• 제목/요약/키워드: Cloning

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알카리 내성 Bacillus sp. YA-14의 Pectate Lyase 유전자의 클로닝과 발현 (Cloning of Pectate Lyase Gene of Alkali-tolerant Bacillus sp. YA-14 and Its Expression in Escherichia coli)

  • Yu, Ju-Hyun;Park, Yoon-Suk;Kim, Jin-Man;Kong, In-Soo;Chung, Yong-Joon
    • 한국미생물·생명공학회지
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    • 제16권4호
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    • pp.316-319
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    • 1988
  • 토양으로부터 분리한 알카리내성 Bacillus sp. YA-14의 Pectate lyase(PL) 유전자를 E. coli에 cloning하여 제조한 재조합 plasmid pYPC29는 삽입 된 1.6kb 단편내에 PL 유전자를 함유하고 있었으며, 이 외래 DNA가 Bacillus sp. YA-14의 chromosomal DNA에서 유래된 것임을 Southern hybridization을 통하여 확인하였다. 재조합 plasmid pYPC29는 E. coli내에서 안정하게 존재하였으며 이를 함유한 재조합체의 전체 PL 활성 중 약 70%가 periplasmic space에 존재하였다.

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Glyphosate 저항성 pseudomonas sp. strain HG-1 의 분리 및 저항성 유전자의 클로닝

  • 이병철;조홍범;채영규;최영길
    • 미생물학회지
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    • 제30권1호
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    • pp.42-46
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    • 1992
  • 본 연구는 제초제의 일종인 glyphosate에 저항성을 갖는 균주를 분리하고 그 유전자를 cloning 함으로써 glyphosate 에 저항성을 갖는 유용작물의 인위적 생성 가능성을 모색코자 하였다. 제초제가 처리된 토양환경으로 부터 glyphosate에 고도의 저항성을 나타내는 균주를 분리하였다. 분리된 균주를 동정한 결과 Pseudomonas cepacia로 밝혀졌으며 10mM의 glyphosate가 처리된 환경에서도 강한 내성을 갖는 것으로 나타났다. Glyphosate 저항성 유전자는 염색체상에 존재하는 것으로 판명되었으며 저항성 유전자를 클로닝한 결과 glyphosate 에 저항성을 나타내는 클론 (E. coli THG-101)을 얻었으며 P. cepacia 에서 유래된 glyphosate 저항성 유전자를 갖고 있는 plasmid pGR19를 확인하였다.

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Molecular Cloning of Seven-band Grouper (Epinephelus septemfasciatus) Growth Hormone cDNA and Its Expression in Escherichia coli

  • Lee Jehee;Munasinghe Helani;Song Choon Bok
    • Fisheries and Aquatic Sciences
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    • 제6권3호
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    • pp.116-124
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    • 2003
  • Isolation and cloning of seven-band grouper (Epinephelus septemfasciatus) growth hormone cDNA from pituitary gland revealed an open reading frame of 612 bp coding for a pre-growth hormone of 204 amino acids with a 17 amino acid putative signal peptide. Deduced amino acid sequence showed that there was one possible N-glycosylation site at $Asn^{l84}$ and four cysteine residues $(Cys^{52},\;Cys^{160},\;Cys^{177},\;Cys^{185})$ on t e same positions as in some other species where they were involved in the stabilization of the tertiary structure. The seven-band grouper growth hormone (sbgGH) presented a $99.5\%$ amino acid sequence identity with the growth hormone of Epinephelus coioides and contained the conserved hormone domain region. Comparison of growth hormone sequences from evolutionarily diverse species revealed 25 amino acid residues conserved in jawless fishes to modern mammals. It also revealed an evolutionary trend to retain the same polypeptide sequence even in the distantly related animals while allowing alterations to occur in polypeptides of the closely related species. In order to create a recombinant system to produce high levels of the growth hormone, it was expressed in Escherichia coli (BL21) cells. The gel analysis revealed theoretically expected molecular weights for both mature and pre-sbgGHs.

역전사효소(逆轉寫酵素) 유전자(遺傳子)의 cloning 에 관(關)한 연구(硏究) (Cloning of Reverse Transcriptase Gene of Avian Sarcoma Virus)

  • 김용웅;김광식;서용택
    • Applied Biological Chemistry
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    • 제31권3호
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    • pp.219-225
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    • 1988
  • Avian Sarcoma Virus의 plasmid DNA중(中)의 역 이사효소의 유전자(遺傳子)를 온도의존성(溫度依存性) 발현(發現) vector인 pPL-lambda에 cloning하여 온도(溫度)에 민감한 phage ${\lambda}$의 repressor인 cI857 gene을 갖고 있는 bacteriophage lysogen인 N4830에 transformation시켰다. transformant를 pL promoter의 발현(發現)을 억제(抑制)하는 저온(低溫)$(28^{\circ}C)$에서 배양(培養)시킨 뒤, 이 repressor를 억제(抑制)하여 transcription을 촉진(促進)하게 하는 고온(高溫)$(42^{\circ}C)$에서 배양(培養)시킨 다음 균체(菌體)를 회수(回收)하여 RNA를 추출(抽出)하고 분석(分析)을 한 결과(結果) 도입(導入)된 역전사 효소 유전자(遺傳子)의 전사(轉寫)가 고온(高溫)에서 증대(增大)되었다.

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국내에서 분리된 canine parvovirus의 구조유전자 cloning과 염기서열 분석 (Cloning and sequencing of the gene encoding structural protein of canine parvovirus isolated in Korea)

  • 박종현;송재영;이중복;현방훈;안수환;전무형
    • 대한수의학회지
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    • 제32권4호
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    • pp.555-567
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    • 1992
  • In this study gene encoding structural proteins of a CPV isolate was cloned and sequenced to elucidate the molecular genetical properties of the canine parvoviruses isolated from the field. Six recombinant plasmids of pEP3, p1471, p2070, pEP069, pEP338 and p14711p were constructed from the map positions 22 to 98 of RF DNA to clone the VP1 and VP2 genes of CPV-V20. Sequentialy the gene comprising 3780 nucleotides were sequenced by dideoxy chain termination method. When nucleotide sequence of gene encoding the structural proteins of CPV-V20 was compared with those of other strains, CPV-N, CPV-d and CPV-780929 published previously, DNA, homologies to CPV-V20 were 99.87% with CPV-N, 99.73% with CPV-d, 96.85% with CPV-780929 and 98.4% with FPLV-Carl, respectively. The DNA sequence data of CPV-V20 showed seven point mutations and also deletion of 135 nucleotides from the nucleotide position 4745 to 4879 located in the 3'-noncoding region of CPV-N.

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Nocardioides sp. J-326TK의 Adenosine Deaminase Gene에 관한 연구 (Studies on the Adenosine Deaminase Gene from Nocardioides sp. J-326TK)

  • 전홍기;백형석;정춘식
    • 생명과학회지
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    • 제8권6호
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    • pp.673-680
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    • 1998
  • Nocardioides sp. J-326TK의 adenosine deaminase gene을 분리하기 위하여 genomic DNA를 제한효소로 무작위적으로 절단하여 pBluscript KS에 ligation시켰다. 또한 hu-man과 mouse, E. cali 등의 adenosine deaminase gene의 보존적인 부위를 primer로 합성을 하여 PCR reaction을 행하였다. Genomic DNA를 cloning시킨 pKSN60은 5kb정도의 DNA를 포함하고 있으며 sourthern hybridization 등의 여러 확인 실험을 통하여 adenosine deaminase gene을 포함하고 있다는 알았다. PCR product를 cloning시켜 형성된 recombinant plasmid를 PCR reaction의 primer로서 pTBN20를 sequencing을 행하였다. 그 결과를 다른 ade-nosine deaminase gene의 서열과 비교를 하였는데 미생물인 E. coli와는 nucleotide sequence는 99.5%, amino acid sequence는 98.9%의 homology를 나타내고 human과는 각각 59.5%, 46.8%의 homolosy를 나타내었다.

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Klebsiella pneumoniae의 nif Gene Cluster의 Cloning 및 Escherichia coli 에서의 발현 (Cloning of nif Gene Cluster from Klebsiella pneumoniae and Expression in Escherichia coli)

  • 이재선;이성희;심웅섭
    • 미생물학회지
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    • 제27권1호
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    • pp.21-26
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    • 1989
  • 한국산 Klebsiella pnelµnoniae KNFl의 chromosomal DNA를 Hind III로 부분소화하고 pBR 322도 같은 효소로 완전소화했다. 소화된 pBR 322 의 5'- 말단연산기를 제거하여 두 DNA 표품을 ligation 한 후 E. coli K060 으로 transformation 하 였다. 이러한 transformants중 N-free 한천배지에서 자라는 단일 colony을을 얻었으며, 이들은 모두 ampicillin에 대해 저 항성을 가지고 있었고 tetracycline에 대해 저항성이 없었으며 cunng 되였을 때는 질소고정능을 잃었다. 이런 사실로부터 이 transformants가 K. pneumoniae의 질소고정능 유전자을 포함하는 recombinant plasmid를 가지고 있음을 확인할 수 있었다. 이들 transformants의 nitrogenase 역가는 K. pneumoniae KNF 1보다 더 높았다.

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Bacillus circulans의 호산성 $\alpha$-amylase 유전자의 클로닝 및 발현 (Cloning and Expression of an Acidophilic $\alpha$-Amylase Gene from Bacillus circulans in Escherichia coli)

  • 이종석;김지연;김한복;이동석
    • 미생물학회지
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    • 제36권2호
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    • pp.112-118
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    • 2000
  • Bacillus circulans KCT3004 유래의 호산성 $\alpha$-amylase 유전자가 pUC19을 vector로 하여 대장균 내에서 클로닝 되었다. 클로닝된 5.8kb Pst I DNA절편은 pUC19내에서의 삽입방향과는 무관하게 $\alpha$-amylans보다 약40배 정도의 높은 효소활성을 나타내었다. 본 연구에서 클로닝 및 발현된 효소의 최적 pH와 온도는 각각 pH 3.6 $45^{\circ}C$였으며, $40^{\circ}C$에서 1시간 동안의 사전 열처리에도 활성의 감소를 일으키지 않았다. 이 효소는 SDS-PAG와 zymogram을 통해 분석해 본 결과 분자량은 약 55,000으로 추정되었으며 기질로 starch만을 가수분해하여 maltoriose 이상의 올리고당 분자들을 주로 생산할수 있었다.

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Identification and Characterization of a Novel Angiostatin-binding Protein by the Display Cloning Method

  • Kang, Ha-Tan;Bang, Won-Ki;Yu, Yeon-Gyu
    • BMB Reports
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    • 제37권2호
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    • pp.159-166
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    • 2004
  • Angiostatin is a potent anti-angiogenic protein. To examine the angiostatin-interacting proteins, we used the display-cloning method with a T7 phage library presenting human cDNAs. The specific T7 phage clone that bound to the immobilized angiostatin was isolated, and a novel gene encoding the displayed polypeptide on the isolated T7 phage was identified. The displayed angiostatin-binding sequence was expressed in E. coli as a soluble protein and purified to homogeneity. This novel angiostatin-binding region interacted specifically to angiostatin with a dissociation constant of $3.4{\times}10^{-7}\;M$. A sequence analysis showed that the identified sequence was a part of the large ORF of 1,998 amino acids, whose function has not yet been characterized. A Northern analysis indicated that the gene containing the angiostatin-binding sequence was expressed differentially in the developmental stages or cell types.

Molecular Cloning and Characterization of Chymotrypsin Inhibitor and Chitin-Binding Protein Homologs from the Bumblebee Bombus terrestris

  • Qiu, Yuling;Yoon, Hyung-Joo;Jin, Byung-Rae
    • International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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    • 제25권1호
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    • pp.115-121
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    • 2012
  • The bumblebee Bombus terrestris is widely used in greenhouses to pollinate crops. Here, we report the molecular cloning and characterization of chymotrypsin inhibitor and chitin-binding protein homologs from B. terrestris. Two cDNAs encoding chymotrypsin inhibitor (Bt-CI) and chitin-binding protein (Bt-CBP) homologs were cloned from B. terrestris. Gene sequence analysis showed that Bt-CI gene consists of three exons encoding 75 amino acids, including a predicted 20-amino acid signal peptide, while Bt-CBP consists of two exons encoding 78 amino acids, including a predicted 26-amino acid signal peptide. The mature Bt-CI and Bt-CBP peptides contain ten and six conserved cysteine residues, respectively. Database searches using the deduced sequences of Bt-CI and Bt-CBP showed similarity to those from B. impatiens (96% peptide sequence identities). Bt-CI and Bt-CBP were expressed in both the venom gland and fat body of B. terrestris worker bees. The recombinant Bt-CI and Bt-CBP peptides were expressed in baculovirus-infected insect cells. Taken together, our findings describe the molecular characterization of Bt-CI and Bt-CBP from B. terrestris.