• 제목/요약/키워드: ErmE

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ErmSF에서 특이적으로 발견되는 N-terminal end region에 존재하는 1-25번째 아미노산을 함유하는 peptide segment의 효소 활성에서의 역할 (Functional Role of Peptide Segment Containing 1-25 Amino Acids in N-terminal End Region of ErmSF)

  • 진형종
    • 미생물학회지
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    • 제42권3호
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    • pp.165-171
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    • 2006
  • ERM protein 은 23S rRNA의 $A_{2058}$에 dimethylation시킴으로써 $MLS_B$계 항생제의 부착을 저해하여 항생제의 활성을 억제하는 내생인자 단백질이다. ERM 단백질의 하나인 ErmSF의 N-말단부위(N-termimal end region, NTER)에 존재하는 1-25번째 아미노산을 함유하는 펩타이드의 활성에서의 역할을 알아보기 위해 이률 제거한 변이 단백질을 표현하는 유전자를 클로닝하고 대장균에서 수용성 단백질로 12.65 mg/L culture의 수율로 대량생산하였다. 이렇게 대량생산된 단백질의 활성을 in vivo와 in vitro에서 확인하였다. 그 결과 in vitro에서 야생형(wild type)의 단백질에 비해 15%의 활성이 감소한 것을 확인하였고 이는 제거된 펩타이드가 기질과 상호작용하여 효소의 활성에 영향을 미친다는 것을 시사하고 있다. 이렇게 감소된 효소의 활성은 생체 내(in vivo) 활성에도 적용되어 처음에는 변이 단백질을 함유하는 세포가 항생제의 작용에 의하여 성장억제를 받지만 시간의 경과와 함께 내성을 회복하여 밤샘 배양하였을 경우는 야생형 단백질을 함유한 세포와 동일한 내성 즉 항생제에 의한 성장억제지역(inhibition zone)을 전혀 나타내지 않는 것으로 밝혀졌다.

Staphylococcus aureus DH1에서 분리된 Macrolide-Lincosamide-Streptogramin B 계열 항생물질에 대한 저항성 인자의 특성과 염기서열 (Nucleotide Sequence and Properties of Macrolide-Lincosamide-Streptogramin B Resistance Gene from Staphylococcus aureus DH1)

  • 권동현;박승문;윤권상;변우현
    • 미생물학회지
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    • 제28권1호
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    • pp.27-34
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    • 1990
  • 지속성 및 유발성 발한의 두 macrolide-lincosamide-streptogramin B 저항성 인자가 한 Staphylococcus aureus DHI 균주의 염색체 DNA 및 plasmid pDE1(7.4kb)로부터 각각 분리되었다. pDE1상의 유발성 Em 저항성 인자의 염기서열은 이미 보고 된 바 있는 pE194상의 ermC와 동일하였으며 지속성 Em 저항성 인자의 경우는 그 제한효소 인식부위의 mapping 결과로 보아 ermCdb전자에서 유발성 기구에 관여하는 leader peptide 부위가 결여된 인자인 것으로 밝혀졌다.

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Detection of Antibiotic Resistance and Resistance Genes in Enterococci Isolated from Sucuk, a Traditional Turkish Dry-Fermented Sausage

  • Demirgul, Furkan;Tuncer, Yasin
    • 한국축산식품학회지
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    • 제37권5호
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    • pp.670-681
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    • 2017
  • The aim of this study was to isolate enterococci in Sucuk, a traditional Turkish dry-fermented sausage and to analyze isolates for their biodiversity, antibiotic resistance patterns and the presence of some antibiotic resistance genes. A total of 60 enterococci strains were isolated from 20 sucuk samples manufactured without using a starter culture and they were identified as E. faecium (73.3%), E. faecalis (11.7%), E. hirae (8.3%), E. durans (3.3%), E. mundtii (1.7%) and E. thailandicus (1.7%). Most of the strains were found resistant to rifampin (51.67%) followed by ciprofloxacin (38.33%), nitrofurantoin (33.33%) and erythromycin (21.67%). All strains were found susceptible to ampicillin. Only E. faecium FYE4 and FYE60 strains displayed susceptibility to all antibiotics. Other strains showed different resistance patterns to antibiotics. E. faecalis was found more resistant to antibiotics than other species. Most of the strains (61.7%) displayed resistance from between two and eight antibiotics. The ermB, ermC, gyrA, tetM, tetL and vanA genes were detected in some strains. A lack of correlation between genotypic and phenotypic analysis for some strains was detected. The results of this study indicated that Sucuk manufactured without using a starter culture is a reservoir of multiple antibiotic resistant enterococci. Consequently, Sucuk is a potential reservoir for the transmission of antibiotic resistance genes from animals to humans.

Fillers in the Hong Kong Corpus of Spoken English (HKCSE)

  • Seto, Andy
    • 아시아태평양코퍼스연구
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    • 제2권1호
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    • pp.13-22
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    • 2021
  • The present study employed an analytical framework that is characterised by a synthesis of quantitative and qualitative analyses with a specially designed computer software SpeechActConc to examine speech acts in business communication. The naturally occurring data from the audio recordings and the prosodic transcriptions of the business sub-corpora of the HKCSE (prosodic) are manually annotated with a speech act taxonomy for finding out the frequency of fillers, the co-occurring patterns of fillers with other speech acts, and the linguistic realisations of fillers. The discoursal function of fillers to sustain the discourse or to hold the floor has diverse linguistic realisations, ranging from a sound (e.g. 'uhuh') and a word (e.g. 'well') to sounds (e.g. 'um er') and words, namely phrase ('sort of') and clause (e.g. 'you know'). Some are even combinations of sound(s) and word(s) (e.g. 'and um', 'yes er um', 'sort of erm'). Among the top five frequent linguistic realisations of fillers, 'er' and 'um' are the most common ones found in all the six genres with relatively higher percentages of occurrence. The remaining more frequent realisations consist of clause ('you know'), word ('yeah') and sound ('erm'). These common forms are syntactically simpler than the less frequent realisations found in the genres. The co-occurring patterns of fillers and other speech acts are diverse. The more common co-occurring speech acts with fillers include informing and answering. The findings show that fillers are not only frequently used by speakers in spontaneous conversation but also mostly represented in sounds or non-linguistic realisations.

전자자원관리시스템의 이용자 태그 기반의 전자저널 검색 모형 설계 및 평가에 관한 연구 (Design and Evaluation of a User Tag-based Retrieval Model for Electronic Journals within Electronic Resource Management Systems)

  • 강정원;김현희
    • 한국문헌정보학회지
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    • 제43권4호
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    • pp.241-264
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    • 2009
  • 본 연구는 전자저널의 효율적인 검색과 이용을 위한 방안을 모색하기 위해 문헌조사와 96명을 대상으로 한 설문조사 및 두 개의 전자자원관리시스템(Verde와 Millennium)에 대한 사례조사를 수행하고, 이를 바탕으로 하여 전자저널 검색 모형을 설계한 후 평가하였다. 이 모형의 핵심은 택소노미 기반의 전자자원관리시스템에 폭소노미 태그 기능을 결합하여 시스템 중심의 서비스와 이용자 중심의 서비스를 상호 보완하였다는 점이다. 또한 이용자가 직접 부여하는 태그 이외에 시스템내의 로그파일을 이용하여 자동으로 태그를 생성하여 전자저널 검색의 접근점을 확장시키고, 태그의 비통제 어휘 문제를 극복하기 위해서 관리자가 시스템을 통해서 태그를 통제할 수 있는 기능도 포함시켰다.

봉독이 위암 세포주에 미치는 효과 (Effects of the Bee Venom on Human Gastric Adenocarcinoma Cell Lines)

  • 허경;김명호;임성우
    • 동의생리병리학회지
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    • 제27권1호
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    • pp.92-98
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    • 2013
  • Bee Venom(below BV) has been used in alternative medicine to treat the diseases, such as pain diseases. BV contains a variety of peptides, including melittin, apamin, adolapin, MCD peptide, enzymes(i.e. PLA2), amines(i.e. histamine and epinephrine), and nonpeptide components. The two main components of BV are melittin and PLA2. The cell cytotoxic effects through the activation of PLA2 by melittin have been suggested to be the critical mechanism for the depress of cancer cell. Melittin and PLA2 have been reported to induce apoptosis and to possess anti-cancer effects and neurite outgrowth in PC12 cells. Analysis of proliferation was confirmed by MTT assay. BV decreased cell number through dose- and duration-dependent manner and these effects are apparent at a concentration of 3 ${\mu}g/ml$. To observe which signaling molecules will be activated by BV, phosphorylation of ERK, p38 MAPK, JNK and ERM were examined by Western blot analysis. To study the long term effect of BV in human gastric adenocarcinoma cell lines, the image of cells treated with BV for 4 days were obtained. BV was shown to exhibit anti-cancer activity in human gastric adenocarcinoma cell lines at a broad range of concentrations of 3 ${\mu}g/ml$. ERK, p38 MAPK and JNK were found to increase in BV treated cells. However, ERM which known to be involved in the cell death, was gradually decreased to 30minutes after addition 3 ${\mu}g/ml$ of BV. These results provide a possible BV-induced inhibitory signal for cancer proliferation that is initiated by the decrease in ERM activity. Moreover, it is likely that the activation of ERK, p38 MAPK and JNK are required for the BV-induced inhibition of cancer proliferation.

Improvement of Natamycin Production by Cholesterol Oxidase Overexpression in Streptomyces gilvosporeus

  • Wang, Miao;Wang, Shaohua;Zong, Gongli;Hou, Zhongwen;Liu, Fei;Liao, D. Joshua;Zhu, Xiqiang
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제26권2호
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    • pp.241-247
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    • 2016
  • Natamycin is a widely used antifungal antibiotic. For natamycin biosynthesis, the gene pimE encodes cholesterol oxidase, which acts as a signalling protein. To confirm the positive effect of the gene pimE on natamycin biosynthesis, an additional copy of the gene pimE was inserted into the genome of Streptomyces gilvosporeus 712 under the control of the ermE* promoter (permE*) using intergeneric conjugation. Overexpression of the target protein engendered 72% and 81% increases in the natamycin production and cell productivity, respectively, compared with the control strain. Further improvement in the antibiotic production was achieved in a 1 L fermenter to 7.0 g/l, which was a 153% improvement after 120 h cultivation. Exconjugants highly expressing pimE and pimM were constructed to investigate the effects of both genes on the increase of natamycin production. However, the co-effect of pimE and pimM did not enhance the antibiotic production obviously, compared with the exconjugants highly expressing pimE only. These results suggest not only a new application of cholesterol oxidase but also a useful strategy to genetically engineer natamycin production.

DNA Microarray 시스템을 이용한 방선균 독소루비신 생합성 유전자군의 발현패턴 분석 (Expression Profiles of Streptomyces Doxorubicin Biosynthetic Gene Cluster Using DNA Microarray System)

  • 강승훈;김명근;박현주;김응수
    • KSBB Journal
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    • 제20권3호
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    • pp.220-227
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    • 2005
  • 독소루비신 생합성 유전자의 발현을 촉진시키는 유전자인 dnrI와 다나루비신으로부터 독소루비신으로의 생전환에 관여하는 유전자인 doxA를 ermE 프로모터가 포함된 pSE34에 도입하였을 때 각각 5.5배, 2.5배의 독소루비신 생산성 증가가 이루어졌다. 독소루비신 생합성 유전자군의 발현패턴 분석을 위한 DNA microarray system을 구축하였고, 고생산 균주의 독소루비신 생합성 유전자 발현 패턴을 DNA microarray를 통해 확인하였다. 독소루비신 생합성 유전자군의 세포성장에 따른 발현패턴을 분석한 결과, 독소루비신 생산성 증가에 따라 생합성 유전자의 발현도 증가함을 확인할 수 있었고, pSE34를 통해 도입해준 donA, dnrI 유전자의 경우 전체 생합성 유전자의 평균보다 높은 수준의 발현량을 보여줌으로써, ermE 프로모터에 의해 발현이 극대화되었음을 확인할 수 있었다. 독소루비신 내성 유전자의 경우 다른 독소루비신 생합성 유전자들에 비해 발현정도가 크게 증가했고, DnrI 의해 조절을 받는 다른 유전자들의 발현 수준과 비교하였을 때 TDP-daunosamine을 생합성의 첫 번째 단계에 관여하는 dnmL 유전자는 그 발현양의 증가가 크지 않았다. 따라서 DNA microarray 시스템 분석 결과, 독소루비신 생산성 극대화를 위해서는 dnrI, doxA, drrA, drrB, drrC, dnmL 등의 유전자들의 안정적 발현이 매우 중요하고도 핵심적인 인자임이 확인되었다.

디지털도서관 정보관리자를 위한 전자정보자원관리시스템 구축 연구 (A Study on Implementation of the Integrated Electronic Resource Management System for Digital Librarian)

  • 한종엽;조현양;기명종
    • 한국문헌정보학회지
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    • 제40권3호
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    • pp.263-287
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    • 2006
  • 정보매체와 정보환경의 변화에 따라 전통적인 도서관은 디지털도서관으로 진화발전하고 있다. 따라서 디지털 환경에서 급증하는 다양한 전자정보자원을 효율적으로 관리하기 위한 종합적인 시스템이 필요하다. 본 연구에서의 전자정보자원으로는 전자저널, 웹 데이터베이스. 전자책, 오픈엑세스 자원 등을 대상으로 하였다. DLF의 ERMI를 분석하여 국내 디지털도서관 정보관리자를 위한 ERMS를 구축하는 것이 연구목적이다. 이를 위해 본 연구에서는 전자정보자원의 다양한 생성주기, 구독모델, 수록범위, 정보제공자를 조사하여 ERMS를 설계하고 구현하였다.

원유시료에서 분리한 장구균의 에리스로마이신 내성 유전자형 및 표현형 분석 (Analysis of Genotype and Phenotype of Erythromycin Resistance in Enterococci spp. Isolated from Raw Milk Samples)

  • 이혜인;정재혁;이상진;최성숙
    • 미생물학회지
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    • 제46권2호
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    • pp.148-151
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    • 2010
  • 동물성 식품 유래 장구균의 에리스로마이신 내성 유전자형 및 표현형을 분석하고자 하였다. 경기북부지역의 축산 농가 15곳으로부터 원유 시료 378개를 분양받아 본실험에 사용하였으며 에리스로마이신 내성 장구균 분리에 사용하였다. 총 110균주의 장구균이 분리 되었으며 이중 E. faecalis가 101균주, E. avium이 7균주, E durans가 2균주였다. 에리스로마이신에 대한 내성 비율은 65.45%였으며 $MIC_{50}$은 16 ${\mu}g$/ml, $MIC_{90}$은 64 ${\mu}g$/ml이었다. 분리된 장구균 110균주 모두 erm(B) 유전자를 소유하고 있었으며 75.45%인 83균주가 mef(A)를 소유하고 있음을 확인하였다. 표현형 분석에 따르면 지속성 내성($cMLS_B$)을 나타내는 균주는 95균주(86.36%)였으며 유도내성 ($iMLS_B$)을 보이는 균주는 15균주(13.34%)였다.