• 제목/요약/키워드: Data races

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The Use of Fibroin Light Chain Gene Sequence for the Genetic Marker of the Silkworm Races

  • Park, Kwang-Ho;Kang, Seok-Woo;Kang, Pil-Don;Goo, Tea-Won;Hwang, Jae-Sam;Yun, Eun-Young;Lee, Sang-Mong;Sohn, Hung-Dae;Jin, Byung-Rae
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제6권1호
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    • pp.45-48
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    • 2003
  • We have previously cloned and characterized the complete fibroin L-chain gene from one of the silkworm races Baekok-Jam (Bombyx mori) and found two variable regions (I, intron 2 ~ exon 3; II, intron 6) with the primer sets designed to cover these variable regions. We tested the utility of these regions as genetic markers among silkworm races. For the purpose of study, Japanese race (Jam 123), Chinese race (Jam 124) and their F$_1$hybrid Baekok-Jam were used. The PCR product size of region I was 787 bp in Jam 123, 770 bp in Jam 124 and 768 bp in Baekok-Jam. The size of region II was 470 bp in Jam 123, 428 bp in Jam 124 and 429 Up in Baekok-Jam. In the extended experiment, Jam 125 (Japanese race), Jam 126 (Chinese race) and their F$_1$hybrid Daeseong-Jam were also analyzed. The sizes of region I and II in Jam 125, Jam 126 and Daeseong-Jam were similar to those of Jam 123, Jam 124 and Baekok-Jam. DNA sequence divergence between the two geographic races of Jam 123 or Jam 125 and Jam 124 or Jam 126 was substantial. The result suggests that the fibroin L-chain gene of F$_1$hybrids were inherited from Chinese races. These results are concordant with cocoon shapes of tested animals, and suggested that Baekok-Jam or Daeseong-jam is more closely related to Jam 124 or Jam 126 than to Jam 123 or Jam 125. Taken these data together, the primer sets designed from two variable regions of fibroin L-chain gene would be highly useful, as the genetic markers for silkworm races, at least in Japanese and Chinese races, although an extended study including more geographic races is required.

OpenMP 디렉티브 프로그램을 위한 자료경합 검증도구 (A Verification Tool of Data Races in Programs with OpenMP Directives)

  • 김영주;전용기
    • 한국정보과학회논문지:시스템및이론
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    • 제34권9호
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    • pp.395-406
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    • 2007
  • OpenMP 디렉티브를 가진 프로그램에서 경합은 프로그램의 의도하지 않은 비결정적 수행결과를 초래하기 때문에 디버깅을 위해서 반드시 탐지되어야 한다. 하지만 이를 위한 기존의 경합탐지 도구인 Intel사의 Thread Checker는 경합의 존재를 검증하지 못하고 경합을 탐지하는 비용이 크므로 비실용적이다. 본 논문에서는 OpenMP 프로그램의 특성 및 사용자 요구사항의 분석결과를 이용하여 최적의 기능과 성능으로 경합을 검증하는 웹 기반 도구를 제시한다. 그리고 합성 프로그램을 이용하여 실험한 결과로서 Thread Checker는 경합의 존재를 검증하지 못하고 경합탐지 시에 소요되는 시간의 증가비율은 총 접근 사건수 n에 대해서 $O(n^2)$이지만 제안된 도구는 경합의 존재를 검증하고 소요되는 시간의 증가비율은 O(n)이므로 기능 및 성능적인 측면에서 실용적인 도구이다.

비친화적 및 친화적 레이스의 혼합접종에 따른 벼흰잎마름병 발병도의 변화 (Variation of Disease Severity by Mixed Inoculation of Compatible and Incompatible Races of Bacterial Blight in Rice)

  • 김보라;이은정;최재을
    • 한국작물학회지
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    • 제52권2호
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    • pp.162-168
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    • 2007
  • 본 연구는 벼흰잎마름병 저항성유전자 Xa1, Xa 3 및 Xa7을 가진 단인자 근동질 유전자계통에 일본의 대표균주(T7174, T7147, T7133)를 단독 및 혼합 접종하여 친화적 및 비친화적 균주의 상호작용에 따른 벼흰잎마름병 발병도에 미치는 영향을 조사하였다. Xa1 유전자를 갖는 IRBB 101 계통은 벼의 생육기간 전반에 걸쳐 T7147와 T7133 균주에는 친화적 관계로, T7174 균주에는 비친화적 관계로 작용하였다. Xa3 유전자를 갖는 IRBB 103 계통은 유묘기에서는 3 균주가 친화적 관계로 반응하였으나 출수기에 비교적 안정된 저항성을 나타냈다. Xa7 유전자를 갖는IRBB 107은 유묘기 접종에서는 3 균주가 비친화적 관계에 유사한 반응을 나타냈고, 최고분얼기 접종에서는 대부분 저항성으로 반응하였으며, 출수기에는 모두 강한 저항성으로 반응하여 비친화적 관계로 변화하였다. 친화적 균주와 비친화적 균주의 혼합접종에서는 비친화적 균주의 혼합비율이 증가할수록 병반장이 감소하는 경향 이였고, 친화적 및 비친화적 관계가 확실치 않는 경우는 병반장의 변화가 거의 없었다. 친화적 균주의 혼합접종에서는 친화적 균주의 단독 접종보다 대체로 병반장이 증가하는 경향이었으나, 비친화적 균주의 혼합접종에서는 단독 접종과 유사한 반응을 나타내어 병반장의 변화가 적었다. Xa7 유전자를 갖는 IRBB 107 계통은 벼의 생육기간동안 사용된 3 균주 모두에 저항성으로 반응하여 가장 안정된 저항성원인 것으로 판단된다.

소프트웨어 트랜잭셔널 메모리를 이용한 자료경합 치유 기술 설계 (A Design of Healing Data Races using Software Transactional Memory)

  • 최으뜸;하옥균;전용기
    • 한국컴퓨터정보학회:학술대회논문집
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    • 한국컴퓨터정보학회 2016년도 제54차 하계학술대회논문집 24권2호
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    • pp.3-4
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    • 2016
  • 멀티스레드 프로그램의 수행 중에 발생할 수 있는 자료경합은 프로그래머가 의도하지 않은 비결정적 수행으로 인해 신뢰할 수 없는 프로그램의 결과를 발생시킨다. 이러한 자료경합의 디버깅을 위해서 시간 및 자원적 비용이 과도하게 발생하기 때문에 프로그램의 수행 중에 이를 용인하고 치유하는 것이 중요하다. 본 논문은 멀티스레드 프로그램을 대상으로 소프트웨어 트랜잭셔널 메모리(STM)를 사용하여 공유변수에 대한 트랜잭션 영역을 설정하고 공유변수에 대한 이벤트 충돌 유형에 따른 자료경합 치유기법을 설계한다. 최종적으로는 프로그램 수행 중에 자료경합을 치유하는 기법의 실현가능성을 확인한다.

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Examination of Genetic Relationships of Silkworm Stocks in Korea by Additive Isozyme Analysis

  • Sohn, Bong-Hee;Kim, Hyun-Su;Kang, Pil-Don;Lee, Sang-Uk;Seong, Su-Il
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제5권2호
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    • pp.205-211
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    • 2002
  • Previously, genetic relationships among 321 silkworm races preserved in the Department of Sericulture and Entomology, NIAST, RDA were studied using six isozymes comprising 20 loci. As a part of additional studies, three additional isozymes with 7 loci [phos-phoglucomutase (PGM), glucose phosphate isomerase (GPI), malete dehydrogenase (MDH)] from hemolymphs, midgets, and eggs were employed to reevaluate the previous dendrogram (UPGMA method). Although the current study supported the recognition of the previously identified major groups, some minor changes were apparent among the selected 47 forms. The current study showed that the polymorphic loci of GPI from eggs and MDH from hemolymph appear to be responsible characters for generating a new major group in the genetic relationship. Interpreting the data with current additive isozymes may represent more robust genetic relatioships among 321 silkworm races preserved in Korea, until further evidence is available.

Fine mapping of rice bacterial leaf blight resistance loci on K1 and K2 of Korean races of Xoo (Xanthomonas oryzae) using GWAS analysis

  • 현도윤;이정로;조규택;;신명재;이경준
    • 한국자원식물학회:학술대회논문집
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    • 한국자원식물학회 2019년도 춘계학술대회
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    • pp.62-62
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    • 2019
  • Bacterial leaf blight(BLB), caused by X. oryzae pv. oryzae(Xoo), is one of the most destructive diseases of rice due to its high epidemic potential. Understanding BLB resistance at a genetic level is important to further improve the rice breeding that provides one of the best approaches to control BLB disease. In the present investigation, a collection of 192 accessions was used in the genome-wide association study (GWAS) for BLB resistance loci against four Korean races of Xoo that were represented by the prevailing BLB isolates under Xoo differential system. A total of 192 accessions of rice germplasm were selected on the basis of the bioassay using four isolated races of Xoo such as K1 and K2. The selected accessions was used to prepare 384-plex genotyping by sequencing (GBS) libraries and Illumina HiSeq 2000 pairedend read was used for GBS sequencing. GWAS was conducted using TASSEL 5.0. The TASSEL program uses a mixed linear model (MLM). The results of the bioassay using a selected set of 192 accessions showed that a large number of accessions (93.75%) were resistant to K1 race and K2 resistant germplasm proportion remained between 66.67. The genotypic data produced SNP matrix for a total of 293,379 SNPs. After imputation the missing data was removed, which exhibited 34,724 SNPs for association analysis. GWAS results showed strong signals of association at a threshold of [-log10(P-value)] more than 5 (K1 and K2) for nine of the 39 SNPs, which are plausible candidate loci of resistance genes. These SNP loci were positioned on rice chromosome 2, 9, and 11 for K1 and K2 races. The significant loci detected have also been illustrated and make the CPAS markers for NBS-LRR type disease resistance protein, SNARE domain containing protein, Histone deacetylase 19, NADP-dependent oxidoreductase, and other expressed and unknown proteins. Our results provide a better understanding of the distribution of genetic variation of BLB resistance to Korean pathogen races and breeding of resistant rice.

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RAPD 방법을 이용한 국내 수집 인삼 (Panax ginseng C. A. Meyer)의 다양성 분석 (Analysis of Diversity of Panax ginseng Collected in Korea by RAPD Technique)

  • 서상덕;육진아;차선경;김현호;성봉재;김선익;최재을
    • 한국약용작물학회지
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    • 제11권5호
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    • pp.377-384
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    • 2003
  • 본 연구는 고려인삼 재래종의 유전적 차이를 RAPD marker로 평가하였다. 재래종은 우리나라 주요 인삼재배 단지인 괴산, 금산, 남원, 포천, 양주, 연천, 영주로부터 수집한 인삼에서 10개체를 임의 선발하여 사용하였다. 9개 지역의 90개체를 대상으로 RAPD분석을 한 결과 48개의 primer 중 OPA 7, OPA 13, URP 2, URP 3, UBC 3의 5개 primer가 재현성이 있고 재래종 내 개체간에도 다형성인 band를 보였다. 재래종 집단간보다 재래종 내에서 유전적 다양성이 낮았다. 재래종 집단 간 또는 재래종 집단내의 유전적 차이가 있다는 것은 이 집단들이 헤테로라는 것을 의미한다. 이러한 결과는 우리나라에서 재배중인 고려 인삼은 유전 자원의 혼합으로 헤테로라는 것을 암시한다. 선발된 5개의 primer를 이용하여 90개체를 집괴분석한 결과 국내 재래종 인삼은 5개군으로 그리고 3개의 아군으로 구분되었다. 국내 재래종 인삼은 유전적 변이가 크므로 인삼 육종을 위한 재료로 이용될 수 있을 것이다.

병렬프로그램의 경합조건을 수행 중에 효율적으로 탐지하기 위한 레이블링 기법 (A Labeling Scheme for Efficient On-the-fly Detection of Race Conditions in Parallel Programs)

  • 박소희;우종정;배종민;전용기
    • 정보처리학회논문지A
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    • 제9A권4호
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    • pp.525-534
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    • 2002
  • 병렬프로그램에서 경합 조건은 비결정적인 수행 결과를 초래하므로 디버깅을 위해 반드시 탐지되어야 한다. 이러한 경합을 수행 중에 탐지하는 기존의 기법들은 병행성 정보 생성 시에 공유 자료구조를 사용하여 심각한 병목현상을 발생시키거나, 병행성 정보 비교 시에 내포병렬성의 정도에 의존하는 비효율적인 시간 복잡도를 가진다. 본 논문에서는 개별 자료구조를 사용함으로써 병목현상을 제거하여 병행성 정보를 확장적으로 생성하며, 생성된 병행성 정보의 비교 시간을 상수적인 복잡도로 개선한 새로운 레이블링 기법을 제안한다. 그러므로 제안된 레이블링 기법의 확장성 및 효율성은 공유메모리와 메시지전달 프로그램뿐만 아니라 이를 혼합하여 사용하는 병렬프로그램에서도 효율적인 수행중 경합탐지를 가능하게 한다.

Estimation of Hybrid Vigor of Some Egyptian Single Local Hybrids of Mulberry Silkworm, Bombyx mori L.

  • Ghazy, Usama Mohamed Mohamed
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제25권2호
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    • pp.147-151
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    • 2012
  • Fifteen races resulted from silkworm breeding program at Sericulture Research Department (SRD) were used for hybridization. Fourteen hybrids were obtained and coded as; Giza C, D, R, S, T, U, A, V, W, P, H, L and Qanater 1, 2. The traits of cocoon weight, cocoon shell weight, pupal weight, cocoon shell ratio, silk productivity, fifth instar duration, total larval duration, number of cocoon per liter and pupation ratio were evaluated. Data were analyzed by using three formulae of heterosis over better, mid and check parent values. Hybrids of Giza V, C, N, Qanater 1 and 2 are promising and could be used in commercial cocoon production. Generally, there are some new hybrids can be exploited in commercial scale. Also, the local races can be evolved using the hybridization, inbreeding and selection program.

Ditching the Party: Disaggregating Split Ticket Voting in Taiwan's 2016 Legislative Election

  • Rich, Timothy S.
    • 분석과 대안
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    • 제3권1호
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    • pp.63-92
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    • 2019
  • What motivates split-ticket voting in mixed electoral systems, where voters choose one party in district races and another party on the party list ballot? While much of the literature assumes strategic intent, three aspects commonly are overlooked: the competitiveness of district races, the presence of a district candidate from one's preferred party, and whether voters know the electoral threshold for party list seats. Furthermore, few studies disaggregate types of split-ticket voting (e.g. not voting for one's preferred party in a district vs. party list). Taiwan provides an intriguing case study for analysis, not only as a relatively new adopter of a mixed system, but also the presence of additional conditions that would encourage at least the consideration of a split ticket. Using survey data from the Taiwan's Election and Democratization Studies (TEDS) after the Taiwan's 2016 Legislative Yuan election, this analysis finds that knowing the threshold, the winner's margin, and the placement of a district candidate from one's preferred party all influence split-ticket voting among those with a partisan preference. However, closer inspection identifies a distinction between defecting from the district versus the party list. Evidence shows that district competitiveness and candidate placement influences defection from the district candidate, while the electoral threshold influences defection from the party list. The results add to our understanding of strategic and non-strategic incentives in mixed systems.

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