• 제목/요약/키워드: Environmental DNA

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일차배양 간세포에서 Monosodium Glutamate에 의한 돌연변이 유발성의 검증 (Effects of Monosodium Glutamate on Unscheduled DNA Synthesis and DNA Single-Strand Breaks in Primary Cultures of Rat Hepatocytes)

  • 김동현;양규환
    • 한국환경성돌연변이발암원학회지
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    • 제7권2호
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    • pp.59-64
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    • 1987
  • 조미료로 널리 사용되고 있는 monosodium glutamate(MSG)의 세포독성 및 돌연변이 유발성을 일차 배양 간세포에서 조사하였다. MSG를 세포 배양액에 첨가하여 24시간 동안 간세포에 처리한 결과 0.5% 농도까지는 간세포에 아무런 독성을 나타내지 않았으며 비주기성 DNA합성이나 DNA 단사 절단도 유발시키지 않았다. 1% MSG에서는 간세포의 생존율이 약간 저하되었으나 이 농도에서도 돌연변이 유발성이 전혀 없는 것으로 판명되었으며, aflatoxin B$_1$과 동시 처리시에도 aflatoxin B$_1$에 의한 DNA 손상을 증가 또는 감소시키지 않았다.

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효율적인 Metagenomic Library의 제작 방법 탐구 (Development of an Efficient Procedure for the Construction of Metagenomic Library from Environment Samples)

  • 임동빈
    • 미생물학회지
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    • 제40권4호
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    • pp.359-363
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    • 2004
  • 자연계에 존재하는 미생물의 대부분이 배양이 불가능하다는 것이 밝혀진 이후, 자연계의 시료로부터 직접 유전자를 클로닝하여 유용유전자를 발굴하는 메타제놈(metagenome) 이용 방법이 주목을 받게 되었다. 그러나 실제로 오염이 심한 환경시료로부터 DNA를 추출하여 유용한 메타제놈 라이브러리(metagenomic library)를 제작하기란 쉽지 않은 일이다. 따라서 본 연구에서는 실제 메타제놈 라이브러리를 제작할 때 만나는 기술적 문제점에 대한 해결 방법을 탐구하였다. 메타제놈 라이브러리 제작에는 fosmid vector가 가장 편리하였으며, 성공적인 라이브러리제작에는 fosmid vector에 클로닝이 가능한 40 kbp 크기의 DNA 조각을 얻는 과정이 중요함을 알았다. 여러 실험 조건을 종합적으로 검사한 후 메타제놈 라이브러리 제작에 대한 최적 방법을 제사하였다.

Anabaena cylindrica 분해세균의 분리 및 동정 (Isolation and Identification of Bacteria Lysing Anabaena cylindrica)

  • 최영길;홍엽;신규철;김민성;한명수
    • 미생물학회지
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    • 제38권2호
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    • pp.107-112
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    • 2002
  • 남조류 분해세균을 분리하기 위하여 도창, 팔당 저수지와 석촌 호수로부터 저층시료를 채취하였다. Anabaena cylindrica lawn에 각각의 시료를 도말한 후 11 일간 배양하였고 석촌 시료를 접중한 Anabaena cylindrica lawn에서 Anabaena cylindrica에 분해능을 가지는 세균을 분리하였다. 분해능 화인은 남조류와 분해세균을 혼합한 후 chlorophyll a간의 측정과 분리세균의 cell counting방법으로 확인하였고, 세포외 물질이 Anabaena cylindrica를 분해하는 것을 확인하였다. 분리균주는 16S rDNA 염기서열 분석과 형태학적, 생리학적 특징을 기초로 하여 동정하였다. 분리균주의 165 rDNA염기서열을 기초로한 분자계통학적 분석을 통하여 Bacillus속에 포함하는 계통학적 그룹에 속한다는 것을 확인하였고, Bacillus sp. CHSl으로 명하였다.

총 디젤분진의 DNA 손상작용과 야채 및 과일추출물의 보호효과 (Chemopreventive Effect of Vegetable or Fruit Extract Against Total Diesel Exhaust Particle Extract in NIH/3T3 Cells Using Alkaline Single Cell Gel Electrophoresis)

  • 허찬;김남이;허문영
    • Environmental Analysis Health and Toxicology
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    • 제21권2호
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    • pp.127-138
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    • 2006
  • In urban areas, diesel exhaust particles (DEP) are probably a major component of particulate matters, especially in Korea where drive many diesel vehicles. The aim of this study was to investigate genotoxic effects of DEP using single ceil gel electrophoresis. In order to evaluate the mechanisms of DEP genotoxicity, the rat microsome mediated and DNA repair enzyme treated comet assays together with conventional comet assay were performed. Total diesel particles (DEPT) was collected without site fractionation from diesel engine bus and dichloromethane extract was obtained. The organic extract of DEPT revealed DNA damage itself in NIH/3T3 cells. The level of DNA breaks plus oxidative DNA lesions and microsome mediated DNA damage was assessed by modified single cell gel eletrophoresis. DEPT was able to induce oxidative DNA damage as well as microsome mediated DNA damage. Vitamin C as an model antioxidant reduced DNA damage in endonuclase III treated comet assay. One of flavonoid, galangin as a CYP1A1 inhibitor. reduced DNA damage in the presence of S-9 mixture. $DEP_T$ is the sources of oxidative stress, but antioxidants can significantly reduce oxidative DNA dmage. And $DEP_T$ may contain indirect mutagens which can be inhibited by CYP1A1 inhibitors. The ethanol extracts of the mixed vegetables (BV) or the mixed fruits (BF) were evaluated for their in vitro antigenotoxic effects. BV and BF showed potent Inhibitory effects against DEPT induced DNA damage with oxidative DNA lesions and in the prescence of S-9 mixture. These results indicate that BV and BF could prevent cellular DNA damage by inhibiting oxidative stress and suppressing cytochrome P4501A1 in cell culture.

환경성 유해요인이 유전물질과 세포활성에 미치는 영향 III. 포유동물세포에서 돌연변이원에 의한 DNA 상해의 회복에 미치는 DNA 중합효소저해제의 영향 (Enviromental Toxic Agents on Genetic Material and Cellular Activity III. DNA Polymerase Inhibitors on Repair of Mutagen-Induced DNA Damage in Mammalian Cells)

  • 엄경일;선우양일;이천복;신은주
    • 한국환경성돌연변이발암원학회지
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    • 제8권1호
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    • pp.1-12
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    • 1988
  • 본 연구는 Ethyl methanesulfonato(EMS) 혹은 Bleomycin(BLM)에 의해 유발된 DNA상해의 회복에 미치는 DNA 종합효소 $\alpha$ 저해제인 Aphidicolin(APC)과 DNA 종합효소 $\beta$의 저해제인 2`, 3`-dideoxythymididine 5`-triphosphate(ddTTP)의 영향을 조사하기 위하여 Chinese hamster ovary(CHO)-Kl 세포를 재료로 비주기성 DNA 합성법과 알칼리유출법 및 스칼리 자당구배침강법으로 수행하여 얻은 결과는 다음과 같다. APC와 ddTTP는 EMS에 의해 유발된 DNA 상해의 회복을 저해하여 APC 혹은 ddTTP를 처리하지 않고 배양한 실험군 보다 비주기성 DNA 합성율과 DNA 단사 절단율이 증가되었다. 한편 BLM에 의해 유발된 DNA 상해의 회복에서는 ddTTP를 처리했을 경우에만 저해되었다. 즉 BLM 처리 후 ddTTP를 후처리한 실험군의 비주기성 DNA 합성율과 DNA단사 절단율은 ddTTP를 처리하지 않은 군보다 증가되었고, BLM 처리 후 APC를 후처리할 경우에 비주기성 DNA 합성율과 DNA 단사 절단율은 APC를 처리하지 않은 군과 유사하였다. 이상의 결과들에서 EMS에 의해 유발된 DNA 상해의 회복에는 DNA 중합효소 $\alpha$, $\beta$양자가 관여하나 BLM에 의해 유발된 DNA 상해의 회복에는 중합효소 $\beta$가 관여하는 것으로 추측된다.

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cDNA microarray와 E-screening assay를 이용한 MCF7 세포에서 dibuty1 phthalate의 유전자 발현 양상과 에스트로젠 활성 (Gene expression profile and estrogenicity of dibutyl phthalate in MCF7 cells using cDNA microarray and E-screening assay)

  • Kim, Hyung-Tae;Ryu, Jae-Chun
    • 한국환경독성학회:학술대회논문집
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    • 한국환경독성학회 2000년도 추계심포지움 및 학술발표회:바이오모니터링 기법을 이용한 환경위해성 평가
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    • pp.54-54
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    • 2000
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