• 제목/요약/키워드: Fungal isolation

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한국의 산과 섬 지역에서 채집한 곤충기생 진균의 분리 및 동정 (Isolation and Identification of Entomopathogenic Fungi Collected from Mountains and Islands in Korea)

  • 김완규;석순자;원항연;이강효;이찬중;김양섭
    • 한국균학회지
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    • 제38권2호
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    • pp.99-104
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    • 2010
  • 2003년부터 2007년까지 국내 여러 지역의 산과 섬 지역을 조사하여 진균에 감염된 죽은 곤충시료를 채집하였다. 채집한 곤충시료에 형성된 진균의 자실체 형태를 조사하고, 채집한 곤충시료에서 총 542균주의 진균을 분리하였다. 분리한 균주의 형태적 및 배양적 특성을 조사하여 동정한 결과, 분리빈도가 많은 곤충기생 진균은 Beauveria속이 3종, Cordyceps속이 8종, Isaria속이 4종이었다. 이외에 분리된 곤충기생 진균은 Metarhizium anisopliae, Nomuraea rileyi, Paecilomyces sp., Verticillium sp.였다.

Isolation, Identification and Enzymatic Activity of Halotolerant and Halophilic Fungi from the Great Sebkha of Oran in Northwestern of Algeria

  • Chamekh, Rajaa;Deniel, Franck;Donot, Christelle;Jany, Jean-Luc;Nodet, Patrice;Belabid, Lakhder
    • Mycobiology
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    • 제47권2호
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    • pp.230-241
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    • 2019
  • The Great Sebkha of Oran is a closed depression located in northwestern of Algeria. Despite the ranking of this sebkha among the wetlands of global importance by Ramsar Convention in 2002, no studies on the fungal community in this area have been carried out. In our study, samples were collected from two different regions. The first region is characterized by halophilic vegetation and cereal crops and the second by a total absence of vegetation. The isolated strains were identified morphologically then by molecular analysis. The biotechnological interest of the strains was evaluated by testing their ability to grow at different concentration of NaCl and to produce extracellular enzymes (i.e., lipase, amylase, protease, and cellulase) on solid medium. The results showed that the soil of sebkha is alkaline, with the exception of the soil of cereal crops that is neutral, and extremely saline. In this work, the species Gymnoascus halophilus, Trichoderma gamsii, the two phytopathogenic fungi, Fusarium brachygibbosum and Penicillium allii, and the teleomorphic form of P. longicatenatum observed for the first time in this species, were isolated for the first time in Algeria. The halotolerance test revealed that the majority of the isolated are halotolerant. Wallemia sp. and two strains of G. halophilus are the only obligate halophilic strains. All strains are capable to secrete at least one of the four tested enzymes. The most interesting species presenting the highest enzymatic index were Aspergillus sp. strain A4, Chaetomium sp. strain H1, P. vinaceum, G. halophilus, Wallemia sp. and Ustilago cynodontis.

Development of a Selective Medium for Surveillance of Fusarium Head Blight Disease

  • Hosung Jeon;Jung Wook Yang;Donghwan Shin;Donggyu Min;Byung Joo Kim;Kyunghun Min;Hokyoung Son
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제40권2호
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    • pp.106-114
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    • 2024
  • Fusarium head blight (FHB), predominantly caused by Fusarium graminearum and F. asiaticum, is a significant fungal disease impacting small-grain cereals. The absence of highly resistant cultivars underscores the need for vigilant FHB surveillance to mitigate its detrimental effects. In 2023, a notable FHB outbreak occurred in the southern region of Korea. We assessed FHB disease severity by quantifying infected spikelets and grains. Isolating fungal pathogens from infected samples often encounters interference from various microorganisms. We developed a cost-effective, selective medium, named BGT (Burkholderia glumae Toxoflavin) medium, utilizing B. glumae, which is primarily known for causing bacterial panicle blight in rice. This medium exhibited selective growth properties, predominantly supporting Fusarium spp., while substantially inhibiting the growth of other fungi. Using the BGT medium, we isolated F. graminearum and F. asiaticum from infected wheat and barley samples across Korea. To further streamline the process, we used a direct PCR approach to amplify the translation elongation factor 1-α (TEF-1α) region without a separate genomic DNA extraction step. Phylogenetic analysis of the TEF-1α region revealed that the majority of the isolates were identified as F. asiaticum. Our results demonstrate that BGT medium is an effective tool for FHB diagnosis and Fusarium strain isolation.

한국(韓國) 논토양중(土壤中)의 균류(菌類)에 관(關)한 연구(硏究) IV. 열처리(熱處理)로 분리(分離)한 사상균류(絲狀菌類) (Fungal flora of paddy field in Korea IV. Filamentous fungi isolated by heat treatment)

  • 민경희;이등충의;횡산용부
    • 한국균학회지
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    • 제15권3호
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    • pp.187-195
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    • 1987
  • 두가지 열처리법에 의한 균 분리방법을 사용하여, 보통균을 제외한 토양균의 분리와 그의 논토양중의 수직 및 계절별 분포를 파악하기 위하여 역곡동과 신원동의 논토양을 시료로 사용하였다. $42^{\circ}C$에서 2일간 배양후 $37^{\circ}C$로 배양하는 방법과 $70^{\circ}C$에서 15분간 열처리하는 방법을 사용하였다. $42^{\circ}C$ 배양법에서는 두 장소에서 분리된 토양균은 거의가 mesophile이었으며 thermotolerant fungi는 Asergillus fumigatus, thermophile로는 Sporotrichum thermophile과 Malbranchea pulchella var. sulfrea이었고, 이들 중 우점종은 Asergillus fumigatus이었다. 두 장소에서 9속, 14종이 분리동정되었으며 Sporotrichum thermophile, Talaromyces ucrainicus, Malbranchea pulchella var. sulfrea는 한국 미기록 종이다. $72^{\circ}C$ 열처리방법으로 분리한 경우 두 장소에서 10속, 20종이 분리동정되었으며, 분리된 균은 거의가 mesophile이었으며 thermotolerant fungi는 Asergillus fumigatus이었고, 우점종은 Talaromyces stipitatus이었다. 또한 Talaromyces helicus var. major, Emericella nidulans var. nidulans, Chaetomium subspirale, Neosartorya fishiri var. fischeri는 한국 미기록 종이다. 두가지 분리방법으로 분리된 토양균의 계절적 분포는 여름과 봄이 가을과 겨울보다 높았으며, 전체 균의 수와 우점종 균수, 그리고 나타나는 종의 빈도는 그 수직분포에 있어서 상층에서 가장 높았으나 하층으로 내려갈수록 감소하였다.

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Factors Affecting the Vineyard Populational Diversity of Plasmopara viticola

  • Boso, Susana;Gago, Pilar;Santiago, Jose-Luis;de la Fuente, Maria;Martinez, Maria-Carmen
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제35권2호
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    • pp.125-136
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    • 2019
  • Vitis vinifera is very susceptible to downy mildew (Plasmopara viticola). A number of authors have suggested different genetic populations of this fungus exist in Europe, each showing a different degree of virulence. Work performed to date indicates this diversity to be the result of different factors. In areas where gene flow is greater and recombination more frequent, the diversity of P. viticola appears to be wider. In vineyards isolated by geographic barriers, a race may become dominant and produce clonal epidemics driven by asexual reproduction. The aim of the present work was to identify the conditions that influence the genetic diversity of P. viticola populations in the vineyards of northwestern Spain, where the climatic conditions for the growth of this fungus are very good. Vineyards situated in a closed, narrow valley of the interior, in more open valleys, and on the coast were sampled and the populations of P. viticola detected were differentiated at the molecular level through the examination of microsatellite markers. The populations of P. viticola represented in primary and secondary infections were investigated in the same way. The concentration of airborne sporangia in the vegetative cycle was also examined, as was the virulence of the different P. viticola populations detected. The epidemiological characteristics of the fungus differed depending on the degree of isolation of the vineyard, the airborne spore concentration, and on whether the attack was primary or secondary. Strong isolation was associated with the appearance of dominant fungal races and, therefore, reduced populational diversity.

한우 및 산양의 장내 섬유소 분해 혐기 곰팡이의 분리 및 특성 구명 (Isolation and Characterization of Cellulolytic Anaerobic Fungi from the Guts of the Hanwoo Cattle and the Korean Native Goat)

  • 김창현;이성실
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제45권6호
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    • pp.1019-1030
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    • 2003
  • 본 연구는 국내의 재래 반추동물인 재래산양과 한우의 장내에 서식하며 강력한 섬유소를 분해하는 혐기 곰팡이를 탐색하고 분리하여 섬유소 분해 특성을 구명하고자 실시되었다. 산양의 반추위로부터 16종과 한우의 십이지장 소화물로부터 5종의 혐기 곰팡이를 분리하여 총 21종의 혐기성 곰팡이가 분리되었다. 섬유소 분해효소의 활력을 측정하여 그 중 섬유소 분해력이 높은 4종의 곰팡이에 대하여 광학현미경에 의한 형태학적 관찰을 기초로 동정 작업을 수행하였다. NLRI-M003은 monocentric 성장형태, 구형의 포자낭, filamentous rhizoid 및 유주자의 flagella가 다수인 Neocallimastix sp., NLRI-M014는 monocentric 성장형태, 방추형의 포자낭, filamentous rhizoid 및 유주자의 flagella가 단수인 Piromyces sp.로, NLRI-T004는 monocentric 성장형태, 난형의 포자낭, filamentous rhizoid 및 유주자의 fagella 수가 다수인 Neocallimastix sp.로 각각 확인되었다. NLRI-M001은 Orpinomyces sp. 와 유사한 것으로 추측되나 지금까지 밝혀진 곰팡이 이외에 다른 밝혀지지 않은 곰팡이가 존재할 가능성이 있을 것으로 평가되어 더욱 더 세부적인 조사가 필요하다고 사료되었다. 혐기 곰팡이의 섬유소 분해 특성을 조사하기 위해 산양의 반추위로부터 분리된 NLRI-M003 혐기 곰팡이 배양액을 2% 첨가하여 혼합 반추위 미생물의 in vitro 건물 분해율을 볏짚과 filter paper를 기질로 하여 조사하였다. 모든 처리구에서 혐기 곰팡이 배양액을 첨가한 첨가구가 무첨가구에 비하여 볏짚의 경우 약 4%이상(p〈0.05) 그리고 filtre paper를 기질로 사용시 11% 이상(p〈0.001)의 분해율이 증가하였다. 또한 CMCase와 xylanase 효소의 활력도 첨가구에서 증가하였으며 특히 반추위 곰팡이는 강력한 xylanase 효소활력이 높음을 보여주었다.

초등학교 실내환경에서 공기 중 세균과 진균의 분리 및 특성 (Isolation and Characterization of Airborne Bacteria and Fungi in Indoor Environment of Elementary Schools)

  • 김나영;김영란;김민규;조두완;김종설
    • 미생물학회지
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    • 제43권3호
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    • pp.193-200
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    • 2007
  • 울산 소재 초등학교 3곳의 교실과 복도에서, 배양가능한 공기중 세균과 진균의 농도를 조사하고, 이들 미생물을 분리한 후 동정하였다. 세균과 진균의 포집에는 충돌식 공기 채취기를 사용하였으며, 세균수와 진균수의 측정에는 각각 plate count agar와 dichloran rose bengal chloramphenicol agar를 사용하였다. 학기 중 세균 농도는 교실에서 $168{\sim}3,887MPN/m^3$ 복도에서 $168{\sim}6,339MPN/m^3$의 범위였으며, 진균 농도는 교실에서 $34{\sim}389MPN/m^3$, 복도에서 $91{\sim}507MPN/m^3$의 범위로, 상황과 학교에 따른 측정값의 편차는 세균에서 진균보다 더 크게 나타났다. 분리한 세균의 84%는 그람양성으로 관찰되었는데, 전체 시험한 세균의 61%는 Micrococcus 속으로, 이중 75%는 M. luteus로 확인되었으며, Staphylococcus속은 전체의 10%수준이었다. Micrococcus 속의 주요 발생원은 사람으로 생각되며, 함유한 색소나 높은 세포벽 함량 등의 생리적 특징이 이들 세균의 공기중 생존력을 높이는 것으로 추측된다. 포집한 시료로부터 15속의 사상성 진균을 확인할 수 있었으며, Cladosporium 속, Aspergillus 속, Penicillium속 등이 분리한 진균의 69%를 차지하였다. 1개 학교의 교실에서는 Stachybotrys속이 검출되었는데, 이 속의 S. chartarum은 많은 진균독소를 생산하는 것으로 잘 알려져 있다. 독소생산과 관련이 깊은 Aspergillus 속, Penicillium속, Stachybotrys 속에 대한 종 수준에서의 동정, 분리한 진균의 독소생산능력, 공기중 진균독소 검출 및 진균 농도와의 상관관계 분석 등에 대한 보다 체계적인 연구가 필요하다고 판단된다.

내산성(耐酸性) 소화효소제(消化酵素劑)의 생산(生産)에 관(關)한 연구(硏究) -내산성(耐酸性) 효소생산균(酵素生産菌)의 분리(分離)와 효소(酵素) 생산조건(生産條件)에 관(關)하여- (Studies on the Production of Acid Digestive Enzyme -Isolation and Characterization of a Fungal Strain Which Produces Acid Enzymes-)

  • 손천배;박윤중
    • 한국식품과학회지
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    • 제13권3호
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    • pp.241-246
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    • 1981
  • 소화효소제(消化酵素劑) 생산(生産)에 이용(利用)하기 위하여 공기(空器)중(中)에서 내산성(耐酸性) protease 및 amylase 생산능(生産能)이 강(强)한 균주(菌株)를 분리(分離), 선정(選定)하고 선정균(選定菌)의 균학적(菌學的) 성질(性質)을 검토(檢討)하였다. 아울러 생성효소(生成酵素)의 내산성(耐酸性)(반응(反應) pH와 효소활성(酵素活性)과의 관계(關係)과 효소(酵素) 생산조건(生産條件)을 검토(檢討)하였다. 1. 선정균주(選定菌株)는 내산성(耐酸性) protease 및 amylase를 강(强)하게 생산(生産)하는 균주(菌株)로서 Raper와 Fennel의 manual에 의(依)하여 Aspergillus niger로 동정(同定)되었다. 2. 선정균(選定菌)의 protease는 pH 2.0에서 최대활성(最大活性)을 나타냈으며, ${\alpha}-amylase$$pH4{\sim}5$, glucoamylase는 $pH3{\sim}5$에서 최대활성(最大活性)을 나타냈다. 3. 밀기울 배지(培地)에 배양시(培養時) protease(pH 2.5에서의 활성)생산(生産)의 최적조건(最適條件)은 $30^{\circ}C$, $2{\sim}3$일간(日間)이며 , ${\alpha}-amylase$ 및 glucoamylase(pH3.0 에서의 활성(活性))의 경우는 $30^{\circ}C$, 3일간(日間)이었다. 4. 밀기을배지(培地)에 옥수수전분을 2% 첨가(添加)한 경우 내산성(耐酸性) protease 및 glucoamylase의 생성(生成)이 약(約) 20%씩 증가(增加)되었다. 5. 밀기울배지(培地)에 황산암모늄 0.3%를 첨가(添加)한 경우 내산성(耐酸性) protease 및 glucoamylase의 생성(生成)이 증가(增加)되었으며, 특(特)히 내산성(耐酸性) protease의 생성(生成)에 효과적(效果的)이었다.

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소나무와 잣나무 원목에서 변재변색 발생 (Development of Fungal Sapstain in Logs of Japanese Red Pine and Korean Pine)

  • 김규혁;김재진;나종범
    • Journal of the Korean Wood Science and Technology
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    • 제30권2호
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    • pp.128-133
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    • 2002
  • 본 연구는 동절기(1월 중순)에 벌채된 후 목재집하장으로 운반되어 야적장에 저목 중인 소나무와 잣나무 원목을 대상으로 변재변색의 발생시기와 변색 특성을 조사하기 위하여 수행되었다. 벌채 후 3, 4, 5, 6, 8개월 경과시 변색 평가를 실시하였는데, 매 평가시 원목 3개를 임의로 선정하여 원목당 수축방향에 대해 일정 간격으로 7~9개의 두께 3 cm 원판을 채취하여 변색 원인균을 분리한 후 변재변색의 방사방향 최대 침투깊이와 % 변색율을 측정하였다. 변재변색은 전적으로 충형변색이었으며, 주요 변색원인균인 Ophiostomatoid 균을 매개하는 수피천공충은 소나무좀으로 확인되었다. 소나무와 잣나무 원목은 5월 이전까지는 변재변색의 위험없이 저목할 수 있으나 5월 이후부터는 원목의 변재변색이 급속하게 증가하였다. 변색의 정도는 소나무보다 잣나무에서 심하였으며, 장마철 저목 중에 소나무 원목에서 개떡버섯과 치마버섯의 자실체를 다수 관찰할 수 있었다. 본 연구를 통해 밝혀진 결과들은 앞으로 동절기에 벌채되어 저목 중인 소나무와 잣나무 원목에 발생하는 변재변색을 예방하기 위한 제반 조치를 취하는데 매우 중요한 자료로 사용될 것이다.

Uniqueness of Microbial Cutinases in Hydrolysis of p-Nitrophenyl Esters

  • KIM, YANG-HOON;JEEWON LEE;SEUNG-HYEON MOON
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제13권1호
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    • pp.57-63
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    • 2003
  • Using fungal (Fusarium solani f. pisi) and bacterial (Pseudomonas mendocina) cutinases, the initial hydrolysis rate of p-nitrophenyl esters was systematically estimated for a wide range of enzyme and substrate concentrations using a 96-well microplate reader. Both cutinases exhibited a high substrate specificity; i.e. a high hydrolytic activity on p-nitrophenyl butyrate (PNB), yet extremely low activity on p-nitrophenyl palmitate (PNP). When compared to the hydrolysis of PNB and PNP by other hydrolases [lipases and esterases derived from different microbial sources, such as bacteria (Pseudomonas cepacia, Psedomonas furescens, Baciilus stearothermophilus), molds (Aspeillus niger, mucor miehei), and yeasts (Candida rugosa, Candida cylindracea)], the above substrate specificity would seem to be a unique characteristic of cutinases. Secondly, the hydrolytic activity of the cutinases on PNB appeared much faster than that of the other hydrolytic enzymes mentioned above. Furthermore, the current study proved that even when the cutinases were mixed with large amounts of other hydrolases (lipases or esterases), the Initial hydrolysis rate of PNB was determined only by the cutinase concentration for each PNB concentration. This property of cutinase activity would seem to result from a higher accessibility to the substrate PNB, compared with the other hydrolytic enzymes. Accordingly, these distinct properties of cutinases may be very useful in the rapid and easy isolation of various natural cutinases with different microbial sources, each of which may provide a novel industrial application with a specific enzymatic function.