• Childhood Kidney Diseases
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• 제19권2호
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• pp.148-153
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• 2015

Purpose: We investigated trends in antibiotic resistance for gram-negative bacteria in infants with a urinary tract infection (UTI) over 15 years at a single institution. Methods: A retrospective chart review was conducted for children younger than 24 months who visited the emergency room and were diagnosed with a UTI between January 2000 and December 2014. We selected urine culture data that grew Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae. Baseline clinical information and results of antimicrobial susceptibility tests were analyzed by dividing the 15-year study time frame into three periods (A: 2000-2004, B: 2005-2009, and C: 2010-2014). Results: During the study period, 478 applicable children were identified (E. coli, 89.7% and K. pneumoniae, 10.3%). Antibiotic resistance to third-generation cephalosporins was increased from period A to period C (A, 2.1%; B, 8.3%; C, 8.8%; P=0.025). Resistance to quinolones also showed a steady pattern during periods A to C, although it was not statistically significant (A, 7.9%; B, 9.7%; C, 12.4%; P=0.221). The incidence of Extended-spectrum ${\beta}$-lactamase (ESBL)-producing gram-negative bacteria increased from period A to period C (A, 1.4%; B, 7.6%; C, 8.2%; P=0.012). Conclusion: This study revealed that the common uropathogens E. coli and K. pneumoniae experienced increasing resistance rates against third-generation cephalosporins and a constant antibiotic resistance to quinolones in children younger than 24 months. We also showed a recent increased incidence of ESBL-producing gram-negative bacteria in patients with community-acquired UTIs. Therefore, it is necessary to actively surveil resistance in order to properly select empirical antibiotics.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제60권7호
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• pp.221-226
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• 2017

Purpose: Escherichia coli sequence type (ST) 131, a multidrug-resistant clone causing extraintestinal infections, has rapidly become prevalent worldwide. However, the epidemiological and clinical features of pediatric infections are poorly understood. We aimed to explore the characteristics of ST131 Escherichia coli isolated from Korean children with urinary tract infections. Methods: We examined 114 uropathogenic E. coli (UPEC) isolates from children hospitalized at Chung-Ang University Hospital between 2011 and 2014. Bacterial strains were classified into STs by partial sequencing of seven housekeeping genes (adk, fumC, gyrB, icd, mdh, purA, and recA). Clinical characteristics and antimicrobial susceptibility were compared between ST131 and non-ST131 UPEC isolates. Results: Sixteen UPEC isolates (14.0%) were extended-spectrum ${\beta}-lactamase$ (ESBL)-producers; 50.0% of ESBL-producers were ST131 isolates. Of all the isolates tested, 13.2% (15 of 114) were classified as ST131. There were no statistically significant associations between ST131 and age, sex, or clinical characteristics, including fever, white blood cell counts in urine and serum, C-reactive protein, radiologic abnormalities, and clinical outcome. However, ST131 isolates showed significantly lower rates of susceptibility to cefazolin (26.7%), cefotaxime (40.0%), cefepime (40.0%), and ciprofloxacin (53.3%) than non-ST131 isolates (65.7%, 91.9%, 92.9%, and 87.9%, respectively; P<0.001 for all). ESBL was more frequently produced in ST131 (53.3%) than in non-ST131 (8.1%) isolates (P<0.01). Conclusion: ST131 E. coli isolates were prevalent uropathogens in children at a single medical center in Korea between 2011 and 2014. Although ST131 isolates showed higher rates of antimicrobial resistance, clinical presentation and outcomes of patients were similar to those of patients infected with non-ST131 isolates.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제24권6호
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• pp.765-770
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• 2014

This study aimed to characterize CTX-M producers of urinary E. coli and K. pneumoniae isolates and to determine the prevalence of plasmid-mediated antimicrobial resistance genes among them. Minimum inhibitory concentrations (MICs) were determined, and PCR and sequencing were performed. Among the 42 (82.3%) E. coli and 24 (77.4%) K. pneumoniae isolates containing $bla_{CTX-M}$, $bla_{CTX-M-14}$ and $bla_{CTX-M-15}$ were detected in 23 and 19 E. coli isolates, respectively, and in 7 and 17 K. pneumoniae isolates, respectively. CTX-M producers of urinary E. coli and K. pneumoniae were resistant to multiple antibiotics and contained other antimicrobial resistance genes. CTX-M-15 producers contained more antimicrobial resistance genes than did CTX-M-14 producers.

• 대한의생명과학회지
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• 제21권2호
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• pp.84-91
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• 2015

To provide guidelines for the empirical treatment of urinary tract infections, we observed annual changes in the occurrence frequency and antimicrobial susceptibility of urinary isolates in a university hospital in the Chungbuk province, South Korea, over a period of 10 years (2004~2013). Escherichia coli (38.2%), Enterococcus faecalis (11.7%), Klebsiella pneumoniae (7.3%), Pseudomonas aeruginosa (4.3%), E. faecium (4.3%), and Staphylococcus aureus (4.1%) were commonly isolated urinary pathogens. The prevalence of E. coli, E. faecium and Streptococcus agalactiae were significantly higher in females (P < 0.001), whereas E. faecalis, P. aeruginosa and S. aureus were significantly more common in male patients (P < 0.001). E. coli mostly frequently showed resistance to ampicillin (67.94%), followed by trimethoprim/sulfamethoxazole (36.06%) and ciprofloxacin (26.84%). Over the studied time period, resistance rates of E. coli to ciprofloxacin significantly increased (20.44% to 33.55%). Moreover, extended-spectrum $\beta$-lactamase (ESBL) producing isolates also significantly increased in E. coli (4.2% to 18.3%) and K. pneumoniae (9.6% to 26.9%). In addition, the proportion of vancomycin-resistant Enterococcus facium (VRE) also increased (15.7% to 25.0%). In conclusion, over the last 10 years, the proportions of ciprofloxacin resistant E. coli and multidrug-resistant bacteria, such as ESBL and VRE have significantly increased. This trend must be strictly controlled and demonstrates the need for more updated guidelines for the treatment of urinary tract infections.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제28권7호
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• pp.1178-1184
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• 2018

The spread of antibiotic-resistant Enterobacteriaceae in the community is one of the main challenges for antibiotic treatment of community-onset infections. We evaluated the microbiological and molecular characteristics of stool samples from adults with comprehensive health examinations. Of 109 fecal samples, bacterial growth was observed in 86 samples and 61 gram-negative bacterial isolates were identified, of which 45 were Escherichia coli isolates (73.8%). Two isolates of Raoultella showed imipenem resistance, and both E. coli and Citrobacter freundii showed intermediate resistance to imipenem. Colistin resistance was identified in isolates of Klebsiella variicola and Salmonella subterranean, but no isolates carried mcr-1. As for E. coli genotypes, 35 sequence types were identified. $bla_{TEM-1}$, $bla_{TEM-30}$, and $bla_{CTX-M}$ were identified in 15, 1, and 4 E. coli isolates, respectively. In addition, all four Klebsiella pneumoniae isolates carried $bla_{SHV}$. Many genotypes that have been identified in isolates causing human infections were found in isolates in this study. There is a need to control the rise and spread of antibiotic-resistant pathogens by fecal carriage.

• Pediatric Infection and Vaccine
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• 제17권1호
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• pp.30-35
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• 2010

목 적 : 소아 요로 감염은 가장 흔한 세균성 질환의 하나로, 특히 요로계의 해부학적 기형이 동반되면 재발하기 쉽고, 치료가 되지 않을 경우 고혈압, 신부전, 말기 신질환 등을 초래할 수 있다. 따라서 조기 진단과 적절한 치료 및 반복 감염의 예방이 중요한데, 이를 위해서는 정확한 원인 균주의 파악이 선행되어야 한다. 이에 저자들은 지역사회를 기반으로 하는 2차 병원에서 진단되는 소아요로감염의 원인균 및 항생제 감수성을 조사하여 적절한 항생제 선택에 도움이 되고자 본 연구를 시행하였다. 방 법: 2005년 1월 1일부터 2008년 12월 31일까지 관동대 명지병원 소아과에 입원하여 농뇨(WBC>5/HPF)와 요배양검사 상 $1.0{\times}10^5CFU/mL$ 이상의 배양검사결과를 보인 환아를 대상으로 소변 검사, 소변 배양 검사소견, 항생제 감수성 결과, 방사선 소견 등의 검사 결과를 의무 기록을 통해 후향적으로 조사하였다. 결 과:국내 3차 기관 등에서의 보고와는 다르게 대부분의 요로감염은 E. coli에 의한 것이었으며 ESBL 생성균주 또한 낮게 나타났다. 1) 전체 환아 62명의 평균 연령은 20개월이었으며, 1세 미만에서 호발(50명, 78.1%)하였다. 전체 환아 62명의 남녀 비는 1.6:1이었고, 1세 미만에서는 2.6:1, 1세 이상에서는 1:3.7이었다. 2) 전체 62명의 소변 배양 검사에서 분리된 균주는 E.coli가 가장 많았고(53명, 82.8%), K. pneumoniae (5명, 8.1%), Enterobacter (4명, 6.5%) Enterococcus, $\beta$-streptococcus, diphtheroides 각각 (1명, 1.6%)순이었다. 3) E. coli의 항생제에 대한 감수성은 ampicillin 30.2%, cefotaxime 98.1%, gentamicin 94.9%, amikacin100%, levofloxacin 98.1%, trimethoprim/sulfame-thoxazole 73.6%의 결과를 보였으며, 이 중 ESBL 생성균주는 1주가 검출되었다. 최근 3차 병원에서 실시한 감수성 결과와 차이를 보이는 것으로 의료기관에 따라 항생제 내성율의 차이가 있음을 시사하는 결과로 생각되며, 이는 일차 항생제 선택에 있어 지역별, 병원별 차이를 시사하는 것으로 생각할 수 있다. 결 론 : 향후 요로 감염 원인균 및 항생제 감수성에 대한 기관별, 지역별 지속적인 조사가 필요할 것으로 사료되며, 이에 기반한 적절한 항생제 사용이 요구된다.

• 대한미생물학회지
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• 제35권3호
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• pp.263-271
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• 2000

A clinical isolate of Klebsiella pneumoniae K7746 produced the extended-spectrum ${\beta}$-lactamase (ESBL) SHV-12. A 6.6 kb BamHI fragment containing the $bla_{SHV-12}$ gene of K7746 strain was cloned into pCRScriptCAM vector resulting in the recombinant plasmid p7746-Cl. The restriction map of 3.6 kb inserted DNA and sequences immediately surrounding $bla_{SHV-12}$ of p7746-C1 were homologous to plasmid pMPA2a carrying $bla_{SHV-2a}$. In addition, both $bla_{SHV-12}$ and $bla_{SHV-2a}$ were expressed from a common hybrid promoter made of the -35 region derived from the left inverted repeat of IS26 and the -10 region from the $bla_{SHV}$ promoter itself. The results indicate that $bla_{SHV-12}$ and $bla_{SHV-2a}$ may have evolved from a common ancestor in the sequential order of $bla_{SHV-2a}$ first, followed by $bla_{SHV-12}$. Furthermore, by the PCR mapping method using primers corresponding to the IS26 and $bla_{SHV}$, the association between IS26 and $bla_{SHV}$ was studied in 12 clinical isolates carrying $bla_{SHV-2a}$, 27 clinical isolates carrying $bla_{SHV-12}$, and 5 reference strains carrying $bla_{SHV-1}$ to $bla_{SHV-5}$. All 39 strains carrying $bla_{SHV-2a}$ or $bla_{SHV-12}$ were positive by the PCR, providing confirmative evidence that IS26 has been involved in the evolution and dissemination of $bla_{SHV-2a}$ and $bla_{SHV-12}$. But 5 reference strains carrying $bla_{SHV-1}$ to $bla_{SHV-5}$ were negative by the PCR. Therefore, we concluded that the molecular evolutionary pathway of $bla_{SHV-2a}$ and $bla_{SHV-12}$ may be different from that of other $bla_{SHV-ESBL}$, e.g., $bla_{SHV-2}$, $bla_{SHV-3}$, $bla_{SHV-4}$, and $bla_{SHV-5}$.

• Clinical and Experimental Pediatrics
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• 제49권8호
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• pp.882-888
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• 2006

목 적 : 소아 종양 환아 치료에서 감염은 사망까지 초래할 수 있어, 균혈증에 적절히 대처하는 것은 매우 중요하다. 이에 저자들은 현 시점에서 소아 암 환아에서 발생한 균혈증을 분석하여 앞으로의 치료에 참조하기 위해 이 연구를 시행하였다. 방 법 : 1998년 2월부터 2005년 5월 까지 계명대학교 동산의료원 소아과 병동에서 총 44명의 소아 종양 환아에서 발생되었던 62건의 균혈증을 후향적으로 분석하였다. 입원 당시 감염 소견이 있거나 입원 48시간 이내 발열이 있었던 환아들은 대상군에서 제외하였다. 결 과 : 그람양성균에 의한 균혈증은 30례, 그람음성균에 의한 균혈증은 24례, 진균혈증은 8례로 그람양성균의 빈도가 가장 높았다. 그람양성균 중에서는 Staphylococcus epidermidis 19례, Staphylococcus aureus 5례, alpha-hemolytic Streptococcus 5례의 순으로 빈도가 높았으며, 그람음성균에서는 Alcaligenes xylosoxidans 10례, Klebsiella pneumoniae 5례, Stenotrophomonas maltophilia 3례의 순으로 빈도가 높았다. 절대 호중구 수치가 $500/mm^3$ 이하인 경우는 모두 28례(45.2 %)였으며 그람양성균에서는 S. epidermidis가, 그람음성균에서는 K. pneumoniae가 가장 많았다. 항생제 감수성 검사를 시행하여서는 그람양성균 모두가 vancomycin과 teicoplanin에 감수성이 있었으나 methicillin에 내성을 보이는 경우가 S. epidermidis에서 61.5%(8/13), S. aureus에서 80%(4/5)이었다. 그람음성균에서의 감수성 결과, 대부분이 imipenem에 감수성을 보였다. K. pneumoniae는 모든 경우에서 extended-spectrum beta-lactamase(ESBL)가 양성이었고 K. pneumoniae에 감염된 환아 5례 중 4례가 패혈증과 관련되어 사망하였다. 결 론 : 본원에서도 다른 기관과 마찬가지로 균혈증의 원인으로 그람양성균이 많았다. 앞으로 주기적으로 균혈증의 원인균주를 분석하고 그 균주에 대한 항생제의 감수성을 참조하여 적절한 항생제를 선택할 수 있도록 하여야 할 것이다.

• 한국식품위생안전성학회지
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• 제32권2호
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• pp.147-153
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• 2017

본 연구는 다양한 농업 환경에서 채집된 파리의 분비물에서 E. coli을 분리하고 분리된 E. coli의 병원성유전자 및 항생제내성을 조사하기 위하여 수행되였다. 파리는 과일농장(n = 19), 장류생산농장(n = 9), 생활쓰레기 야적장(n = 46), 축사(n = 66), 도축장(n = 38), 퇴비장(n = 10)에서 총 188마리를 채집하여 토사물과 배설물로부터 E. coli을 분리 및 동정하였다. 그 결과, 채집된 파리의 63%(119/188)에서 E. coli이 검출되었으며 특히 도축장에서 채집된 파리에서 E. coli의 검출률이 89%(34/38)로 가장 높았다. 또한 분리된 E. coli을 대상으로 병원성 유전자 8종(ST, LT, VT1, VT2, aggR, bfpA, eaeA, ipaH)을 조사한 결과, 도축장에서 채집된 파리에서 분리된 E. coli 중 91%(31/34)가 장독소를 생산할 수 있는 ST유전자를 보유하고 있었다. 분리된 E. coli의 16%(31/188)가 1종 이상의 항생제에 내성을 보였다. 특히, 항생제 사용빈도가 높은 축사에서 채집된 파리의 E. coli 경우에는 59%(23/39)가 항생제 내성을 나타내었다. 분리된 항생제 내성 E. coli 균주 중 10%(12/119)는 2종 이상의 항생제에 내성을 보였고, 모두 축사 채집 파리에서 분리된 균주였으며, 이 중 2개 균주는 다재내성의 지표인 ESBL (Extended-spectrum beta-lactamase)에 양성을 나타내었다. ESBL 양성균주 중 1 균주는 7종의 항생제에 내성을 보였이는 것으로 조사되었다. 본 연구의 결과, 축산환경 서식 파리에서 분리된 E. coli은 병원성 유전자를 보유하고 있을 가능성이 높을 뿐만 아니라 항생제에 내성을 나타낼 가능성도 높기 때문에 농식품을 생산하는 농장이나 식품공장은 가급적 축산환경으로부터 일정한 거리를 두거나 방충망 등의 차단조치가 필요할 것으로 판단된다.