CoMponent analysis of Gene-Gene Interactions" (HisCoM-GGI) software for GGI analysis with a continuous phenotype. The HisCoM-GGI method considers hierarchical structural relationships between genes and single nucleotide polymorphisms (SNPs), enabling both gene-level and SNP-level interaction analysis in a single model. Furthermore, this software accepts various types of genomic data and supports data management and multithreading to improve the efficiency of genome-wide association study data analysis. We expect that HisCoM-GGI software will provide advanced accessibility to researchers in genetic interaction studies and a more effective way to understand biological mechanisms of complex diseases.

국제지표로 살펴 본 성평등지수 (A Study and Review of Gender Inequality Index)

  • 성문주
    • 디지털융복합연구
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    • 제14권6호
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    • pp.43-49
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    • 2016
  • 본 논문은 다양한 국제지수로 우리나라의 성평등 현주소를 살펴본다. 성평등지수의 장점은 이 지표들을 활용하여 성평등을 위한 전략적이고 구체적인 정책방향을 제시할 수 있고, 국제비교가 가능한 장점을 가진다. 대표적으로 UNDP에서 개발한 GDI, GEM, GII와 WEF에서 개발한 GGI가 있다. 네 가지 지수들의 성격이 다르기 때문에 성평등지수에 대한 이해도를 높이기 위해 각 지수의 내용과 측정지표들을 소개하고, 각 지수에 따른 우리나라 순위를 살펴본다. 이 지표를 기준으로 보면 우리나라는 GDI는 상위권, GII는 중상위권, GEM GGI는 최하위권에 속하는 것을 알 수 있었다. 국제지수 순위를 통해 우리나라의 경우 포괄적이고 실제적인 성평등을 이루기 위해서 정치참여와 경제영역에서 성평등이 시급하다는 것을 알 수 있었다.

Steady-state Capabilities for Hydroturbines with OpenFOAM

  • Page, Maryse;Beaudoin, Martin;Giroux, Anne-Marie
    • International Journal of Fluid Machinery and Systems
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    • 제4권1호
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    • pp.161-171
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    • 2011
  • The availability of a high quality open source CFD simulation platform like OpenFOAM offers new R&D opportunities by providing direct access to models and solver implementation details. Efforts have been made by Hydro-Qu$\'{e}$bec to adapt OpenFOAM to hydroturbines for the development of steady-state capabilities. This paper describes the developments that have been made to implement new turbomachinery related capabilities: multiple frames of reference solver, domain coupling interfaces (GGI, cyclicGGI and mixing plane) and specialized boundary conditions. Practical use of the new turbomachinery capabilities are demonstrated for the analysis of a 195-MW Francis turbine.

경계요소법을 이용한 실리콘내에서 2차원 불순물 분포의 산출 (A production of two-dimensional impurity using boundary element method in silicon)

  • 김찬규;황호정
    • 대한전기학회:학술대회논문집
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    • 대한전기학회 1987년도 전기.전자공학 학술대회 논문집(I)
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    • pp.458-460
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    • 1987
  • A two-dimensional numerical simulation program is presented which enables the concentrion of impurity in Silicon to be caculated. The numerical algorithm used is based on the boundary element menthod.

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오픈 소스 라이브러리를 이용한 수치수조 구현 및 적용 (Development of Numerical Tank Using Open Source Libraries and Its Application)

  • 박선호;이신형
    • 해양환경안전학회지
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    • 제20권6호
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    • pp.746-751
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    • 2014
  • 본 논문에서는 소스 코드가 공개된 라이브러리를 이용하여 선박의 성능을 예측할 수 있는 해석 코드를 개발하였다. 질량보존 방정식, 모멘튼 보존방정식, 난류를 고려하기 위해 난류모델과 벽함수를 고려하였다. 자유수면 계산을 위해 볼륨비 수송방정식을 고려하였고, 자유수면의 정확도 높은 계산을 위해 고차 도식을 포함하는 라이브러리를 개발하였다. 개발한 프로그램을 컨테이너선인 KCS에 적용한 결과 실험에서 포착된 자유수면 분포를 잘 예측하였다. 자항성능 평가 시 추진기 회전을 위해 GGI 라이브러리를 사용하였다. 계산결과 실험과 비교해 약 7 % 정도의 정확도로 자항성능을 예측하였다. 캐비테이션 예측을 위해 이상 균질 모델을 포함하는 새로운 라이브러리를 개발하였다. 이상 균질 모델을 추진기에 적용한 결과 일반적으로 발생하는 얇은 층 캐비테이션을 잘 예측하는 것을 확인하였다. 오픈 소스 라이브러리를 이용하여 개발한 수치수조를 KCS에 적용한 결과 오픈 소스 라이브러리에 대한 가능성을 확인하였다.

유방암에서 자기공명영상 근거 영상표현형과 유전자 발현 프로파일 근거 위험도의 관계 (Correlation between MR Image-Based Radiomics Features and Risk Scores Associated with Gene Expression Profiles in Breast Cancer)

  • 김가람;구유진;김준호;김은경
    • 대한영상의학회지
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    • 제81권3호
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    • pp.632-643
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    • 2020
  • 목적 자기공명영상 근거 영상표현형과 생체분자학적 아형, 유전자 발현 프로파일 근거 위험도 등 유방암 유전체 특징의 관계를 분석하고자 하였다. 대상과 방법 The Cancer Genome Atlas와 and the Cancer Imaging Archive에 공개된 자료를 이용하였다. 122개의 유방암의 자기공명영상에서 영상표현형이 추출되었다. 유전자 발현 프로파일에 따라 PAM50아형을 분류하고 위험도를 지정하였다. 영상표현형과 생체분자학적 특징의 관계를 분석하였다. 예측모델을 알아보기 위해 penalized generalized regression analysis를 이용하였다. 결과 PAM50아형은 maximum 2D diameter (p = 0.0189), degree of correlation (p = 0.0386), 그리고 inverse difference moment normalized (p = 0.0337)와 유의하게 관련이 있었다. 위험도 시스템 중에 GGI와 GENE70이 통계적으로 유의하게 8개의 영상표현형 특징을 서로 공유하였다(p = 0.0008~0.0492). Maximum 2D diameter가 두 위험도 시스템에서 가장 유의하게 관련있는 특징이었으나(p = 0.0139, p = 0.0008) 예측모델의 전반적인 연관 정도는 약했고 가장 높은 연관계수는 GENE70이 0.2171이었다. 결론 영상표현형 중에 maximum 2D diameter, degree of correlation, 그리고 inverse difference moment normalized가 PAM50 아형 그리고 GENE70과 같은 유전자 발현 프로파일 근거 위험도와 그 연관도는 약하였으나 유의한 관련을 보였다.

Unsteady Simulations of the Flow in a Swirl Generator, Using OpenFOAM

  • Petit, Olivier;Bosioc, Alin I.;Nilsson, Hakan;Muntean, Sebastian;Susan-Resiga, Romeo F.
    • International Journal of Fluid Machinery and Systems
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    • 제4권1호
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    • pp.199-208
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    • 2011
  • This work presents numerical results, using OpenFOAM, of the flow in the swirl flow generator test rig developed at Politehnica University of Timisoara, Romania. The work shows results computed by solving the unsteady Reynolds Averaged Navier Stokes equations. The unsteady method couples the rotating and stationary parts using a sliding grid interface based on a GGI formulation. Turbulence is modeled using the standard k-${\varepsilon}$ model, and block structured wall function ICEM-Hexa meshes are used. The numerical results are validated against experimental LDV results, and against design velocity profiles. The investigation shows that OpenFOAM gives results that are comparable to the experimental and design profiles. The unsteady pressure fluctuations at four different positions in the draft tube is recorded. A Fourier analysis of the numerical results is compared whit that of the experimental values. The amplitude and frequency predicted by the numerical simulation are comparable to those given by the experimental results, though slightly over estimated.

홍국파우더 루 첨가량을 달리한 브라운소스의 품질특성에 관한 연구 (A Study on the Quality Characteristics of Brown Sauce by the Addition of Red Yeast Rice Powder Roux)

  • 김세한;신경은;최수근;서윤원
    • 한국조리학회지
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    • 제18권4호
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    • pp.222-232
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    • 2012
  • 본 연구는 일반적으로 농후제로 사용되는 루(Roux)에 홍국파우더를 첨가하여 제조한 브라운소스의 일반성분 및 이화학적 특성, 관능적 특성을 평가하였다. 수분은 홍국파우더 루의 첨가량이 증가할수록 감소하였다. 점도와 탁도는 홍국파우더 루의 첨가량이 많을수록 증가하였으며, pH, 당도, 환원당도 홍국파우더 루의 첨가량이 많을수록 증가하는 경향을 보였다. 관능검사중 정량적 묘사분석 결과는, 붉은 색의 정도, 걸쭉한 정도, 시큼한 맛, 쌉쌀한 맛, 깔깔한 정도는 홍국파우더 루의 첨가량이 많아질수록 증가를 하였고, 누린내는 감소하였음을 알 수 있다. 브라운소스의 품질향상에 홍국파우더 루가 영향을 주는 것으로 사료된다. 이상의 실험결과를 종합해 볼 때, 브라운소스의 홍국파우더 루 첨가는 전체적인 기호도에 영향을 미치며, 홍국 파우더 30% 첨가 시 브라운소스의 기계적 특성과 관능 및 기호도의 향상에 가장 적절하다고 사료된다.

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Experimental Assessment of Mechanical Properties of Geo-grid Reinforced Material and Long-Term Performance of GT/HDPE Composite

  • Seo, Jung-Min;Min, Kyung-Ho;Hwang, Beong-Bok;Lee, In-Chul;Ruchiranga, Jayasekara Vishara;Jeon, Han-Yong;Jang, Dong-Hwan;Lim, Joong-Yeon
    • Advanced Composite Materials
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    • 제17권3호
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    • pp.247-258
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    • 2008
  • This paper is concerned with the long-term performance of geo-textile (GT) composites in terms of creep deformation and frictional properties. Composites of PVA GT and HDPE GM were made to investigate the advanced properties of long-term performance related to waste landfill applications. The same experiments were also performed for typical polypropylene and polyester GT and compared to PVA GT/HDPE GM composites. We also develop high performance GT composites with GM by using PVA GT, which is capable of improving the frictional properties and thus enhances long-term performance of GT composites. Experimental study reveals that the friction coefficient of GT composites is relatively large compared with those of polyester and polypropylene non-woven GT as long as the friction media has similar size to the particles of domestic standard earth. In addition, the geo-composites bonded with geo-grid by a chemical process were investigated experimentally in terms of strain evaluation and creep response values. Geo-grid plays an important role as a reinforcing material. Three kinds of geo-grid were prepared as strong yarn polyester and they were woven type, non-woven type, and wrap knitted type. The sample geo-grids were then coated with PVC. The rib tensile strength tests were conducted to evaluate geo-grid products in terms of tensile strength with regard to single rib. The test was performed according to GRI-GGI. It was concluded again from the experiments that the tensile and creep strains of the geo-grid showed such stable values that the geo-grid prepared in this study could protect geo-textile partially in practical structures.

게르만어의 공명음 중복현상과 후두음이론 (Germanische Resonantengemination und Laryngaltheorie)

  • 전순환
    • 한국독어학회지:독어학
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    • 제5집
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    • pp.1-22
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    • 2002
  • 본 논문의 목적은 게르만제어(예를들어 고트어, 고대북구어, 고고지독일어, 고대영어 등)에 나타나는 공명음중복 현상이 원-인도유럽어시기의 후두음에 기인함을 보이는 것이다. 고트어의 ddj/ggw, 고대북구어의 ggi/ggr, 고고지독일어 ij/uw (이상 소위 '예음화현상'으로 불림)와 그 외 게르만제어에 공통적으로 나타나는 공명음들의 중복, -rr-, -ll-, -nn-, -mm- 등은 원-게르만어시기에 각각 $\ast-ii-,\;\ast-uu-,\;\ast-rr-,\;\ast-ll-,\;\ast-nn-,\;\ast-mm-$ 등으로 소급된다. 그러나 이러한 자음군이 게르만어 이외의 다른 인도유럽어들( 대표적으로 고대인도이란어, 고전희랍어, 라전어 등)과 비교되어 원-인도유럽어시기로 소급되는 경우, 각각 $\ast-iH-,\;\ast-uH-,\;\ast-rH-,\;\ast-lH-,\;\ast-nH-,\;\ast-mH-$ 등으로 재구된다. 따라서 원-게르만어의 자음중복 현상이 후두음의 영향으로 나타난 것으로 해석되는데, 아마도 후두음이 선행하는 공명음에 동화되어 일어난 것으로 보인다. 소쉬르(1987)이래 발전해 온 후두음이론은 현재 그 이론적 틀을 확립한 상태이다. 이 이론은 고전 인도유럽어학에서 설명하지 못했던 여러 언어현상들을 설명하였고, 현대 인도유럽어 역사비교언어학에서 언어변화에 대한 필수적인 설명기재로서 사용되고 있다. 원-인도유럽어의 많은 특징들을 계승한 전형적인 다른 고대 인도유럽어들과는 달리, 시기적으로 늦은 고대 게르만어에서 음운론적 층위에서 공명음중복 현상이 후두음에 기인함은 인도유럽어 역사비교언어학에서 뿐만 아니라 게르만어학에서도 큰 의미를 갖는다고 볼 수 있다.간접으로 본동사 앞에 놓여 있어야 되는 모든 문장성분과 부문장 때문에, 즉 한국어의 전면적인 전위수식 현상으로 흔히 큰 부담/복잡함을 야기한다는 데에 그 원인이 있다. 이러한 상황에서 동사는 가능한 한 그의 문장성분을 줄이려 한다. 통사적으로 보장되어 이미 있으니 말이다. 그래서 한국어 동사의 부정성은 일종의 부담해소 대책으로 간주될 수 있을 것이다. $\ast$ 두 비교 대상에서의 핵 및 최소문장 가능성은 역시 원자가에 대한 비구속성에서 비롯된다. $\ast$ 우리 한국인이 빨리 말할 때 흔히 범하는 부정성으로 인한 인칭변화에서의 오류는 무엇보다도 정형성/제한성을 지닌 독일어 정동사가 인칭 변화하는 데 반해 한국어에서는 부정성/비구속성을 지닌 동사가 그것과는 무관한 페 기인한다. 동사의 속성을 철저히 분석함으로써 이런 과오를 극복해야 할 것이다. 한국어 동사의 부정성은 지금까지 거의 연구되지 않았다. 이 문제는 또한 지속적으로 수많은 다른 자연어들과의 비교분석을 통해 관찰돼야 할 것이다. 이 논문이 이런 연구와 언어습득을 위한 작업에 도움이 되기를 바란다.적 성분구조가 다르다는 것을 알 수 있다. 우리는 이 글이 외국어로서의 독일어를 배우는 이들에게 독일어의 관용구를 보다 올바르게 이해할 수 있는 방법론적인 토대를 제공함은 물론, (관용어) 사전에서 외국인 학습자를 고려하여 관용구를 알기 쉽게 기술하는 데 도움을 줄 수 있기를 바란다.되기 시작하면서 남황해 분지는 구조역전의 현상이 일어났으며, 동시에 발해 분지는 인리형 분지로 발달하게 되었다. 따라서, 올리고세 동안 발해 분지에서는 퇴적작용이, 남황해 분지에서는 심한 구조역전에 의한 분지변형이 동시에 일어났다 올리고세 이후 현재까지, 남황해

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