Proceedings of the Korean Nutrition Society Conference
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2002.06a
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pp.613-616
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2002
락토페린은 주로 유즙에 많이 포함되어 있으며 인간분비물 등에서도 발견되는 당단백질로써, 미생물 감염에 대한 방어작용이 있는 것으로 알려져 있다. 락토페린의 미생물에 대한 방어작용은 미생물 성장에 필요한 철이온이 락토페린에 결합하여 성장을 저해하기 때문인 것으로 알려져 있다. 락토페린은 이외에도 염증반응의 조절, 임파세포의 성장촉진 등 면역반응에도 관여하는데 이러한 활성은 철에 결합하는 성질과는 무관하게 일어나며 락토페린이 DNA에 결합하는 성질과 관련이 있는 것으로 추측되어진다. 락토페린은 DNA에 결합하여 유전자의 전사에 관여할 것으로 여겨지는데 그 동안 어떤 유전자의 발현에 관여하는지에 대해서 알려진 바가 없었다. 최근 본 연구팀은 락토페린이 포유세포의 세포유전자의 전사에 관여하는지를 분석한 결과 락토페린 결합부위를 가지고 있는 유전자중의 하나인 인간 인터루킨-1$eta$ 유전자의 전사를 활성화시킨다는 연구 결과를 보여 주었다. 인간 myelogenous leukaemia 세포주인 K562 세포를 락토페린과 phorbol myristate acetate(PMA)로 함께 처리하면 K562 세포의 인터루킨-1$\beta$ mRNA의 양은 PMA 단독으로 처리하였을 때 보다 상승적으로 더 많이 유도됨을 보여주었다. 또한 IL-1$\beta$/Luciferase 융합 유전자를 K562 배양세포에 넣어 전사 활성을 비교함으로써 락토페린에 의한 인터루킨-1$\beta$의 전사활성을 확인하였다. 락토페린을 전체, N-말단, 혹은 C- 말단 부위를 COS-1 세포에 발현시켜 전사 활성을 측정한 결과 C-말단 쪽은 전사활성이 없었으나 N-말단 90개 아미노산 부위(NIa라 명명)가 전사활성을 가지고 있음을 규명하였다. 본 연구결과는 락토페린이 인터루킨-I$\beta$의 유전자의 전사에 역할을 하고 있음을 보여 주고 있으며 또한 인터루킨-1$\beta$의 유전자 외에도 락토페린 결합 부위를 유전자의 조절부위에 포함하고 있는 세포 유전자의 전사도 관여할 수 있음을 제시하고 있다.
Ryu, Jea Woon;Lee, Sang Cheol;Yoo, Jaesoo;Kim, Hak Yong
The Journal of the Korea Contents Association
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v.13
no.8
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pp.466-473
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2013
Gene expression is regulated by a wide range of mechanisms at the DNA sequence level. In addition, gene expression is also regulated by epigenetic mechanisms through DNA methylation, histone modification, and ncRNA. To understand the regulation of gene expression at the epigenetic level, we constructed aging related gene database and analyzed epigenetic properties that are focused on DNA methylation. The DNA methylation of promoter or upstream region of the genes induces to repress the gene expression. We compared and analyzed distribution between whole human genes and aging related genes in the epigenetic properties such as CGI distribution, methylation motif pattern, and TFBS (transcription factor binding site) distribution. In contrast to methylation motif pattern, CGI and TFBS distributions are positively correlated with epigenetic regulation of aging related gene expression. In this study, the epigenetic data about DNA methylation of the aging genes will provide us to understand phenomena of the aging and epigenetic mechanism for regulation of aging related genes.
Park, Jun-Kyu;Kim, Dong-gon;Choi, Changyong;Jang, Mi-Kyeong;Nah, Jae-Woon
Applied Chemistry for Engineering
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v.18
no.6
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pp.607-611
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2007
To improve transfection efficiency, we prepared histidine-low molecular weight water-soluble chitosan (LMWSC) having the potential to form complex with DNA as a cationic polymer. Histidine-LMWSC was synthesized by the esterification reaction and removing phthaloyl group. The histidine-LMWSC was characterized using FT-IR, $^1H$ NMR spectra. Histidine-LMWSC was complexed with plasmid DNA (pDNA) in various polymer/DNA (N/P) weight ratios, and the complex was identified using gel retardation assay. The particle sizes of the hisitidine-LMWSC/DNA complexes were measured on a DLS instrument by fixing the histidine-LMWSC/DNA weight ratio of 10/1. Owing to the utilization of a large excess amount of cationic LMWSC against anionic DNA, the particle size of histidine-LMWSC/DNA complexes was in the range of 100~200 nm. Therefore, histidine-LMWSC will be useful in the development of gene carriers.
본고에서는 바이오 기술(BT: Bio Technology)의 주요 소재인 DNA(DeoxyriboNucleic Acid, 디옥시리보핵산)를 정보기술(IT: Information Technology)과 나노 기술(NT: Nano Technology)에 적용한 세 가지 DNA 응용 기술 동향에 대해 소개하였다. 먼저 1958년 프랜시스 크릭(Francis Crick)이 주장한 센트럴 도그마(Central Dogma)의 출발점인 DNA의 구조와 기능에 대해 최대한 자세히 소개하였고, DNA의 염기 서열 방식을 이용한 DNA 저장장치에 관해 설명하였다. 그다음 장에서는 DNA의 자기 조립(Self-Assembly) 능력과 자기 복제 능력 및 다른 분자를 인식하여 결합하는 특성을 정보기술에 적용한 DNA 컴퓨터에 대해 설명하였다. 마지막으로, 나노 단위의 DNA 구조를 응용한 나노 기술 중에서 다양한 나노구조물을 만드는 기술인 DNA 오리가미 기술에 대해 설명하였다.
Proceedings of the Korean Institute of Electrical and Electronic Material Engineers Conference
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2009.11a
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pp.247-247
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2009
반도체 집적회로의 고질적화와 고성능화를 위한 기본소자의 미세화 및 단위공정의 개선이 필요하다. 이를 위해서 본 연구에서는 자기조립특성을 가지는 DNA분자를 형틀로 이용한 황화구리 나노선의 합성 및 배열기술을 연구하였다. DNA 나노구조물을 기반으로 다양한 형태의 나노구조물 형성이 가능하다는 장점과 반도체성 물질인 황화구리와의 결합 특성을 이용하여 나노선 및 나노소자를 제작하는 기술을 확보하였다.
Proceedings of the Korean Institute of Electrical and Electronic Material Engineers Conference
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2009.11a
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pp.246-246
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2009
반도체 집적회로의 고집적화와 고성능화를 위한 기본소자의 미세화 및 단위공정의 개선이 필요하다. 이를 위해서 본 연구에서는 자기조립특성을 가지는 DNA분자를 형틀로 이용한 CdSe 나노입자들의 위치제어 및 배열기술을 연구하였다. DNA 나노구조물을 기반으로 다양한 형태의 나노구조물 형성이 가능하다는 장점과 발광물질 CdSe 나노입자와의 결합 특성을 이용하여 나노선 및 나노소자를 제작하는 기술을 확보하였다.
Proceedings of the Korean Aquaculture Society Conference
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2003.10a
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pp.25-25
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2003
어류의 번식활동은 뇌-뇌하수체-생식소로 이어지는 내분비기관이 주로 담당하고 있으며, 그 중에서 뇌하수체에서 만들어지는 생식선자극호르몬 (GTH)은 생식소 발달에 매우 중요한 역할을 한다. 한편, GTH는 생식소에서 생성되는 스테로이드호르몬에 의해 유전자의 발현이 조절된다. 본 연구에서는 산천어 (Oncorhynchus masou)의 GTH 유전자발현에 미치는 estradiol-17$\beta$ (E2)의 영향을 생체내에서 먼저 조사하고, 유전자발현조절의 메카니즘을 구명하기 위하여 에스트로젠 수용체 (ER)의 cDNA를 cloning하였다. 또한 내분비교란물질로 알려져 있으며 에스트로젠 수용체와의 유사결합작용이 알려진 노닐페놀 (NP)의 영향도 아울러 조사하였다. 미성숙 산천어를 E2 및 NP (각각 5 mg/kg 및 10 mg/kg 체중)로 처리하면 72 시간째에 뇌하수체내의 $\beta$-actin mRNA에 비해 GTH (FSH$\beta$, LH$\beta$) mRNA가 상대적으로 증가하는 경향을 나타내었다. 뇌하수체에서 분리한 ER의 기본적인 구조는 DNA결합도메인 (Zf-C4), 호르몬결합도메인 (hormone_rec), 기타 전사활성화도메인으로 구성되어 있었으며 (그림 1), 기존에 보고된 에스트로젠 수용체중에서 무지개송어 및 대서양연어의 ER과 각각 98%, 96%의 높은 상동성이 관찰되었다. 향후, 준비된 ER을 재료로 하여 GTH 유전자발현의 호르몬의존성을 조사할 예정이다.
Molecular Orbital calculations using the SC-MEH method have been carried out for the interaction of Adenine, Guanine and Cytosine as DNA base and diaminecytosineplatinum(DCP) in various conformations. The results showed that the order of DCP binding to the DNA bases was guanine > adenine > cytosine and the stabilization energy of cis-isomer was larger than that of trans-isomer in the adenine-DCP complexes system. Furthermore, platinum(II) binding to DNA bases markedly gives rise to change of atomic charge in DNA bases ring, which can explain anti-tumor activity of platinum complex.
Column-purified double-stranded RNA binding factor (RBF) protein was tested for its binding affinity for the different forms of nucleic acids structure such as single-stranded(ss) and double-stranded(ds)RNA and ss- and dsDNA. The RBF protein was incubated with each of these nucleic acid structures in separate reactions and its comparative binding affnity was visualized by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. The RBF protein bound to the dsRNA molecule to form a tight RNA:protein complex in agreement with previous studies, but not to the other nucleic acid molecules confirming its distinctive affinity for the dsRNA structure. In phosphorylation assay in vito, the purified RBF protein significantly inhibited the autophosphorylation of the PKR derived from not only human but mouse source in the presence of poly(I):poly(C). It is suggesting that PKR vs. RBF is similarly under a competitive interaction among different eukaryotic organisms during protein synthesis.
Deinococcus radiodurans RecA protein, when bound to DNA, exhibits a DNA-dependent ATPase. In the absence of DNA, the rate of RecA protein-promoted ATP hydrolysis drops 1,000-fold under the physiological concentrations of salt. This DNA-independent activity can be stimulated to levels approximating those observed with DNA by adding high concentrations (approximately 1.6 M) of a wide variety of salts. This effect was characterized by varying salt concentration and comparing the effects of different ion types. The higher concentrations of salt stimulated the ATP hydrolysis by RecA protein in the absence of DNA. At 1.6 M chloride, the observed stimulation showed the following cation trend $K^+{\geq}Na^+$ > $NH_4^+$ and the following anion sequence was observed: $glutamate^- \; > \; C1^- \;> \; acetate^-\; > \;PO_4^-$ at 1.6 M $K^+$. The catalytic properties of the salt-stimulated ATP hydrolysis reaction was optimal between pH 7.0 and 8.0, which was similar to the double stran nded DNA-dependent ATPase activities of Deinococcus radiodurans RecA protein. In the absence of DNA the active species for ATP hydrolysis by RecA protein was shown to be an aggregate of three RecA protein molecules.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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