Jung, Paul Eunil;Fong, Jonathan J.;Park, Myung Soo;Oh, Seung-Yoon;Kim, Changmu;Lim, Young Woon
Journal of Microbiology and Biotechnology
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제24권10호
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pp.1301-1307
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2014
White-rot fungi of the genus Bjerkandera are cosmopolitan and have shown potential for industrial application and bioremediation. When distinguishing morphological characters are no longer present (e.g., cultures or dried specimen fragments), characterizing true sequences of Bjerkandera is crucial for accurate identification and application of the species. To build a framework for molecular identification of Bjerkandera, we carefully identified specimens of B. adusta and B. fumosa from Korea based on morphological characters, followed by sequencing the internal transcribed spacer region and 28S nuclear ribosomal large subunit. The phylogenetic analysis of Korean Bjerkandera specimens showed clear genetic differentiation between the two species. Using this phylogeny as a framework, we examined the identification accuracy of sequences available in GenBank. Analyses revealed that many Bjerkandera sequences in the database are either misidentified or unidentified. This study provides robust reference sequences for sequence-based identification of Bjerkandera, and further demonstrates the presence and dangers of incorrect sequences in GenBank.
Twenty-one different fungi were tested for their ability to decolorize a wide range of structurally different dyes. Twenty fungal strains were isolated from fruiting bodies which were collected at the Kwangneung National Arboretum, Korea. One fungal strain were isolated from a rotting wood at Soongsil University, Korea. Nine kinds of dyes were used: three anthraquinone dyes and six azo dyes. The five fungal strains, Laetiporus sulphureus, Polyporus arcularius. Auricularia polytricha, Stereum ostrea, and Bjerkandera sp. UK-l showed decolorization ability. Except Auricularia polytricha, the four fungal strains were wood rotting fungi, and belonged to Aphyllophorales. Bjerkandera sp. UK-I, which was a white rot fungus, could decolorize all kinds of dyes tested in this study, indicating this fungus is one of candidates for applying in biological methods of dye waste treatment.
Manganese dependent peroxidase (MnP) is the most ubiquitous enzyme produced by white-rot fungi, MnP is known to be involved in lignin degradation, biobleaching and oxidation of hazardous organopollutants. Bjerkandera fumosa is a nitrogen-unregulated white-rot fungus, which produces high amounts of MnP in the excess of N-nutrients due to increased biomass yield. The objective of this study was to optimize the MnP production in N-sufficient cultures by varying different physiological factors such as Mn concentration, culture pH, and incubation temperature. The growth of fungus was optimal in pH 4.5 at $30^{\circ}C$, $N_2$-unregulated white-rot fungus produces high amounts of MnP in the excess N-nutrients. The fungus produced the highest level of MnP (up to $1000U/{\ell}$) with $0.25g/{\ell}$ asparagine and $1g/{\ell}$$NH_4Cl$ as N source at 1.5 mM $MnCl_2$ concentration, pH value of 4.5 at $30^{\circ}C$. Purification of MnP revealed the existence of two isoforms: MnPl and MnP2. The molecular masses of the purified MnPl and MnP2 were in the same range of 42~45 kDa. These isoforms of B. fumosa strictly require Mn to oxidize phenolic substrates. Concerned to kinetic constants of B. fumosa MnPs, B. fumosa has similar Km value and Vmax compared to the other white-rot fungi.
전라남도 장흥군 일대에서 재배 중인 표고골목에 대량으로 발생한 해균을 육안과 현미경관찰 및 ITS (Internal Transcribed Spacers) 분석한 결과, 줄버섯(Bjerkandera adusta)인 것으로 확인되었다. 줄버섯이 표고골목에 대량 발생한 예는 아직까지 없기 때문에 이 해균에 대한 특성 또한 보고된 바가 없다. 따라서 본 연구에서는 줄버섯에 의해 피해를 입은 골목 내부의 상태와 일부 생리적인 특성 및 표고균에 대한 길항력에 대해 시험을 진행했다. 먼저, 줄버섯은 표고와 같은 백색부후균이기 때문에 골목 내부의 상태가 표고에 의해 부후된 것과 비슷했다. 하지만 표고균에 의해 부후된 골목과 달리 수피 아래 목질 조직에 깨알 같은 점들이 많이 있는 특징을 보였다. 그리고 표고균의 최적균사생장 온도가 $25^{\circ}C$ 내외인 반면에 줄버섯균주는 $30^{\circ}C$에서 최적의 생장을 보였다. $15^{\circ}C$, $20^{\circ}C$, $25^{\circ}C$, $30^{\circ}C$에서 표고균주와의 대치배양 결과, 모든 온도조건에서 표고균주보다 균사생장이 빨라 표고균사를 덮었다. 이런 시험결과는 표고골목이 고온에 노출될 경우, 줄버섯의 대량 번식 위험이 높을 뿐만 아니라 일단 줄버섯에 오염되면 표고균이 입을 피해가 큼을 의미한다. 따라서 줄버섯에 의한 피해를 예방하기 위해서는 골목 내부에서 표고균이 빠르게 만연될 수 있도록 배양하면서 여름에는 골목이 고온에 노출되지 않게 관리해야할 것으로 판단된다.
HUE05-1는 Bjerkandera adusta와 87.7% 정도만이 유사도를 갖고 있는 다른 새로운 종의 색도제거능력이 있는 균주로 판별되었으며, RO 16, RB 19, RB 49, RY 145, AO 10, AV 43, AB 350, DB 106등의 8가지 염료에 대하여 우수한 색도제거효과를 보였다.
This study was performed to understand the interaction between Ophiostomataceae and basidiomycetes fungi during cultures, and whether the basidiomycetes fungi inhibit the growth and decolorize dark pigments of blue staining fungi. The conjoint cultivation was studied on 2% malt extract agar. The ability of basidial cultures to decolorize dark pigments of ophiostomatoid fungi was the main characteristics estimated during this study. More than half of basidial cultures were characterized by deadlock interaction with blue staining fungi. In the dual cultures, where basidial partners were presented by Agaricus bisporus(64), Laetiporus sulphureus(L01/89), Trametes versicolor(09) and unknown fungus(02), antagonism was found at the phase of primary contact of colonies. Replacement interaction resulted usually in decreasing dark colour of substrate was observed for 11 basidial cultures that were belonging mainly to white-rot fungi. Among them Abortiporus biennis(123), Antrodiella hoehnelii(S28/91), Bjerkandera fumosa (137), and Gleophyllum odoratum(124) were characterized by the absence of deadlock-phase: they began to grow over dark colonies of their partners just after primary contact. Basidiomycetes did not affect strongly the pigments of Ceratocystis spp. and Leptographium sibirica isolates, but completely decolorized colonies of Ophiostoma ips and to a smaller degree Ophiostoma minus. Antrodiella hoehnelii(S28/91), Bjerkandera fumosa(137), Gleophyllum odoratum(124) and Trametes versicolor(B18/91) cultures were found to be the most active in decreasing dark color of blue staining fungi colonies. The cultures were recommended for further development as agents of biopulping of wood chips and bio-control of blue stain in woods.
목재부후성 담자균류의 배양 균사체의 생물활성을 조사하기 위하여 항균활성, 식물생장조절활성, 항암활성 및 그들이 생산하는 효소활성을 검정한 결과 Coriozus versicolor 5129와 C. pubescens 5131 균주는 그람양성세균에, Lenzites betulina 8029 균주는 그람음성세균에 저지 효과를 나타내었으며 L. betulina 8085 균주는 세균과 진균에 저지 효과를 나타내어 광범위한 항균 spectrum을 보였다. 대부분의 균주가 0.8ml/ml 농도 처리시 배추 및 무의 발아 및 생장을 억제하였으며, 특히 Fomitopsis pinicolor 8059와 Fomitella fraxinea 8084 균주의 경우 생육을 장하게 억제하였다. 그러나, Bjerkandera adusta 8054 균주는 0.4 및 0.2ml/ml농도에서 배추 및 무의 생육을 촉진하였다. 몇종의 목재부후균 다당체를 추출하여 암세포를 이식한 ICR mouse에 투여한 결과 거의 전 균주가 항종양 작용을 나타내었으나 버섯종류 간에 큰 차이를 보였고 그중 L. betulina 8029와 미분류된 8058 균주는 효과가 비교적 높았다. 목재부후균의 세룰로스와 리그닌 분해력은 거의 전 공시균주에서 나타났고 종류간에 역가가 다양하여 강력한 분해균의 선발 가능성을 보였다.
We conducted field and laboratory observations of the life histories and fungal hosts of the darkling beetle, Platydema nigroaeneum Motschulsky. P. nigroaeneum, a fungivorous tenebrionid beetle, was a widespread inhabitant of fungi on deciduous trees (Quercus, Salix, Alnus and Carpinus etc.) in Korea. Development from egg to adulthood took $4\sim11$ months in nature and about 66 days in the laboratory at $25.5{\sim}26.1^{\circ}C$ and $63.5\sim64.5%$ relative humidity. Both larvae and adults overwintered in their host fungi or beneath the bark of the host tree near the host fungi. Sporophores of Coriolus $Qu{\acute{e}}let$, Bjerkandera Karst., Daedaleopsis Schroet. and Merulius were common feeding and breeding sites in Korea.
Interaction between wood-destroying basidiomycetes and blue stain fungi were studied during conjoint cultivation on 2% malt extract agar. The ability of basidial cultures to decolourise dark pigments of ophiostomatoid fungi was the main characteristics estimated during this investigation. Antrodiella hoehnelii(S28/91), Bjerkandera fumosa(137), Gleophyllum odoratum(124), Trametes versicolor (B18/91) cultures were found to be the most active in decreasing dark colour of blue stain fungi colonies. The cultures were recommended for further development as agents of biopulping and control of blue stain fungi in wood chips.
담자균류 균심류의 영지과에 속하는 잔나비걸상(Ganoderma applanatum)과 구멍장이 버섯과에 속하는 좀구멍버섯 (Schizopora paradoxa) 두 종의 5S rRNA 염기서열들을 (EMBL accession mumbers X73589 and X73890) directchemical method로 분석 결정하고 담자균류 균심류와 복균류의 기존에 밝혀진 9종 버섯의 염기서열과 비교하였다. 잔나비걸상과 좀구멍버섯의 5S rRNA는 각각 118개의 염기로 구성되어 있으며 B형 5S rRNA에 해당하였고 Huysmans 등이 제시한 2차구조의 모델에 들어 맞으며 Walker와 Doolittle이 제시한 제 5 염기서열군에 속하였다. 진화거리를 나타내는 Kimura의 염기치환상수 $K_{nuc}$값에 으하면 잔나비걸상과 가장 가까운 좋은 고약버석과의 Ceratobasidium cornigerum으로서 염기 3개의 차이를 보였으며 좀구멍버섯과 가장 가까운 좋은 구멍장이 보섯과의 줄버섯(Bjerkandera adusta)으로서 염기 두개의 차이를 보였다.11개 5S rRNA의 이차구조를 비교하였을때 염기의 치환은 loop 부분보다는 helix 부분에서 많이 일어났으며, 이는 helix 부분이 loop 부분보다는 진화적으로 덜 보존되어 있고 진화 분지를 형성하는데 보다 많은 영향을 주었음을 시사하였다. Kimura의 two parameter method로 계산된distance matrix를 사용하고 Felsenstein PHYLIP package의 Neighbor program에서 Neighborjpomomg option을 이용하여 계통수를 그렸을 때 균심류의 버섯들은 부분적으로 목별로 구분되었다. 균심류의 민주름버섯목에는 적어도 먹물버섯류(Coprinus radiatus)를 제외한 2개의 계통분지가 있고 주름버섯목에도 2개의 계통 분지가 있으며, 복균류에는 말불버섯(Lycoperdon pyriforme)이 독립된 계통분지를 형성하고 있음을 시사하였다.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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