Marker-assisted gene pyramiding aims to produce individuals with superior economic traits according to the optimal breeding scheme which involves selecting a series of favorite target alleles after cross of base populations and pyramiding them into a single genotype. Inspired by the science of evolutionary computation, we used the metaphor of hill-climbing to model the dynamic behavior of gene pyramiding. In consideration of the traditional cross program of animals along with the features of animal segregating populations, four types of cross programs and two types of selection strategies for gene pyramiding are performed from a practical perspective. Two population cross for pyramiding two genes (denoted II), three population cascading cross for pyramiding three genes(denoted III), four population symmetry (denoted IIII-S) and cascading cross for pyramiding four genes (denoted IIII-C), and various schemes (denoted cross program-A-E) are designed for each cross program given different levels of initial favorite allele frequencies, base population sizes and trait heritabilities. The process of gene pyramiding breeding for various schemes are simulated and compared based on the population hamming distance, average superior genotype frequencies and average phenotypic values. By simulation, the results show that the larger base population size and the higher the initial favorite allele frequency the higher the efficiency of gene pyramiding. Parents cross order is shown to be the most important factor in a cascading cross, but has no significant influence on the symmetric cross. The results also show that genotypic selection strategy is superior to phenotypic selection in accelerating gene pyramiding. Moreover, the method and corresponding software was used to compare different cross schemes and selection strategies.
Journal of the Korea Academia-Industrial cooperation Society
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v.21
no.4
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pp.538-545
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2020
This study measured the economic impact (from 2012 through the end of 2017) of the KOR-USA FTA (Free Trade Agreement) on the Korean citrus industry according to importing orange from the USA after the implementation of the KOR-USA FTA. Citrus fruits were divided into field citrus grown in open fields, house citrus grown in green houses, and late-maturing citrus (including winter season citrus) based on the cultivation methods and the varieties of citrus. We specified the structural and dynamic recursive demand-supply equilibrium models of three citrus fruits to analyze policy simulations. The results showed that for field citrus, due to the impact of some amounts of TRQ, the annual average of the real gross revenue dropped by 2.39 billion KRW between 2012 and 2017. As for house citrus, due to the impact of oranges and cherries, the annual average of the real gross revenue declined by 3.01 billion KRW between 2012 and 2017, and for late-maturing citrus (including winter season citrus), the annual average of the real gross revenue fell by 15.11 billion KRW between 2012 and 2017. This paper also suggests several policy implications.
Mo, Hyoung-ho;Kang, Ju Wan;Cho, Kijong;Bae, Yeon Jae;Lee, Mi-Gyung;Park, Jung-Joon
Korean Journal of Environmental Biology
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v.34
no.1
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pp.56-62
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2016
Pest population density models are very important to monitor the initial occurrence and to understand the continuous fluctuation pattern of pest in pest management. This is one of the major issues in agriculture because these predictions make pesticides more effective and environmental impact of pesticides less. In this study, we combined and predicted the mortality change of pest caused by pesticides with temperature change and population dynamic model. Sensitive strain of two-spotted spider mite (Tetranychus urticae Koch) with kidney bean leaf as host was exposed to mixed acaricide, Acrinathrin-Spiromesifen and organotin acaricide, Azocyclotin, at 20, 25, 30, and $35^{\circ}C$, respectively. There was significant difference in mortality of T. urticae among pesticides and temperatures. We used DYMEX to simulate population density of T. urticae and predicted that the initial management time and number of chemical control would be changed in the future with climate change. There would be implications for strategies for pest management and selection process of pesticide in the future corresponding climate change.
In this study, the characteristics of flow and bed changes with variation of space and length of serial spur dikes were investigated with 2 dimensional numerical simulation. Upstream spur dike was affected by flow and made a role as a single spur dike. As time increased, local scouring was developed around outside of spur dike, and migrated upstream. The aggradation of the bed at the back of spur-dike was made at the initial stage of experiment and numerical modelling. However, the aggradation of the bed was increased in the downstream area. The scour whole around a spur dike upstream was not deep as the Dimensionless spur-dike interval (b) of the dike increased. The depth of scour hole was nearly constant at the dynamic equilibrium state. The dimensionless scour depth ($y_s/H$) increased with L/b. The spur dike downstream had the characteristics of single spur dike as the L/b was larger than 10. However, the spur dike downstream was affected by the dike upstream as the L/b was less than 4, and the bed of the upstream in the spur dike was aggradated and the effects of the serial spur dikes on the bed decreased.
The Transactions of the Korean Institute of Power Electronics
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v.6
no.1
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pp.98-106
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2001
This paper presents external load disturbance compensation that used to deadbeat load torque observer and regulation of the compensation gain by parameter estimator. As a result, the response of PMSM follows that of the nominal plant. The load torque compensation method is compose of a dead beat observer that is well-known method. However it has disadvantage such as a noise amplification effect. To reduce of the effect, the post-filter, which is implemented by MA process, is proposed. The parameter compensator with RLSM(recursive least square method) parameter estimator is suggested to increase the performance of the load torque observer and main controller. Although RLSM estimator is one of the most effective methods for online parameter identification, it is difficult to obtain unbiased result in this application. It is caused by disturbed dynamic model with external torque. The proposed RLSM estimator is combined with a high performance torque observer to resolve the problems. As a result, the proposed control system becomes a robust and precise system against the load torque and the parameter variation. A stability and usefulness, through the verified computer simulation and experiment, are shown in this paper.
Surface-subsurface interactions are an intrinsic component of the hydrologic response within a watershed. In general, these interactions are considered to be one of the most difficult areas of the discipline, particularly for the modeler who intends simulate the dynamic relations between these two major domains of the hydrological cycle. In essence, one major complexity is the spatial and temporal variations in the dynamically interacting system behavior. The proper simulation of these variations requires the need for providing an appropriate coupling mechanism between the surface and subsurface components of the system. In this study, an approach for modelling surface-subsurface flow and transport in a fully intergrated way is presented. The model uses the 2-dimensional diffusion wave equation for sheet surface water flow, and the Boussinesq equation with the Darcy's law and Dupuit-Forchheimer's assumption for variably saturated subsurface water flow. The coupled system of equations governing surface and subsurface flows is discretized using the finite volume method with central differencing in space and the Crank-Nicolson method in time. The interactions between surface and subsurface flows are considered mass balance based on the continuity conditions of pressure head and exchange flux. The major module consists of four sub-module (SUBFA, SFA, IA and NS module) is developed.
The Journal of The Korea Institute of Intelligent Transport Systems
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v.18
no.2
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pp.58-76
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2019
As the number of reported injuries has tended to increase over time, large hospitalization expenditure from excessive medical treatments and hospitalization, and insurance frauds associated with moral hazard in minor collisions have caused a global societal problem. Many occupants of rear-ended vehicles involved in rear-end collisions complain of whiplash injury, which is also known as neck injury, without any anatomical and radiological evidence. With only clinical symptoms, stating that a whiplash injury is a type of injury defined by the Abbreviated Injury Scale would be difficult. Therefore, this study focuses on minor rear-end collisions, where the rear-ender vehicle collides with the rear-ended vehicle at rest. The mathematics dynamic model is employed to simulate a total of 100 rear-end collision scenarios based on various weights and collision speeds and identify how the weights and speeds of both vehicles influence the risk of whiplash injury in occupants involved in minor rear-end collisions. The possibility of an injury is very high when the same-weight vehicles are involved in accidents at collision speeds of 15 km/h or higher. The possibilities are 36% and 84% with collision speeds of 15 km/h and 20 km/h, respectively, if weights are disregarded.
This study, it was tried to evaluate the asphalt behavior under tensile loading conditions through indirect Brazilian and direct tensile tests, experimentally and numerically. This paper is important from two points of view. The first one, a new test method was developed for the determination of the direct tensile strength of asphalt and its difference was obtained from the indirect test method. The second one, the effects of particle size and loading rate have been cleared on the tensile fracture mechanism. The experimental direct tensile strength of the asphalt specimens was measured in the laboratory using the compression-to-tensile load converting (CTLC) device. Some special types of asphalt specimens were prepared in the form of slabs with a central hole. The CTLC device is then equipped with this specimen and placed in the universal testing machine. Then, the direct tensile strength of asphalt specimens with different sizes of ingredients can be measured at different loading rates in the laboratory. The particle flow code (PFC) was used to numerically simulate the direct tensile strength test of asphalt samples. This numerical modeling technique is based on the versatile discrete element method (DEM). Three different particle diameters were chosen and were tested under three different loading rates. The results show that when the loading rate was 0.016 mm/sec, two tensile cracks were initiated from the left and right of the hole and propagated perpendicular to the loading axis till coalescence to the model boundary. When the loading rate was 0.032 mm/sec, two tensile cracks were initiated from the left and right of the hole and propagated perpendicular to the loading axis. The branching occurs in these cracks. This shows that the crack propagation is under quasi-static conditions. When the loading rate was 0.064 mm/sec, mixed tensile and shear cracks were initiated below the loading walls and branching occurred in these cracks. This shows that the crack propagation is under dynamic conditions. The loading rate increases and the tensile strength increases. Because all defects mobilized under a low loading rate and this led to decreasing the tensile strength. The experimental results for the direct tensile strengths of asphalt specimens of different ingredients were in good accordance with their corresponding results approximated by DEM software.
Sejun Kim;Hyungmo Kim;Seongwoo Cheon;Sungjun Kim;Haeseong Cho;Lae-Hyong Kang
Journal of Aerospace System Engineering
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v.18
no.1
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pp.37-45
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2024
This paper presents a design approach for passive vibration control to reduce vertical vibrations transmitted to the control unit during hovering flight of a quadrotor drone. Ground vibration test simulation based on finite element model was performed for forced vibration analysis of the quadrotor drone. First, modal analysis was performed to evaluate dynamic characteristics. Forced vibration response analysis was then performed to obtain the steady-state response within the operating frequency range under the hovering flight condition. Furthermore, to obtain the vibration reduction effect, a viscous damping tape was applied at positions that could induce vibrations transmitted to the control unit under the same conditions. Such a passive vibration control approach was investigated. Relevant vibration reduction effect was assessed with respect to the application of damping materials and the attachment position.
Kim, Tae-Ho;Yoon, Jai-Woong;Kang, Seong-Hee;Suh, Tae-Suk
Progress in Medical Physics
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v.23
no.3
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pp.145-153
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2012
In this study, we quantify the residual motion artifact in 4D-CT scan using the dynamic lung phantom which could simulate respiratory target motion and suggest a simple one-dimension theoretical model to explain and characterize the source of motion artifacts in 4DCT scanning. We set-up regular 1D sine motion and adjusted three level of amplitude (10, 20, 30 mm) with fixed period (4s). The 4DCT scans are acquired in helical mode and phase information provided by the belt type respiratory monitoring system. The images were sorted into ten phase bins ranging from 0% to 90%. The reconstructed images were subsequently imported into the Treatment Planning System (CorePLAN, SC&J) for target delineation using a fixed contour window and dimensions of the three targets are measured along the direction of motion. Target dimension of each phase image have same changing trend. The error is minimum at 50% phase in all case (10, 20, 30 mm) and we found that ${\Delta}S$ (target dimension change) of 10, 20 and 30 mm amplitude were 0 (0%), 0.1 (5%), 0.1 (5%) cm respectively compare to the static image of target diameter (2 cm). while the error is maximum at 30% and 80% phase ${\Delta}S$ of 10, 20 and 30 mm amplitude were 0.2 (10%), 0.7 (35%), 0.9 (45%) cm respectively. Based on these result, we try to analysis the residual motion artifact in 4D-CT scan using a simple one-dimension theoretical model and also we developed a simulation program. Our results explain the effect of residual motion on each phase target displacement and also shown that residual motion artifact was affected that the target velocity at each phase. In this study, we focus on provides a more intuitive understanding about the residual motion artifact and try to explain the relationship motion parameters of the scanner, treatment couch and tumor. In conclusion, our results could help to decide the appropriate reconstruction phase and CT parameters which reduce the residual motion artifact in 4DCT.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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