• 한국잠사곤충학회지
• /
• 제22권1호
• /
• pp.26-45
• /
• 1980

가잠의 견사물질 생성능력에 대한 견사선의 특이성을 구명코저 견사생산성이 다른 8개 원종과 그 F$_1$교잡종에 대하여 견사선의 성장 및 조직학적 특성, 후부견, 사선의 RNA 및 DNA합성과 그 아미노산조성 등을 조사한 결과 다음과 같을 결론을 얻었다. 1) 견사생성량이 다론 가잠품종간 F$_1$ 교배조를 만들 경우 다사량 품종은 5령유충기의 잠체중대 견사선중비 및 견사선중대 견사생성량비가 다사량 품종에 비하여 증가되었다. 2) 후부견사선의 조직학적 관찰에서 견사물질합성이 활발히 전개될 때는 세포핵의 크기 및 분지가 증대하고 5령 96시간째 세포핵의 형태에 있어서 견사생성량이 가장 적은 품종인 $N_2$ 및 $C_{60}$의 세포핵은 잠107, 잠108 등의 것에 비하여 크기가 작고 단순한 형태를 취하였다. 3) 가잠 후부견사선의 RNA함유율은 다사량계 품종이 소사량계 품종에 비하여 높았고 잠품종간 F$_1$ 교배조를 만들 경우 견사생성량과 RNA 함유율은 정상관으로 비례하였다. 4) 가잠 5령유충기중 5령 3일을 전후(2일~4일) 한 후부견사선의 RNA 및 DNA 생성량의 증가율은 다사량계품종이 소사량계에 비하여 약 30%정도 높았다. 5) 가잠 5령유충기(2~4일)의 후부견사선에 있어서 DNA에 의한 RNA 생성효율은 다사량계가 소사량 계품종에 비하여 높았다. 6) 다사량계 잠품종의 후부견사선 DNA 생성량은 5령 4일째 374$\mu\textrm{g}$/두인데 비하여 소사량계품종은 199$\mu\textrm{g}$로서 약 53%정도이었다. 7) 가잠 후부견사선의 아미노산 조성에 있어서 함유량이 가장 높은 것은 Alanine 34.8%이며 Glycine 22.8%, Serine 9.1%, Tyrosine 7.3%의 순으로서 견사 fibroin의 아미노산조성과는 달리 Glycine 함량이 Alanine에 비하여 적었다. 8) 가잠 원종과 교잡종의 후부견사선 아미노산 조성에 있어서 Valine, Isoleucine, Leucine, Phenylalanine, Lysine, Histidine 및 Arginine등 잠체성장에 대한 영양성 아미노산은 원종에 비교적 많이 함유되었고 Glycine Serine, Aspartic acid, Glutamic acid등 비영양성 아미노산과 Threonine은 F$_1$ 교잡종에 비교적 많이 함유되었다. 9) 견사 생성량이 다른 가잠 품종간의 F$_1$ 교배조에 있어서 후부견사선의 아미노산조성중 G.A.S.(Glycine+Alanine+Serine)함량은 다사량 품종일수록 증가되었다.

• 한국어류학회지
• /
• 제33권4호
• /
• pp.226-239
• /
• 2021

좀볼락 (Sebastes minor), 세줄볼락 (Sebastes trivittatus), 황볼락 (Sebastes owstoni) 및 노랑볼락 (Sebastes steindachneri)은 한국 동해 중부 이북해역에 서식하는 동해안 특산 어종이다. 이들 동해안 특산 볼락류의 분자진화를 이해하기 위하여 좀볼락과 세줄볼락의 미토콘드리아 유전체 (미토게놈)를 해독하였고, 한반도 주변 해역에 출현하는 16종 볼락의 미토게놈과 비교하였다. 좀볼락 및 세줄볼락의 미토게놈 전체 크기는 각각 16,408 bp 및 16,409 bp이었으며, 37개의 유전자 (13개의 단백질 코딩 유전자, 2개의 리보솜 RNA 유전자 및 22개의 tRNA 유전자)와 1개의 비암호화 영역으로 이루어져 있었다. 동해안 특산 볼락에 속하는 좀볼락, 세줄볼락, 황볼락 및 노랑볼락의 미토게놈을 분석한 결과, 유전체 구조, 뉴클레오티드 구성, 유전자 배열 등에서 매우 유사한 특징을 가지고 있었다. 또한 비암호화 영역인 조절영역에 잘 보존된 "ATGTA" 모티프(motif) 2개가 존재하는 것이 확인되었고, 특정 염기서열의 반복(tandem repeats)은 발견되지 않았다. 이들 동해안 특산 볼락류 4종의 미토게놈 염기서열 간에 차이는 단백질 코딩 유전자 영역보다 조절영역에서 더 큰 것으로 나타났다. 한반도 주변 해역에 출현하는 볼락속 어류의 미토게놈 정보를 이용하여 분자계통학적 유연관계를 분석한 결과, 16종의 볼락을 4개의 클러스터(cluster)로 그룹화할 수 있었고, 이 중에서 동해안 특산 볼락류 4종은 3개의 클러스터에 속해 있었다. 황볼락(S. owstoni)은 흰꼬리볼락(S. longispinis), 우럭볼락(S. hubbsi), 개볼락(S. pachycephalus), 황점볼락(S. oblongus), 황해볼락 (S. koreanus), 조피볼락 (S. schlegelii) 및 탁자볼락(S. taczanowskii)과 동일한 클러스터에 속하고, 세줄볼락 (S. trivittatus)은 누루시볼락 (S. vulpes)과 동일한 유전적 분기군으로 나타났다. 동해안 특산 볼락류 4종 중에서 좀볼락(S. minor)과 노랑볼락(S. steindachneri)은 동일한 클러스터로 분류되어 유연관계가 가장 높은 것으로 나타났다. 본 연구의 결과는 한국 동해 중부해역에 서식하는 볼락류의 진화양상을 이해하거나, Sebastidae 어류의 유전적 진화연구에 유용한 정보로 활용될 수 있을 것으로 판단된다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
• /
• 제32권7호
• /
• pp.949-955
• /
• 2019

Objective: The present study was to investigate the association of polymorphisms in exon-9 of the bone morphogenetic protein receptor-1B (BMPR-1B) gene (C864T) with litter size in 240 Dorset, 232 Mongolian, and 124 Small Tail Han ewes. Methods: Blood samples were collected from 596 ewes and genomic DNA was extracted using the phenol: chloroform extraction method. The 304-bp amplified polymerase chain reaction product was analyzed for polymorphism by single-strand conformation polymorphism method. The genotypic frequency and allele frequency of BMPR-1B gene exon-9 were computed after sequence alignment. The ${\chi}^2$ independence test was used to analyze the association of genotypic frequency and litter size traits with in each ewe breed, where the phenotype was directly treated as category. Results: The results indicated two different banding patterns AA and AB for this fragment, with the most frequent genotype and allele of AA and A. Calculated Chi-square test for BMPR-1B gene exon-9 was found to be more than that of p value at the 5% level of significance, indicating that the population under study was in Hardy-Weinberg equilibrium for all ewes. The ${\chi}^2$ independence test analyses indicated litter size differences between genotypes was not the same for each breed. The 304-bp nucleotide sequence was subjected to BLAST analysis, and the C864T mutation significantly affected litter size in singletons, twins and multiples. The heterozygosity in exon-9 of BMPR-1B gene could increase litter size for all the studied ewes. Conclusion: Consequently, it appears that the polymorphism BMPR-1B gene exon-9 detected in this study may have potential use in marker assisted selection for litter size in Dorset, Mongolian, and Small Tail Han ewes.

• 원예과학기술지
• /
• 제28권6호
• /
• pp.1025-1038
• /
• 2010

당근($Daucus$ $carota$ L. var. $sativa$)은 세계적으로 널리 이용되는 작물 중 하나이다. 또한 Vitamin A의 전구체인 ${\beta}$-carotene의 함량이 높아 영양적으로도 주요한 작물이다. 하지만 종자 표피세포에서 생성되는 종자모는 종자발아시 흡수를 저해하며 발아를 억제하여 기계적인 제모작업을 거쳐 상품화되고 있다. 이러한 과정에서 발생하는 여러가지 단점을 보완하기 위해 무모종자 당근 품종의 육종이 필요하다. 따라서 본 연구는 단모종자 표현형 CT-ATR615 OP 666-13 개체와 control 유모종자 표현형 CR-ATR615 OP-CK1-9개체의 종자 cDNA library를 작성하여 EST sequence비교를 통해 표현형의 차이에 따라 종자모 형성에 관련하여 발현양상을 비교 분석하였다. BlastX 결과를 바탕으로 개체간 동일한 결과를 제외한 EST sequence를 각각 FunCat 기능별 category로 분류하였다. Metabolism category에서 단모종자 표현형 개체가 오히려 유모종자 표현형 개체보다 높은 발현량을 보이는 것을 확인하였으며, 단모 및 장모종자 개체간의 protein folding and stabilization, subcellular localization category에서 나타난 뚜렷한 발현량 차이는 종자모 형성에 많은 영향을 미치는 것으로 예측되었다. 또한 분석된 EST sequece를 바탕으로 개체별로 각각 50개 및 59개의 SSR site를 확인하였으며, 각각 2개씩의 SNP site를 확인하였다. 이들 SSR 및 SNP site의 primer 작성하여 마커로 개발하였으며, 이를 종자모 형성에 관련된 분자마커 개발에 이용하는 것은 물론 당근의 계통 분류 및 여러가지 형질 관련 분자 마커 연구에 활용 가능할 것으로 기대된다.

• The Korean Journal of Ecology
• /
• 제22권1호
• /
• pp.39-43
• /
• 1999

중금속에 대한 내성을 나타낸 Serratia marcescens를 이용하여 카드뮴 흡착 기작에 관하여 조사하였다. 먼저 카드뮴에 대하여 민감성을 나타내는 돌연변이 균주인 PM을 개발하였으며 PM균주는 50ppm 이상의 카드뮴 농도에서 성장하지 못하였다. 카드뮴을 50ppm 처리한 균주에서 10회 이상 계대 배양하여 카드뮴에 적응을 유도한 PA균주는 PC, PM균주에 비해 성장 속도가 증가하였으며 세포 내 카드뮴 축적량도 4∼5배 증가하였다. PA균주는 100 ppm 카드뮴 처리군에서 처리량 중 23%를 세포내에 축적하였으며 세포막 부위보다 세포질 부위에 더욱 많은 카드뮴을 축적하였다. 카드뮴 처리시, 전 세포 단백질 양상에서 28 KDa과 64 KDa의 2개의 유도 단백질과 45 KDa의 감소 유도 단백질을 확인하였으며 원자 흡광 분석을 통하여 각각의 유도 단백질에 결합된 카드뮴 양은 단백질 1 g당 318.25 ㎍, 325.37 ㎍이 검출되었다. 세포내에 축적된 카드뮴을 전자현미경을 이용하여 카드뮴 결합 물질을 확인한 결과, 세포질의 단백질 분획에서 28 KDa크기의 유도 단백질이 카드뮴과 흡착한 것으로 나타났다. 카드뮴 흡착에 대한 DNA조사 결과 20 Kb 크기의 plasmid가 존재하였으며, curing agent로 plasmid를 제거한 결과 카드뮴 내성을 상실하여 본 분리 균주의 카드뮴 내성 유전자는 plasmid상에 위치하는 것으로 확인하였다.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
• /
• 제16권4호
• /
• pp.301-307
• /
• 2012

Olive flounder Paralichthys olivaceus is one of the most widely cultured fish species in Korea. Although olive flounder receive attention from aquaculture and fisheries and extensive research has been conducted eye morphological change in metamorphosis, but little information was known to molecular mechanism and gene expression of eye development- related genes during the early part of eye formation period. For the reason of eyesight is the most important sense in flounder larvae to search prey, the screening and identification of expressed genes in the eye will provide useful insight into the molecular regulation mechanism of eye development in olive flounder. Through the search of an olive flounder DNA database of expressed sequence tags (EST), we found a partial sequence that was similar to crystallin beta A1 and gamma S. Microscopic observation of retinal formation correspond with the time of expression of the crystallin beta A1 and gamma S gene in the developmental stage, these result suggesting that beta A1 and gamma S play a vital role in the remodeling of the retina during eye development. The expression of crystallin beta A1 and gamma S were obviously strong in eye at all tested developing stage, it is also hypothesized that crystallin acts as a molecular chaperone to prevent protein aggregation during maturation and aging in the eye.

• The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
• /
• 제25권4호
• /
• pp.307-319
• /
• 2021

Dysregulation of the Wnt pathway causes various diseases including cancer, Parkinson's disease, Alzheimer's disease, schizophrenia, osteoporosis, obesity and chronic kidney diseases. The modulation of dysregulated Wnt pathway is absolutely necessary. In the present study, we evaluated the anti-inflammatory effect and the mechanism of action of Wnt-C59, a Wnt signaling inhibitor, in lipopolysaccharide (LPS)-stimulated epithelial cells and macrophage cells. Wnt-C59 showed a dose-dependent anti-inflammatory effect by suppressing the expression of proinflammatory cytokines including IL6, CCL2, IL1A, IL1B, and TNF in LPS-stimulated cells. The dysregulation of the Wnt/β-catenin pathway in LPS stimulated cells was suppressed by WntC59 treatment. The level of β-catenin, the executor protein of Wnt/β-catenin pathway, was elevated by LPS and suppressed by Wnt-C59. Overexpression of β-catenin rescued the suppressive effect of Wnt-C59 on proinflammatory cytokine expression and nuclear factor-kappa B (NF-κB) activity. We found that the interaction between β-catenin and NF-κB, measured by co-immunoprecipitation assay, was elevated by LPS and suppressed by Wnt-C59 treatment. Both NF-κB activity for its target DNA binding and the reporter activity of NF-κB-responsive promoter showed identical patterns with the interaction between β-catenin and NF-κB. Altogether, our findings suggest that the anti-inflammatory effect of Wnt-C59 is mediated by the reduction of the cellular level of β-catenin and the interaction between β-catenin and NF-κB, which results in the suppressions of the NF-κB activity and proinflammatory cytokine expression.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
• /
• 제17권2호
• /
• pp.262-270
• /
• 2007

Of the twelve lytic bacteriophages recovered from five different fermenting cucumber tanks that were inoculated with Pediococcus sp. LA0281, a lytic phage, ${\phi}ps05$, was characterized in the present study. The plaques were mostly clear and round-shaped on the lawn of starter strain, indicating lytic phage. Overall appearance indicated that it belongs to the Siphoviridae family or Bradley's group B1, with a small isometric head and a flexible noncontractile tail with swollen base plate. The average size was found to be 51.2 nm in head diameter and 11.6 nm wide ${\times}$ 129.6 nm long for the tail. The single-step growth kinetics curve showed that the eclipse and the latent period were 29 min and 34 min, respectively, and an average burst size was calculated to be 12 particles per infective center. The optimum proliferating temperature ($35^{\circ}C$) was slightly lower than that of cell growth ($35\;to\;40^{\circ}C$). The structural proteins revealed by SDS-PAGE consisted of one main protein of 33 kDa and three minor proteins of 85, 58, and 52 kDa. The phage genome was a linear double-stranded DNA without cohesive ends. Based on the single and double digestion patterns obtained by EcoRI, HindIII, and SalI, the physical map was constructed. The overall size of the phage genome was estimated to be 24.1 kb. The present report describes the presence of a lytic phage active against a commercial starter culture Pediococcus sp. LA0281 in cucumber fermentation, and a preliminary study characterizes the phage on bacterial successions in the process of starter-added cucumber fermentation.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
• /
• 제14권5호
• /
• pp.3309-3314
• /
• 2013

Spleen tyrosine kinase (SYK) is a non-receptor type cytoplasmic protein and a known tumor suppressor gene in breast cancer. Polymorphisms in SYK have been reported to be associated with cell invasion/cell morality and an increased risk of cancer development. In this case control study, all exons of the SYK gene and its exon/ intron boundaries were amplified in 200 breast cancer cases and 100 matched controls and then analyzed by single stranded conformational polymorphism. Amplified products showing altered mobility patterns were sequenced and analyzed. Twelve variations were identified in exonic and intronic regions of DNA encoding SH2 domain and kinase domain of the SYK gene. All of these mutations are novel. Among them, 5 missense mutations were observed in exon 15 while one missense mutation was found in exon 8. In addition to these mutations, six mutations were also identified in intronic regions. We found a significant association between SYK mutations and breast cancer and observed that Glu241Arg, a missense mutation is associated with an increase risk of ~7 fold (OR=6.7, 95% CI=1.54-28.8), Thr581Pro (missense mutation) is associated with increased risk of ~16 fold (OR=15.5, 95%CI=2.07-115.45) and 63367 T>G (missense mutation) is associated with increased risk of ~13 fold (OR=12.8, 95%CI=1.71-96.71) for breast cancer. Significant associations were observed for each of these variations with both late menopause (p<0.01) and early menarche (p<0.005) cases when compared to controls. Our findings suggest that the polymorphic gene SYK may contribute to the development of breast cancer in at least the Pakistani population. This study provides an insight view of SYK which may provide a significant finding for the pharmaceutical and biotechnology industry.