• 제목/요약/키워드: Biological information

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Nomenclatural review of new names proposed by Yong No Lee

  • JANG, Hyun-Do;LEE, Sang-Jun
    • 식물분류학회지
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    • 제52권1호
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    • pp.1-23
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    • 2022
  • This review provides information about the nomenclatural status of new names proposed by Dr. Yong No Lee, in accordance with the current International Code of Nomenclature for Algae, Fungi, and Plants. A total of 363 designations and names were proposed from 16 books and 95 papers by Dr. Yong No Lee, and their status was examined, with 161 designations found to be not validly published. In addition, 13 later isonyms and ten later homonyms were found by this review. However, 173 names were found to be legitimate. All designations and names were categorized according to their nomenclatural status and were listed by place of publication. The nomenclatural statuses of six designations or names, including "Iris odaesanensis," were not confirmed in this review. It is therefore necessary to undertake further research into the nomenclatural status of these taxa by examining their types and published protologues.

Three Species of the Subfamilies, Lithocolletinae and Ornixolinae (Lepidoptera, Gracillariidae), New to Korea

  • Da-Som Kim;Ji-Young Lee;Bong-Kyu Byun
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제39권4호
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    • pp.212-217
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    • 2023
  • The subfamilies Lithocolletinae and Ornixolinae belong to the family Gracillariidae (Lepidoptera). In this study, one species in the subfamily Lithocolletinae, Neolithocolletis hikomonticola Kumata, 1963 and two species in the subfamily Ornixolinae, Conopomorpha flueggella Li, 2011 and Epicephala nudilingua Kawakita & Kato, 2016 are reported for the first time from Korea. Also, two genera, Neolithocolletis Kumata, 1963 and Conopomorpha Meyrick, 1885 are reported as new to Korea. All available information of these taxa, including details on their host plants and distributional regions are provided with the descriptions and illustrations of the adults, male and female genitalia of these taxa.

Two Species of the Genus Grapholita (Lepidoptera: Tortricidae: Oletherutinae: Grapholitini) New to Korea

  • Jin-Sung Kweon;Yonghwan Park;Bong-Kyu Byun
    • Animal Systematics, Evolution and Diversity
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    • 제40권1호
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    • pp.68-72
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    • 2024
  • The genus Grapholita Treitschke, belonging to the tribe Grapholitini, comprises over 150 species worldwide with the majority occurring in the Holarctic region. However, in other regions, only few species are reported owing to a lack of collection and taxonomic study. The genus includes important agricultural pests worldwide that feed on several plants in the families Fabaceae and Rosaceae. In Korea, a comprehensive taxonomic study is required as only eight species have been reported to date. In this study, two species of Grapholita Treitschke, G. latericia Komai, 1999 and G. pallifrontana (Lienig & Zeller, 1846) are newly recorded from Korea. We provide redescribed and illustrated adult and available genitalia. Additionally, all available information, including collecting localities, distribution, host plants and biological characteristics is presented.

단백질 경로 분석 시스템의 설계 및 구현 (Design and Implementation of Protein Pathway Analysis System)

  • 이재권;강태호;이영훈;유재수
    • 한국콘텐츠학회논문지
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    • 제5권6호
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    • pp.31-40
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    • 2005
  • 포스트 게놈 시대에는 단백질에 대한 연구의 필요성이 증대되고 있다. 특히 단백질-단백질 상호작용 및 단백질 네트워크에 대한 연구를 기반으로 전체 생물 체계를 분석하는 연구가 중요하게 대두되고 있다. 기존에 생물학자들이 실험을 통해서 증명한 사실들을 논문이나 기타 매체를 통해서 공개를 하고 있다. 하지만 공개된 정보의 양이 방대하므로 생물학자들이 정보를 효율적으로 이용하지 못하는 경우가 많다. 다행히도 인터넷의 발달로 하루에도 수 없이 쏟아져 나오는 연구 성과들에 쉽게 접근이 가능해졌다. 이러한 매체로부터 생물학적 의미를 가지는 정보를 효과적으로 추출하는 일이 중요하게 대두되었다. 따라서 본 연구에서는 인터넷상에 공개된 다량의 논문 및 기타 정보 매체로부터 단백질 정보를 추출한 데이터베이스로부터 단백질 네트워크를 구성하고, 단백질 네트워크를 통해서 생물학적 의미를 가지는 여러가지 경로 분석 알고리즘을 설계하고 구현한다.

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단백질-단백질 상호작용 경로 분석 알고리즘의 설계 및 구현 (Design and Implementation of the Protein to Protein Interaction Pathway Analysis Algorithms)

  • 이재권;강태호;이영훈;유재수
    • 한국콘텐츠학회:학술대회논문집
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    • 한국콘텐츠학회 2004년도 추계 종합학술대회 논문집
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    • pp.511-515
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    • 2004
  • Post-genome 시대에는 유전체뿐만 아니라 단백질에 대한 연구의 필요성이 증대되고 있다. 특히 단백질-단백질 상호작용 및 단백질 네트워크에 대한 연구를 기반으로 전체 생물 시스템을 분석하는 연구가 중요한 이슈로 떠오르고 있다. 기존에 생물학자들이 실험을 통해서 증명한 사실들을 논문이나 기타 매체를 통해서 공개를 하고 있다. 하지만 공개된 정보의 양이 방대하므로 생물학자들이 정보를 효율적으로 이용하지 못하는 경우가 많다. 인터넷의 발달로 하루에도 수 없이 쏟아져 나오는 연구 성과들에 쉽게 접근이 가능해졌다. 이러한 매체로부터 생물학적 의미를 가지는 정보를 효과적으로 추출하는 일이 중요하게 대두되었다. 따라서 본 연구에서는 인터넷상에 공개된 다량의 논문 및 기타정보 매체로부터 단백질-단백질 상호작용 정보를 추출한 데이터베이스로부터 단백질의 네트워크를 구성하고 단백질 네트워크를 통해서 생물학적 의미를 가지는 여러 가지 경로 분석 알고리즘을 설계하고 구현한다.

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RDF(S) 모델에 기반한 다양한 형태의 단백질 데이타베이스 통합 (Integration of Heterogeneous Protein Databases Based on RDF(S) Models)

  • 이강표;유상원;김형주
    • 한국정보과학회논문지:데이타베이스
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    • 제35권2호
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    • pp.132-142
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    • 2008
  • 현재 생물학 분야에는 단백질이라는 동일한 대상에 대해 각기 고유한 의미를 지니고 있는 다양한 형태의 단백질 분석 데이타베이스들이 존재한다. 이렇게 산재되어 있는 이종의 단백질 정보들을 효과적으로 통합한다면 개개의 데이터베이스로부터는 얻을 수 없는 유용한 정보를 도출해낼 수 있다. 생물학 데이타의 특성상 이 각각의 정보들은 자신만의 고유한 형태와 의미를 지니는데, 시맨틱 웹 기술의 표준인 RDF(S) 모델을 이용하여 데이타를 기술하면 형태론적인 통합뿐만 아니라 의미론적인 통합까지 이루어낼 수 있다. 이에 본 논문에서는 RDF 통합 스키마에 기반한 새로운 통합 레이어(layer)를 제안하였다. 이를 위해 개념적 모델 차원으로서는 단백질 정보를 중심으로 통합 스키마를 구축하였고, 표현적 모델 차원으로 서는 래퍼(wrapper)가 해당 데이터베이스들로부터 필요한 정보를 취하여 동적으로 RDF 인스턴스를 구축하는 방법을 제안하였다. 실제로 이 통합 레이어는 연구자들이 필요로 하는 통합 질의 예제를 성공적으로 처리하여 그 결과를 보여줄 수 있음을 확인하였다.

Are the conservation areas sufficient to conserve endangered plant species in Korea?

  • Kang, Hye-Soon;Shin, Sook-Yung;Whang, Hye-Jin
    • Journal of Ecology and Environment
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    • 제33권4호
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    • pp.377-389
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    • 2010
  • Understanding the factors relevant to endangerment and the patterns of habitat locations in relation to protected areas is critically important for the conservation of rare species. Although 64 plant species have recently been listed as endangered species in Korea, this information has, until now, not been available, making appropriate management and conservation strategies impossible to devise. Thus, we collected information on potentially threatening factors, as well as information on the locations in which these species were observed. The potentially threatening factors were classified into seven categories. National parks, provincial parks, ecosystem conservation areas, and wetland conservation areas were defined as protected conservation areas. Korean digital elevation model data, along with the maps of all protected areas were combined with the maps of endangered plant species, and analyzed via Geographic Information Systems (GIS). Excluding the category of "small population", endangered plant species in Korea were associated more frequently with extrinsic factors than intrinsic factors. Considering land surface only, all conservation areas in Korea totaled 4.9% of the land, far lower than International Union for Conservation of Nature and Natural Resources (IUCN)'s 10% coverage target. At the species level, 69% of the endangered plant species were detected in conservation areas, mostly in national parks. However, this result demonstrates that 31% of endangered species inhabit areas outside the conservation zones. Furthermore, at the habitat level, a large proportion of endangered species were found to reside in unprotected areas, revealing "gaps" in protected land. In the face of rapid environmental changes such as population increases, urbanization, and climate changes, converting these gap areas to endangered species' habitats, or at least including them in habitat networks, will help to perpetuate the existence of endangered species.

유-헬스케어 기반 실시간 혈압, 혈당 측정치 전송의 간호기록 시간 단축 (Shortening of Nursing Record Time about Real Time Transmission Effect of Blood Pressure, Blood Glucose Value Based on U-Healthcare)

  • 박정은;김화선;홍해숙
    • Journal of Korean Biological Nursing Science
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    • 제15권4호
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    • pp.164-172
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    • 2013
  • Purpose: The aim was to measure the real-time trans-mission effect of blood-pressure and blood-glucose value based on u-healthcare for saving the time and effort of nursing recording time. Methods: This study used a u-healthcare system based on the international standards for the exchange of health information. In order to verify the effectiveness of the u-healthcare, a clinical trial for the system regarding blood-pressure and blood-glucose targeting of patients with endocrine disorders at KNUH from February 7 to 9, 2012 was performed. Results: According to the analyzed results, of the 86 times the 11 patients were tested, measuring blood-pressure and blood-glucose using the u-healthcare system, we found the time differences between the real-time transfer recording method and existing hospital records that were used in the hospital. Based on the average time interval, there was a difference of 1,090.45 seconds (18.17 minutes). Conclusion: Therefore, it's cumbersome that nurses in the hospital have to record the numerical values of the measured blood-pressure and blood-glucose manually and input the recorded values directly into the electronic nursing record system. However, it was found in terms of the newly designed system, that it could save time and effort for nurses, since measured information is sent to the hospital information system on a real-time basis.

위치 추적 센서 기반의 IOT 헬스케어 서비스 관리 모델 (An Efficient IoT Healthcare Service Management Model of Location Tracking Sensor)

  • 정윤수
    • 디지털융복합연구
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    • 제14권3호
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    • pp.261-267
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    • 2016
  • 전 세계적으로 사물인터넷(IoT) 기술이 주목을 받으면서 사물 인터넷 기반의 헬스케어, 스마트 시티, 농업, 국방 등의 다양한 서비스 개발이 진행되고 있다. 그러나, IoT를 적용한 헬스케어 서비스는 환자의 생체정보가 제3자에게 유출되어 환자의 생명을 위협하는 상황이 발생할 수 있는 문제가 존재한다. 본 논문에서는 사물 인터넷 기반의 헬스케어 서비스를 제공받는 환자의 생체정보를 제3자에게 유출되지 않으면서 센싱된 데이터 및 자원을 이용하여 치료/행정 처리의 시간 및 절차를 간소화하기 위한 위치추적 센서 기반의 IoT 헬스케어 서비스 관리 모델을 제안한다. 제안 모델은 환자의 위치 정보를 이용하여 병원내 의료진들이 환자의 위치를 실시간으로 확인하고 응급상황이 발생했을 경우에도 신속하게 대응할 수 있다. 또한, 병원 내 의료장비에도 위치추적 센서를 부착해 치료에 필요한 장비들의 위치도 즉각적으로 확인 가능하기 때문에 의료서비스의 시간 및 절차를 최소화할 수 있는 장점이 있다.

The BIOWAY System: A Data Warehouse for Generalized Representation & Visualization of Bio-Pathways

  • Kim, Min Kyung;Seo, Young Joo;Lee, Sang Ho;Song, Eun Ha;Lee, Ho Il;Ahn, Chang Shin;Choi, Eun Chung;Park, Hyun Seok
    • Genomics & Informatics
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    • 제2권4호
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    • pp.191-194
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    • 2004
  • Exponentially increasing biopathway data in recent years provide us with means to elucidate the large-scale modular organization of the cell. Given the existing information on metabolic and regulatory networks, inferring biopathway information through scientific reasoning or data mining of large scale array data or proteomics data get great attention. Naturally, there is a need for a user-friendly system allowing the user to combine large and diverse pathway data sets from different resources. We built a data warehouse - BIOWAY - for analyzing and visualizing biological pathways, by integrating and customizing resources. We have collected many different types of data in regards to pathway information, including metabolic pathway data from KEGG/LIGAND, signaling pathway data from BIND, and protein information data from SWISS-PROT. In addition to providing general data retrieval mechanism, a successful user interface should provide convenient visualization mechanism since biological pathway data is difficult to conceptualize without graphical representations. Still, the visual interface in the previous systems, at best, uses static images only for the specific categorized pathways. Thus, it is difficult to cope with more complex pathways. In the BIOWAY system, all the pathway data can be displayed in computer generated graphical networks, rather than manually drawn image data. Furthermore, it is designed in such a way that all the pathway maps can be expanded or shrinked, by introducing the concept of super node. A subtle graphic layout algorithm has been applied to best display the pathway data.