• 제목/요약/키워드: Clusterin

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Effects of Panax ginseng and Ziziphus jujuba on stress-induced apoptosis in rats

  • Kim, Hyung-Chan
    • International Journal of Oral Biology
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    • 제33권1호
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    • pp.7-12
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    • 2008
  • PG has been well studied about effects of stress resistance. Although ZJ has been known that it had stress resistance effect since ancient times, its pharmacological properties and clinical applications have not been studied and reported until recently. Therefore, the purpose of this study is to determine whether effects of stress hormones, mechanism of stress protein could be induced by PG and ZJ of herb extract ingestion during stress exposure. In addition, this study identified expression of apoptosis factors related to stress. 1) Bcl-2 expression of the stressed rats decreased in comparison with the unstressed rats in heart and stomach. Bcl-2 expression of rats administered to PG was higher than the stressed rats in heart and that of rats administered to ZJ was higher than the stressed rats in stomach. 2) Stressed rats were decreased in p53 protein expression than normal rats. Thus, the results suggest stress-induced apoptosis is p53-independent apoptosis. And these results demonstrated that PG or ZJ administration helped to return from stress state to normal. 3) Clusterin expressed markedly in only salivary gland, but that of expression was no difference among four groups in tissues. Clusterin expression has no relation of stress-induced apoptosis.

Hypoxia Inducible Factor-1α Directly Regulates Nuclear Clusterin Transcription by Interacting with Hypoxia Response Elements in the Clusterin Promoter

  • Park, Jeongsook;Park, So Yun;Shin, Eunkyung;Lee, Sun Hee;Kim, Yoon Sook;Lee, Dong Hoon;Roh, Gu Seob;Kim, Hyun Joon;Kang, Sang Soo;Cho, Gyeong Jae;Jeong, Bo-Young;Kim, Hwajin;Choi, Wan Sung
    • Molecules and Cells
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    • 제37권2호
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    • pp.178-186
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    • 2014
  • Differential transcription of the clusterin (CLU) gene yields two CLU isoforms, a nuclear form (nCLU) and a secretory form (sCLU), which play crucial roles in prostate tumorigenesis. Pro-apoptotic nCLU and anti-apoptotic sCLU have opposite effects and are differentially expressed in normal and cancer cells; however, their regulatory mechanisms at the transcriptional level are not yet known. Here, we examined the transcriptional regulation of nCLU in response to hypoxia. We identified three putative hypoxia response elements (HREs) in the human CLU promoter between positions -806 and +51 bp. Using a luciferase reporter, electrophoretic gel mobility shift, and chromatin immunoprecipitation assays, we further showed that hypoxia-inducible factor-$1{\alpha}$ (HIF-$1{\alpha}$) bound directly to these sites and activated transcription. Exposure to the hypoxia-mimetic compound $CoCl_2$, incubation under 1% $O_2$ conditions, or overexpression of HIF-$1{\alpha}$ enhanced nCLU expression and induced apoptosis in human prostate cancer PC3M cells. However, LNCaP prostate cancer cells were resistant to hypoxia-induced cell death. Methylation-specific PCR analysis revealed that the CLU promoter in PC3M cells was not methylated; in contrast, the CLU promoter in LNCap cells was methylated. Co-treatment of LNCaP cells with $CoCl_2$ and a demethylating agent promoted apoptotic cell death through the induction of nCLU. We conclude that nCLU expression is regulated by direct binding of HIF-$1{\alpha}$ to HRE sites and is epigenetically controlled by methylation of its promoter region.

Identification of Differentially Expressed Genes by Proto-oncogene Protein DEK using Annealing Control Primers

  • Kim, Dong-Wook;Lee, Jae-Hwi;Seo, Sang-Beom
    • Biomolecules & Therapeutics
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    • 제16권3호
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    • pp.184-189
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    • 2008
  • The proto-oncogene protein DEK has been implicated in various human disease including cancer. We have shown that DEK induces caspase-dependent apoptosis in Drosophila by regulating histone acetylation. Reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) method based on annealing control primers was used to screen and identify differentially expressed genes (DEGs) in DEK overexpressed HeLa cells. Among the genes identified, clusterin and fibrillarin have major role in apoptosis pathway regulation. TFIIIC and RPS24 are implicated in HAT mediated transcriptional initiation and cololectal cancer, respectively. To further analyze DEK's role in apoptosis, multiplex PCR was performed. Caspase-3, -7, and -10 and proapoptotic gene bid were newly identified as possible target genes regulated by DEK expression.

Fuzzy Clustering을 이용한 순간전압강하(Voltage Sag)의 확장된 심각도 지수(Expanded Severity Index) 연구 (A Study of Expanded Severity Index of Voltage Sag Using Fuzzy Clusterin)

  • 오원욱;김용수
    • 한국컴퓨터정보학회:학술대회논문집
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    • 한국컴퓨터정보학회 2011년도 제43차 동계학술발표논문집 19권1호
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    • pp.81-84
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    • 2011
  • 본 논문은 전압 이벤트 현상 중 순간전압강하(Sag) 현상에 초점을 맞추었다. Sag 현상의 심각한 정도를 표현하는 심각도(Voltage Sag Severity) 지수는 동일 지속시간에 대한 임계치와의 비로 표현하였다. 제안하는 확장된 심각도(Expanded Severity) 지수는 sag현상의 분포에 따른 일시반복성의 정보를 표현하였다. 기존의 임계치를 표현하는 ITIC curve를 기반으로 된 심각도와 sag 현상이 발생하는 지속시간-전압 그래프의 분포를 fuzzy clustering을 통하여 medoid를 측정하고, medoid의 심각도와 실제 임계치에 근접한 sag 지점의 심각도를 계산하여 비교하였다. 확장된 심각도 지수는 심각도가 높은 현상들과의 연계성을 나타내는 지수로 심각한 정도의 수치 정보 이외에 일시적인 현상인지 지속 반복적인 현상인지를 0과 1사이의 수치로 표현하였고, 실험을 통하여 입증하였다.

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출산 후 경과한 날에 따른 한국인 산모의 모유 단백체 분석 (Proteomic analysis of Korean mothers' human milk at different lactation stages; postpartum 1, 3, and 6 weeks)

  • 박종문;이후근;송승현;한원호;김미정;이주현;강남미
    • 분석과학
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    • 제30권6호
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    • pp.348-354
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    • 2017
  • 이 연구는 출산 후 1, 3, 6주가 경과한 산모에서 얻은 모유의 단백체 발현 양상과 과 발현 단백질을 검출하는 것을 목적으로 하였다. 샷 건 정량 단백체 분석법을 이용하여 모유 중의 단백질을 동정하였고, 각 수유단계 간에 정량적 비교를 하였다. 각 주의 모유 샘플은 두 명의 산모로부터 얻어진 모유를 혼합하였고, 각 샘플 마다 3회 반복 실험을 하였다. Casein은 모유 내에 가장 많이 존재하는 단백질로서 실험의 정확성을 위하여 제거하였고, 트립신을 이용한 절편 화로 모유 단백질들을 펩타이드로 변환하였다. 처리된 펩타이드들은 역상 C18 미세관 크로마토그래피 및 이온-트랩 질량분석기를 이용하여 분석하였으며, Spectra Counting으로 단백질의 정량적 비교를 하였다. 각 샘플 당, 80-109 개의 단백질을 중복 제거한 후 동정하였다. 당화 단백질, metabolic enzyme, 및 lactoferrin, Carboxylic ester hydrolase, Clusterin을 포함하는 chaperon 효소들이 주로 검출되었다. 각 반복실험에서 재현성 있게 검출되는 63개의 단백질에 대한 정량적 비교분석 결과 25개의 단백질이 통계적으로 유의하게 수유단계에 따라 변화하는 것을 확인할 수 있었고, 특히 Ig lambda-7 chain C region과 Tenascin은 시간에 따라 현저하게 감소하였다. 향후 이와 같은 수유 단계에 따른 모유 내 단백의 변화가 생리적으로 가지는 의미에 관하여 추가적인 연구가 필요하다 생각된다.

Butyrate-induced differentiation of PC12 cells to chromaffin cells involves cell adhesion and induction of extracellular proteins and cell adhesion proteins

  • Heo, Jee-In;Oh, Soo-Jin;Kho, Yoon-Jung;Kim, Jeong-Hyeon;Kang, Hong-Joon;Park, Seong-Hoon;Kim, Hyun-Seok;Shin, Jong-Yeon;Lee, Sung-Young;Kim, Min-Ju;Min, Bon-Hong;Kim, Sung-Chan;Park, Jae-Bong;Kim, Jae-Bong;Lee, Jae-Yong
    • Animal cells and systems
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    • 제14권4호
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    • pp.261-266
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    • 2010
  • PC12 cells were differentiated into the cells of chromaffin phenotype by butyrate treatment. Cells were aggregated and formed tight cell adhesion. To investigate the molecular change in this differentiation, we examined expression levels of cell adhesion proteins and extracellular proteins during butyrate induced-differentiation of PC12 cells. Integrin ${\beta}1$, integrin ${\alpha}7$, E cadherin, VCAM, collagen-I, fibronectin, desmoglein and connexin were increased during differentiation. The levels of clusterin and secreted clusterin were also increased. These increased levels of cell adhesion proteins and extracellular proteins appear to induce cell aggregation and tight cell adhesion. The levels of p21, p27 and p16 were increased probably because of differentiation-related growth arrest during differentiation. Prolonged incubation of butyrate up to 1 day was required for differentiation. Signal transduction pathways for this differentiatiom could not be identified since various inhibitors had no effect. The results showed that butyrateinduced differentiation of PC12 cells to chromaffin cells involves tight cell adhesion and induction of extracellular proteins and cell adhesion proteins.

폐암 세포주에서 광역학 치료에 의한 유전자 발현 분석 (Gene Expression Profile of Lung Cancer Cells Following Photodynamic Therapy)

  • 성지현;이미은;한선숙;이승준;하권수;김우진
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제63권1호
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    • pp.52-58
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    • 2007
  • 연구배경: 광역학 치료는 폐암 치료에 실질적으로 이용 가능하며, 많은 연구들에서 폐암 세포에서 세포사멸을 일으킨다는 것이 이미 알려져 있다. 그러나 이 세포사멸의 기전은 아직 정확히 알려져 있지 않으며, 이에 암세포의 전사에서 초기 변화가 어떻게 일어나는 지를 알아보기 위하여 실험을 수행하였다. 방 법: 광과민성 물질인 DH-I-180-3으로 A549 세포에 처리를 하고 광역학 치료를 한 후 관찰하였다. 광역학 치료 후 DEG kit를 이용하여 폐암 세포주에서의 유전자 발현을 보았으며, 유세포 분석기를 이용하여 세포 사멸을 측정하였다. 광역학 치료 후 의미있는 변화를 보인 유전자는 염기서열분석으로 확인하였다. 결 과: 유세포분석 결과 폐암세포주는 대부분 세포괴사에 의하여 사멸되었다.광역학 치료 후, 9개의 유전자에서 명확한 변화가 있음을 발견했으며 이 중8개의 유전자를 밝혀내었다. 3-phosphoglycerate dehydrogenase와 리보솜 단백질 S29의 유전자 발현이 증가되어 있었으며, carbonic anhydrase XII, clusterin, MRP3s1 protein, complement 3, membrane cofactor protein, ${\beta}$-1 integrin의 유전자 발현은 감소되어 있었다. 결 론: 본 연구는 광과민성 물질인 DH-I-180-3을 이용한 광역학 치료에서 폐암 세포의 세포사멸의 주된 기전이 세포괴사에 의해 이루어 진 것임을 밝혀냈으며, 이와 관련된 유전자들 대부분이 막단백의 변화를 통해 이루어짐을 알 수 있었다.

개체병렬결합(parabiosis)실험모델과 혈액교환을 이용한 노화(aging)연구 분석 (Parabiosis and Blood Exchange Techniques in Aging Research)

  • 정경태
    • 생명과학회지
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    • 제33권2호
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    • pp.208-215
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    • 2023
  • 최근 수십년간 노화연구의 영역은 유전자 수준에서부터 세포 수준을 거쳐 혈액을 교환하는 in vivo 모델까지 진보를 거듭하면서 발전하고 있다. 예쁜꼬마선충에서 수명을 연장시킬 수 있는 유전자의 존재가 알려지면서, 유전체학, 단백질체학, 대사체학, 전사체학과 같은 다양한 분석방법이 사용되면서 보다 다양한 노화 연관 표적분자들이 발견되었다. 따라서, 표적분자들 간의 상호관계에 대한 연구결과도 증가하고 있다. 또한, 두 실험동물을 외과적으로 결합시킨 개체병렬결합 방법을 사용한 노화연구로 노화 현상을 역행시킬 수도 있는 인자가 보고되었고, 젊은 개체의 혈액 내에 존재할 수 있는 노화 역행 인자를 찾기 위한 더 정확하고, 효과적인 연구로 확장되면서, 노화연구의 방법에 새로운 패러다임이 확립되었다. 2022년 실험동물에 정교하게 혈액을 교환할 수 있는 장치에 대한 논문이 발표되었고, 이 장치를 사용한 연구가 노화 역행에 영향을 줄 수 있는 새로운 결과를 제시하였다. 새롭게 고안된 장치와 그로 인한 결과뿐만 아니라 젊은 혈액 또는 조건화된 혈액을 주입하여 얻은 최신 연구결과로 처음 발표되었던 GDF11 외에도 혈액 내에 존재하는 노화 역행 후보물질로서 β2m, TIMP2, VCAM1, Gpld1, clusterin과 같은 혈액 내 용해성 인자뿐만 아니라 mcicroglia 세포와 neuroinflammation과 같은 생화학적 현상이 직접적으로 노화요인으로 증명되고 있다. 이 총설에서는 이 같은 노화연구에 대한 최신 결과에 대해 논의하고자 한다.

Gene Expression Analysis of Megakaryocytes Derived from Human Umbilical Cord $CD34^+$ Cells by Thrombopoietin

  • Kim, Jeong-Ah;Kim, Hyung-Lae
    • Genomics & Informatics
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    • 제3권1호
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    • pp.8-14
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    • 2005
  • Although much is known about the molecular biology of platelets, the megakaryocytes' (MKs) molecular biology was not understood so well because of their rareness. By the cloning and characterization of thrombopoietin (TPO), which is the principal regulator of the growth and development of the MKs, researches on the MKs have been growing rapidly. To understand megakaryocytopoiesis, we investigated the gene expression profile of the MKs using oligonucleotide microarray where 10,108 unique genes were spotted. Comparing the fluorescence intensities of which ratio is $\ge$ ${\mid}2{\mid}$, 372 genes were up-regulated and 541 genes were down-regulated in MKs. For confirmatory expression, RNase protection assay (RPA) establishing abundant apoptotic gene expression was carried out. In MKs, many of the known genes, including several platelet related genes, GATA binding protein were highly expressed. Particularly, TGF beta, clusterin (complement lysis inhibitor), and thymosin beta 4 (actin-sequestering molecules) were expressed highly in MKs. As MKs specific expressed genes may regulate normal and pathologic platelet (and/or MK) functions, the transcript profiling using microarray was useful on molecular understanding of MKs,