• 제목/요약/키워드: Breakpoint

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폐암 세포주에서 염색체 3p14.2에 위치한 FHIT 유전자의 발현 이상에 대한 연구 (Expression of the FHIT gene Located in Chromosome 3p14.2 in Human Lung Cancer Cell Lines)

  • 김철현;유철규;이춘택;한성구;심영수;김영환
    • Tuberculosis and Respiratory Diseases
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    • 제45권5호
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    • pp.984-991
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    • 1998
  • 연구배경: 폐암을 포함한 여러 종양에서 3p의 allelic loss가 매우 흔하게 관찰된다는 것은 널리 알려진 사실이다. 따라서 이 구역에 암억제유전자가 존재할 가능성이 높다고 생각되어 과거부터 이에 대한 연구가 활발하게 진행되고 있다. 하지만 현재까지는 몇몇 후보 유전자들이 밝혀져 있을 뿐, 확실한 암억제유전자를 규명해내지는 못하고 있는 실정이다. FHIT(Fragile Histidine Triad) 유전자는 최근 주목을 받고 있는 후보 암억제유전자로서 3p14.2에 위치하고 있으며 식도, 위, 두경부암 등의 여러 종양에서 이 위치의 homozygous deletion이 보고된 바 있다. 서열 분석상 이 유전자는 human genome 중 손상에 가장 취약한 곳중 하나인 FRA3B fragile site와 신세포암에서 잘 발견되는 t(3;8) chromosomal translocation의 breakpoint를 포함하고 있다. 이러한 구조적 특정과 함께 폐암에서 3p의 allelic loss가 특히 높은 빈도로 나타난다는 점에 주목하여, 연자들은 폐암 세포주를 대상으로 FHIT 유전자의 발현 이상을 살펴봄으로써 암억제유전자로서의 가능성을 평가하고자 하였다. 방 법: 총 21개 세포주(비소세포폐암 : 16, 소세포폐암 : 5)를 배양하여 RNA를 분리하였고 reverse transcription을 시행하여 single-strand cDNA를 합성하였다. 이후 FHIT 유전자의 exon 5에서 exon 9에 해당하는 coding region을 PCR로 증폭하였다. 이 PCR product를 ethidium bromide로 염색된 1.5 % agarose gel에서 전기영동시킨 후 band를 관찰하였다. 결 과: 총 21개 폐암 세포주중 12개(57%) 세포주에서 비정상적인 band가 관찰되거나(3개), band가 관찰되지 않았다(9개). 16개의 비소세포폐암 세포주중 7개 (44%)에서 비정상적인 band가 관찰되거나(2개), band가 관찰되지 않았다(5개). 5개의 소세포폐암 세포주에서는 5개(100%) 모두에서 비정상적인 band가 관찰되거나(1개), band가 관찰되지 않았다 (4개). 결 론: 이러한 결과를 살펴볼 때, FHIT 유전자의 발현 이상은 폐암, 특히 소세포폐암에서 높은 빈도로 관찰되었으며, 이는 FHIT 유전자가 폐암 발생에 있어서 중요한 암억제유전자일 것이라는 가설을 뒷받침하는 소견이라 생각된다.

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한반도 멧돼지 KIT 유전자의 유전적 변이와 신규 돌연변이 (Novel Mutation and Genetic Variation of the KIT Gene in Korean Wild Boars(Sus scrofa coreanus))

  • 조인철;최유림;고문석;김재환;이정규;전진태;이항;오문유;한상현
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제48권1호
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    • pp.1-8
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    • 2006
  • 포유동물에서 KIT 유전자는 우성 백색의 모색발현에 관여하는 후보유전자로서 mast/stem cell growth factor receptor를 암호화하는 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 한반도에서 서식하고 있는 야생멧돼지의 모색발현에 있어서 KIT 유전자의 유전적 변이를 확인하기 위하여 PCR- RFLP와 염기서열 분석을 수행하여 유전적 변이를 관찰하였다. 멧돼지 KIT 유전자의 exon17- intron 17 경계부위에 대한 NlaⅢ-RFLP 결과 splicing mutation이 없고, exon 19 상에서의 SNP C2678T에 대한 AciⅠ-RFLP 결과 역시 백색 품종들의 유전자형과는 다르게 나타났다. 이상의 결과는 멧돼지 집단 내 교잡에 의해 백모색의 자손이 출현하지 않음을 의미한다. 또한 exon 19과 exon 20에서 새로운 SNP들이 확인되었으며 이들 중 exon 20에서의 SNP A2760G는 아미노산의 변화(iso-leucine→valine)를 초래할 수 있으나 모색 발현과의 연관은 확인할 수 없었다. 돼지 KIT 유전자의 exon 19, 20과 intron 19 상에서의 새로 발견된 SNP와 splicing mutation의 존재 여부 등은 품종특이적인 양상으로 확인되었고, 이 같은 결과는 돼지에서 백색 모색 발현을 설명할 수 있는 좋은 자료가 될 것으로 사료된다.

Qplus-T내장형 인터넷 시스템에서 멀티 태스크 프로그램을 위한 원격 트레이스 디버거 (A Remote Trace Debugger for Multi-Task Programs in Qplus-T Embedded Internet System)

  • 이광용;김흥남
    • 한국정보과학회논문지:컴퓨팅의 실제 및 레터
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    • 제9권2호
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    • pp.166-181
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    • 2003
  • 최근 인터넷의 급속한 성장으로 Web TV, PDA 및 Web phone과 같은 장치들이 인터넷에 연결되기 시작하고 있다. 그러나, 이러한 장치들은 복잡한 실시간 응용 시스템을 지원하기 위해 RTOS와 같은 실시간 운영체제가 필요로 하게 되었으며, 특히, 내장형 인터넷 응용 시스템을 개발하기 위한 디버거 등과 같은 적절한 도구들의 부족으로 개발하는데 어려움을 겪고 있다. 이에, 본 논문에서는 Qplus-T 실시간 운영 체제 내장형 시스템을 위한 새로운 트레이스포인트 디버깅 도구를 제안하다. 이 도구는 타이밍 트레이스포인트들을 이용하여 실시간 응용 소프트웨어의 디버깅을 쉽게 한다. 전통적인 브레이크포인트 디버거에 비해, 이 트레이스포인트 디버거는 온라인 및 오프라인 분석을 위해 응용 프로그램의 데이터를 동적으로 수집하고 기록하는 기능을 제공한다. 그리고, 응용프로그램의 실행을 멈추거나 원래의 실행 속도에 참견이 거의 없이 실행중인 응용프로그램의 변수들에 새로운 값을 할당해 보기 위한 수단으로도 제공된다. 본 논문에서 제시하는 트레이스포인트 디버거는 Qplus-T 인터넷 응용프로그램과 같은 타겟 실시간 응용 프로그램에 수많은 모니터링 트레이스포인트들을 추가하기 위한 효과적인 방법을 제공하며, 실행 중에 응용프로 그램의 행위를 모니터하고 분석하기 위한 트레이스포인트를 설정할 수 있다. 또한, RTL(Real-Time Logic) 표현을 이용하여 타이밍 문제를 명세화하고 검출할 수 있어 기존 트레이스포인트 디버거와는 다르다.

편평한 암석절리면의 속도 의존적 전단거동 특성 (Characteristics of velocity-dependent shear behavior of saw-cut rock joints at different shear velocities)

  • 박병기;이창수;전석원
    • 한국터널지하공간학회 논문집
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    • 제9권2호
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    • pp.121-131
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    • 2007
  • 최근 암반구조물의 규모가 점차 대형.대단면화됨에 따라 암반 절리면이 자유면에 노출되는 경우가 빈번하게 발생할 수 있으며 지진, 발파와 같은 외부 동적 하중의 영향을 받을 가능성이 커지고 있으므로 다양한 동적 하중조건 하에서 암반 불연속면의 거동 특성 파악을 위한 연구의 필요성이 증대되고 있다. 본 연구에서는 전단속도의 변화에 따른 편평한 화강암 전단면의 마찰특성 변화를 알아보고자 다양한 조건하에서 직접전단시험을 수행하였다. 수행한 직접전단시험은 크게 두 가지로 나눌 수 있는데 첫 번째 시험에서는 시험이 수행되는 동안 각각 7가지의 일정한 전단속도로 전단변위가 발생되도록 하여 전단속도에 따른 마찰계수의 변화를 살펴보았으며, 두 번째 시험에서는 전단변위가 발생되는 중간에3가지 형태의 순간적인 전단속도 변화가 마찰특성에 미치는 영향을 살펴보았다. 수직응력과 전단속도의 변화에 따른 편평한 화강암의 마찰계수 변화는 가해진 수직응력 수준에 영향을 받는 것으로 나타났으며, 전단속도의 변화가 마찰거동에 영향을 미치기 시작하는 전이속도는 수직응력이 증가함에 따라 낮아지는 것으로 나타났다. 또한 전단속도가 느릴수록 stick-slip 거동에서의 응력 저하 폭이 커지는 경향을 보였다. 순간적인 전단속도 변화에 따른 정상 상태에서의 마찰계수 변화를 살펴본 결과 순간적인 속도의 증가에 따라 마찰계수가 감소하는 속도 연화 현상이 나타났으며, 느린 전단속도에서 전단속도의 변화에 따른 마찰계수의 감소폭이 빠른 전단속도에서의 변화에 따른 감소폭보다 더 큰 경향을 보였다.

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PC 환경에서 시뮬레이션 기능을 포함한 블루투스 프로토콜 분석장비 (A Bluetooth Protocol Analyzer including Simulation Function based on PC Environment)

  • 정중수
    • 한국정보과학회논문지:컴퓨팅의 실제 및 레터
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    • 제9권1호
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    • pp.95-99
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    • 2003
  • 오늘날 무선통신 기술은 기존 유선 통신방식과 더불어 매우 주꽉받고 있는 정보통신 혁명음 주도하였다 무선 통신에서 자제 피코넷흘 형성하여 음성이나 데이타 통신을 수행하는 블루투스 기술은 이제 액세스망올 통해 공중망과 접속 가능하게 되었다 본 논문에서는 블루투스 디바이스와 UART 케이블로 접속된 PC 환경에서 블푸투스 프로토콜을 분석하는 블루투스 프로토콜 분석장비 개발을 소개하였다 이의 개발 환경으로는 윈도우 98 OS와 MS 비주얼 C를 사용하였다 비주얼 C로 작성된 응용 프로그램은 블루투스 디바이스에 성장된 펌웨어와 인터페이스를 수행하여 개발되었다. 또한 개발된 시스템으로 실제 음성 시험을 위하여 시그널링 용으로 헤드셋을 사용하고, 파일 전달용으로 PC를 사용한 블루투스 시스템간 프로토콜 정보를 시뮬레이션 하였다 시뮬레이션은 하드웨어인 디바이스와 소프트웨어가 설장된 PC 간의 UART 통신의 속도는 다양하게 변회가능하나 약 2 20kbps 이하의 속도를 제외하고는 성능에 영향은 거의 주지 않았으므로 한계치인 115kbps로 시험하였다 성능해석은 블루투스 시스템간 파일 전달시 치리량을, 헤드셋과의 통신은 호 섣정 시간과 해제시간용 성능 분석 파라메터로 제시하였다 이때 파일 전달은 개발된 소프트웨어에서 파연 액세스 하는 주기적인 시간이 매우 큰 의미가 있었다 액세스하는 파일의 패킷 크기는 가변이나 통상 많이 사용하는 128 바이트로 고정 하고 시험 한 결과, 주기적인 파일 액세스 시간이 0.04초일 때 약 Uk bps 처리량용 유지하든 블레이크 포인트 시간이었다 헤드셋과의 통신시 호 시간과 해제시간은 약 16.6ms가 소요된다 따라서 이와 같은 결과는 실제 블루투스 시스템이 저속의 파일전달이나 음성 정보전달을 위한 시그널링 용의 장비 개발 시 충분한 성능 검증용으로 활용될 수 있다

한국 농촌지역의 회충 감염율, 감염량 및 역학적 변수 (Prevalence, Worm Burden and Other Epidemiological Parameters of Ascaris lumbricoides Infection in Rural Communities in Korea)

  • 채종일;금구진
    • Parasites, Hosts and Diseases
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    • 제23권2호
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    • pp.241-246
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    • 1985
  • 우리나라 8개 농촌지역의 회충 감염율, 감염 량 및 기초산란율(basic reproductive rate)등 역학적 변수의 상관관계를 관찰함으로써 우리나라 회충감염 실태를 분석하였다. 이들 감염율, 감염량 등은 대변검사는 물론 pyrantel pamoate투여후 충체 회수결과에 의해 측정하였으며 그 결과는 다음과 같다. 1. 각 조사지역의 충체양성률(감염율)은 16.5~79.5%의 범위에 있었고 이것은 대변검사에 의한 충란양성률 3.3~66.7%보다 9~18%가 높은 수치이었다. 조사대상 주민의 평균 회충 감염량은 지역에 따라 0.21에서 8.44로 나타났고 개인별 감염량 분포는 'k'치가 0.38~0.54인 부이항분포(negative binomial distribution)를 보였다. 2. 이 조사에서 나타난 충체양성률은 Anderson과 May의 수식 $p=1-(1+M^{*}/k)^{-k}$ (p : 충체양성률, $M^*$ : 평형상태의 평균 감염량)에 의해 구한 이론치와 거의 일치하여 우리나라 농촌지역의 회충감염률과 감염량의 상관관계는 이 수식에 의해 매우 정확히 표현됨을 알 수 있었다. 또 회충 암컷 1마리가 평생 산출하는 무수한 충란중 다음 숙주에 성공적으로 감염되고 성숙되는 암컷의 수를 표시하는 기초산란을(R)은 지역에 따라 1.03에서 2.11까지인 것으로 나타났다. 이상의 결과로 보아 'R'치가 1에 가까운 지역은 역학적으로 재감염의 breakpoin떼 도달하고 있는 것으로 판정되므로 회충 박멸이 매우 희망적이지만 전국적으로 'R'치가 1이하로 될 때까지 우리나라 회충관리사업은 계속되어야 할 것으로 생각된다.

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UGT2B17 유전자의 deletion polymorphism과 폐암과의 연관성 (Deletion Polymorphism of UGT2B17 and Its Relation to Lung Cancer)

  • 이세라;안명현;설소영;이지선;정정남;임선희
    • 생명과학회지
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    • 제20권5호
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    • pp.703-709
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    • 2010
  • Glucuronidation은 NNAL [4-(methylnitrosamno)-1-(3-pyridyl)-1-butanol]의 주요 pathway이며, UGT2B의 family인 UGT2B17 (UGT, uridine diphospho-glucuronosyltransferase) 유전자는 발암원의 glucuronidation에 관여 한다. UGT2B17 결손은 NNAL의 감소 수준과 특정 암에 있어 위험도를 증가시킨다. UGT2B17 유전자의 copy 수는 사람에서 개인별로 0~2로 다양하다. 본 연구에서는 UGT2B17 결손이 폐암의 위험도와 연관성을 가지는 가를 알아보기 위해 한국인인 271명의 대조군과 176명의 폐암환자의 샘플로 PCR 방법으로 CNV를 조사하였다. 그 결과, 현재까지 보고된 백인과 흑인에 비해 한국인에서 결실 대립형질이 현저히 높게 나타났다. 백인에서 유전자 두 개 모두가 결실된 0 copy 수가 약 10%를 나타낸 것에 비해, 본 연구의 한국인에서는 0 copy 수가 약 74%를 나타내었다. 더욱이 양 쪽 결실이 여성그룹에서 전반적으로 남성그룹에 비해 높게 나타났다. 그러나 UGT2B17 유전자가 CNV와 폐암과의 연관성은 찾을 수 없었다. 이러한 결과는 UGT2B17 유전자의 결실이 폐암의 감수성과는 연관되어 있지 않으나, UGT2B17 CNV 다형성이 인종간의 진화적 분석의 유용한 마커로 사용이 가능할 것으로 사료된다.

상수원수의 고도정수처리 공정 파일롯 운전 연구 (Operation of Advanced Water Treatment Processes for Downstream River Source Water)

  • 왕창근;오상은
    • 대한환경공학회지
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    • 제34권1호
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    • pp.1-6
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    • 2012
  • 상수원인 K강 하류부에서의 COD (4~10 mg/L)는 매우 높으며 암모니아성질소의 농도(겨울철 3.5 mg/L) 또한 매우 높다. 암모나아 자체는 이 농도 범위에서 인체에 독성을 주지는 않지만 우리나라 먹는물 기준인 0.5 mg/L로 맞추어져야 한다. 본 연구에서는 K강 상수원을 고도처리 하고자 기존의 일반적인 상수처리공정을 수정하여 파일롯플랜트를 제작하여 운전하였다. 암모니아를 제거하고 염소소독 부산물 일부 제거를 위하여 파괴점 염소주입 및 분말활성탄 투여 공정을 응집조 전 공정에 넣었다. 또한 모래여과 공정 다음에 입상활성탄공정을 넣어 미량 잔류유기물을 제거하고자 하였다. 파일롯플렌트는 36톤/일 규모이며 1년 동안 운전이 되었다. 본 수정된 공정을 통하여 암모니아를 제거하고 여러 유기물질(DOC, MBAS, UV-254 nm absorbance 등)들을 제거할 수 있었다. 유입 DOC 농도는 유입기간 동안 3~6 mg/L 계속 높았으며 1 mg/L로 낮추기 위해서는 GAC 필터의 2 m 높이는 낮은 것으로 판단되었다. 파괴점 염소주입에서 투입 염소농도가 잘 주입이 되었을 때 암모니아의 제거는 98%이상이었으며 낮은 유리 잔류염소 농도와 분말활성탄 투여로 트리할로메탄(THM)은 낮게 검출되었다.

실내 보관 삼나무 목재의 재색 및 화학적·현미경적 변화 특성 (Chemical and Morphological Change and Discoloration of Cedar Wood Stored Indoor)

  • 이광호;차미영;정우양;배현종;김윤수
    • Journal of the Korean Wood Science and Technology
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    • 제37권6호
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    • pp.566-577
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    • 2009
  • 실내에서 일어나는 목재의 표면 열화특성을 재색, 화학적 및 해부학적 변화 차원에서 분석하였다. 실험대상으로는 실내에서 장기간 보관중인 삼나무 목제품을 사용하였다. 실내 보존 초기에는 황색도와 적색도가 급격히 변하였고 5년 사이에 백색도의 감소가 두드러졌다. 화학성분의 분석결과 셀룰로오스, 헤미셀룰로오스, 리그닌 성분 모두 감소하였으나 리그닌의 감소가 더 컸다. 현미경 관찰 결과 5년이 경과한 목제품에서는 목재표면에서 2~3개 층에서 리그닌이 분해되어 중간층이 분리되었다. 실내 환경조건에서 발생되는 표면 열화 특성은 야외에서 발생되는 표면열화 특성과 매우 유사하였으나 그 정도는 미약하였다.

전기화학적 방법을 이용한 Spent Granular Activated Carbon (GAC)의 재생 연구 (A Study of the Regeneration of Spent GAC using an Electrochemical Method)

  • 이상민;주수빈;조영수;오예지;김형준;심인태
    • 대한토목학회논문집
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    • 제42권4호
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    • pp.481-491
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    • 2022
  • 본 연구는 CSOs의 고도처리를 목적으로 다단 횡류식 여과와 GAC 흡착조의 융합공정의 운영에서 GAC 흡착조의 유기물 처리 특성을 조사하고 설계 파과점에 도달한 GAC를 전기화학적 방법을 통한 재생효율을 평가하는 것이다. 여과공정은 부유물질은 용이하게 제거되지만 용존 유기물이 제거되지 않아 CSOs의 고도처리를 위해서는 용존유기물질의 제거능이 추가로 필요하다. 일반적으로 GAC 흡착은 정수처리 공정이나 하수의 3차 처리공정과 같은 저농도 유기물 조건에서 적용되어왔고 하수나 CSOs와 같이 유기물 농도가 높은 조건에서는 거의 적용이 되지 않았기에 본 연구에서 GAC를 이용한 CSOs 처리는 흥미로운 경험을 제공할 것이다. 본 연구는 유입 유기물 강도에 따른 GAC의 연속 운전 및 파과 특성을 조사하고 사용된 GAC를 전기화학적 재생을 적용하였으며, 이때 전압강도 및 전해액이 종류에 따른 흡착 유기물의 탈착 특성을 조사하였고 재생 후 GAC의 재흡착실험을 통해서 재생효율을 평가하였다. GAC 연속 운전결과 파과기간은 고농도 조건에서 21일, 중농도에서 28일 그리고 저농도에서 32일을 나타내었다. 전기분해를 통한 흡착 유기물의 탈착은 전기 분해 조건에 따라 188~609 mgCOD/L까지 발생하였고 전해액 종류의 영향은 NaOH가 H2O2보다 조금 우수한 탈착 특성을 나타냈다.