• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제20권11호
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• pp.1655-1661
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• 2007

Prolyl 4-hydroxylase (P4H) plays a central role in collagen synthesis by catalyzing the hydroxylation of the proline residue in the X-Pro-Gly amino acid sequence, and controls the biosynthesis of collagen that influences overall meat quality. In order to verify expression level of the catalytic ${\alpha}$ subunit of P4H, a 2.7 kb clone of the ${\alpha}$ subunit gene for P4H was selected from a cDNA library prepared from the muscular tissue of Sancheong berkshire pigs, and the whole gene sequence was determined. As expression level of the ${\alpha}$ subunit of P4H differed between tissues of pigs, we intended to assess more precisely the level of ${\alpha}$-subunit expression between tissues of Sancheong Berkshire pigs by using RT-PCR. Muscular and adipose tissues were taken from each pig grouped by growth stage (weighing 60, 80, and 110 kg) of Yorkshire and Sancheong Berkshire pigs, and the expression levels of the ${\alpha}$-subunit of P4H were examined. Since there were significant differences in the expression level with respect to variation in growth stage (p<0.01), an attempt was made to identify any influences of pig species and tissue variation. The muscular and adipose tissues of pigs weighing 110 kg showed higher expression levels than pigs weighing 60 kg and 80 kg. In general, significantly higher expression levels were found in muscular than in adipose tissue. The expression levels in Sancheong Berkshire were significantly higher than in Yorkshire pigs (p<0.01 or p<0.05). Since expression level of the ${\alpha}$-subunit of P4H affects the activity of P4H and is connected to the biosynthesis of collagen and increased collagen can improve meat texture, this finding may explain why meat quality of the Sancheong Berkshire pig is acclaimed in Korea. Given the higher expression levels of the ${\alpha}$-subunit gene in adipose than in muscular tissue, and also in the heavier pigs, more intensive studies are required to assess the correlation between expression level of the ${\alpha}$ subunit gene and overall meat quality.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제31권5호
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• pp.650-657
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• 2018

Objective: The study investigated the biological functions and mechanisms for controlling cashmere growth of Liaoning cashmere goat by ovarian carcinoma immunoreactive antigen-like protein 2 (OCIAD2) and decorin (DCN) genes. Methods: cDNA library of Liaoning cashmere goat was constructed in early stages. OCIAD2 and DCN genes related to cashmere growth were identified by homology analysis comparison. The expression location of OCIAD2 and DCN genes in primary and secondary hair follicles (SF) was performed using in situ hybridization. The expression of OCIAD2 and DCN genes in primary and SF was performed using real-time polymerase chain reaction (PCR). Results: In situ hybridization revealed that OCIAD2 and DCN were expressed in the inner root sheath of Liaoning cashmere goat hair follicles. Real-time quantitative PCR showed that these genes were highly expressed in SF during anagen, while these genes were highly expressed in primary hair follicle in catagen phase. Melatonin (MT) inhibited the expression of OCIAD2 and promoted the expression of DCN. Insulin-like growth factors-1 (IGF-1) inhibited the expression of OCIAD2 and DCN, while fibroblast growth factors 5 (FGF5) promoted the expression of these genes. MT and IGF-1 promoted OCIAD2 synergistically, while MT and FGF5 inhibited the genes simultaneously. MT+IGF-1/MT+FGF5 inhibited DCN gene. RNAi technology showed that OCIAD2 expression was promoted, while that of DCN was inhibited. Conclusion: Activation of bone morphogenetic protein (BMP) signaling pathway up-regulated OCIAD2 expression and stimulated SF to control cell proliferation. DCN gene affected hair follicle morphogenesis and periodic changes by promoting transforming growth $factor-{\beta}$ ($TGF-{\beta}$) and BMP signaling pathways. OCIAD2 and DCN genes have opposite effects on $TGF-{\beta}$ signaling pathway and inhibit each other to affect the hair growth.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제26권6호
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• pp.483-489
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• 1998

효모의 전체 게놈서열에서 확인된 새로운 티오레독신(Trx3)과 이미 효모에서 티오레독신으로서의 기능이 보고된 Trx1, 2 및 TR을 대장균에 발현시켜 정제후 활성을 비교, 조사하였다. Trx1, 2 및 TR은 대부분 수용성 분획에 발현되었으며, 이로부터 정제한 단백질의 분자량은 보고된 분자량과 일치하였다. Trx3는 수용성 분획과 침전 분획 모두에서 발현되었으며, 수용성 분획으로부터 정제한 Trx3의 분자량은 14 kDa이었고, 침전 분획의 Trx3는 18 kDa였다. 수용성 분획으로부터 정제한 Trx3의 아미노말단의 아미노산 서열은 FQSSYTS로 분석되었으며 이는 보고된 Trx3의 20번에서 26번의 아미노산에 해당하였다. NADPH, 티오레독신 환원효소와 함께 Trx3는 인슐린과 DTNB의 disulfide 결합을 환원시켰다. Trx3는 디티오트레이톨을 포함하는 금속촉매산화계에 의한 효소 불활성화를 억제하는 TPx1의 항산화효과를 증가시켰으며, TPx1의 항산화활성을 증가시키는 Trx3의 활성은 Trx1 또는 2의 10% 수준이었다. 또한 Trx3는 TPx1의 disulfide를 thiol로 환원시켜 TPx가 티오레독신 의존성 과산화물 분해활성을 갖도록 하였다. Western blotting실험 결과, Trx3에 대한 항체는 효모 조추출물과 정제된 Trx1 및 Trx2와는 교차반응 하지 않았다. 그러나, 효모 CDNA 유전자 은행을 template로 한 PCR 실험 에서는 Trx3를 암호화하는 유전자가 증폭되었다.

• 한국음향학회지
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• 제30권1호
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• pp.22-32
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• 2011

본 논문은 건축음향 설계에 있어서 가장 많이 활용되고 있는 컴퓨터 시뮬레이션의 정밀도 향상을 위한 3차원 모델의 구체성에 대하여 연구하였다. 본 연구에서는 건축음향 시뮬레이션 프로그램인 odeon 6.5에서 제시하고 있는 transition order의 단계를 기준으로 3D 모델의 구체성을 총 4단계로 구분하였다. 각 실내마감재의 흡음률은 도면에 표기된 재료를 odeon의 material library 및 시험성적서를 참고해 입력하였으며 확산률은 odeon의 마감의 표면형태에 따른 권장치를 입력하였다. 또한 room setup 설정시 사용음선수를 동일하게 입력하였으며, trasition order는 각 모델의 유효표면수에 맞게 입력하였다. 실제 공연장에서 측정한 현장음향실험 결과를 기준으로 시뮬레이션 결과와 비교하여 물리적 음향인자 (음압레벨, 잔향시간, 명료도 등)의 오차를 분석하였다. 또한 가청화시재를 제작하여 현장에서 녹음한 음원과 청감실험을 통해 비교하여 주관적 음향인자 (잔향감, 명료함 등)별 유사 정도를 평가하였다. 물리적 음향인자 분석결과, 가장 구체적인 3D모델의 잔향시간 오차가 가장 작게 나타났으며 명료도의 경우 단순한 모델의 오차가 가장 작았다. 그러나 단순한 모델은 저주파수 대역의 오차가 상대적으로 매우 크게 나타남에 따라 3D 모델을 구체적으로 작성할수록 보다 정밀한 음향예측이 가능할 것으로 판단된다. 또한 주관적 청감실험 결과, 물리적 오차가 작을수록 가청화시재가 원음과 가장 유사하게 들린다고 응답함으로써 3D 모델의 구체성이 가청화시제 제작에 영향을 미치고 있음을 알 수 있었다.

• 한국멀티미디어학회논문지
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• 제2권2호
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• pp.217-229
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• 1999

프레임워크는추상화된 클래스들의 집합또는특정 도메인에서 재사용가능한설계를구성하는상호연관된 클래스틀의 집합으로 도메인에 속한 애플리케이션들간의 공통된 아키텍쳐를 정의한다- 프레엄워크를 재사용 함으로 개발자들은 클래스 코드뿐만 아니라 도메인에 대한 폭넓은 도메인 지식을 재사용할 수 있다. 따라서 본 논문에서는 프레임워크 재사용을 위해 컴퍼넌트기반의 방법론(COM; Component→Oriented M Methodology)을 제시하고 프레임워크 구축환경을 개발한다. 즉, 컴퍼넌트기반의 소프트웨어 생성을 위해 실세계의 도메인 지식을 입력으로 도메인을 분석하고 분석된 정보를 통해 hotspot을 식별하여 사용자와 개빌 자의 추가정보를 첨가하는 재설계 과정올 거친다. 이후 도메인에 따라 도메인 프레임워크와 애플리케이션 프레임워크를 생성한다 이러한 컴퍼넌트 지향 방법론은 내부적으로는 컴퍼넌트/패턴 라이브러리 저장소를 통해 정보를 검색, 이해하여 추출하거나 혹은 합성으로 얻어진 정보는 각각 컴퍼넌트와 패턴에 대한 정보로 분류되고 이것은 재설계시 추가정보로 사용되어진다. 이로 인해 사용자는 멀티미디어 컴퍼넌트를 이용해 자신의 애플리케이션에 쉽게 적용가능한 개발 환경 즉, 본 논문에서는 CORBA(Common Object Request B Broker Architecture) 환경하에 컴퍼넌트/패턴 관리 시스템(Component Pattern Management System C CPMS)을 통해 멀티 미 디 어 컴 퍼 넌트를 추가 갱 신 삭제하는 기 반 환경 (infrastructure environment)을 구축함 으로 재사용성, 사용의 용이성과 이식성을 가질 수 있다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제34권1호
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• pp.58-62
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• 2006

티로신 및 방향족 아미노산 유도체의 생물학적 합성에 이용되는 유용 효소인 tyrosine phenol-lyase(TPL) 활성을 평판배지에서 정량적으로 감지할 수 있는 기술을 개발하였다. 불투명 평판배지(turbid plate)의 제조과정은 먼저, 2 N염산과 DMSO로 조성된 공용매에 난용성 티로신을 400 mM 농도로 녹여서 배지에 가하고, 온도를 조절하여 니들형 티로신을 형성하도록 결정화를 유도하는 것이었다. 니들형 티로신은 일반적인 컬럼형에 비하여 약 $5{\sim}6$배 낮은 농도인 3.6g/L에서도 불투명 평판배지를 제조할 수 있었으며, 효소활성에 의하여 쉽게 분해되고, TPL활성의 고감도 고속탐색기술 개발에 적합하였다. 이 불투명 평판배지에 변이유발PCR법으로 제조한 TPL 라이브러리를 도말하고, 단일 콜로니 주변에서 형성되는 투명환의 크기와 실측한 TPL활성을 비교한 결과 직접적인 비례관계가 있음을 확인하였다. 따라서 난용성 물질의 미세입자를 평판배지에서 직접 발생시킨 후, 효소활성에 의한 투명환의 형성을 정량 관찰하는 본 연구의 방법은 신규 고활성 TPL의 분리 및 방향성 분자진화 등을 위한 고속탐색기술에 유용하게 사용될 수 있다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제20권7호
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• pp.1057-1066
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• 2007

Six male Gayal (Bos frontalis), approximately two years of age and with a mean live weight of $203{\pm}17$ kg ($mean{\pm}standard\;deviation$), were housed indoors in metabolism cages and fed bamboo (Sinarundinaria) leaves and twigs. After an adjustment period of 24 days of feeding the diet, samples of rumen liquor were obtained for analyses of bacteria in the liquor. The diversity of rumen bacteria was investigated by constructing a 16S rDNA clone library. A total of 147 clones, comprising nearly full length sequences (with a mean length of 1.5 kb) were sequenced and submitted to an on-line similarity search and phylogenetic analysis. Using the criterion of 97% or greater similarity with the sequences of known bacteria, 17 clones were identified as Ruminococcus albus, Butyrivibrio fibrosolvens, Quinella ovalis, Clostridium symbiosium, Succiniclasticum ruminis, Selenomonas ruminantium and Allisonella histaminiformans, respectively. A further 22 clones shared similarity ranging from 90-97% with known bacteria but the similarity in sequences for the remaining 109 clones was less than 90% of those of known bacteria. Using a phylogenetic analysis it was found that the majority of the clones identified (57.1%) were located in the low G+C subdivision, with most of the remainder (42.2% of clones) located in the Cytophage-Flexibacter-Bacteroides (CFB) phylum and one clone (0.7%) was identified as a Spirochaete. It was apparent that Gayal have a large and diverse range of bacteria in the rumen liquor which differ from those of cattle and other ruminants. This may explain the greater live weights of Gayal, compared to cattle, grazing in the harsh natural environments in which Gayal are located naturally.

• Asian Pacific Journal of Cancer Prevention
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• 제15권22호
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• pp.9731-9737
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• 2014

Large scale secular registry or surveillance systems have been accumulating vast data that allow mathematical modeling of cancer incidence and mortality rates. Most contemporary models in this regard use time series and APC (age-period-cohort) methods and focus primarily on predicting or analyzing cancer epidemiology with little attention being paid to implications for designing cancer registry, surveillance or evaluation initiatives. This research models age-specific cancer incidence rates using logistic growth equations and explores their performance under different scenarios of data completeness in the hope of deriving clues for reshaping relevant data collection. The study used China Cancer Registry Report 2012 as the data source. It employed 3-parameter logistic growth equations and modeled the age-specific incidence rates of all and the top 10 cancers presented in the registry report. The study performed 3 types of modeling, namely full age-span by fitting, multiple 5-year-segment fitting and single-segment fitting. Measurement of model performance adopted adjusted goodness of fit that combines sum of squred residuals and relative errors. Both model simulation and performance evalation utilized self-developed algorithms programed using C# languade and MS Visual Studio 2008. For models built upon full age-span data, predicted age-specific cancer incidence rates fitted very well with observed values for most (except cervical and breast) cancers with estimated goodness of fit (Rs) being over 0.96. When a given cancer is concerned, the R valuae of the logistic growth model derived using observed data from urban residents was greater than or at least equal to that of the same model built on data from rural people. For models based on multiple-5-year-segment data, the Rs remained fairly high (over 0.89) until 3-fourths of the data segments were excluded. For models using a fixed length single-segment of observed data, the older the age covered by the corresponding data segment, the higher the resulting Rs. Logistic growth models describe age-specific incidence rates perfectly for most cancers and may be used to inform data collection for purposes of monitoring and analyzing cancer epidemic. Helped by appropriate logistic growth equations, the work vomume of contemporary data collection, e.g., cancer registry and surveilance systems, may be reduced substantially.

• 전자공학회논문지CI
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• 제45권4호
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• pp.12-18
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• 2008

입자 물리 방사선 연구는 우리 일상생활의 많은 부분에 도움을 주고 있다. 비파괴검사를 가능하게 하여 우리가 사용하는 물건의 안전성을 검증하고, 사람에게 유해한 환경을 판단하고, 사람의 질병을 치료하는 등 다양한 분야에서 활용되고 있다. 이와 같이 입자 물리 방사선 연구는 유용하지만 직접적인 실험을 하기가 어려워 컴퓨터 시뮬레이션을 이용한다. 그 중 현재 대표적인 입자 물리 시뮬레이션 라이브러리 중 하나가 Geant4이다. 그러나 Geant4는 시뮬레이션을 하기 위해 사용자가 직접 C++언어를 통하여 프로그램을 작성해야 하는 어려움이 있다. 이 어려움을 해결하기 위해 물리연구자의 요구사항을 분석하여 Geant4 에 맞는 시뮬레이션 환경을 생성하는 시뮬레이션 자동화 프레임워크인 Geant4Editor를 설계하였다. Geant4Editor는 자원 관리자(Data Manager)를 통하여 자원(사용자 생성 데이터)을 효율적으로 관리하며, 시뮬레이션에서 필요한 필수 클래스를 사용자의 요구를 반영하여 자동으로 생성한다.

• 대한한방소아과학회지
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• 제27권1호
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• pp.36-49
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• 2013

Objectives The goal of this review is to investigate clinical and experimental studies on external application treatment for atopic dermatitis in Korean literature and to propose for the better method of clinical studies in order to seek more effective treatment. Methods Electronic researches were performed with KTKP, OASIS, National Assembly Library, Korean Medicine Database, KISS, DBpia, and KISTI. Results and Conclusions In Twenty six studies, the numbers of clinical and experimental studies are respectively 10 (38.46%) and 16 (61.54%). The numbers of studies that used herbal complex were 20 (76.92%), and out of that, 6 studies had used a single herbal medicine (23.08%). The external application with oriental medicine for the atopic dermatitis used with Phellodendri Cortex (7), Sophorae Radix (6), Scutellariae Radix (6), Lonicerae Flos (5), Coptidis Rhizoma (5) and so on. Among the clinical studies, the 5 studies were double-blind and randomized-controlled study (50%). The numbers of studies that used Hanifin and Rajka Diagnostic Criteria (1980) were 6 (60%), and that used the Diagnostic Criteria in Korean Atopic Dermatitis (2005) were 4 (40%). Among the clinical studies, categories to evaluate of atopic dermatitis are respectively SCORAD Index (80%), Total IgE (80%), Eosinophil count (70%) and so on. All of the clinical studies (100%) showed a statistically significant decline in atopic dermatitis according to the SCORAD Index, Modified SCORAD Index, the Clinic index score. Among the experimental studies, the numbers of studies that used NC/Nga mice were 9 (56.25%), and out of that 5 studies used BALB/c mice (31.25%). Most of the studies (68.75%) used DNCB as allergy inducing materials. The scales for evaluation of atopic dermatitis were Clinical skin severity score, Histopathologic examination, Immunohematologic examination, safety test and so on. In 12 cases (75%) of experimental studies, the IgE level of experimental group showed a statistically significant decline after using external application. In 8 study cases (50%), Clinical skin severity score of experimental group showed a statistically significant decline after using external application.