An, Hyejin;Lee, Hwa-Yong;Shin, Hyeran;Bang, Jun Hyoung;Han, Seahee;Oh, Youn-Lee;Jang, Kab-Yeul;Cho, Hyunwoo;Hyun, Tae Kyung;Sung, Jwakyung;So, Yoon-Sup;Jo, Ick-Hyun;Chung, Jong-Wook
Mycobiology
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v.49
no.4
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pp.376-384
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2021
Agaricus bisporus is a popular edible mushroom that is cultivated worldwide. Due to its secondary homothallic nature, cultivated A. bisporus strains have low genetic diversity, and breeding novel strains is challenging. The aim of this study was to investigate the genetic diversity and population structure of globally collected A. bisporus strains using simple sequence repeat (SSR) markers. Agaricus bisporus strains were divided based on genetic distance-based groups and model-based subpopulations. The major allele frequency (MAF), number of genotypes (NG), number of alleles (NA), observed heterozygosity (HO), expected heterozygosity (HE), and polymorphic information content (PIC) were calculated, and genetic distance, population structure, genetic differentiation, and Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) were assessed. Strains were divided into two groups by distance-based analysis and into three subpopulations by model-based analysis. Strains in subpopulations POP A and POP B were included in Group I, and strains in subpopulation POP C were included in Group II. Genetic differentiation between strains was 99%. Marker AB-gSSR-1057 in Group II and subpopulation POP C was confirmed to be in HWE. These results will enhance A. bisporus breeding programs and support the protection of genetic resources.
The patterns of saponins of lateral gingengs cultivated different areas and various ginseng products were investigated by quantitative thin-layer chromatography. In the case of ginseng cultivated in the Kum San and Gang Hwa area, some parts of the panaxatriol series of the saponins (peak 6 and 7.8.9) were higher in concentration than in ginseng grown in other areas while the other ingredients were almost the same. In the process of heat treatment the quantity of peak 2 was generally decreased. However, in the case of red and white ginseng, one part of the panaxatriol saponins, peak 6 was increased. This tendency was also found in honeyed ginseng and ginseng tea which were not exposed to sunlight, but the increase was much less. The change in the red and white ginseng which were exposed to sunlight was very substantial. Therefore we can assume that the increase of peak 6 comes about due to the combination of heat treatment and exposure to sunlight, especially due to exposure to sunlight.
In order to learn the origin of the Chinese Mongolian horse, we analyzed polymorphisms within the mtDNA D-loop variable region in 305 horses of 6 types of 3 different breeds, including one imported breed, one cultivated breed and 4 types of one local breed. We detected 13 different haplotypes, and subsequent sequence analysis showed that all 6 horse types were genetically diverse. By constructing a cladogram of mtDNA D-loop sequences from the 6 horse types along with homologous sequences from several other horse types obtained from GenBank, we showed that Chinese Mongolian horses have a close genetic relationship with other horse types from Mongolia. We also speculate that several Chinese Mongolian horses descended from Przewalskii horse. Additionally, the 13 haplotypes were dispersed throughout the cladogram, suggesting that Chinese Mongolian horses likely originated from multiple female ancestors. A phylogenetic map of the 6 horse types showed that the genetic relationship between the local Wuzhumuqin and Wushen types were the closest. The Xinihe and Baerhu were also closely related to each other, and slightly more distantly related to the cultivated Sanhe breed. All five of the local Chinese horse types had a much more distant relationship with the imported Thoroughbred breed.
Poria cocos is an importantant medical macrofungus,the sclerotium of Poria cocos has specific value as the drug material. There are few papers about its breeding and spawn rejuvenation. In this project, the protoplasts of cultivated strain T and wild strain L were prepared and treated separately by ultraviolet and heating, then fused with the PEG6000. The tural fusants were selected and identified by the affinity and ISSR analysis. 71 incompatibility strains between parents and reg regenerations were obtained from 118 regenerations by the affinity analysis. Five incompatibility strains were amplified with different primers, the results were showed that they had specific bands of both parents in the profile amplified with 3 primers, which proved these 5 strains were fusants by means of molecular biology marker. On the other hand, 25 strain were selected from 168 protoplast regenerations of cultivated strain T for cultivation experiment. The fresh sclerotium weight of these protoplast regenerations were better than the original strain.significantil 3 strains (T-1, T-4, T-7) increased respectively 118%, 73% and 73% than original strain. This method could be the effective in the rejuvenation Poria cocos.
Journal of the Korean Society of Environmental Restoration Technology
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v.10
no.6
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pp.120-129
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2007
Rapid urbanization has transformed the spatial pattern of urban land use or cover. This paper concentrates that changed characteristics of landscape structure in the Tancheon Watershed, from 1995 to 2003 were investigated using land cover map. We used FRAGSTATS software to calculate landscape indices to characterize the landscape structure. We found that built up area has been increased rapidly during the study period, while cultivated area and forest area have been decreased rapidly in the same period. From 1995 to 2003, built up area was increased from 19.73% to 39.62% and cultivated area and forest area was decreased 17.60% to 5.97% and 58.31% to 49.41%. Number of patches, mean euclidean nearest-neighbor distance, contagion index, Shannon's diversity index increased considerably from 1995 to 2003, also suggesting the landscape in the study area became more fragmented and heterogeneous. but because of continuously fragmentation, landscape became homogeneity. The study demonstrates that landscape metrics can be a useful indicator in landscape monitoring and landscape assessment.
Microbial dysbiosis in the gut is associated with human diseases, and variations in mucus alter gut microbiota. Therefore, we explored the effects of mucin on the gut microbiota using a community of 19 synthetic gut microbial species. Cultivation of these species in modified Gifu anaerobic medium (GAM) supplemented with mucin before synthetic community assembly facilitated substantial growth of the Bacteroides, Akkermansia, and Clostridium genera. The results of 16S rRNA microbial relative abundance profiling revealed more of the beneficial microbes Collinsella, Bifidobacterium, Ruminococcus, and Lactobacillus. This increased acetate levels in the community cultivated with, rather than without (control), mucin. We identified differences in predicted cell function and metabolism between microbes cultivated in GAM with and without mucin. Mucin not only changed the composition of the gut microbial community, but also modulated metabolic functions, indicating that it could help to modulate microbial changes associated with human diseases.
Cuong, To Dao;Anh, Hoang Thi Ngoc;Huong, Tran Thu;Khanh, Pham Ngoc;Ha, Vu Thi;Hung, Tran Manh;Kim, Young Ho;Cuong, Nguyen Manh
Natural Product Sciences
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v.25
no.4
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pp.348-353
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2019
Soluble epoxide hydrolases (sEH) are enzymes present in all living organisms, metabolize epoxy fatty acids to 1,2-diols. sEH in the metabolism of polyunsaturated fatty acids plays a key role in inflammation. In addition, the endogenous lipid mediators in cardiovascular disease are also broken down to diols by the action of sEH that enhanced cardiovascular protection. In this study, sEH inhibitory guided fractionation led to the isolation of five phenolic compounds trans-resveratrol (1), trans-piceatannol (2), sulfuretin (3), (+)-balanophonin (4), and cassigarol E (5) from the ethanol extract of the seeds of Passiflora edulis Sims cultivated in Vietnam. The chemical structures of isolated compounds were determined by the interpretation of NMR spectral data, mass spectra, and comparison with data from the literature. The soluble epoxide hydrolase (sEH) inhibitory activity of isolated compounds was evaluated. Among them, trans-piceatannol (2) showed the most potent inhibitory activity on sEH with an IC50 value of 3.4 μM. This study marks the first time that sulfuretin (3) was isolated from Passiflora edulis as well as (+)-balanophonin (4), and cassigarol E (5) were isolated from Passiflora genus.
Journal of the Korean Society of Food Science and Nutrition
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v.45
no.12
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pp.1740-1746
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2016
In this study, we investigated the nutritional and functional constituents as well as quality characteristics and antioxidant activity of Korean cultivated wild ginseng (KG). The chemical compositions and amino acid content of KG were 7.56% water, 73.01% carbohydrates, 12.58% protein, 1.99% lipids, and 5.54% ash as well as 16.17 mg/g of amino acids, respectively. The major ginsenoside and minor ginsenoside contents of KG were 15.94 mg/g and 0.04 mg/g, respectively. The total polyphenol and flavonoid contents of KGE (Korean cultivated wild ginseng with 70% ethanol extract) were 8.93 mg GAE/g and 3.96 mg RHE/g, respectively. KGE also showed higher antioxidant activity than the other extracts (KGW, Korean cultivated wild ginseng with water extract) with regard to DPPH and ABTS radical scavenging activities (57.75% and 70.73%, respectively), nitrite oxide scavenging activity (44.01%), SOD-like activity (78.05%), reducing power activity ($1.08OD_{700nm}$), and ferrous ion-chelating activity (65.33%). Additionally, KGE had higher elastase, collagenase, and tyrosinase inhibition activities than KGW. These results suggest that KGE can be used as a bioactive and functional material in the food industry.
Park, Se Won;Lee, Ji Won;Kim, Kwang Yong;Kim, Young Cheol;Hong, Se Jin
Horticultural Science & Technology
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v.17
no.2
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pp.115-117
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1999
Tomato (Lycopersicon esculentum) fruits were grown by the hydroponic cultivation system using perlite and soil cultivation system. The growth, yield, and fruit quality were compared between two growing seasons of spring and summer and two cultivation systems, respectively. In tomato, little difference was observed in growth and yield between two cultivation systems, but plant growth and total yield of fruits were much more in summer than in spring. The contents of glucose and fructose were more in spring-grown fruit than in summer-grown one, and in hydroponically cultivated fruit than in soilcultivated, respectively. The weight loss during room temperature storage was lower in hydroponically cultivated fruit than in soil-cultivated one, and in summer-grown fruit than in spring-grown one, respectively. In terms of color change, the shelf-life of tomato fruit was shorter by one day in summer-grown one fruit than in spring-grown one, and in hydroponcically cultivated one fruit than in soil-cultivated, respectively.
This study was carried out to investigate the antioxidant activity of the ethanol extract from $d\bar{o}d\bar{o}k$ compared with that from ginseng. The peroxide values and thiobarbituric acid values were examined in order to estimate the antioxidant activity of the extract in soybean oil and lard. The antioxidant activity of the extract in soybean oil increased in the order of BHA$d\bar{o}d\bar{o}k$ cold extract(WDCE)$d\bar{o}d\bar{o}k$ reflux extract(WDRE)$d\bar{o}d\bar{o}k$ cold extract(CDCE)$d\bar{o}d\bar{o}k$ reflux extract(CDRE) $d\bar{o}d\bar{o}k$ showed significantly stronger antioxidant activity than that from ginseng.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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