• 제목/요약/키워드: Epidemiological Investigation

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Ciprofloxacin 내성 대장균에서 Sequence Type과 Fluoroquinolone 내성의 분석 (Analysis of Sequence Type and Fluoroquinolone Resistance in Ciprofloxacin-Resistant Escherichia coli)

  • 조혜현
    • 대한임상검사과학회지
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    • 제53권3호
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    • pp.217-224
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    • 2021
  • 전 세계적으로 fluoroquinolone (FQ) 내성 그람음성균이 출현하고 있는 가운데, 최근 우리나라에서 FQ 내성 E. coli의 증가 추세는 심각한 우려를 낳고 있다. 이에 본 연구에서는 2018년 6월부터 12월까지 대전지역의 3차 병원에서 분리된 ciprofloxacin 내성 E. coli 56균주를 대상으로, 역학관계와 FQ 내성 결정인자의 양상을 조사하였다. 역학관계를 확인하기 위해 multilocus sequence typing (MLST)을 실시하였다. PCR과 염기서열 분석은 gyrA, gyrB, parC, parE 유전자의 QRDR에서 염색체상의 돌연변이와 aac(6)-Ib-cr, qepA, qnrA, qnrB, qnrC, qnrD 및 qnrS와 같은 PMQR 유전자의 빈도를 확인하였다. MLST 분석 결과, 12개의 ST를 확인하였으며, 이 중 가장 우세한 ST는 ST131 (31/56, 55.4%)이었고, 순차적으로 ST1193 (13/56, 23.2%), ST405 (3/56, 5.4%)의 결과를 보였다. ciprofloxacin 내성 E. coli 56균주 중 gyrA 유전자에서 83번째 아미노산인 serine (S)이 leucine (L)으로, 87번째 아미노산인 aspartic acid (D)가 asparagine (N)으로 치환되고, parC 유전자에서 80번째 아미노산인 serine (S)이 isoleucine (I)으로, 84번째 아미노산인 glutamic acid (E)가 valine (V)으로 치환된 결과(29/56, 51.8%)가 가장 빈번하게 확인되었고, aac(6)-Ib-cr (19/56, 33.9%)은 가장 흔한 PMQR 유전자로 확인되었다. 이러한 FQ 내성 결정인자의 결과는 다른 클론과 비교하여 ST131에서 더 빈번하게 확인되었다. ciprofloxacin 내성 E. coli 균주에 대한 역학적 특성의 지속적인 모니터링과 FQ 내성 결정인자에 대한 추가 연구가 필요할 것으로 사료된다.

Epidemiological investigation of porcine pseudorabies virus and its coinfection rate in Shandong Province in China from 2015 to 2018

  • Ma, Zicheng;Han, Zifeng;Liu, Zhaohu;Meng, Fanliang;Wang, Hongyu;Cao, Longlong;Li, Yan;Jiao, Qiulin;Liu, Sidang;Liu, Mengda
    • Journal of Veterinary Science
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    • 제21권3호
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    • pp.36.1-36.9
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    • 2020
  • Background: Pseudorabies, also known as Aujeszky's disease, is caused by the pseudorabies virus (PRV) and has been recognized as a critical disease affecting the pig industry and a wide range of animals around the world, resulting in great economic losses each year. Shandong province, one of the most vital food animal-breeding regions in China, has a very dense pig population, within which pseudorabies infections were detected in recent years. The data, however, on PRV epidemiology and coinfection rates of PRV with other major swine diseases is sparse. Objectives: This study aimed to investigate the PRV epidemiology in Shandong and analyze the current control measures. Methods: In this study, a total number of 16,457 serum samples and 1,638 tissue samples, which were collected from 362 intensive pig farms (≥ 300 sows/farm) covered all cities in Shandong, were tested by performing enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA) and polymerase chain reaction (PCR). Results: Overall, 52.7% and 91.5% of the serum samples were positive for PRV-gE and -gB, respectively, based on ELISA results. In addition, 15.7% of the tissue samples were PCR positive for PRV. The coinfection rates of PRV with porcine circovirus type 2 (PCV2), porcine reproductive and respiratory syndrome virus, and classical swine fever virus were measured; coinfection with PCV2 was 35.0%, higher than those of the other two viruses. Macroscopic and microscopic lesions were observed in various tissues during histopathological examination. Conclusions: The results demonstrate the PRV prevalence and its coinfection rates in Shandong province and indicate that pseudorabies is endemic in pig farms in this region. This study provides epidemiological data that can be useful in the prevention and control of pseudorabies in Shandong, China.

노로바이러스에 기인한 수인성·식품매개감염병 집단발생의 지연신고에 대한 역학조사 (Epidemiological investigation on the outbreak of foodborne and waterborne disease due to Norovirus with delayed notification)

  • 하미경;김형수;김용호;나민선;유미정
    • 농촌의학ㆍ지역보건
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    • 제43권4호
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    • pp.258-269
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    • 2018
  • 2018년 6월 12일 충청북도 옥천군 소재 A고등학교에서 노로바이러스의 유행을 지연신고하는 사례가 발생하였고, 이에 대한 원인과 전파양식 등을 규명하고 예방 및 관리대책을 마련 하기 위하여 역학조사를 수행하였다. A고등학교 학생 183명을 대상으로 설문조사, 환례자 60명, 조리종사자 10명을 대상으로 세균 10종 및 바이러스 5종에 대한 검체검사를 실시하였다. 설문조사는 최초환자 발생일 6월 5일을 기준으로 3일 전인 6월 2일부터 12일까지의 식단을 이용하여 환자-대조군 조사를 시행하였다. 학생, 교직원, 조리종사자 785명 중 환례는 61명으로 노로바이러스의 발병률은 7.8% 이었다. 위험요인 분석에서 정수기 음용수가 유의한 변수이었다. 검체검사에서 학생 2명, 정수기 음용수, 환경검체에서 동일 유형의Norovirus GI-8이 검출되었다. 이번 유행의 원인으로 본관, 기숙사, 급식실 정수기 음용수가 오염되고 그로 인해 원인병원체 노로바이러스의 전파가 이루어졌다고 판단하였다. 이번 연구는 6월 5일 첫 환례자가 발생했음에도 신고가 7일이 경과한 6월 12일 지연신고 되어 장관감염증 확산 조기차단이 이루어지지 않아 환례자가 더 많이 발생한 것으로 추정된다. 향후 학교급식 시 발생하는 수인성 및 식품매개성질병으로부터 학생을 보호하고 집단발생을 예방하기 위하여 학생의 증상을 가장 우선적으로 파악이 가능한 담임선생님과 보건교사의 공조체제 개선, 보건교사 부재 시 대응방안, 보건교사의 학교 감염병 집단발생에 대한 인식제고를 위한 시스템 보완이 이루어져야 할 것이다. 또한 질병관리본부의 기본 역학조사서 서식에 지연신고에 대한 사유를 기록하는 항목을 추가하여 지연신고에 대한 원인에 대한 규명과 그에 따른 대책을 마련해야 할 것이다.

경기도 식중독에서 분리된 Clostridium perfringens의 유전적 특성 분석 (Genetic diversity of Clostridium perfringens form food-poisoning outbreak in Gyeonggi-do, 2013-2014)

  • 박성희;최옥경;정진아;김운호;이예은;박광희;윤미혜
    • 미생물학회지
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    • 제52권3호
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    • pp.286-297
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    • 2016
  • 질병관리본부에서 2012년 이후 수인성식품매개질환 실험실 진단실무지침에 cpb2 유전자를 포함시킨 후, 2013-2014년 경기도의 C. perfringens에 의한 식중독이 원인불명을 제외하고 가장 많이 발생되었으며, 그 발생률이 2011-2012년에 비해 큰 폭으로 증가하였다. 따라서 경기도내 유행하는 toxinotype을 파악하고, PFGE, MLST를 통해 이들의 분자역학적 연관성을 연구함으로서 C. perfringens에 의한 식중독 발생 시 역학조사 기초자료로 활용하고자 하였다. 2013-2014년 경기도에서 분리된 120주의 C. perfringens 중 cpe 보유균주는 49주, cpb2 보유균주는 71주였다. 발생건별로 살펴보면, cpe 단독발생건은 2건(10주), cpb2 단독발생건은 7건(45주), cpe, cpb2 혼합발생건은 7건(65주)로 cpb2 단독발생과 cpe, cpb2 혼합발생이 대부분을 차지하였다. Toxinotype PCR 결과, 120주 모두 C. perfringens에 의한 식중독의 주요 타입인 A로 밝혀졌다. PFGE 분석 결과, 53.5-100%의 유사도와 75 유형으로 나뉘었다. 65% 이상을 기준으로 했을 때 5가지 그룹으로 나뉘어졌다. A, C, D, E 그룹은 1개의 균주를 제외하고 모두 cpb2 보유균주로 이루어졌고, B 그룹은 1개의 균주를 제외하고 모두 cpe 보유균주로 구성되었다. 2014년 안산상록구 식중독 4주와 2014년 수원 권선구 식중독 3주를 제외하고, 64 cpb2 보유균주들은 대부분 다양한 유전자패턴을 보였다. 41 cpe 보유균주 중 3개의 균주를 제외하고, 2013년 부천원미구, 성남분당구, 2014년 안산상록구, 평택, 김포, 화성 식중독 모두 각각 동일한 유전자 패턴을 보였다. 2013 수원영통구 식중독은 2가지 cpe 유전형 패턴을 보였다. MLST 분석 결과, 크게 P-cpe 및 cpb2 그룹과 C-cpe 그룹으로 나뉘어 졌고, 세세하게 11개의 cluster로 나뉘어졌다. 경기도에서 분리된 31개 균주 중, 16 cpb2 보유균주와 2014-06-03 cpe 보유균주는 1-7 cluster에 속해있었고, 14 cpe 보유균주는 모두 8-11 cluster에 속해있었다. 하나의 cpe 보유균주를 포함하여 cpb2 보유균주들은 P-cpe 그룹과 건강한 사람에서 분리된 cpb2 그룹들 사이에 산재되어 cluster되었고, cpe 보유균주는 C-cpe 그룹에 속해있었다. 2014-06-03주의 cpe gene은 plasmid에 존재하고, 나머지 cpe 보유균주의 cpe gene은 모두 chromosome에 존재함을 추정 할 수 있었다. PFGE 및 MLST 분석 결과, cpe 보유균주에 비해 cpb2 보유균주가 훨씬 다양하고 복잡한 유전자패턴을 나타내며, cpe 유전자 보유균주의 경우 단일 유전자형이거나 유사도가 높은 유전자형으로 이루어져 있음을 알 수 있었다. cpe 보유균주의 경우 집단식중독의 원인균 파악이 용이하였으나, cpb2 보유균주의 경우 2 발생건을 제외하고 역학적인 연관성이 낮음을 확인 할 수 있었다.

Seroepidemiological study of Toxoplasma gondii infection in the rural area Okcheon-gun, Korea

  • Lee, Young-Ha;Hoh, Hyung-Jun;Hwang, Ok-Sun;Lee, Sang-Keol;Shin, Dae-Whan
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제38권4호
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    • pp.251-256
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    • 2000
  • There have been some reports about the prevalence of anti-Toxoplasma gondii antibody among Koreans, and most of all data were taken from patients visiting hospitals. However, the epidemiological data of the community-based study in Korea are rare. This study was performed to evaluate the seroprevalence of toxoplasmosis among the inhabitants of the rural area Okcheon-gun, Korea. A total of 1,109 serum samples (499 males, 610 females) were examined for the IgG antibodies by ELISA. To set up the cut-off point for ELISA, we used a commercial latex agglutination (LA) kit. The sensitivity and specificity of ELISA against LA test were 89.5%, and 98.6% respectively. Among 1,109 sera, 6.9% showed seropositivity by ELISA. The positive rates of males and females were 6.0% and 7.2%, respectively. However, there were no significant differences between sexes. Comparing the age groups, the highest seropositive rate showed in the seventies or higher, and their rates had a tendency to increase with age (0.05 < p < 0.3). These results revealed that the seroprevalence of toxoplasmosis in rural inhabitants is similar to previous reports in Korea; however we need further investigation to clarify the prevalence of toxoplasmosis in the general population.

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Significant Correlation between Salivary and Serum Ca 15-3 in Healthy Women and Breast Cancer Patients

  • Laidi, Fatna;Bouziane, Amal;Lakhdar, Amina;Khabouze, Samira;Amrani, Mariam;Rhrab, Brahim;Zaoui, Fatima
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제15권11호
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    • pp.4659-4662
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    • 2014
  • The tumor marker CA 15-3 is one of the most import reliable for metastatic breast cancer monitoring. While it is generally assessed in serum of patients, blood sampling is an invasive method compared to saliva sampling which is simple and could be an alternative to blood according to many studies. The aim of this investigation was to assess the relationship between serum and salivary concentrations of the protein CA 15-3 in patients with breast cancer and healthy asymptomatic volunteers. A case-control study was conducted with 60 women: 29 breast cancer patients from the Maternity Hospital Souissi Rabat (Morocco) and 31 healthy asymptomatic women. The CA 15-3 concentrations in saliva and serum samples were assessed using an enzyme immune assay (EIA kits) and comparison between cases and controls was made by the Mann-Whitney test. The correlation between serum and saliva CA 15-3 concentration was tested using Pearson correlation. The comparison result of CA15-3 concentration in saliva and serum level in cases and controls was not statistically significant (p>0.05). However, the correlation between salivary and serum CA 15-3 concentration was positive and statistically significant (r=0.27, p=0.03). In conclusion, the positive correlation between salivary and serum expression found in our study suggests that saliva could be an alternative to blood sampling to help breast cancer monitoring.

서울에 거주하는 직장인의 측두하악장애에 대한 역학적 연구 (An Epidemiology Study on Temporo-mandibular Disorders of Employees Residing at Seoul)

  • 이희경
    • Journal of Yeungnam Medical Science
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    • 제13권2호
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    • pp.308-323
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    • 1996
  • 저자는 설문지 방식에 의해 1995년 8월1일부터 1995년 11월 30일까지 서울에 직장을 갖고 있는 직장인 282명을 대상으로 그들이 작성한 설문지를 분석하여 측두하악장애의 분포 및 관련요인과의 상관관계에 대해 다음과 같은 결론을 얻었다. 1. 측두하악장애의 증상을 가진 사람이 남자 41.88%, 여자 46.15%로 전체의 43.26%였다. 2. 일반관절 및 근육통의 증상이 심할수록, 두통 및 진통제 복용빈도가 높을수록, 측두하악장애증상의 빈도가 높았으며 이들 사이에 매우 유의한 상관이 있었다(p<0.001). 3. 이갈이, 이악물기, 구강악습관의 빈도가 높을수록 측두하악장애 증상의 빈도가 높았으며 Stress에 예민하게 반응할수록 이갈이나 이악물기, 깨무는 습관 등 이상기능 빈도가 높게 나타났다. 4. 편측저작이 양측저작에 비해 측두하악장애지수가 높게 나타났으며 통증부위와 측두하악장애 지수와의 연관성은 나타나지 않았다.

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High Resolution Whole Genome Multilocus Sequence Typing (wgMLST) Schemes for Salmonella enterica Weltevreden Epidemiologic Investigations

  • Tadee, Pakpoom;Tadee, Phacharaporn;Hitchings, Matthew D.;Pascoe, Ben;Sheppard, Samuel K.;Patchanee, Prapas
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제46권2호
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    • pp.162-170
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    • 2018
  • Non-typhoidal Salmonella is one of the main pathogens causing food-borne illness in humans, with up to 20% of cases resulting from consumption of pork products. Over the gastroenteritis signs, multidrug resistant Salmonella has arisen. In this study, pan-susceptible phenotypic strains of Salmonella enterica serotype Weltevreden recovered from pig production chain in Chiang Mai, Thailand during 2012-2014 were chosen for analysis. The aim of this study was to use whole genome sequencing (WGS) data with an emphasis on antimicrobial resistance gene investigation to assess their pathogenic potential and genetic diversity determination based on whole genome Multilocus Sequence Typing (wgMLST) to expand epidemiological knowledge and to provide additional guidance for disease control. Analyis using ResFinder 3.0 for WGS database tracing found that one of pan-susceptible phenotypic strain carried five classes of resistance genes: aminoglycoside, beta-lactam, phenicol, sulfonamide, and tetracycline associated genes. Twenty four and 36 loci differences were detected by core genome Multilocus Sequence Typing (cgMLST) and pan genome Multilocus Sequence Typing (pgMLST), respectively, in two matching strains (44/13 vs A543057 and A543056 vs 204/13) initially assigned by conventional MLST and Pulsed-field Gel Electrophoresis (PFGE). One hundread percent discriminant ability can be achieved using the wgMLST technique. WGS is currently the ultimate molecular technique for various in-depth studies. As the findings stated above, a new of "gold standard typing method era" for routine works in genome study is being set.

Epidemiological Study on Breast Cancer Associated Risk Factors and Screening Practices among Women in the Holy City of Varanasi, Uttar Pradesh, India

  • Paul, Shatabdi;Solanki, Prem Prakash;Shahi, Uday Pratap;Srikrishna, Saripella
    • Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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    • 제16권18호
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    • pp.8163-8171
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    • 2016
  • Background: Breast cancer is the second most cause of death (1.38 million, 10.9% of all cancer) worldwide after lung cancer. In present study, we assess the knowledge, level of awareness of risk factors and screening practices especially breast self examination (BSE) among women, considering the non-feasibility of diagnostic tools such as mammography for breast screening techniques of breast cancer in the holy city Varanasi, Uttar Pradesh, India. Materials and Methods: A cross-sectional population based survey was conducted. The investigation tool adopted was self administrated questionnaire format. Data were analysed using SPSS 20 version and Chi square test to determine significant association between various education groups with awareness and knowledge, analysis of variance was applied in order to establish significance. Results: The attitude of participants in this study, among 560 women 500 (89%) responded (age group 18-65 years), 53.8% were married. The knowledge about BSE was very low (16%) and out of them 15.6% were practised BSE only once in life time. study shown that prominent age at which women achieve their parity was 20 yrs, among 500 participants 224 women have achieved their parity from age 18 to 30 yrs. Very well known awareness about risk factors of breast cancer were alcohol (64.6%), smoking (64%) and least known awareness risk factors were early menarche (17.2%) and use of red meat (23%). The recovery factors of breast cancer cases were doctors support (95%) and family support (94.5%) as most familiar responses of the holy city Varanasi. Conclusions: The study revealed that the awareness about risk factors and practised of BSE among women in Varanasi is extremely low in comparison with other cities and countries as well (Delhi, Mumbai, Himachal Pradesh, Turkey and Nigeria). However, doctors and health workers may promote the early diagnosis of breast cancer.

경기도(京畿道) 여주군(驪州郡)에 있어서의 간흡충감염실태조사(肝吸虫感染實態調査) (Epidemiological Survey on Clonorchis sinensis in Yeoju Gun Gyeong-gi Do)

  • 주경환;최득린;임한종
    • 농촌의학ㆍ지역보건
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    • 제7권1호
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    • pp.43-49
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    • 1982
  • Clonorchiasis sinensis is one of the most important endemic diseases in Korea, and this disease has been known to be one of public health concern in many areas of Korea. This survey was undertaken to evaluate the status of clonorchiasis in Yeoju Gun, Gyeong-gi Do from July to September 1980. A total of 1,194 male students were examined by intradermal test with Clonorchis antigen. In order to detect Clonorchis egg, the stool examinations were undertaken to 1,158 students, and the intensity of the Clonorchis infection was estimated by the Stoll's egg count. The prevalence rate was reanalyzed by the regional groups for an investigation of regional characteristics of infection. The following results were obtained in this survey. 1) Among 1,194 students in Yeoju Eup, positive rate of intradermal test with C. sinensis antigen was 17.2 percent. (middle school14.6% and high school 20.1%). 2) In the examination of 1,158 stool specimens, Clonorchis eggs were found in 97 (8.4%) cases. 3) Mean E.P.G. of Clonorchis infected case was $1,330{\pm}2,620$. 4) The degree of the intensity of Clonorchis infection by E.P.G. count was distributed as 73.6% in light infection (100-999), 22.6%, in moderate infection (1,000-9,999), and 3.8% in heavy infection (10,000-29,999). 5) High prevalence rate of Clonorchis sinensis was found in the Sang-Ri(9,3%) and Ha-Ri(8.4%) in Yeoju Eup. Neighbouring Bugnae Myun (11.5%), Gangcheon Myun(12.1%) and Neungseo Myun (11.1%) adjacent to the river had a similary high prevalence of C. sinensis.

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