• 정보처리학회논문지C
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• 제12C권1호
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• pp.111-120
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• 2005

이동 애드-혹 네트워크는 물리적 위치 이동이 가능한 노트들에 의해 자체적으로 형성되는 시스템으로 동적 위상을 고려한 라우팅 프로토콜을 필요로 한다 본 논문에서는 IETT의 라우팅 프로토콜 DSR을 확장한 R-DSR이라 불리는 온-디멘드 다중경로 프로토콜을 제안한다. 제안된 프로토콜에서는 DSR에 의해 구축되는 단인 경로 상의 2-홉 간격의 모든 노드들에 대해 별도의 노드론 경유하는 추가 경로가 연결된다. 수학적 분석을 통하여 DSR 관련 연구 중 가장 대표적인 방법 중의 하나인 Das의 다중경로 프로토콜보다 더 높은 메시지 전달 확률을 제공함을 보였다.

• 원예과학기술지
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• 제33권4호
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• pp.575-584
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• 2015

건조 스트레스는 작물의 생존과 생산성을 결정하는데 매우 중요한 환경요인이다. 본 연구의 목적은 배추에서 신규 건조 스트레스 저항성 유전자를 동정 검정하는 것이다. 건조 스트레스 하에서 생육된 지부('Chiifu') 배추를 이용하여 제작된 KBGP-24K 마이크로어레이 데이터 분석을 통해 738개의 건조 반응 유전자 중 기능은 밝혀져 있지 않지만, 건조 스트레스 하에서 발현량이 6배 이상 크게 증가한 1개의 유전자를 선발하여 BrDSR(B. rapa Drought Stress Resistance)이라 명명하였다. 이의 검정을 위해 내혼계배추('CT001')에서 BrDSR을 동정한 결과 438bp의 오픈리딩프레임과 145개의 아미노산을 가지고 있음을 확인하였고, 동정된 완전장의 cDNA 염기서열은 형질전환용 과발현 vector인 'pSL100' 제작에 이용하였다. BrDSR이 식물체에서 건조 스트레스 저항성을 향상시켜줄 수 있는지 분석하기 위해 담배 형질전환을 수행하였다. PCR과 DNA 블롯 분석으로 선발된 T1 세대 담배 형질전환체들을 대상으로 quantitative real-time RT PCR 분석을 수행한 결과, 형질전환체의 BrDSR 발현량은 비형질 전환체 보다 2.6배까지 증가하였다. 또한 건조처리 10일째 수행한 표현형 분석에서 BrDSR이 발현되는 담배 형질전환체들이 비형질전환체들 보다 우수한 건조 저항성을 보였다. 연구 결과들을 종합하면 BrDSR은 건조 스트레스 하에서 식물의 생장과 생존에 효과적인 저항성 기능을 할 것으로 기대된다.

• 원예과학기술지
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• 제34권1호
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• pp.102-111
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• 2016

본 연구의 목적은 BrDSR(Drought Stress Resistance in B. rapa) 유전자의 기능을 명확히 밝히고, 배추에서 건조 스트레스 반응 유전자들을 분석하는데 있다. 내혼계배추('CT001')와 BrDSR 완전장(438bp의 오픈리딩프레임)을 지닌 pSL100 vector를 재료로 아그로박테리아를 이용한 배추 형질전환을 수행하였다. PCR 분석을 통해 4개체의 형질전환체를 확보하였고, 이들의 BrDSR 발현량은 건조 스트레스 조건에서 비형질전환체 대비 약 1.9-3.4배 정도 더 큰 것으로 분석되었다. 또한 표현형 분석에서도 BrDSR이 과발현된 형질전환체들은 건조 스트레스에 저항성을 보이며 정상적인 생장을 하였다. 기 구축된 건조 스트레스 반응 유전자의 상호발현 네트워크를 기반으로 BrDSR과 밀접한 관련이 있는 유전자들을 분석하기 위해 B. rapa 135K cDNA microarray 데이터를 분석하였다. 그 결과, 환경 스트레스와 관련하여 식물체에서 잎의 노화와 자가소화에 관련된 것으로 보고된 'dark inducible 2(DIN2, AT3G60140)'와 'autophagy 8h(ATG8H, AT3G06420)' 유전자가 확인되었다. 위 결과들을 근거로 BrDSR 유전자는 건조 스트레스에 대한 저항성 향상에 중요한 역할을 할 것으로 판단되었다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제34권2호
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• pp.399-406
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• 2024

Lactiplantibacillus plantarum DSR330 (DSR330) has been examined for its antimicrobials production and probiotics. In this study, the hepatoprotective effects of DSR330 were examined against nonalcoholic fatty liver disease (NAFLD) in a high-fat diet (HFD)-fed C57BL/6 mouse model. To induce the development of fatty liver, a HFD was administered for five weeks, and then silymarin (positive control) or DSR330 (10⁸ or 10⁹ CFU/day) was administered along with the HFD for seven weeks. DSR330 significantly decreased body weight and altered serum and hepatic lipid profiles, including a reduction in triglyceride, total cholesterol, and low-density lipoprotein cholesterol levels compared to those in the HFD group. DSR330 significantly alleviated HFD-related hepatic injury by inducing morphological changes and reducing the levels of biomarkers, including AST, ALT, and ALP. Additionally, DSR330 alleviated the expression of SREBP-1c, ACC1, FAS, ACO, PPARα, and CPT-1 in liver cells. Insulin and leptin levels were decreased by DSR330 compared to those observed in the HFD group. However, adiponectin levels were increased, similar to those observed in the ND group. These results demonstrate that L. plantarum DSR330 inhibited HFD-induced hepatic steatosis in mice with NAFLD by modulating various signaling pathways. Hence, the use of probiotics can lead to hepatoprotective effects.

• 전기전자학회논문지
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• 제5권1호
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• pp.67-74
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• 2001

본 논문은 기존 DSR 알고리즘의 경로에러 발견 시 경로 복구 처리과정을 개선하기 위한 방법을 제안한다. 이동 Ad Hoc 망에서는 이동 노드들 자체가 라우터의 기능을 가지기 때문에 두 이동 노드들 간에 경로설정을 위해 잘 정의된 라우팅 프로토콜이 필수적이다. 그러나 기존의 DSR 라우팅 프로토콜은 경로에러 발생 시, 복구 지연으로 인해 패킷이 폐기되는 문제점을 갖고 있다. 그 문제점을 개선하기 위해서 본 논문에서는 경로에러 복구시간을 단축할 수 있도록 개선된 DSR 프로토콜을 제안하고 시뮬레이션을 통해 평가하였다. 평가 결과, 제안한 DSR 프로토콜은 기존의 DSR 프로토콜에 비해 시나리오에 따라 대략 4배에서 30배 빠른 경로에러복구 시간을 제공함을 확인하였다.

• Imaging Science in Dentistry
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• 제47권2호
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• pp.99-107
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• 2017

Purpose: Erosions and osteophytes are radiographic characteristics that are found in different stages of temporomandibular joint (TMJ) osteoarthritis. This study assessed the effectiveness of digital subtraction radiography (DSR) in diagnosing simulated osteophytes and erosions in the TMJ. Materials and Methods: Five intact, dry human skulls were used to assess the effectiveness of DSR in detecting osteophytes. Four cortical bone chips of varying thicknesses (0.5 mm, 1.0 mm, 1.5 mm, and 2.0 mm) were placed at the medial, central, and lateral aspects of the condyle anterior surface. Two defects of varying depth (1.0 mm and 1.5 mm) were created on the lateral, central, and medial poles of the condyles of 2 skulls to simulate erosions. Panoramic images of the condyles were acquired before and after artificially creating the changes. Digital subtraction was performed with Emago dental image archiving software. Five observers familiar with the interpretation of TMJ radiographs evaluated the images. Receiver operating characteristic (ROC) analysis was used to evaluate the diagnostic accuracy of the imaging methods. Results: The area under the ROC curve (Az) value for the overall diagnostic accuracy of DSR in detecting osteophytic changes was 0.931. The Az value for the overall diagnostic accuracy of panoramic imaging was 0.695. The accuracy of DSR in detecting erosive changes was 0.854 and 0.696 for panoramic imaging. DSR was remarkably more accurate than panoramic imaging in detecting simulated osteophytic and erosive changes. Conclusion: The accuracy of panoramic imaging in detecting degenerative changes was significantly lower than the accuracy of DSR (P<.05). DSR improved the accuracy of detection using panoramic images.

• 한국재료학회지
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• 제22권11호
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• pp.581-586
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• 2012

The microstructure and mechanical properties of a copper alloy sheet processed by differential speed rolling (DSR) were investigated in detail. A copper alloy with thickness of 3 mm was rolled to a 50% reduction at ambient temperature without lubrication and with a differential speed ratio of 2.0:1. For comparison, conventional rolling (CR), in which the rolling speeds of the upper and lower rolls is 2.0 m/min, was also performed under the same rolling conditions. The shear strain of the sample processed by CR showed positive values at the positions of the upper roll side and negative values at the positions of the lower roll side. On the other hand, the sample processed by the DSR showed zero or positive shear strain values at all positions. However, the microstructure and mechanical properties of the as-rolled copper alloys did not show such significant differences between the CR and the DSR. The samples rolled by the CR and the DSR exhibited a typical deformation structure. In addition, the DSR processed samples showed a typical rolling texture in which {112}<111>, {011}<211> and {123}<634> components were developed at all positions. Therefore, it is concluded that the DSR was very effective for the introduction of a uniform microstructure throughout the thickness of the copper alloy.

• 한국식품영양과학회지
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• 제22권3호
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• pp.262-265
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• 1993

두부 제조공정 중의 부산물인 비지의 효율적인 이용을 위하여, 유기용매를 이용하여 건조시킨 비지를 원료 대두 중량의 10%가 되게 첨가하여 제조한 두부의 dietary fiber 함량과 탄수화물 소화율을 측정하였다. 또한 두부 제조 공정 각 단계별 시료의 소화율과 섬유소함량도 아울러 측정하였다. 전통적인 방법으로 제조한 두부와 비지첨가두부를 제외하고는 원료대두를 비롯한 전 시료중의 가용성 섬유 및 불용성 섬유의 비율은 1 : 3.5(w/w, 건물중량 기준)이었으며 비지제품은 각 섬유소의 함량이 상대적으로 원료 대두보다 1.5~2.5배 증가하였다. 또한 섬유소의 함량이 극히 적었던 전통두부에 건조비지를 첨가하면 불용성 및 가용성 섬유소가 각각 30%와 45%씩 증가하여 두부에서도 섬유의 영양적 효과를 기대할 수 있었다 탄수화물의 소화율은 비지의 경우 10%를 넘지 못하는 수준이었으며 전통두부 역시20% 정도였다. 비지 첨가 두부의 탄수화물 소화율도 비지의 소화율과 별차이를 보이지 않았다. (12.5%). 두부 및 관련 제품들의 탄수화물 소화율과 식이 섬유소 함량과의 상관관계가 역의 상관관계 r =-0.9243)를 보였다.

• 미생물학회지
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• 제44권2호
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• pp.147-155
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• 2008

한국의 시화호와 중국의 Aha호 저질토에서 서식하는 황산염 환원세균(sulfate reducing bacteria, SRB)의 깊이에 따른 군집구조를 비교하기 위하여, 이화성 아황산염 환원효소(EC 1.8.99.1; dissimilatory sulfite reductase, dsr) 유전자를 대상으로, polymerase chain reaction (PCR), denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) 및 클론 라이브러리를 이용하여 미생물의 군집구조를 분석하였다. DGGE band 양상을 분석한 결과, Aha호 보다는 시화호에서 더 맡은 밴드를 보여 다양성이 높았고, 깊이별 차이는 나타나지 않았다. 두 서식지에서 얻은총68개 클론의 염기서열을 가지고 계통학적 분석을 한 결과 시화호에서는 Deltaproteobacteria 그룹, Firmicutes 그룹에 속해있는 Desulfotomaculum 종과 archaeal thermophilic SRB 그룹에 속해있는 Archaeoglobus 종이, Aha호에서는 Desulfotomaculum 그룹과 유사성이 높았다. 분리된 대부분의 클론들(59%)은 배양된 황산염 환원세균과는 매우 낮은 유사도를 보였고, 환경에서 분리된 클론들과도90% 이하의 유사도를 나타냈다. 총 클론을 88% 유사도를 기준으로 9그룹으로 나뉘었을 때 시하호와 Aha호의 각 클론은 서로 다른 그룹으로 존재하였다. 이러한 결과는 두 서식지의 이화성 아황산염 환원효소를 가지고 있는 미생물의 군집구조는 확연히 다르고 각 서식지에 특이적인 황산염 환원 미생물이 존재함을 시사한다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제33권9호
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• pp.1228-1237
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• 2023

The CRISPR-Cas system has emerged as the most efficient genome editing technique for a wide range of cells. Delivery of the Cas9-sgRNA ribonucleoprotein complex (Cas9 RNP) has gained popularity. The objective of this study was to develop a quantitative polymerase chain reaction (qPCR)-based assay to quantify the double-strand break reaction mediated by Cas9 RNP. To accomplish this, the dextransucrase gene (dsr) from Leuconostoc citreum was selected as the target DNA. The Cas9 protein was produced using recombinant Escherichia coli BL21, and two sgRNAs were synthesized through in vitro transcription to facilitate binding with the dsr gene. Under optimized in vitro conditions, the 2.6 kb dsr DNA was specifically cleaved into 1.1 and 1.5 kb fragments by both Cas9-sgRNA365 and Cas9-sgRNA433. By monitoring changes in dsr concentration using qPCR, the endonuclease activities of the two Cas9 RNPs were measured, and their efficiencies were compared. Specifically, the specific activities of dsr365RNP and dsr433RNP were 28.74 and 34.48 (unit/㎍ RNP), respectively. The versatility of this method was also verified using different target genes, uracil phosphoribosyl transferase (upp) gene, of Bifidobacterium bifidum and specific sgRNAs. The assay method was also utilized to determine the impact of high electrical field on Cas9 RNP activity during an efficient electroporation process. Overall, the results demonstrated that the qPCR-based method is an effective tool for measuring the endonuclease activity of Cas9 RNP.