• Title/Summary/Keyword: CGH.

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Amplification of the UQCRFS1 Gene in Gastric Cancers

  • Jun, Kyong-Hwa;Kim, Su-Young;Yoon, Jung-Hwan;Song, Jae-Hwi;Park, Won-Sang
    • Journal of Gastric Cancer
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    • v.12 no.2
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    • pp.73-80
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    • 2012
  • Purpose: The specific aim of this study is to unravel a DNA copy number alterations, and to search for novel genes that are associated with the development of Korean gastric cancer. Materials and Methods: We investigated a DNA copy number changes in 23 gastric adenocarcinomas by array-comparative genomic hybridization and quantitative real-time polymerase chain reaction analyses. Besides, the expression of UQCRFS1, which shows amplification in array-CGH, was examined in 186 gastric cancer tissues by an immunohistochemistry, and in 9 gastric cancer cell lines, as well as 24 gastric cancer tissues by immunoblotting. Results: We found common gains at 48 different loci, and a common loss at 19 different loci. Amplification of UQCRFS1 gene at 19q12 was found in 5 (21.7%) of the 23 gastric cancers in an array-comparative genomic hybridization and DNA copy number were increased in 5 (20.0%) out of the 25 gastric cancer in quantitative real-time polymerase chain reaction. In immunohistochemistry, the overexpression of the protein was detected in 105 (56.5%) out of the 186 gastric cancer tissues. Statistically, there was no significant relationship between the overexpression of UQCRFS1 and clinicopathologic parameters (P>0.05). In parallel, the overexpression of UQCRFS1 protein was confirmed in 6 (66.7%) of the 9 gastric cancer cell lines, and 12 (50.0%) of the 24 gastric cancer tissues by immunoblotting. Conclusions: These results suggest that the overexpression of UQCRFS1 gene may contribute to the development and/or progression of gastric cancer, and further supported that mitochondrial change may serve as a potential cancer biomarker.

Efficient Generation of 3-D Video Holograms Using Temporal-Spatial Redundancy of 3-D Moving Images (3차원 동영상의 시ㆍ공간적 정보 중복성을 이용한 효과적인 3차원 비디오 홀로그램의 생성)

  • Kim, Dong-Wook;Koo, Jung-Sik;Kim, Seung-Cheol;Kim, Eun-Soo
    • The Journal of Korean Institute of Communications and Information Sciences
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    • v.37C no.10
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    • pp.859-869
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    • 2012
  • In this paper, a new method to efficiently generate the 3-D(three-dimensional) video holograms for 3-D moving scenes, which is called here the TSR-N-LUT method, is proposed by the combined use of temporal-spatial redundancy(TSR) of 3-D video images and novel look-up table(N-LUT) technique. That is, in the proposed scheme, with the differential pulse code modulation (DPCM) algorithm, temporally redundancy redundant data in the inter-frame of a 3-D video images are removed between the frames, and then inter-line redundant data in the inter-frame of 3-D video images are also removed by using the DPCM method between the lines. Experimental results show that the proposed method could reduced the number of calculated object points and the calculation time of one object point by 23.72% and 19.55%, respectively on the average compared to the conventional method. Good experimental results with 3-D test moving pictures finally confirmed the feasibility of the proposed method to the fast generation of CGH patterns of the 3-D video images.

Diffraction Efficiency Analysis for Reconstruction of Digital Hologram based on SLM (SLM 기반의 디지털 홀로그램 복원에 대한 회절효율 특성 분석)

  • Seo, Young-Ho;Lee, Yoon-Huck;Kim, Dong-Wook
    • Journal of Broadcast Engineering
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    • v.24 no.3
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    • pp.452-462
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    • 2019
  • A digital hologram, which is one of the next generation visual systems, can be generated and displayed in various formats, and a digital hologram is created in accordance with the characteristics of the system for display. Diffraction efficiency can be used as a measure of the characteristics of digital holograms generaged under various conditions in various display environments. In this paper, diffraction efficiency for computer-generated hologram (CGH) under various conditions was measured. This paper discusses the generation conditions that should be considered in hologram display. We compared each condition by measuring the intensity of the first order diffraction pattern of the fringe generated under the Fresnel condition for the phase hologram. Through this paper, we showed the tend about characteristics of the diffraction efficiency according to object point, reconstruction distance, laser and SLM.

Prenatal Diagnosis of the 22q11.2 Duplication Syndrome

  • Lee, Moon-Hee;Park, So-Yeon;Lee, Bom-Yi;Choi, Eun-Young;Kim, Jin-Woo;Park, Ju-Yeon;Lee, Yeon-Woo;Oh, Ah-Rum;Lee, Shin-Young;Yang, Jae-Hyug;Ryu, Hyun-Mee
    • Journal of Genetic Medicine
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    • v.6 no.2
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    • pp.175-178
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    • 2009
  • The 22q11.2 duplication syndrome is an extremely variable disorder with a phenotype ranging from normal to congenital defects and learning disabilities. Recently, the detection rate of 22q11.2 duplication has been increased by molecular techniques, such as array CGH. In this study, we report a familial case of 22q11.2 duplication detected prenatally. Her first pregnancy was terminated because of 22q11.2 duplication detected incidentally by BAC array CGH. The case was referred due to second pregnancy with same 22q11.2 duplication. We perfomed repeat amniocentesis for karyotype and FISH analysis. Karyotype analysis from amniocytes and parental lymphocytes were normal, while FISH analysis of interphase cells presented a duplication of 22q11.2 in the fetus and phenotypically normal mother. The fetal ultrasound showed grossly normal finding. After genetic counseling about variable phenotype with intrafamilial variability with 50% recurrence rate, the couple decided to continue the pregnancy. The newborn had no apparent congenital abnormalities until 2 weeks after birth. We recommend that family members of patients with a 22q11.2 duplication be tested by the interphase FISH analysis. Also, we point out the importance of genetic counseling and an evaluation of the clinical relevance of diagnostic test results.

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A System Architecture for Digital Holographic Video Service (디지털 홀로그래픽 비디오 서비스 시스템의 구조)

  • Seo, Young-Ho;Bae, Yoon-Jin;Choi, Hyun-Jun;Yoo, Ji-Sang;Kim, Dong-Wook
    • Proceedings of the Korean Society of Broadcast Engineers Conference
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    • 2010.11a
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    • pp.21-22
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    • 2010
  • 본 논문에서는 디지털 홀로그래피 방식의 비디오 서비스를 위한 서비스 시스템의 구조를 제안하고자 한다. 실사 영상의 디지털 홀로그래피 서비스를 위해서 레이저를 이용한 광학적인 홀로그램 획득이 아닌 실사 기반의 홀로그램 획득 방법을 이용한다. 실사 기반의 홀로그램 획득 방법에는 스테레오 및 다시점 카메라, 그리고 깊이 카메라를 이용하는 것들이 포함된다. 각 카메라 시스템으로 획득된 정보는 깊이와 RGB 정보로 만들어진 후에 컴퓨터 생성 홀로그램(computer-generated hologram, CGH) 과정을 거치면서 홀로그램이 된다. 생성된 홀로그램은 SLM(spatical light modulator)를 통해서 복원되어 영상 서비스를 제공한다. 또한 디지털 홀로그램 기반의 비디오 서비스를 위한 신호처리 기법들을 종합적으로 논의하고, 마지막으로 스테레오 및 깊이 카메라 기반의 홀로그램 생성 결과들을 보인다.

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Fast Hologram Generation Method Using Scheduling of Multi-GPGPUs (다중 GPGPU의 스케쥴링을 이용한 고속 홀로그램 생성 방법)

  • Lee, Yoon-Hyuk;Seo, Young-Ho;Kim, Dong-Wook
    • Proceedings of the Korean Society of Broadcast Engineers Conference
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    • 2016.06a
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    • pp.364-365
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    • 2016
  • 컴퓨터 생성 홀로그램(CGH)는 방대한 계산 량을 가지고 있어, 고해상도의 홀로그램을 생성하기 위하여 고속 홀로그램 생성 방법이 필요하다. 본 논문에서는 다중 GPGPU의 스케쥴링 기법을 이용하여 고속화 하는 방법을 제안한다. 첫 번째로는 커널 내에서 공유 메모리를 이용한 스케쥴링 기법을 통하여 고속화를 하고, 두 번째로는 GPGPU간의 P2P(peer-to-peer)데이터 전송을 이용한 스케쥴링을 했다. nVidia의 GTX680 2개 GPGPU를 이용하여 기존의 방법보다 약 50%의 속도 향상을 확인하였다.

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Parametric Study for a Diffraction Optics Fabrication by Using a Direct Laser Lithographic System (회절광학소자 제작을 위한 레이저 직접 노광기의 공정실험)

  • Kim, Young-Gwang;Rhee, Hyug-Gyo;Ghim, Young-Sik;Lee, Yun-Woo
    • Journal of the Korean Society for Precision Engineering
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    • v.33 no.10
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    • pp.845-850
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    • 2016
  • A direct laser lithography system is widely used to fabricate various types of DOEs (Diffractive Optical Elements) including lenses made as CGH (Computer Generated Hologram). However, a parametric study that uniformly and precisely fabricates the diffractive patterns on a large area (up to $200mm{\times}200mm$) has not yet been reported. In this paper, four parameters (Focal Position Error, Intensity Variation of the Lithographic Beam, Patterning Speed, and Etching Time) were considered for stabilization of the direct laser lithography system, and the experimental results were presented.

Digital Hologram Data Compression Scheme using Motion Estimation in Frequency-domain (주파수 영역에서 움직임 예측을 이용한 디지털 홀로그램 압축 기법)

  • Bae, Yun-Jin;Choi, Hyun-Jun;Seo, Young-Ho;Kim, Dong-Wook
    • Proceedings of the Korean Society of Broadcast Engineers Conference
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    • 2010.07a
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    • pp.108-111
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    • 2010
  • 본 논문에서는 기존의 2차원 영상/비디오 압축 기술을 홀로그램의 특성에 적합하게 변형시켜서 홀로그램 데이터를 압축하는 압축 기법을 제안하였다. 컴퓨터 생성 홀로그램(computer generated holograms, CGH) 기법을 이용해 생성한 디지털 홀로그램을 사용하였다. 본 논문에서는 전처리된 디지털 홀로그램에 대해 분할, 주파수 변환, 움직임 예측과 주파수 영역에서의 잔여영상 생성 기법을 적용하여 데이터 압축을 수행한다. 압축은 H.264/AVC, 무손실 압축기법인 BinHex와, 선형 양자화를 이용하였고, 실험 결과를 보면 제안한 데이터 압축 기법은 전체 압축률이 10:1~90:1까지 변화함에따라 25.4dB~16.5dB로 감소함을 확인할 수 있다. 그러나 시각적인 영상의 품질은 앞서 제시한 PSNR값 보다 훨씬 우수함을 확인 할 수 있다.

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Effective light source-based SNR scalable coding of Digital Hologram (디지털 홀로그램의 효과적인 광원 기반의 SNR 스케일러블 코딩 기법)

  • Kim, Younjoo;Lee, Yoon-Hyuk;Seo, Young-Ho;Kim, Dong-Wook
    • Proceedings of the Korean Society of Broadcast Engineers Conference
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    • 2013.06a
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    • pp.77-79
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    • 2013
  • 본 논문에서는 광원 정보를 사용하여 다양한 재생환경에서 효과적인 홀로그래픽 비디오 서비스를 제공하기 위한 방법을 제안한다. 제안하는 기법에서 부호화 과정에서는 가우시안 블러를 적용한 영상의 개수를 조절, 분리 하고 다운 샘플링 한 하나의 영상 압축을 한 뒤 전송한다. 이 영상을 다운 샘플링, 업 샘플링, 보간법, 양방향 필터 (Bi-lateral filter) 등의 기법을 이용하여 획득한 영상과 나머지 영상을 다운 샘플링과 업 샘플링 하여 더한 영상의 차를 압축하여 수신측으로 전송한다. 복호화 과정에서는 압축된 광원 정보를 복원한 후 기본계층 정보를 가진 영상을 업 샘플링과 보간법, 양방향 필터 (Bi-lateral filter) 등의 기법을 적용하고 수신자의 환경과 고려에 따라 차영상을 더 한 후 CGH를 통해 홀로그램을 획득하였다. 실험을 통해 제안하는 기법이 기존의 방법들 보다 우수한 홀로그램을 복원 할 수 있다는 것을 확인하였다.

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Digital Hologram Compression Scheme based on Fresnelet Transform (Fresnelet 변환 기반의 디지털 홀로그램 압축 기법)

  • Kim, Wooyoul;Lee, Yoonhyuk;Seo, Youngho;Kim, Dongwook
    • Proceedings of the Korean Society of Broadcast Engineers Conference
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    • 2013.06a
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    • pp.80-82
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    • 2013
  • 최근 3D의 발전으로 다음 세대의 3D 기술로 디지털 홀로그램을 지목하고 있다. 본 논문에서는 CGH 영상에서 Fresnelet 변환을 통해 주파수 영역에서 각각의 부대역의 특성에 따라 양자화를 다르게 적용하였고, 무손실 부호화인 허프만 코딩을 이용하여 데이터를 압축하는 방법을 제안한다. 실험결과 영상 품질이 다소 열화 되었다는 것을 PSNR 감소를 통해 알 수 있었고, PSNR이 33.50dB인 영상과 원본 영상을 비교하였을 때, 아주 좋은 영상 품직을 갖는 것을 확인 할 수 있었다. 압축률은 PSNR 33.5dB에서 약 50:1의 결과를 보였다.

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