• 한국식품과학회지
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• 제35권1호
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• pp.132-137
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• 2003

국내에서 생산된 거봉 및 캠벨 포도의 씨, 줄기 및 껍질 추출물에 대하여 항산화 작용, 염증 관련 인자 생성에 미치는 활성 및 암세포 성장에 대한 영향 등을 resveratrol과 비교하여 평가하였다. 그 결과 포도 추출물 중 거봉줄기, 캠벨줄기, 캠벨씨 및 거봉씨 추출물들이 항산화 능력을 나타내었고 그 중 거봉씨 추출물은 vitamin C와 효력이 유사하게 나타나 항산화 효능이 우수함을 알 수 있었다. 또한 마우스 대식세포주인 RAW 264.7 cell을 이용하여 포도 추출물들의 LPS처리에 의한 $PGE_2$ 및 NO 생성을 저해 여부를 확인한 결과, 거봉줄기, 거봉씨, 및 캠벨씨 추출물이 $50\;{\mu}g/mL$에서 $PGE_2$ 및 NO 생성을 50% 가량 저해하는 효능을 나타내었다. 또한 사람 폐암 및 대장암 세포주를 이용하여 포도 추출물들이 암세포 성장 저해 효과를 나타내는지를 확인하였는데 거봉줄기 및 씨 추출물 $50\;{\mu}g/mL$에서 30% 정도의 암세포 성장 저해 작용을 나타내었다.

• Genomics & Informatics
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• 제17권3호
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• pp.32.1-32.6
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• 2019

Currently, Illumina sequencers are the globally leading sequencing platform in the next-generation sequencing market. Recently, MGI Tech launched a series of new sequencers, including the MGISEQ-2000, which promise to deliver high-quality sequencing data faster and at lower prices than Illumina's sequencers. In this study, we compared the performance of two major sequencers (MGISEQ-2000 and HiSeq 4000) to test whether the MGISEQ-2000 sequencer delivers high-quality sequence data as suggested. We performed RNA sequencing of four human colon cancer samples with the two platforms, and compared the sequencing quality and expression values. The data produced from the MGISEQ-2000 and HiSeq 4000 showed high concordance, with Pearson correlation coefficients ranging from 0.98 to 0.99. Various quality control (QC) analyses showed that the MGISEQ-2000 data fulfilled the required QC measures. Our study suggests that the performance of the MGISEQ-2000 is comparable to that of the HiSeq 4000 and that the MGISEQ-2000 can be a useful platform for sequencing.

• Journal of the Korean Data and Information Science Society
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• 제23권4호
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• pp.677-682
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• 2012

여러 분야에서 자료를 수집하기 위하여 모집단에서 표본을 추출하는 표본설계를 하고 있다. 특히 실험군과 대조군이 존재하는 임상자료에서는 모집단에서 집단별 일반적 변수들의 특성이 표본에 잘 반영되어야 하므로 더욱더 표본설계가 중요한 문제이다. 즉 모집단에서 집단별로 일반적 변수들이 가지는 빈도, 중심척도 그리고 산포척도 등이 표본에서도 동일하게 나타나야 한다. 그러나 주로 이루어지는 표본설계는 매우 복잡하고 어려워 일반 연구자가 사용하는데 있어 어려움을 겪는다. 따라서 본 논문에서는 시뮬레이션을 이용하여 집단별로 일반적 특성을 유지할 수 있는 임상자료의 샘플링 방법을 연구하였다. 또한 중환자실에 있는 환자자료에 적용하여 모집단과 표본의 일반적 변수의 특성값을 계산하여 보았고 통계적 가설검정을 이용하여 모집단과 표본집단에서 일반적 변수들의 값의 차이 여부를 비교하여 보았다.

• 한국산학기술학회논문지
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• 제14권9호
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• pp.4335-4341
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• 2013

본 연구는 검진센터에서 대장내시경을 실시한 무증상 성인들을 중심으로 대장암의 전구병변인 대장용종의 유병률 및 위험인자를 알아보고 무증상의 건강한 성인들에게 대장암 관리를 위한 기초자료를 제공하고자 시행하였다. 2010년 1월부터 12월까지 일개 대학병원 검진센터에서 대장내시경검사를 받은 995명을 대상으로 자기기입식 설문지, 의료기록지, 임상검사 결과지들을 이용하여 후향적으로 시행하였으며, 자료의 분석은 SPSS18.0을 이용하였다. 무증상 성인들의 대장용종 유병률은 남성에서 높았고, 연령대가 높을수록 증가하였다. 남성, 고령, 운동을 하지 않은 경우 독립적인 위험인자로서 대장용종과 밀접한 관련이 있는 것으로 나타났다. 따라서 40대 이상 성인에서는 대장내시경 검사를 통한 대장용종의 조기 발견이 중요하며, 대장암 전구병변인 대장용종의 일차 예방을 위한 지속적인 생활습관 교정 및 운동프로그램 개발이 필요하다.

• 생약학회지
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• 제46권2호
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• pp.133-139
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• 2015

Two coumarinolignans, cleomiscosins C (1) and D (2) were isolated from the heartwood of Acer mono, together with four compounds, 5-O-methyl-(E)-resveratrol-3-O-${\beta}$-D-glucopyranoside (3), 5-O-methyl-(E)-resveratrol-3-O-${\beta}$-D-apiofuranosyl-(1$\rightarrow$6)-${\beta}$-D-glucopyranoside (4), scopoletin (5), and (E)-resveratrol-3-O-${\beta}$-D-glucopyranoside (6). Of them, cleomiscosins C (1) and D (2) were applied to preparing inclusion complex molecules with ${\beta}$-cyclodextrin (${\beta}$-CD) to improve the very poor solubility in cell media. The CD complexes of 1 and 2 exhibited an enhancement of water solubility which is feasible to measure their cytotoxicity using a spectrophotometer in a cell-based assay. Anti-proliferative activity of these complex molecules was successfully estimated on HCT116 human colon cancer cells, and cleomiscosin D (2) showed anti-proliferative effects at the concentration of 1.95~31.2 ${{\mu}g}$/mL in a dose-dependent manner.

• Genomics & Informatics
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• 제19권1호
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• pp.5.1-5.11
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• 2021

Head and neck squamous cell carcinoma (HNSCC) is the most frequent type of head and neck cancer that usually arises from the mucosal surfaces of several organs including nasal cavity, paranasal sinuses, oral cavity, tongue, pharynx, and larynx. The Wnt signaling pathway is a crucial mechanism for cellular maintenance and development. It regulates cell cycle progression, apoptosis, proliferation, migration, and differentiation. Dysregulation of this pathway correlates with oncogenesis in various tissues including breast, colon, pancreatic as well as head and neck cancers. The present study aims to assess the gene alterations in the Wnt family of genes so as to derive an association with HNSCC. Computational approaches have been utilized for the identification of gene alterations in the Wnt family of genes. Several databases such as cBioportal, STRING, and UALCAN were used for the purpose. The frequency of alteration was high in case of Wnt family member 11 (5%). Gene amplification, deep deletions, missense and truncating mutations were observed in HNSCC patients. There was a marked difference in the gene expression profile of WNT11 between grades as well as normal samples. The survival probability measured using the Kaplan-Meier curve also presented with a significant difference among male and female subjects experiencing a low/medium level expression. The female patients showed less survival probability when compared to the male subjects. This provides the prognostic significance of the WNT11 gene in HNSCC. Taken together, the present study provides clues on the possible association of WNT11 gene alterations with HNSCC, which has to be further validated using experimental approaches.

• 식품과학과 산업
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• 제52권1호
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• pp.84-99
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• 2019

Dietary fiber is defined as soluble and insoluble polysaccharide consisted in the plant cell wall-associated fibers naturally occurring in fruits, vegetables, and cereal products, and of isolated fibers that are added to processed foods which are also artificially modified. There are so many difference types of dietary fibers as arabinoxylan, polydextrose chicory, oligosccharide. inulin, pectin, bran, cellulose, ${\beta}$-glucan, resistant starch and some seaweed polymers as alginate. Most of them provide many biological benefits in the intestine, as lower risk for developing coronary heart disease, stroke, hypertension, diabetes, obesity and some of the gastrointestinal disease like as colon cancer. And also lowering cholesterol levels, improves glycemic and insulin sensitivity to non-diabetic and diabetic persons including immune system. Beside of many benefits, average consumers in developed and under developing countries take far less amounts of dietary fiber that international organization recommended. Adequate intake of dietary fiber is 14g/1,000kcal base using the energy guide line of 2,000kcal/day for women and 26,000 kcal/day for men, dietary intake is 28g/day of adult women and 36g/day for adult men. The mechanisms behind the reported effects of dietary fiber on metabolic health are not fully well established. It is suggested that changes in intestinal viscosity resulting mucus increasing, macro-nutrients absorption, rate of passage of large intestinal, production of short chain fatty acids by fermentation. Production of gut hormones and changes of microbiota in intestine. It is necessary to do more research in this field in the future and combined interdisciplinary works together.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제34권7호
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• pp.1452-1463
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• 2024

Fungi generate different metabolites some of which are intrinsically bioactive and could therefore serve as templates for drug development. In the current study, six endophytic fungi namely Aspergillus flavus, Aspergillus tubigenesis, Aspergillus oryzae, Penicillium oxalicum, Aspergillus niger, and Aspergillus brasiliensis were isolated and identified from the medicinal plant, Silybum marianum. These endophytic fungi were identified through intra transcribed sequence (ITS) gene sequencing. The bioactive potentials of fungal extracts were investigated using several bioassays such as antibacterial activity by well-diffusion, MIC, MBC, anti-biofilm, antioxidant, and haemolysis. The Pseudomonas aeruginosa PAO1 was used to determine the antibiofilm activity. The ethyl acetate extract of Aspergillus flavus showed strong to moderate efficacy against Staphylococcus aureus, Escherichia coli, P. aeruginosa, and Bacillus spizizenii. Aspergillus flavus and Aspergillus brasiliensis exhibited significant antibiofilm activity with IC₅₀ at 4.02 and 3.63 mg/ml, while A. flavus exhibited maximum antioxidant activity of 50.8%. Based on HPLC, LC-MS, and NMR experiments kojic acid (1) and carbamic acid (methylene-4, 1-phenylene) bis-dimethyl ester (2) were identified from A. flavus. Kojic acid exhibited DPPH free radical scavenging activity with an IC₅₀ value of 99.3 ㎍/ml and moderate activity against ovarian teratocarcinoma (CH1), colon carcinoma (SW480), and non-small cell lung cancer (A549) cell lines. These findings suggest that endophytic fungi are able to produce promising bioactive compounds which deserve further investigation.

• 한국식품영양과학회지
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• 제44권4호
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• pp.524-531
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• 2015

죽염된장의 발효기간(3년, 6년)과 죽염의 구운 횟수($3{\times}$, $9{\times}$)에 따른 항산화 및 HT-29 암세포에서 in vitro 항암 효과를 측정하였다. 죽염된장의 발효 기간에 따른 pH 및 아미노태 질소, 암모니아태 질소 함량은 3B-S($3{\times}$, 삶은 콩)를 제외하고는 큰 차이가 없는 것으로 나타났다. 총 폴리페놀 함량은 6Y9B-D(6년, $9{\times}$)가 유의적으로 가장 함량이 높았다(P<0.05). DPPH free radical 소거 효과에서는 6Y3B-D(6년, $3{\times}$)는 $34.1{\pm}0.4%$, 6Y9B-D는 $38.2{\pm}2.5%$, hydroxyl radical 소거 효과 역시 6Y3B-D는 $80.8{\pm}0.9%$, 6Y9B-D는 $86.2{\pm}2.0%$로 높은 소거 효과를 나타내었다. HT-29 인체 대장암세포를 이용한 암세포 성장 억제 효과 역시 6Y3B-D는 $65.9{\pm}2.4%$, 6Y9B-D는 $72.8{\pm}1.7%$로 가장 높은 성장 억제율을 나타내었다. TNF-${\alpha}$, IL-6과 iNOS, COX-2 염증 유발 인자에서 6Y9B-D군이 유의적인 차이를 보이며 mRNA의 발현을 가장 많이 억제하는 것으로 나타났다. 장기간 숙성된 6년 죽염된장이 3년 죽염된장보다 항산화, 항암 효과가 뛰어났고, 3회 죽염보다 9회 죽염을 첨가한 된장이 천일염과 정제염을 혼합해 제조한 시판된장보다 항산화, 항암 효과가 더 우수했다.

• 한국식품조리과학회지
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• 제29권3호
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• pp.241-248
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• 2013

들깻잎은 독특한 향미가 있어 다양한 형태로 빈번히 식용되고 있는 반면 참깻잎은 특별한 향미가 없어 그 기호성이 낮아 거의 식용되지 않는 폐자원이다. 들깻잎의 경우 다양한 기능성이 보고된 바 있으나, 참깻잎의 경우에는 통상적으로 식품으로 이용되는 자원이 아니기 때문에 그 기능성에 대한 연구가 전무한 실정이다. 이에 본 연구에서는 들깻잎과 참깻잎의 항산화 성분함량 및 활성을 비교하여, 참깻잎의 항산화 및 항암 기능성을 조명해 보고자 하였다. 식물성 식품에 널리 존재하는 대표적인 항산화 성분인 폴리페놀과 플라보노이드의 함량을 들깻잎과 참깻잎 추출물에서 측정한 결과, 참깻잎의 총 폴리페놀 및 총 플라보노이드 함량은 들깻잎의 함량의 약 1.5-1.6배 수준이었으며(p<0.05), 참깻잎의 ABTS radical 및 DPPH radical 소거활성 또한 들깻잎 활성의 약 1.7-2배 수준이었다(p<0.01). 또한 참깻잎은 들깻잎보다 대장암세포의 성장을 억제하는 활성이 높은 것으로 나타났다(p<0.001). 이러한 연구 결과는 향후 참깻잎의 항암성을 포함한 다양한 기능성 및 관련 작용기전을 규명하고, 나아가 참깻잎을 이용한 기능성 식품을 개발하기 위한 기초자료로 이용될 수 있을 것으로 생각된다. 또한 참깻잎의 기호성을 증진시키기 위한 조리과학적 연구 등과 같은 참깻잎의 식품학적 가치를 재조명하는 다양한 연구들이 앞으로 종합적으로 수행된다면, 이제까지 폐자원으로 여겨졌던 참깻잎의 새로운 자원화를 통한 경제적인 효과도 기대할 수 있을 것으로 생각된다.