Avian malaria is one of the most important general blood parasites of poultry in Southeast Asia. Plasmodium (P.) juxtanucleare causes avian malaria in wild and domestic fowl. This study aimed to identify and characterize the Plasmodium species infecting in Thai native fowl. Blood samples were collected for microscopic examination, followed by detection of the Plasmodium cox I gene by using PCR. Five of the 10 sampled fowl had the desired 588 base pair amplicons. Sequence analysis of the five amplicons indicated that the nucleotide and amino acid sequences were homologous to each other and were closely related (100% identity) to a P. juxtanucleare strain isolated in Japan (AB250415). Furthermore, the phylogenetic tree of the cox I gene showed that the P. juxtanucleare in this study were grouped together and clustered with the Japan strain. The presence of P. juxtanucleare described in this study is the first report of P. juxtanucleare in the Thai native fowl of Thailand.
Seo, Bo Yoon;Jung, Jin Kyo;Cho, Jum Rae;Kim, Yonggyun;Park, Chang Gyu
Korean journal of applied entomology
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v.51
no.4
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pp.365-370
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2012
The two closely related major leguminous crop pests in Korea, Matsumuraeses phaseoli and M. falcana (Lepidoptera: Tortricidae) have very similar morphological characters, which occasionally give rise to a failure in distinguishing between the two. In this study, we report an easy PCR-SSP method to distinguish between them, with a sequence specific primer set (P-SF2, F-SF3, and C-SR3) based on single nucleotide mismatch in 3' terminal base of a primer, which is found in the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit I DNA (mtCOI). Through application of this method, each species may be clearly identified in terms of its PCR band size and pattern, only one band (245 bp) for M. falcana and one (409 bp) or two bands (409 bp & 245 bp) for M. phaseoli.
To examine the characteristics of antioxidative compounds from Capsella bursa-pastoris, ethanol extracts were separated into five organic solvent fractions; hexane(Fr.H), diethyl ether (Fr.E), ethyl acetate(Fr.EA), butanol (Fr.B), and water(Fr.D) fractions. Fr.B showed the greatest electron donating ability and inhibitory effect on lipid peroxidation. Whereas Fr.E had the most excellent activity in the superoxide radical scavenging activity by xanthine/xanthine oxidase-cytochrome c reduction system. The inhibitory effect of each fraction on xanthine oxidase was also measured. Fr.E had the strongest inhibitory effect on xanthine oxidase and $IC_{50}$ was $5.65\;{\mu}g$. The results indicate that the superoxide radical scavenging activity of Fr.E is caused by the inhibitory effect on radical generating system of xanthine oxidase. Also the order of inhibitory effect on xanthine oxidase was Fr.B
Lee, Sang Mong;Son, Hong Joo;Kim, Keun Ki;Hong, Chang Oh;Park, Hyean Cheal
Journal of Environmental Science International
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v.28
no.1
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pp.75-84
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2019
Cytochrome c oxidase subunit II gene(CO II gene) is subunit of cytochrome oxidase, which is complex IV of mitochondria electron transport system. It has been frequently used in molecular phylogenetic studies because the speed of its DNA variation is faster than that of nucleus. It is especially useful in phylogenetic study of molecular biology in insects. In this study, we cloned and sequenced CO II gene of mitochondria DNA from Rhabditidae family nematode. Our results showed that this gene is comprised of 696 base pairs(bp). In the analysis of similarity of this gene with other known genes of 14 species of nematodes in Rhabditida order, we identified that this gene has high similarity with that of Caenorhabditis briggsae(86.0%) and C. elegans(85.6%) in Rhabditidae family. On the meanwhile, it has very low similarity with that of Angiostrongylus cantonensis(31.8%) in Angiostrongylidae family and Metastrongylus salmi(31.6%) in Metastrongylidae family. Based on the results of this study, we suggest that this nematode is closely related with that of Caenorhabditis genus in Rhabditidae family.
Biochemical consequence of the accumulation in cells of superoxide $(O^{-}_{2})$ which was proposed to be probably a common chemical factor in the secondary process of the mechanism of chilling injury as well as in the visible light photodamage in cells of higher plants, has been investigated in the present work. Especially focused was the destructive effect of $O^{-}_{2}$ on the biochemical activity of mitochondria, as informations which support the suggestion that mitochondrial inner membrane is the major site of $O^{-}_{2}$ production have been collected. Mitochondria and submitochondrial particles (SMP) were prepared from soybean hypocotyls for this case study. When SMP were treated with the electrolytically produced $O^{-}_{2}$ they suffered not only inhibition of the membrane-bound enzymes as demonstrated by cytochrome c oxidase, but also lipid peroxidation of membrane as proved by malondialdehyde production. Malate dehydrogenase present in the protein extract from mitochondrial matrix was also inhibited by the $O^{-}_{2}$ treatment. These results exhibited the chaotic effect of the overproduction and accumulation of $O^{-}_{2}$ in cells under a certain abnormal circumstance such as environmental stress on the physiological function of mitochondrial; disruption of the cellular metabolic pathways and the structural integrity of membrane.
Sun Hee Lee;Bo Reum Park;Hyung Il Kim;Sooyeul Cho;Kyung-Hun Son
Journal of Food Hygiene and Safety
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v.39
no.3
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pp.209-220
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2024
Cavier is graded as Beluga, Osetra, and Sevruga based on the species of sturgeon (Acipenser sinensis). In this study, we developed an analytical method for determining the grade of black caviar using DNA barcodes and KASP markers. To identify the sturgeon species, ten black caviar samples were collected, and a reference DNA barcode library was developed using five genes (namely, 16S ribosomal RNA, cytochrome b, cytochrome c oxidase subunit I, cytochrome c oxidase subunit II, and NADH dehydrogenase subunit 5 genes). To develop the KASP markers, we selected 11 markers that could distinguish between the five grades of black caviar. As a result, specific markers for each of the targeted caviars were clustered into FAM-positive sections. DNA barcoding and the KASP assay revealed that one Beluga, six Osetra, and three Sevruga were identified among the ten caviar samples. Moreover, we found that the sturgeon species were mislabeled in two products. Here, we aimed to develop a KASP assay based on SNP that allows rapid and easy identification of caviar grade. These methods are expected to contribute to preventing the distribution of illegal products.
Cytochrome P45O (CYP) contents and 7-ethoxyresorufin-O-deethylase (EROD) activity were determined in hepatic microsome of olive flounder (Paralichthys olivaceus) exposed to tributyltin chloride (TBTC), tributyltin oxide (TBTO), and triphenyltin chloride (TPTC). In addition, effects of in vivo (intraperitoneal injection of 7.5 mg $kg^{-1}$ BW) exposure of flounder to TPTC on CYP, NADPH cytochrome c reductase, NADH cytochrome b5 yeductase and EROD levels were measured. In in vitro exposure of hepatic microsome to organotins, TBTC, TBTO and TPTC reduced CYP contents and inhibited EROD activity. The TPTC was the strongest inhibitor, which is followed by TBTO and TBTC. The degree of inhibition, especially EROD acitivity, depended on the exposure duration. In addition, all the target enzymes in flounder were inhibited by TPTC with the in vivo exposure to TPTC. As EROD activity was the most sensitive to the inhibitions and demonstrated good reproducibility of the results, it could be used as a helpful tool toy monitor effects of organotin compounds on mixed funciton oxygenase system in marine fish.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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