• Journal of the Korean Wood Science and Technology
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• 제47권6호
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• pp.692-699
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• 2019

Elizabethkingia miricola BM10, a symbiotic bacterium, has been isolated from the hindgut of Reticulitermes speratus KMT001, a termite which occurs on Bukhan Mountain in Seoul, Korea. This strain demonstrated a symbiotic characteristic, in that it lacked endo-${\beta}$-1,4-glucanase activity, in a previous study. The major fatty acids of E. miricola BM10 were iso-$C_{15:0}$, iso-$C_{17:0}$ 3-OH, and summed feature 3 (iso-$C_{16:1}{\omega}7c/C_{16:1}{\omega}6c$). The content of iso-$C_{17:0}$ 3-OH was higher, while those of ECL 13.566, iso-$C_{17:11}{\omega}9c$, and summed feature 4 were lower than the other three type-strains of the Elizabethkingia genus. The 16S rRNA phylogenetic analysis confirmed that E. miricola BM10 is a new species. The whole genome of E. miricola BM10 was sequenced. The average nucleotide identity of strain BM10 as evaluated by pairwise comparison with E. anophelis R26, E. meningoseptica ATCC 13253, and E. miricola GTC 862 was shown to be 91.5%, 81.2%, and 94.29%, respectively. Based on our study results, E. miricola BM10 appears to represent a new strain of the genus Elizabethkingia.

• Journal of the Korean Wood Science and Technology
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• 제51권4호
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• pp.270-282
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• 2023

Lower termites need symbiotic microbes for cellulose digestion. Elizabethkingia miricola strain BM10 has been proposed as a symbiotic microbe that assists in low-temperature digestion and metabolism of Reticulitermes speratus KMT1, a termite on Bukhan Mountain, Seoul, Korea. In E. miricola strain BM10, β-glucosidase genes expressed at 10℃ were identified, and the psychrophilic enzymatic characteristic was confirmed by heterogeneously expressed proteins. Crude β-glucosidase in the culture broth of E. miricola strain BM10 showed specific enzymatic properties, and its substrate affinity was 4.69 times higher than that of Cellic CTec2. Among the genes proposed as β-glucosidase, two genes, bglB_1 and bglA_2, whose gene expression was more than doubled at 10℃ than at 30℃, were identified. They were heterogeneously expressed in Escherichia coli and identified as psychrophilic enzymes with an optimal reaction temperature of about 20℃-25℃. In this study, E. miricola strain BM10, a symbiotic bacterium of lower termites, produced psychrophilic β-glucosidases that contribute to the spread of the low-temperature habitat of a lower termite, R. speratus KMT1.

• 한국임산에너지학회:학술대회논문집
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• 한국산림바이오에너지학회 2011년도 정기총회 및 학술연구발표회
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• pp.53-56
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• 2011

• Journal of the Korean Wood Science and Technology
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• 제46권6호
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• pp.713-725
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• 2018

Lower termites require symbiotic microbes in their gut. The microbial communities in the termites must adapt to the termite temperature. Reticulitermes speratus KMT001 from Bukhan Mountain in Seoul may require a special symbiotic microorganisms for growth in low temperature Korean habitat. A metagenomics analysis showed a dramatic change in the symbiotic bacterial flora in the gut of R. speratus KMT001 in response to low temperatures of $4^{\circ}C$ or $10^{\circ}C$. Elusimicrobia, which are endosymbionts of flagellate protists, is the dominant phylum in the termite gut at ${\geq}15^{\circ}C$ but its population decreased drastically at low temperature. Four representative bacterial strains isolated from R. speratus KMT001 in a previous study produced maximum ${\beta}$-glucosidase levels within the temperature range of $10^{\circ}C-30^{\circ}C$. Elizabethkingia sp. BM10 produced ${\beta}$-glucosidase specifically at $10^{\circ}C$. This strain supported the existence of symbiotic bacteria for the low temperature habitat of the termite. This identified bacterium will be a resource for studying low temperature adaptation of termites, studying the gene expression at low temperatures, and developing an industrial cellulase at low temperature.

• Journal of Applied Biological Chemistry
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• 제54권2호
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• pp.135-142
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• 2011

우모분으로부터 높은 함량의 아미노산을 생성하는 Elizabethkingia meningoseptica CS2-1 (729.7 ${\mu}mol/mL$)를 선발하였다. 선발 균주의 protease 활성과 우모 분해능을 위한 최적배지 및 배양조건을 확립하고 우모 분해산물 아미노산의 특성을 조사하였다. E. meningoseptica CS2-1의 최적 배양조건은 $25^{\circ}C$, pH 7.5, 180 rpm이었으며, 효소는 pH 8.0, $40^{\circ}C$에서 가장 높은 활성을 나타내었다. E. meningoseptica CS2-1의 아미노산 생산을 위한 최적 배지조건은 $NH_4Cl$ 0.05%, NaCl 0.05%, $K_2HPO_4$ 0.03%, $KH_2PO_4$ 0.03%, $MgCl_2{\cdot}6H_2O$ 0.01%, urea 0.1%, 닭 우모분 2%이었다. E. meningoseptica CS2-1를 최적 배지 및 배양조건에서 배양한 결과, 아미노산의 총 함량은 1063 ${\mu}mol/mL$로 기본조건 (729.7 ${\mu}mol/mL$)보다 46%로 향상되었고 필수 아미노산 함유량은 315.9 ${\mu}mol/mL$로 기본조건 (219.3 ${\mu}mol/mL$)보다 44%로 향상되었다. 닭 우모분으로부터 추출되 는 17 종류의 아미노산 중 proline (14%), aspartic acid (12%), serine (10%), alanine (10%), glycine (9%), tyrosine (7%)이 주요 아미노산으로 추출되는 특징을 나타내었다. 따라서, E. meningoseptica CS2-1은 닭 우모로부터 아미노산 생산을 위한 미생물유전자원 소재로서 잠재적 가치가 클 것으로 판단된다.

• 미생물학회지
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• 제51권4호
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• pp.440-443
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• 2015

임상과 자연환경에서 발견되는 항생제내성균의 문제는 보건학적 관심의 대상이 되고 있으며 환경 중의 미생물은 항생제 내성유전자 확산의 한 요인으로 판단되고 있다. 본 연구에서는 국내 하천 7지점으로부터 분리한 배양성 ampicillin 내성균의 다양성을 조사하였다. 분리된 498종의 세균들 중에서 Aeromonas와 Acidovorax 속의 내성균 분포가 가장 높았으며, 66%의 분리균들이 조사된 14종의 항생제 중 6종 이상의 항생제에 내성을 나타내었다. 그리고 7종의 항생제에 내성을 보이는 비율이 19.7%로 가장 높았다. 또한 항생제감수성 조사 결과를 바탕으로, 분포율이 높았던 Aeromonas, Acidovorax, Pseudomonas, Elizabethkingia 속의 내성균에 대한 자연내성 특징을 파악하였다.

• 대한수의학회지
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• 제50권2호
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• pp.125-131
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• 2010

Bacterial contamination is an unavoidable finding of the semen collection process in boar and can lead in deleterious effects on semen quality and longevity if left uncontrolled. The purpose of this study is to identify the bacteria in extended boar semen and to select the effective antimicrobials to control of the contaminants. Of 116 extended boar semen samples submitted from eight AI centers in Korea, 39 (33.6%) samples were positive for bacterial contamination. Among 39 contaminated semen, most of them (84.6%) were contaminated with one or two bacterial species and there was no significant difference between two age groups $(\leq\;24\;and\;>\;24\;month\;old).$ Stenotrophomonas maltophilia (n = 18) was the most predominant bacterium followed by Elizabethkingia meningoseptica (n = 12), Sphingomonas paucimobilis (n = 12), Myroides spp. (n = 5), Ochrobactrum anthropi (n = 3), and so on. Enrofloxacin (72.9%), florfenicol (72.9%), bacitracin (49.2%) and tylosin (49.2%) showed higher sensitivity compared with penicillin (13.6%) or aminoglycosides (6.8%-18.6%). Brucella spp., Leptospira spp., Mycoplasma hyopneumoniae, Mycoplasma hyorhinis, Mycobacterium tuberculosis complex were not detected in semen by PCR.

• Pediatric Infection and Vaccine
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• 제30권3호
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• pp.173-179
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• 2023

완전 디죠지 증후군(complete DiGeroge syndrome)은 디죠지 증후군 중 심한 T세포면역결핍의 양상을 보이는 경우이다. 본 증례보고에서는 치료 불응성 거대세포바이러스 감염 상태에 있는 완전 디죠지 증후군 영아에게 T 세포기능 회복을 위해 CD45RA+ 선별제거 림프구 주입을 시행한 경험을 공유하고자 한다. 증례는 형광제자리부합법으로 22q11.2 결실이 확인된 만삭출생 여아로, T 세포면역결핍(T 세포 수 CD3+ 69/μL, CD4+ 7/μL)이 동반되어 완전 디죠지 증후군으로 진단되었다. 생후 45일에 거대세포바이러스 감염증(혈중 바이러스역가 120,000 IU/mL)이 처음 진단되었고, 간시클로버 치료 56일째까지는 혈중 바이러스역가가 감소하였으나 이후 다시 증가하였다. 간시클로버 저항성을 부여하는 것으로 알려진 거대세포바이러스 UL97 단백 인산화효소의 M460V 변이가 확인되어 포스카넷과의 병합요법으로 치료하였으나, 혈중 바이러스역가 2,820,000 IU/mL 로 상승하며, 거대세포바이러스 망막염이 동반되었다. T 세포기능 회복과 불응성 거대세포바이러스 감염의 치료를 위해, 생후 196일과 207일에 환아의 아버지에게서 채집한 CD45RA+ 선별제거 거대세포바이러스 특이 림프구를 2회 주입한 결과, T세포 증가를 이루지 못하였으나, 거대세포바이러스 역가의 감소는 관찰되었다(2차 주입 후 10일째 바이러스역가, 87,000 IU/mL). 환아는 폐포자충 폐렴과 Elizabethkingia meningoseptica 패혈증으로 생후 222일에 사망하였다.