• 미생물학회지
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• 제36권3호
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• pp.192-195
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• 2000

백색부후균류 laccase의 아미노 말단과 카복시 말단에 잘 보존된 구리결합부위를 암 호화하는 DNA 염기서열과 상보적인 primer를 이용하여 백색부후균의 일종인 영지버섯 Gandoderma lucidum에서 laccase 유전자 단편을 분리하였다. PCR 로 증폭하여 클로닝한 1.6 Kb DNA 절편의 염기 서열을 결정하여 분석하였다. 이 DNA에는 7개의 인트론이 존재 하였으며 엑손의 염기서열과 이로부터 추정된 아미노산 서열은 Tranmetes villosa laccase(lccl)와 각각 47%, 79% 동일하였다. 기타 다른 백색부후균류의 laccase 아미노산 서 열과는 66~78% 동일하였다.

• 한국정보과학회:학술대회논문집
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• 한국정보과학회 2006년도 한국컴퓨터종합학술대회 논문집 Vol.33 No.1 (A)
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• pp.70-72
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• 2006

확률 라이브러리 모델(Probabilistic Library Model)은 DNA컴퓨팅 방법론에 기반하여, 라이브러리를 구성하는 원소들의 빈도를 이용하여 결합확률분포를 표현하고자 하는 모델이다. PLM에서 결합확률분포 외에도 조건부 확률을 계산하는 방법이 필요해짐에 따라, 본 논문에서는 in-vitro메서 DNA를 이용하여 임의의 조건부 확률을 계산하는 방법으로 은닉 확률라이브러리모델(Latent Probabilistic Library Model)을 이용한 방법을 제시하고, 이전 논문에서 미비한 부분인 알고리즘의 타당성 증명을 보완하였다. 또한, 시뮬레이션을 통하여 실제 확률과 1% 이내로 동일한 결과를 얻었다.

• 대한화학회지
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• 제49권5호
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• pp.449-460
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• 2005

• 한국동물학회지
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• 제36권3호
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• pp.367-372
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• 1993

재생쥐간에서 분리한 topoisomerase II에서 protein kinase 활성이 발견되었다. ,topo II 활성 및 kinase 활성은 hydroxyapatite, phosphocellulose, double strand DNA cellulose chromatography 등의 순수 분리 과정 중에도 서로 분리되지 않았으며 glycerol gradient sedimentation 분석에서도 같은 분획에서 활성이 존재하였다. Kinase는 topo II 저해제인 N-ethylmaleimide와 novobiocin 등에 의해 그 활성이 저해되었다. 그러나 이러한 증거들 만으로 kinase 활성이 topo II가 아닌 다른 polypeptide에 의한 것일 가능성을 완전히 배제 할 수는 없다. Topo II와 결합된 kinase 활성에는 Mg++가 절대적으로 필요하였으며 다른 일가 또는 이가 이온으로는 그 효과가 대체되지 않았다. Histone H1은 kinase 활성을 증가 시키며 또 kinase에 의해 강하게 인산화된다. 이러한 효과는 다른 histone 류 및 casein 등에 의해 대체되지 않았다.

• 미생물학회지
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• 제54권1호
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• pp.1-8
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• 2018

원핵 세포는 핵양체 결합 단백질(NAP)로 알려진 다양한 히스톤 유사 단백질을 가지고 있다. 이들은 DNA의 AT-rich 서열에 결합하여, DNA 자체를 감싸거나, 구부리거나, 떨어져 있는 DNA 가닥을 연결시키는 다리 역할을 하여, 결국에는 원핵 생물의 유전자 발현을 조절한다. NAP는 특히 전사의 억제 기능을 가지고 있기 때문에, 유전자 발현 억제에 있어서 이들의 역할과, 구체적인 메커니즘을 밝히는 것을 매우 중요한 일이다. 본 논문에서는 잘 알려져 있는 NAP인 H-NS와 HU에 대하여 정리하였고, 특히 E. coli와 Salmonella Typhimurium에서 이들의 유전자 발현에 대한 기능을 요약하였다. H-NS는 이들의 올리고머화와 필라멘트 구조 형성을 통하여 Salmonella와 같은 사람에 감염하는 병원성 세균의 독성유전자 발현을 억제할 수 있고, 이런 기능을 수행하였을 때 다른 NAP와 함께 작용할 수 있다. 최근에 H-NS는 사람에게 typhoid fever와 systemic disease를 발생시키는 독성물질인, typhoid toxin의 발현 또한 조절할 수 있음이 밝혀졌다. Salmonella에서 HU 또한 독성 유전자뿐만 아니라, 이들의 생리적 기능에 중요한 유전자들의 발현을 조절할 수 있다. 따라서, H-NS와 HU와 같은 NAP들이 원핵 생물의 독성 유전자 발현의 분자적인 메커니즘을 밝히는데 중요한 요소임을 제시한다.

• 생명과학회지
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• 제14권4호
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• pp.716-725
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• 2004

Sox 패밀리는 동물계 전체에서 찾아지는 전사인자이고, HMG라는 특이적인 DNA결합 도메인을 가진다. 이 Sox 패밀리는 HMG 도메인의 아미노산 서열을 바탕으로 현재 10개의 그룹으로 분류된다. 각 그룹의 오소로그한 Sox 단백질들은 선충에서 인간까지 상당한 보존성을 보인다. HMG 도메인은 전사 촉진 좌위에 결합하고 다른 전사인자들의 결합을 조절함으로써 동물 발생과정의 다양한 세포에서 발현되어 그들의 분화에 결정적인 영향을 미친다. 최근 많은 분자 생물학자들이 Sox 유전자와 관련된 질병, 진화, 그리고 계통 분류 등에 많은 관심을 보이고 있다. 특히, 줄기세포에서 Sox 유전자의 연구는 그들의 생물학적인 기능을 이해하기 위해 꼭 필요한 분야이다. 아마도 이 Sox 유전자들을 이해함으로써, 인간의 유전적 질병과 인간을 포함한 전체 동물계의 진화를 이해할 수 있는 열쇠가 될 것이라 생각한다.

• 미생물학회지
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• 제26권4호
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• pp.291-297
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• 1988

신호배열 돌연변이인 rbsB 103는 전구체 리보스 결합단백질을 세포질내에 축적시키고, rbsB 106 복귀유전자는 이 전구체를 숙성 가능하게 하여 페리플라슴으로 수송되게 한다.(Iida el at., 1985, Park, el at., 1988). 본고에서는 rbsB 유전자의 세 allele, rbsB, rbsB 103와 rbsB 106를 이들이 코딩하는 단백질을 대량생산 하그l자 람다 P 프로모터 조절하에 클론하고 나아가서 다섯종의 단백질을 순수정제하였다.. 전구체 단백질의 pI는 8.0, 숙성단백질의 $P_{L}$는 7.5임을 밝혔다. 순수정제된 단백질의 아마노 말단의 아미노산 배열을 결정하여 DNA 염기서열로부터 밝혀진 아미노산 변화를 확인하였다.

• EDISON SW 활용 경진대회 논문집
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• 제3회(2014년)
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• pp.29-38
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• 2014

G-quadruplex를 형성하는 DNA연속체는 텔로미어에서 발견된다. 지금까지의 연구 결과에 따르면 G-quadruplex는 다양한 유전질환과 암과의 상관관계가 있으며, 따라서 G-quadruplex에 대한 연구는 제약 개발 분야에서 활발하게 진행되고 있다. G-quadruplex는 두 개 이상의 G-tetrad들이 쌓여서 형성된 복합체를 의미하며, G-tetrad란 4개의 구아닌 염기들이 Hoogsteen의 수소결합 통해, 정사각형의 평면을 이룬 물질을 일컫는다. 이때, 알칼리 금속 이온이 G-quadruplex에서의 G-tetrad 복합체 형성에 중요한 역할을 한다는 선행연구 결과가 있다. 특히, 알칼리 금속 중 $K^+$이 가장 G-quadruplex와 결합을 잘 한다고 알려져 있는데 그 이유에 대한 분자적 관점의 설명이 이루어져 있지 않다. 따라서 본 연구에서는 먼저 G-quadruplex의 기본 구성 단위 구조인 G-tetrad와 알칼리 금속 결합체들의 수용액상에서의 구조적, 열역학적 특징을 정량적으로 비교, 분석하였다. 또한, 양자화학적 방법으로 계산된 수용액 상태에서의 결합구조에 대한 용매화 자유 에너지 계산을 수행하여 G-quadruplex 간의 자기 조립 (self-assembly) 현상을 설명하였다.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제1권1호
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• pp.37-43
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• 1997

DNA 회복효소인 MPG는 DNA의 퓨린기에 결합되어 있는 메틸기 등 이물질을 염기와 함께 제거하는 작용을 한다. 본 연구에서는 노던 블롯팅 방법을 이용하여 Balb/c mice의 각 조직별로 발생단계별 mRNA 발현 정도를 조사하였다. 뇌와 콩팥조직에서는 출생직후에 발현이 가장 활발하였으며, 성체시기까지 비교적 높은 활성도가 유지되었다. 위장 조직에서는 출생직후에서 일주일 후까지는 명확히 관찰되었으나, 그 이후는 발현이 약화되었다. 간장과 폐조직에서는 그 발현 정도가 매우 약했으며, 특히, 간조직의 경우 출생 직후보다 성체에서 그 발현이 현저히 감소되었다. 이들 조직에서의 활성도는 출생후 24시간 이내에서 1주일후까지 상대적으로 높게 유지되다가 점차 감소되었다. 즉, 수유기(출생직후부터 1주일후)에는 그 활성도가 성체시기(4주에서 6개월)보다 높게 유지되었다. 이러한 결과들로 미루어 보아 늙은 생쥐가 젊고 어린 생쥐보다 alkylating mutagen들에 노출되었을대 암에 걸릴 위험성이 높다고 생각된다.

• 한국발생생물학회지:발생과생식
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• 제2권2호
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• pp.165-171
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• 1998

p62는 임파구에 특이적으로 발현하는 단백질 티로신 키나제인 p56$^{lck}$의 SH2 doamin과 결합하는 세포질 단백질로서 두 단백질의 결합에는 지금까지 알려진 바와 다르게 인산화된 티로신이 필요없다. p62는 기능이 다른 여러 조직에서 공통적으로 발현되며 유비퀴틴, 단백질 키나제 C 이성질체 둥 다양한 단백질과 결합하는 것이 알려져 있다. 이와 같은 현상으로 p62가 다양한 생물학적 기능을 수행할 수 있음을 예측할 수 있으나 그 자세한 기작은 잘 알려져 있지 않다. 본 연구에서는 p62가 T-세포에 특이적으로 발현하는 14-3-3 $ au$ 이성질체와 결합하는 것을 확인하였으며, p62를 인위적으로 T-세포에 다량으로 발현시키면 세포예정사 (apoptosis)의 시작이 지연되는 현상을 조사하였다. 이때 세포사멸과정에서 전형적으로 나타나는 DNA 절단현상 (DNA fragmentaion)과 poly (ADP-ribose) polymerase의 분해가 지연됨을 알 수 있었다. 최근 14-3-3 단백질이 임파구에서 세포예정사를 촉진시키는 기능을 가진 Bad와 결합함으로써 세포의 생존 신호 전달에 중요한 역할을 한다는 것이 보고된 바 있다. 따라서 본 연구의 결과는 T-세포의 활성으로 일어나는 사멸예정사 과정 중에 p62와 14-3-3 단백질에 의해 수행되는 조절 기작이 있음을 시사하고 있다.다.