• 제목/요약/키워드: Expression vector

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CCA 투영기법을 사용한 모션 데이터의 대화식 얼굴 표정 애니메이션 (Interactive Facial Expression Animation of Motion Data using CCA)

  • 김성호
    • 인터넷정보학회논문지
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    • 제6권1호
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    • pp.85-93
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    • 2005
  • 본 논문은 다량의 고차원 얼굴 표정 모션 데이터를 2차원 공간에 분포시키고, 애니메이터가 이 공간을 항해하면서 원하는 표정들을 실시간 적으로 선택함으로써 얼굴 표정 애니메이션을 생성하는 방법을 기술한다. 본 논문에서는 약 2400여개의 얼굴 표정 프레임을 이용하여 표정공간을 구성하였다. 표정공간의 생성은 임의의 두 표정간의 최단거리의 결정으로 귀결된다. 표정공간은 다양체 공간으로서 이 공간내의 두 점간의 거리는 다음과 같이 근사적으로 표현한다. 임의의 마커간의 거리를 표시하는 거리행렬을 사용하여 각 표정의 상태를 표현하는 표정상태벡터를 정의한 후, 두 표정이 인접해 있으면, 이를 두 표정 간 최단거리(다양체 거리)에 대한 근사치로 간주한다. 그리하여 인접 표정들 간의 인접거리가 결정되면, 이들 인접거리들을 연결하여 임의의 두 표정 상태간의 최단거리를 구하는데, 이를 위해 Floyd 알고리즘을 이용한다. 다차원 공간인 표정공간을 가시화하기 위해서는 CCA 투영기법을 이용하여 2차원 평면에 투영시켰다 얼굴 애니메이션은 사용자 인터베이스를 사용하여 애니메이터들이 2차원 공간을 항해하면서 실시간으로 생성한다.

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Inhibitory Effects of Syk Transfection on Lung Cancer Cell Invasion

  • Peng, Chuan-Liang;Zhang, Ying;Sun, Qi-Feng;Zhao, Yun-Peng;Hao, Ying-Tao;Zhao, Xiao-Gang;Cong, Bo
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제14권5호
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    • pp.3001-3003
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    • 2013
  • Objective: Spleen tyrosine kinase (Syk) is closely related to tumor invasion and metastasis, and has been shown to have potential inhibitory effects in tumors. In this study, we constructed a eukaryotic expression vector for Syk and analyzed its effects on invasive ability of the A549 non-small cell lung cancer cell line in vitro. Methods: A fragment of Syk was obtained by RT-PCR from human lung cancer cells and cloned into the expression vector pLNCXSyk. After restriction endonuclease digestion, PCR and DNA sequencing confirmation, the recombinant Syk expression plasmid was transfected into A549 human lung cancer cells using lipofectamine protocols. After selection, the cells stably expressed Syk. Detection of Syk expression of the cells by RT-PCR, and invasive ability were examined. Results: The eukaryotic expression plamid pLNCXSyk was constructed and expressed stably in the A549 human lung cancer cells. The RT-PCR results showed that Syk mRNA expression was upregulated significantly (P<0.05). Lower invasion through a basal membrane were apparent after transfection (P<0.05). Conclusions: A eukaryotic expression plasmid to cause Syk expression in lung cancer cells can obviously inhibit their invasive ability in vitro.

분열형 효모인 Schizosaccharomyces pombe 로부터 rqh1 돌연변이의 DNA damaging agent sensitivity를 보상하는 유전자의 특성 연구 (Isolation and Characterization of DNA Damaging Agent Sensitivity of rqh1 mutant from Schizosaccharomyce pombe)

  • 이인혜;최인순
    • 생명과학회지
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    • 제17권1호
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    • pp.39-44
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    • 2007
  • 분열형 효모에서 Rqh1은 Top3과 함께 vegetative growth에 필수적이다. $rqh^-$ 돌연변이는 DNA damaging agent에 민감성을 보이는데 이때, 부적절한 유전자 발현, 세포 신장, 염색체의 불안전성, 비정상적인 다중격막, 발아의 결핍을 포함한 넓은 범위의 표현형을 보인다. rqh1-overexpression cell 역시 rqh1 deletion mutant에서 보이는 DNA damaging agent 민감성을 관찰할 수 있다. 논문은 nmtl promoter를 가지는 PREP vector에 Rqhl이 과발현 할 때 나타나는 DNA damaging agent 민감성를 보상하는 유전자를 찾아 $rqh1^+$의 기능을 알아보는 것이다. 여기서 보상능이 보이는 rqh156, rqh172 두 개의 돌연변이를 골라냈다. rqhl deletion mutant의 DNA damaging agent 민감성은 rqh156, rqh172의 발현에 의해 보상 되어지는 것을 확인하였다.

메타게놈에서 발굴한 프로모터를 장착한 새로운 항시발현 벡터의 가치평가 (Evaluation of Novel Constitutive Expression Vectors Equipped with Mined Promoters from Metagenome)

  • 한상수;김근중
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제36권4호
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    • pp.260-267
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    • 2008
  • 단백질의 산업적 생산을 위해 발현벡터의 선정이 중요하지만 이용 가능한 프로모터가 극히 제한적이며 많은 경우 과발현되는 특성과 함께 불용성 응집체가 형성되는 단점을 지닌다. 따라서 다양한 생물로부터 유래된 잠재성이 큰 유전자원(metagenome)에서의 프로모터 발굴과 한정된 숙주를 해결하려는 노력이 요구된다. 선행연구에서 발굴한 metagenome 유래의 항시발현 프로모터를 이용해 대장균의 일반적인 배양조건에서 세포생리에 영향이 적은 신규 항시발현 벡터를 제작하였다. 이를 위해 예측된 프로모터 서열과 MCS를 포함하는 합성 primer를 제작한 후 PCR로 증폭해 발현벡터를 구성한 후, 프로모터 구동여부와 단백질 발현양상 등을 관찰하였다. 인위적으로 도입된 MCS에 GFP, esterase, $\beta$-glucosidase를 클로닝해 단백질 발현양과 가용성을 분석한 결과, 안정적으로 전체단백질의 $2{\sim}3%$ 정도로 발현되며 80% 이상의 높은 가용성을 지닌 단백질의 발현이 유도되는 것으로 확인되었다. 이와 같은 결과는 잠재적인 생물자원의 보고로서 metagenome의 활용가능성을 제시하고 있다. 따라서 다양한 숙주에서 작동하는 프로모터의 발굴 및 발현벡터의 제작을 시도할 경우 단백질의 생산이나 대사공학에 의한 균주개량에 유용하게 활용할 수 있을 것이다.

구조화된 벡터 그래픽 표현을 위한 SVG 편집시스템의 프로토타입 설계 (Design of prototype that SVG editing system)

  • 김철순;김창수;정회경
    • 한국정보통신학회:학술대회논문집
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    • 한국해양정보통신학회 2003년도 춘계종합학술대회
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    • pp.281-284
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    • 2003
  • 인터넷의 급속한 발전은 표현의 고급화와 보편성을 제공하는 웹을 주축으로 하여 이루어져 왔으나, 웹 상에서 표현중심의 그래픽처리에는 비구조적인 방법에 따른 많은 문제점을 가지고 있다. 이러한 문제점을 보완하고자 W3C에서는 웹 상에서 벡터그래픽 표현의 효율적인 표현 및 저장, 공유를 가능하게 하기 위해 XML 어플리케이션인 SVG를 제정하였다. 이에 본 논문에서는 SVG 문서를 이용하여 그래픽 편집기 형태로 SVG의 구조적 편집 및 화면에 표현되는 그래픽 객체를 직접 편집할 수 있는 인터페이스를 통해 벡터그래픽을 편집하고 표현하기 위한 SVG 편집시스템을 설계하였다. 본 시스템은 지리정보시스템이나 서비스 환경 등에서 XML기반의 그래픽을 표현하는 효율적인 처리 등에 유용하게 사용할 수 있을 것이다.

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lacZ- and aph-Based Reporter Vectors for In Vivo Expression Technology

  • Baek, Chang-Ho;Kim, Kun-Soo
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제13권6호
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    • pp.872-880
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    • 2003
  • Three vectors, pSG1, 2, and 3, which facilitate in vivo expression technology (IVET) in Gram-negative bacteria, were developed. Vectors pSG1and 2 are derivatives of ColE1, and pSG3 is a derivative of an R6K replicon. These vectors contain oriT sites that allow mobilization when the RK2 Tra functions are provided in trans. These vectors contain promoterless lacZ (pl-lacZ) and promoterless aph (pl-aph) transcriptionally fused together, which allow qualitative and quantitative measurements of the expression of genes in the genome of bacterial cells. pSG1 and 3 contain gentamicin-resistance genes, and pSG2 carries a streptomycin-/spectinomycin-resistance gene, allowing for selection of recombinants generated by a single crossover between a library fragment cloned into a pSG vector and the identical region in the genome of a bacterial species from which the library fragment originated. These vectors were successfully applied to the generation of random fusions at high rates in the genomes of four representative Gram-negative bacteria. In addition, the expression level of ${\beta}-galactosidase$ and the degree of resistance to kanamycin in cells with fusions generated by these vectors were found to be linearly correlated, proving that these vectors can be used for IVET.

Nuclear localization of Obox4 is dependent on its homeobox domain

  • Park, Geon Tae;Lee, Kyung-Ah
    • Clinical and Experimental Reproductive Medicine
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    • 제40권1호
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    • pp.1-6
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    • 2013
  • Objective: Oocyte-specific homeobox 4 (Obox4) is preferentially expressed in oocytes and plays an important role in the completion of meiosis of oocytes. However, the Obox4 expression pattern has not been reported yet. In this study, we investigated the subcellular localization of Obox4 using a green fluorescent protein (GFP) fusion expression system. Methods: Three regions of Obox4 were divided and fused to the GFP expression vector. The partly deleted homeodomain (HD) regions of Obox4 were also fused to the GFP expression vector. The recombinant vectors were transfected into HEK-293T cells plated onto coated glass coverslips. The transfected cells were stained with 4',6-diamidino-2-phenylindol and photographed using a fluorescence microscope. Results: Mutants containing the HD region as well as full-length Obox4 were clearly localized to the nucleus. In contrast, the other mutants of either the N-terminal or C-terminal region without HD had impaired nuclear localization. We also found that the N-terminal and C-terminal of the Obox HD contributed to nuclear localization and the entire HD was necessary for nuclear localization of Obox4. Conclusion: Based on the results of the present study, we demonstrated that the intact HD region of Obox4 is responsible for the nuclear localization of Obox4 protein in cells.

Cloning and Prokaryotic Expression of the Mature Fragment of the Chinese Yellow Bovine Myostatin Gene

  • Lu, Wenfa;Zhao, Jing;Wei, Guojian;Shan, Wuesong
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제20권6호
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    • pp.827-831
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    • 2007
  • Myostatin is a member of the transforming growth factor-${\beta}$(TGF-${\beta}$ super-family. It acts as a negative regulator for skeletal muscle growth. Myostatin mutations are characterized by a visible, generalized increase in muscle mass in double muscled cattle breeds. To understand the biochemistry and physiology of the Chinese Yellow bovine myostatin gene, we report here for the first time expression of the gene in Escherichia coli (E. coli). Primers of the myostatin gene of Chinese Yellow Cattle were designed on the basis of the reported bovine myostatin mRNA sequence (Gen-Bank Accession No. NM005259) and optimized for E. coli codon usage. XhoI and EcoRI restriction enzyme sites were incorporated in the primers, and then cloning vector and expression vector were constructed in a different host bacterium. The expressed protein had a molecule mass of about 16 kDa as determined by SDS-PAGE under reducing conditions. The expressed protein reacted specifically with myostatin monoclonal antibody on immunoblots. Our studies should lead to the investigation of the differences in myostatin genes of various cattle and could benefit human health and food animal agriculture.

Cloning and Prokaryotic Expression of C-type Lysozyme Gene from Agrius convolvuli

  • Kim, Jong-Wan;Yoe, Sung-Moon
    • Animal cells and systems
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    • 제12권3호
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    • pp.149-155
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    • 2008
  • We have isolated and characterized Agrius convolvuli cDNA encoding a c-type lysozyme. The cDNA sequence encodes a processed protein of 139 amino acid residues with 19 amino acid residues amino-terminal signal sequence and 120 amino acid residues mature sequence. The amino acid residues responsible for the catalytic activity and the binding of the substrate are conserved. Agrius lysozyme has a high identity to Manduca sexta. Recombinant A. convolvuli lysozyme was expressed in Escherichia coli BL21(DE3) pLysS cells for pGEX 4T-1 expression vector. Their optimal conditions for the fusion protein expression and purification were screened. Lysozyme gene amplified with primers ACLyz BamHI and ACLyz XhoI was ligated into the pGEX 4T-1 vector, which contained the glutathione S-transferase(GST) gene for fusion partner. The fusion protein was induced by IPTG and identified by SDS-PAGE analysis. Molecular weight of the fusion protein was estimated to be about 45 kDa. Recombinant lysozyme, fused to GST, was purified by glutathion-Sepharose 4B affinity chromatography. Western blot analysis of this protein revealed an immunoreactivity with the anti-Agrius lysozyme.