mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 관여하는 발아효모 Saccharomyces cerevisiae의 SAC3유전자와 유사한 분열효모 Schizosaccharomyces pombe의 유전자 (spSac3로 명명)의 결실돌연변이주 (knockout mutant)를 제조하여 그 특성을 조사하였다. S. pombe의 이배체 (diploid) 균주에서 한 spSac3 유전자만을 결실시킨 후 4분체분석 (tetrad analysis)을 수행한 결과, 이 유전자는 성장에 필수적이었다. 또한 in situ hybridization을 통해 세포 내의 poly(A)+ RNA분포를 살펴본 결과, spSac3 유전자의 결실돌연변이주는 mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 이상이 있었다. 이와 같은 결과들은 spSac3 유전자 역시 mRNA의 핵에서 세포질로의 이동에 매우 중요한 역할을 담당하고 있음을 시사한다.
Kim, Eunha;Ahn, Hyoungjoon;Kim, Min Gyu;Lee, Haein;Kim, Seyun
Molecules and Cells
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제40권5호
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pp.315-321
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2017
The inositol polyphosphates are a group of multifunctional signaling metabolites whose synthesis is catalyzed by a family of inositol kinases that are evolutionarily conserved from yeast to humans. Inositol polyphosphate multikinase (IPMK) was first identified as a subunit of the arginine-responsive transcription complex in budding yeast. In addition to its role in the production of inositol tetrakis- and pentakisphosphates ($IP_4$ and $IP_5$), IPMK also exhibits phosphatidylinositol 3-kinase (PI3-kinase) activity. Through its PI3-kinase activity, IPMK activates Akt/PKB and its downstream signaling pathways. IPMK also regulates several protein targets non-catalytically via protein-protein interactions. These non-catalytic targets include cytosolic signaling factors and transcription factors in the nucleus. In this review, we highlight the many known functions of mammalian IPMK in controlling cellular signaling networks and discuss future challenges related to clarifying the unknown roles IPMK plays in physiology and disease.
출아효모 Saccharomyces cerevisiae에서 RNA-binding 단백질인 Tho1은 mRNA가 전사되는 동안 초기 mRNA에 결합하여 mRNP 생성과 성숙한 mRNA의 핵에서 세포질로의 방출에 관여하는 것으로 여겨진다. 분열효모 Schizosaccharomyces pombe에서도 Tho1과 유사한 단백질을 암호화하는 유전자(spTho1로 명명)를 찾아 그 특성을 조사하였다. 이배체 S.pombe 균주에 하나의 spTho1 유전자만을 결실시킨 후 4분체분석을 수행한 결과, 이 유전자는 생장에 반드시 필요하지 않았다. 또한 spTho1 결실 돌연변이는 mRNA의 핵에서 세포질로의 방출도 정상적으로 보였다. 그러나 티아민에 의해 발현이 조절되는 강력한 프로모터를 이용하여 spTho1를 과발현시키면, 세포의 생장이 억제되었으며 $poly(A)^+$ RNA가 핵 안에 축적되었다. 이와 같은 결과들은 spTho1 유전자가 필수적이지는 않지만 mRNA의 핵에서 세포질로의 방출에 관여하고 있음을 시사한다.
Cell polarity is critical for the division, differentiation, migration, and signaling of eukaryotic cells. RAX2 of budding yeast encodes a membrane protein localized at the cell cortex that helps maintain the polarity of the bipolar pattern. Here, we designate SPAC6f6.06c as $rax2^+$ of Schizosaccharomyces pombe, based on its sequence homology with RAX2, and examine its function in cell polarity. S. pombe $rax2^+$ is not essential, but ${\Delta}rax2$ cells are slightly smaller and grow slower than wild type cells. During vegetative growth or arrest at G1 by mutation of cdc10, deletion of $rax2^+$ increases the number of cells failing old end growth just after division. In addition, this failure of old end growth is dramatically increased in ${\Delta}tea1{\Delta}rax2$, pointing to genetic interaction of $rax2^+$ with $tea1^+$. ${\Delta}rax2$ cells contain normal actin and microtubule cytoskeletons, but lack actin cables, and the polarity factor for3p is not properly localized at the growing tip. In ${\Delta}rax2$ cells, and endogenous rax2p is localized at the cell cortex of growing cell tips in an actin- and microtubule-dependent manner. However, ${\Delta}rax2$ cells show no defects in cell polarity during shmoo formation and conjugation. Taken together, these observations suggest that rax2p controls the cell polarity of fission yeast during vegetative growth by regulating for3p localization.
Hur, Jae-Young;Kang, Gum-Yong;Choi, Min-Yeon;Jung, Jin Woo;Kim, Kwang-Pyo;Park, Sang-Hyun
Molecules and Cells
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제26권1호
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pp.41-47
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2008
Mitogen-activated protein kinase (MAPK) signaling is a crucial component of eukaryotic cells; it plays an important role in responses to extracelluar stimuli and in the regulation of various cellular activities. The signaling cascade is evolutionarily conserved in the eukaryotic kingdom from yeast to human. In response to a variety of extracellular signals, MAPK activity is known to be regulated via phosphorylation of a conserved $T{\times}Y$ motif at the activation loop in which both threonine and tyrosine residues are phosphorylated by the upstream kinase. However, the mechanism by which both residues are phosphorylated continues to remain elusive. In the budding yeast, Saccharomyces cerevisiae, Fus3 MAPK is involved in the mating signaling pathway. In order to elucidate the functional mechanism of MAPK activation, we quantitatively profiled phosphorylation of the $T{\times}Y$ motif in Fus3 using mass spectrometry (MS). We used synthetic heavy stable isotope-labeled phosphopeptides and nonphosphopeptides corresponding to the proteolytic $T{\times}Y$ motif of Fus3 and accompanying data-dependent tandem MS to quantitatively monitor dynamic changes in the phosphorylation events of MAPK. Phosphospecific immunoblotting and the MS data suggested that the tyrosine residue is dynamically phosphorylated upon stimulation and that this leads to dual phosphorylation. In contrast, the magnitude of threonine phosphorylation did not change significantly. However, the absence of a threonine residue leads to hyperphosphorylation of the tyrosine residue in the unstimulated condition, suggesting that the threonine residue contributes to the control of signaling noise.
This study was done to elucidate the electron microscopic characteristics of certain pathogenic fungi. Four Candida species, (C. albicans, C. tropicalis, C. parapsilosis and C. glabrate) and Cryptococcus neoformans were cultured for 3 days at $30^{\circ}C$ in the Sabouraud dextrose medium. After incubation, they were stored at $4^{\circ}C$ for 24hours. Fine structures were analyzed by morphometry, and Tukey's HSD test was used for statistics. On scanning electron microscopy C. albicans and C. neoformans were similar in size but different in shape, showing sphero-shape or ovalo-shape in C. neoformans. Surface of C. neoformans was coarse and spiny, but Candida species examined were uniformly smooth. In size, C. glabrata was the smallest among them. Budding scar as seen on the surface of Candida species by the number ranging from 1 to 7. Cryptococcus neoformans showed one or two budding scar. On transmission electron microscopy the cytoplasm of most yeast cells showed plentiful glycogen particles, mitochondria, peroxisomes and vacuoles. However, cell walls were different among four Candida species and Cryptococcus neoformans. The cell wall of Candida species consisted of fibrous layer, that was electron dense layer and transparent layer, in contrast to Cryptococcus neoformans consisted of electron dense layer with lamellar structure. This layer was two times thicker than that of Candida species. The outer layer of cell wall was of radiating pattern.
제주도 밀감 과수원의 토양으로부터 polygalacturonase 고생산 효모를 분리하였다. 분리된 strain CS-2 의 생리화학적인 실험을 수행한 결과 분리균주는 Diazonium bule B color test 와 urease test에서 양성반응, acetic acid, citrate acid 생성 시험, gelatin 분해시험, fat 분해시험에서는 음성반응을 나타났고, 탄소원의 조사에서 galactose를 탄소원으로 이용할 수 없었고, 질소원은 모두 이용할 수 없었다. 또한 $30^{\circ}C$ 에서는 성장하는 반면, $35^{\circ}C$ 이상에서는 성장을 하지 못하였고 50% 이상의 glucose 농도, 0.01% cyclohexamide 그리고 1% acetic acid에서 성장을 하지 못하였다. 현미경을 이용한 형태학적 관찰 결과, 크기는 $1.3{\times}2.9$$\mu$m인 타원형으로 관찰되었다, ,multiple budding을 하며 ascospore는 존재하는 반면 pseudomycelium과 true mycelium 은 존재하지 않았다. 이와 같은 결과를 종합하여 Cryptococcus 속의 특징과 유사함을 알 수 있었다. 분리된 Cryptococcus sp. CS-2 의 polygalacturonase 는 유도적으로 합성되어 catabolic repression 에 의해 조절됨을 알 수 있었으며, 3일 배양시 가장 높은 활성도를 나타내었으며, 고유 활성도는 2.50~2.55 units/mg 으로 나타났다. 이러한 polygalacturonase를 SDS-PAGE, activity staining 그리고 단일 탄소원에 따른 단백질 양상의 변화를 비교하여 분자량 측정한 결과 약 46KDa으로 나타났다.
아연은 사람에 있어서 필수미량 원소 중의 하나이다. 열대과일 Rambutan으로부터 아연 고함유 효모를 분리하였으며, 이 균주의 아연 함량은 306 ppm (30.6 mg%)이었다. 아연 고함유 효모는 전형적인 둥근 모양과 보통 크기로 다출아 형태를 취하고 있었다. 분리 균주의 동정을 위하여 ITS1-5.8S rDNA sequences를 실시한 결과 효모 S. cerevisiae 와 99%의 높은 상동성을 보였다. 또한 Aspergillus oryzae로 코지를 만들어 알코올 발효를 시킨 결과 12% 정도의 알코올 수득을 얻을 수 있었다. 이상의 결과에서 신규 분리된 효모는 형태학적 및 생리학적 특성과 알코올 발효 특성을 가지는 것으로 보아 S. cerevisiae와 거의 일치하여 S. cerevisiae FF-10으로 명명하였다. 향후 실험에서는 S. cerevisiae FF-10 균주가 세포내에 아연을 최대로 축적할 수 있는 배양 실험조건을 확립할 필요성이 제기된다.
진핵생물에서 THO/TREX 복합체는 전사 신장, pre-mRNA 가공 및 mRNA의 핵에서 방출에 중요한 역할을 담당한다. 이 복합체는 진화적으로 잘 보존되어 있지만, 생명체에 따라 구성성분과 기능에 차이가 존재한다. 이 논문에서는 출아효모보다는 고등생물과 더 유사한 분열효모 Schizosaccharomyces pombe에서 THO/TREX 복합체의 한 구성요소인 spTex1가 생장과 mRNA의 방출에 필수적이지 않다는 것을 보였다. spTex1 유전자의 결실과 과발현 어느 것도 생장의 결함과 $poly(A)^+$ RNA가 핵 안에 축적되는 현상을 거의 보이지 않았다. 또한 spTex1-GFP 단백질은 주로 핵 안에 위치하였다. Yeast two-hybrid와 Co-immunoprecipitation 분석에서 S. pombe Tex1은 THO/TREX 복합체의 주요 구성인자인 spHpr1 (THOC1), spTho2 (THOC2)과 상호작용을 하였다. 이와 같은 결과들은 S. pombe의 Tex1도 THO/TREX 복합체의 구성인자이지만, 생장과 mRNA 방출에는 중요한 역할을 하지 않음을 의미한다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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