• Molecular & Cellular Toxicology
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• 제1권4호
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• pp.230-236
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• 2005

Formaldehyde is a common environmental contaminant found in tobacco smoke, paint, garments, diesel and exhaust, and medical and industrial products. Formaldehyde has been considered to be potentially carcinogenic, making it a subject of major environmental concern. However, only a little information on the mechanism of immunological sensitization and asthma by this compound has been known. So, we performed with Jurkat cell line, a human T lymphocyte, to assess the induction of DNA damage and to identify the DEGs related to immune response or toxicity by formaldehyde. In this study, we investigated the induction of DNA single strand breaks by formaldehyde using single cell gel electrophoresis assay (comet assay). And we compared gene expression between control and formaldehyde treatment to identify genes that are specifically or predominantly expressed by employing annealing control primer (ACP)-based $GeneFishing^{TM}$ method. The cytotoxicity ($IC_{30}$) of formaldehyde was determined above the 0.65 mM in Jurkat cell in 48 h treatment. Based on the $IC_{30}$ value from cytotoxicity test, we performed the comet assay in this concentration. From these results, 0.65 mM of formaldehyde was not revealed significant DNA damages in the absence of S-9 metabolic activation system. And the one differentially expressed gene (DEG) of formaldehyde was identified to zinc finger protein 292 using $GeneFishing^{TM}$ method. Through further investigation, we will identify more meaningful and useful DEGs on formaldehyde, and then can get the information on the associated mechanism and pathway with immune response or other toxicity by formaldehyde exposure.

• 한국해양생명과학회지
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• 제9권1호
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• pp.9-21
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• 2024

마비성 패류 독소(Paralytic shellfish poisoning, PSP)는 유해 조류에 의해 생성되며, 독소에 노출된 수산물을 섭취하였을 때 중독이 발생한다. 수산물 중 PSP를 검출하는 표준 시험법인 Mouse bioassay (MBA)는 낮은 검출한계와 동물 윤리 문제로 대체 시험법의 개발 필요성이 대두되고 있다. 이러한 대체 시험법 중, PSP가 신경 세포막의 Na⁺ 채널을 차단하는 기전을 이용한 마우스 뇌신경 모세포종 세포 기반 시험법(Neuro-2a assay)의 표준화를 위한 노력이 대두되고 있다. Neuro-2a assay의 원리는 Neuro-2a 세포주에 Na⁺/K⁺ ATPase 억제제인 Ouabain(O)과 Na⁺ 채널 활성화제인 Veratridine (V)을 처리하여 과도한 Na⁺ 유입으로 인한 세포사멸을 유도한 상태에서, Na⁺ 채널 억제제인 PSP를 처리하게 되면 Na⁺ 유입이 차단되어 세포가 생존하는 것을 측정하는 것이다. 본 연구에서는 PSP 검출을 위한 Neuro-2a assay를 국내 연구 환경에 맞게 다양한 매개변수를 개선하여 최적 시험법을 확립하고자 하였다. 고려한 매개변수들은 세포밀도, 배양 조건 및 PSP 처리 조건 등으로, 그 결과는 아래와 같다. 초기 세포밀도는 40,000 cells/well로, 세포 배양시간 및 처리시간은 각각 24시간으로 설정하였다. 또한 최적 O/V 농도는 500/50 μM로 설정하였다. 본 연구에서 PSP 중 Saxitoxin (STX)에 대해서 O/V 처리가 된 상태에서 S자형 용량-반응 그래프가 도출되는 8가지 농도(368~47,056 fg/μl)를 확인하였고, Neuro-2a assay의 실험실 간 변동성 비교를 통해, 실험의 적정성 확인을 위한 5가지 Quality Control Criteria와 실험 데이터의 신뢰가능 범위(Data Criteria) 6가지를 설정하였다. 확 립된 조건으로 Neuro-2a assay를 진행한 결과 반수영향농도(EC₅₀) 값은 약 1,800~3,500 fg/μl로 나타났다. 실험실 간 변동성 비교 결과, Quality Control Criteria 값 및 Data criteria 값의 변동계수(coefficients of variation (CVs))가 1.98~29.15% 범위로 산출되어 실험의 적정성 및 재현성이 확인되었다. 본 연구를 통해 우리나라에서 활용할 수 있는 PSP 검출용 Neuro-2a assay 시험법의 최적 조건 및 5가지 Quality control 기준을 제시하였고, PSP 중 대표적인 독소인 STX을 대상으로 Neuro-2a assay를 실시한 결과 유의한 EC₅₀ 값을 산출할 수 있었으며, 향후 국내 수산물을 대상으로 MBA를 대체할 수 있는 PSP 검출법으로 활용될 것으로 기대된다.

• 한국생물공학회:학술대회논문집
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• 한국생물공학회 2005년도 생물공학의 동향(XVI)
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• pp.111-111
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• 2005

• 한국생명과학회:학술대회논문집
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• 한국생명과학회 2005년도 국제학술심포지움 The 44th Annual Meeting of Korean Society for Life Science
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• pp.89-89
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• 2005

• Restorative Dentistry and Endodontics
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• 제45권1호
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• pp.2.1-2.7
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• 2020

Objectives: This study aimed to evaluate the cell viability and migration of Endosequence Bioceramic Root Canal Sealer (BC Sealer) compared to MTA Fillapex and AH Plus. Materials and Methods: BC Sealer, MTA Fillapex, and AH Plus were placed in contact with culture medium to obtain sealers extracts in dilution 1:1, 1:2 and 1:4. 3T3 cells were plated and exposed to the extracts. Cell viability and migration were assessed by 3-(4,5-dimethylthiazoyl)-2,5-diphenyl-tetrazolium bromide (MTT) and Scratch assay, respectively. Data were analyzed by Kruskal-Wallis and Dunn's test (p < 0.05). Results: The MTT assay revealed greater cytotoxicity for AH Plus and MTA Fillapex at 1:1 dilution when compared to control (p < 0.05). At 1:2 and 1:4 dilutions, all sealers were similar to control (p > 0.05) and MTA Fillapex was more cytotoxic than BC Sealer (p < 0.05). Scratch assay demonstrated the continuous closure of the wound according to time. At 30 hours, the control group presented closure of the wound (p < 0.05). At 36 hours, only BC Sealer presented the closure when compared to AH Plus and MTA Fillapex (p < 0.05). At 42 hours, AH Plus and MTA Fillapex showed a wound healing (p > 0.05). Conclusions: All tested sealers demonstrated cell viability highlighting BC Sealer, which showed increased cell migration capacity suggesting that this sealer may achieve better tissue repair when compared to other tested sealers.

• 미생물학회지
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• 제55권3호
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• pp.199-205
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• 2019

Yeast two-hybrid는 특정 단백질에 대한 상호작용 파트너 단백질의 선별을 위한 방법으로 개발되었다. 하지만 대규모 단백질 상호작용체 분석을 수행하기에 요구되는 노동과 대량의 한천배지 사용에 따른 문제에 의해 널리 사용되지 못하고 있다. 따라서 본 연구에서는 새로운 리포터 시스템을 yeast two-hybrid 방법에 도입하여 fluorescence-activated cell sorting (FACS) 또는 magnetic-activated cell sorting (MACS)를 이용하여 상호작용 파트너 단백질을 포함하는 효모 클론을 손쉽게 선별할 수 있도록 하였다. 새로운 리포터 시스템은 c-myc 항원 결정기가 총 10번 반복되는 형태로 효모 표면에 발현되도록 하였으며, p53과 SV40 T항원을 이용한 실험을 통하여 리포터 단백질의 정상적인 발현을 flow cytometry 분석을 통하여 확인하였다. 따라서, 새로운 리포터 시스템을 도입한 yeast two-hybrid 방법은 대규모 상호작용체 분석을 위해 필요한 노력을 현저히 줄일 수 있을 것으로 기대한다.

• 대한의생명과학회지
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• 제16권4호
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• pp.279-285
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• 2010

Endogenous cannabinoids (endocannabinoids) display various pharmacological effects including pain control, anti-inflammation, and neuroprotection. The synthesis and release of endocannabinoids are regulated under both physiological and pathological conditions. The main degrading enzyme of endocannabinoid is fatty acid amide hydrolase (FAAH). Therefore we have developed the fluorescence-based assay system for FAAH. We established stable CosM6 cell lines expressing human FAAH. We also synthesized 2-oxo-2H-chromen-7-yl decanoate (DAEC) as a fluorogenic substrate for FAAH. When crude membrane extracts stably expressing FAAH was incubated with DAEC at $25^{\circ}C$, FAAH reacted specifically to DAEC and catalyzes the hydrolysis of DAEC into decanoic acid and highly fluorescent coumarin. Furthermore, the serin hydrolase inhibitor, phenylmethanesulfonylfluoride, inhibited the coumarin release to the reaction buffer in concentration dependent manner. This assay system is suitable for high-throughput screening since this system has simple experimental procedure and measurement method.

• 생명과학회지
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• 제15권5호
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• pp.779-782
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• 2005

Coupled transcription/translation cocktail을 이용하여 R. glutinis EH 유전자를 in vitro에서 합성하고 활성을 평가하였다. SDS-PAGE 및 immunoblotting을 통하여 45 kDa 크기의 EH 단백질이 발현되었음을 확인하였고, NBP assay 및 chiral GC 분석을 통해 발현된 단백질이 (R)-styrene oxide에 대한 입체선택성이 있음을 확인하였다. 따라서 무세포 단백질 합성 시스템을 이용하여 입체선택성을 유지시킨 EH 유전자 발현이 가능하며, 이러한 방법은 putative EH 유전자 탐색 등에 효율적으로 응용될 것이다.

• KSBB Journal
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• 제21권3호
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• pp.212-219
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• 2006

재조합 생물의약품 생산시, 오염물질의 유래는 외인성(외래성 바이러스, 마이코플라즈마, 미생물) 및 내인성(생산세포주 유래 단백질) 두 가지의 일반적인 가능성으로 존재한다. 이 중 생산세포주 유래의 불순 단백질은 환자에게 면역이상반응을 일으킬 수 있어 제품의 안정성과 사용자의 안전상의 문제가 될 수 있다. 따라서 이들 단백질의 오염 여부를 검출하는 방법의 개발이 요구된다. 상용화된 분석제품들은 일반적인 생산세포주 유래 단백질에 대한 분석은 가능하지만, 생산 방법이나 재조합 된 세포의 특성에 따라 달라질 수 있는 고유한 생산세포주 유래 단백질에 대한 분석은 적합하지 못하다. 본 연구에서는 재조합 항체의약품 생산과 정제과정에서 목적단백질의 생산 유전자를 지니지 않는 null cell mock 배양에 의해 생산세포주 유래 모든 단백질을 얻어 이에 대한 다클론항체를 제작하여 면역학적 반응을 이용하여 생산세포주 유래 단백질을 정량 할 수 있는 ELISA 방법을 개발하였다. 생산세포주 유래 단백질에 대한 다클론항체는 rabbit에서 얻었으며, 이 중 생산세포주 유래 단백질에 특이적인 항체만을 정제하였다. 또한 direct sandwich ELISA 방법 개발을 위해 항체에 발색효소(HRP)를 표지하였다. 이렇게 만들어진 항체를 이용하여 정성분석을 위한 Western blot과 정량분석을 위한 ELISA 방법을 개발하여 목적단백질의 정제과정 내에서 생산세포주 유래 단백질이 제거되는 것을 확인하였다. 또한 개발된 ELISA 방법은 ICH 규정에 따라 validation을 실시한 결과 되어 객관적 검증을 받은 결과, 특이성, 직선성, 정확성, 정밀성의 기준을 만족하며 검출한도가 10.8 ppm인 방법임을 확인하였다.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제13권2호
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• pp.689-692
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• 2012

Objective: To investigate correlations between adenosine triphosphate chemotherapy response assay (ATP-CRA) and clinical outcomes after ATP-CRA-based chemotherapy for drug selection in patients receiving intravesical chemotherapy to prevent recurrence of superficial bladder cancer after surgery. Methods: The chemosensitivities of 12 anticancer drugs were evaluated, including 5-Fu ADM, and EPI, using ATP-CRA and primary tumor cell culture in 54 patients. In addition, a further 58 patients were treated according to clinical experience. Differences in post-chemotherapeutical effects between drug sensitivity assay and experience groups were compared. Results: The evaluable rate of the test was 96.3%, the clinical effective rate was 80.8%, the sensitivity rate was 97.6% (41/42), the specificity was 20%, the total predicting accuracy was 74.3%, the positive predictive value was 83.7% (41/49), the negative predictive value was 66.7% (2/3); in the drug sensitivity test group, the clinical effective rate was 80.8%, the experience group response rate was 63.8%, with a significant difference in clinical effects between the ATP-based sensitivity and experience groups (${\chi}^2$=7.0153, P<0.01). Conclusion: ATP-CRA is a stable, accurate and potentially practical chemosensitivity test providing a predictor of chemotherapeutic response in patients with superficial bladder cancer.