• 생명과학회지
• /
• 제20권6호
• /
• pp.853-860
• /
• 2010

DevSR two-component system은 Mycobacterium smegmatis의 redox sensing에 관련된 주요한 regulatory system이다. DevSR system은 DevS histidine kinase와 DevR response regulator로 구성되어 있다. 저산소 조건에서 DevS histidine kinase는 활성화되어 DevR response regulator를 인산화 시키고, 인산화된 DevR response regulator는 DevR regulon의 transcriptional activator로 작용한다. DevS의 kinase activity는 DevS의 N-terminal에 위치한 GAF domain에 존재하는 heme의 ligand-binding state에 의해 결정된다. 본 연구에서는 C-terminal kinase domain의 redox-responsive cysteine (C547)이 DevS kinase activity의 redox-dependent control과 연관이 있음을 밝혔다. 산소가 존재할 때, C547 residue 사이의 disulfide bond의 형성은 DevS kinase activity를 불활성화 시킨다. $\beta$-mercaptoethanol과 dithiothreitol과 같은 환원제를 이용하여 산화된 DevS를 환원시켰을 때, DevS kinase activity가 복원된 것이 관찰되었다. 또한, C547을 alanine으로 치환했을 때, M. smegmatis의 DevS의 sensory 기능을 부분적으로 손상되는 것이 complementation 실험을 통해 in vivo 상에서 증명되었다.

• Molecules and Cells
• /
• 제40권9호
• /
• pp.632-642
• /
• 2017

The DevSR (DosSR) two-component system, which is a major regulatory system involved in oxygen sensing in mycobacteria, plays an important role in hypoxic induction of many genes in mycobacteria. We demonstrated that overexpression of the kinase domain of Mycobacterium tuberculosis (Mtb) PknB inhibited transcriptional activity of the DevR response regulator in Mycobacterium smegmatis and that this inhibitory effect was exerted through phosphorylation of DevR on Thr180 within its DNA-binding domain. Moreover, the purified kinase domain of Mtb PknB significantly phosphorylated RegX3, NarL, KdpE, TrcR, DosR, and MtrA response regulators of Mtb that contain the Thr residues corresponding to Thr180 of DevR in their DNA-binding domains, implying that transcriptional activities of these response regulators might also be inhibited when the kinase domain of PknB is overexpressed.

• 한국컴퓨터정보학회:학술대회논문집
• /
• 한국컴퓨터정보학회 2019년도 제60차 하계학술대회논문집 27권2호
• /
• pp.127-128
• /
• 2019

본 논문에서는 SR DEVS에서 부모 객체가 자식 개체로의 상속에서 입력 함수와 출력 함수의 상속 형태에 대한 특정한 상황을 고려한다. 히든 상속의 경우 자식 객체는 부모 객체로부터 부모의 자산을 상속받더라도 상속 함수에 대한 작용이 일어나지 않는다. 이 경우 부모에게서 넘겨받은 자산에 대해 상속받지 못한 것은 아니며 단지 숨겨진 상태를 의미한다.

• 한국컴퓨터정보학회:학술대회논문집
• /
• 한국컴퓨터정보학회 2020년도 제61차 동계학술대회논문집 28권1호
• /
• pp.253-254
• /
• 2020

본 논문에서는 SR DEVS에서 객체간의 상속이 발생할 경우 상속 확률 변수에 대해 고려한다. 객체간 상속의 경우 상속 강도는 확률 변수에 의해 결정될 수 있다. 본 논문에서는 확률 변수로 베르누이 확률 분포를 고려하여 객체 상속에 대한 상속 강도를 고려한다.

• 생명과학회지
• /
• 제24권12호
• /
• pp.1330-1338
• /
• 2014

결핵균인 Mycobacterium tuberculosis H37Rv에서는 16개의 adenylyl cyclase (AC) 유전자가, 비병원성인 M. smegmatis에서는 10개의 AC 유전자가 발견되었다. M. smegmatis에서 발견된 10개의 AC 유전자들 중 MSMEG_0228, MSMEG_3243, MSMEG_3780, MSMEG_4279, MSMEG_4477, MSMEG_6154 유전자들의 발현은 저산소 조건에서 유도되었다. 반면에 M. smegmatis가 nitric oxide (NO)에 노출이 되면 MSMEG_3780과 MSMEG_4279 유전자의 발현이 유도되었다. 유산소 조건에서 키운 M. smegmatis와 비교할 때, 저산소 조건에서 성장한 M. smegmatis 세포 내부와 성장 배지 내의 cAMP 양은 각각 450배와 9.8배 증가하였다. M. smegamtis가 NO에 노출이 되면 세포 내의 cAMP 농도는 5.8배 증가하였다. DevSR two-component system은 M. smegmatis가 저산소 조건이나 NO에 노출되었을 때 많은 유전자의 발현을 유도하는 주요 조절계로 알려져 있는데, 저산소 조건에서 발현이 유도된 6개의 AC 유전자의 발현이 M. smegmatis devR mutant에서도 wild type에서와 마찬가지로 저산소 조건에서 유도됨이 관찰되었다. 이 결과는 저산소 조건에서 발현이 유도되는 6개의 AC 유전자들이 DevSR two-component system에 의해 조절되지 않음을 나타내고 있다. 저산소 조건에서 발현이 가장 많이 유도된 MSMEG_3780 유전자의 발현조절에 관련이 있는 조절자를 발굴하기 위해 ligand fishing 분석을 수행하였고, 후보 조절자로서 MSMEG_5136을 발굴하였다.

• 한국정보처리학회:학술대회논문집
• /
• 한국정보처리학회 2012년도 추계학술발표대회
• /
• pp.1493-1496
• /
• 2012

소프트웨어 생명주기 중 가장 많은 비용이 유지보수 개발에서 발생한다. 대형 소프트웨어 시스템의 운영 유지보수 표준은 ISO/IEC 20000 으로 프로세스통합운영 및 개선활동 중심이어서 유지보수 개발에 대한 SR(Service Request) 처리시 개발 표준 및 구체적 절차가 미비하다. 그러나 대형 소프트웨어 시스템 구축 개발 시 많이 채택하고 있는 CMMI-DEV 표준을 ISO/IEC 20000 유지보수 조직 및 팀원이 내제화를 함으로써 유지보수 개발의 상호 보완적 프로세스로 명세 명확화 및 품질을 제고할 수 있고, 생산성과 효율성을 증대할 수 있다. 따라서 본 연구에서는 ISO/IEC 20000 유지보수 조직이 운영하고 있는 표준절차에 CMMI-DEV 표준 프로세스를 상호보완적으로 매칭한 표준절차를 적용한 통합모델을 제안한다. ISO/IEC 20000 모델의 개발단계에 CMMI-DEV 프로세스 모델을 적용한 통합 모델을 구축하고 실제 프로젝트에 적용하여 본 연구의 실효성을 검증한다.

• 한국재료학회:학술대회논문집
• /
• 한국재료학회 1998년도 IUMRS-ICEM ABSTRACT BOOK
• /
• pp.65.1-65
• /
• 1998

• 한국재료학회:학술대회논문집
• /
• 한국재료학회 1998년도 IUMRS-ICEM ABSTRACT BOOK
• /
• pp.65.2-65
• /
• 1998

• 한국컴퓨터정보학회논문지
• /
• 제20권1호
• /
• pp.137-142
• /
• 2015

SR DEVS 모델링에 의한 객체 상속은 일부 자산에 대한 숨겨진 상속이 가능하다. 부모 객체로부터 넘겨받은 자산에 대해 자식 객체는 넘겨받은 자산의 일부 혹은 전부를 각각의 지정된 함수에 의해 수행할 수도 수행하지 않을 수도 있다. 자산 수행에 대한 숨겨진 상속은 자식 객체가 해당 자산에 대해 자원은 보유하고 있더라도 그것에 대한 수행은 하지 않는 것이다. 상속된 자산은 자식 객체의 자산 수행 전체에 나타나지 않을 수도 있으며, 특정한 시스템 상태에 따라 자산 수행을 할 수 있다. 여기서 자산 수행 전체라 함은 자식 객체가 생성되어 소멸될 때까지의 시간적 요소도 포함된다. 본 논문에서는 부모 객체로부터 상속받은 자산에 대해 숨겨진 상속 결정에 대한 확률 방안을 기술한다. 결정확률 함수에 의해 상속 자산이 숨겨진 상속이 될지 정상 상속이 될지 결정되는 것이다.