• 한국토양비료학회지
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• 제42권Spc호
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• pp.1-3
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• 2009

은나노입자는 살균 효과 때문에 농업현장에서 사용되고 있다. 그러나 은나노입자가 토질에 미치는 영향에 대해서는 아직 많은 정보가 없다. 그러므로 비료가 처리 되었을 때 특히 토양에 은나노입자를 처리한 효과에 대한 검증이 반드시 필요하다. 가리계 비료를 모의 실험하기 위해서 토양에 염화가리를 은나노입자와 함께 처리하였다. 은과 염소의 농도는 처리 후 78 내지 84% 그리고 kg 당 3.4 mg 정도 감소하는 경향을 보였다. 그리고 은나노입자와 염화가리를 혼합하였을 때 미생물의 숫자가 증가하였다. 이러한 결과로부터 비료시용은 토양에서 은나노입자의 살생물 효과에 영향을 미친다.

• 한국콘텐츠학회논문지
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• 제15권10호
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• pp.616-625
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• 2015

최근 한의학에 대한 과학적 접근이 진행되면서 한약재 성분의 효능을 검증하고자 하는 다양한 분자 생물학 분야의 연구가 진행되고 있다. 하지만 관련 한약재의 주요 성분과 관련된 생화학적 기작을 손쉽게 검색할 수 있는 시스템이 갖추어져 있지 못한 실정이다. 본 연구는 국내 한약재에 대한 약효 성분과 생물학적 기작에 대한 정보를 수집 및 텍스트마이닝을 수행하여 한약재 정보 데이터베이스를 구축하고자 하였다. 연구자가 손쉽게 분석된 한약재의 화합물, 유전자 그리고 생물학적 상호작용 정보를 검색할 수 있는 웹사이트 원형을 개발하였다. 문헌 분석결과 한의학분야 주요 화합물 및 유전자/단백질 정보를 추출할 수 있었고 현대 한의학 연구 현황의 특징을 보여주었다. 분석된 결과는 웹을 통해 한약재별 PubMed 문헌 정보와 관련된 한약재의 약재 정보 및 생물학적 상호작용 정보를 가시화하여 볼 수 있도록 개발하였다.

• Genomics & Informatics
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• 제15권3호
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• pp.98-107
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• 2017

MicroRNAs (miRNAs) act as regulators of gene expression by binding to the 3' untranslated region (UTR) of target genes. They perform important biological functions in the various species. Among many miRNAs, miR-21-3p is known to serve vital functions in development and apoptosis in olive flounder. Using genomic and bioinformatic tools, evolutionary conservation of miR-21-3p was examined in various species, and expression pattern was analyzed in olive flounder. Conserved sequences (5'-CAGUCG-3') in numerous species were detected through the stem-loop structure of miR-21-3p. Thus, we analyzed target genes of miR-21-3p. Among them, 3' UTR region of PPIL2 gene indicated the highest binding affinity with miR-21-3p based on the minimum free energy value. The PPIL2 gene showed high expression levels in testis tissue of the olive flounder, whereas miR-21-3p showed rather ubiquitous expression patterns except in testis tissue, indicating that miR-21-3p seems to control the PPIL2 gene expression in a complementary repression manner in various tissues of olive flounder. Taken together, this current study contributes to infer the target gene candidates for the miR-21-3p using bioinformatics tools. Furthermore, our data offers important information on the relationship between miR-21-3p and target gene for further functional study.

• Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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• 제11권3호
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• pp.235-239
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• 2006

Due to recent advances in genome sequencing, there has been a dramatic increase in the quantity of genetic information, which has lead to an even greater demand for a faster, more parallel expression system. Therefore, interest in cell-free protein synthesis, as an alternative method for high-throughput gene expression, has been revived. In contrast to in vivo gene expression methods, cell-free protein synthesis provides a completely open system for direct access to the reaction conditions. We have developed an efficient cell-free protein synthesis system by optimizing the energy source and S30 extract. Under the optimized conditions, approximately $650{\mu}g/mL$ of protein was produced after 2h of incubation, with the developed system further modified for the efficient expression of PCR-amplified DNA. When the concentrations of DNA, magnesium, and amino acids were optimized for the production of PCR-based cell-free protein synthesis, the protein yield was comparable to that from the plasmid template.

• BMB Reports
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• 제44권12호
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• pp.793-798
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• 2011

Recently, pluripotency induction or cellular reprogramming by introducing critical transcription factors has been extensively studied, but has been demonstrated only in vitro. Based on reports that Oct4 is critically involved in transforming neural stem cells into pluripotent cells, we used the lentiviral vector to introduce the Oct4 gene into the hippocampal dentate gyrus (DG) of adult mice. We examined whether this manipulation led to cellular or behavioral changes, possibly through processes involving the transformation of NS cells into pluripotent cells. The Oct4 lentivirus-infused group and the green fluorescent protein lentivirus-infused group showed a similar thickness of the DG and a comparable level of synaptophysin expression in the DG. Furthermore, our behavioral analyses did not show any differences between the groups concerning exploratory activity, anxiety, or memory abilities. This first trial for pluripotency induction in vivo, despite negative results, provides implications and information for future studies on in vivo cellular reprogramming.

• 한국응용과학기술학회지
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• 제31권4호
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• pp.669-678
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• 2014

The amount of waste water generated from the domestic sources is consistently increasing in proportion to economic growth, and the conventional activated sludge process is widely being used for general waste water treatment. But the ministry of environment becomes stringthent treatment standards of N and P (less than 20mg/L of N, 2mg/L of P) to prevent the eutrophication of lake water, and therefore highly advanced treatment technology is required not only in the existing treatment plants where the activated sludge process is being used, but also in newly constructed treatment plants for the treatment of N and P. This study is aimed at highly operating the engineering technology method was developed by domestic to eliminate N and P at the same time. Experiments were conducted in the treatment plant located in Yong In city. The bioreactor was started from the principal equipment for the elimination of N and P and the elimination of organic compounds. It consists of an internal recycle piping from the end of the aerobic tank to the anoxic tank and external recycle piping from the final settling basin to the denitrification tank. By experiment of 4 types separate inflow of waste water to the denitrification tank and the anaerobic tank, and changes in staying time at the anoxic tank and the aerobic tank, the elimination of organic compounds in each type and the relationship in the efficiency between the elimination of N and P were researched.

• 대한원격탐사학회:학술대회논문집
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• 대한원격탐사학회 2007년도 Proceedings of ISRS 2007
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• pp.533-536
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• 2007

The LiDAR data structure has the potential for modeling in three dimensions because the LiDAR data can represent voxels with z value under certain defined conditions. Therefore, it is possible to classify the physical damaged degree of vegetation by forest fire as using the LiDAR data because the physical loss of canopy height and width by forest fire can be relative to an amount of points reached to the ground through the canopy of damaged forest. On the other hand, biological damage of vegetation by forest fire can be explained using the NDVI (Normalized Difference Vegetation Index) which show vegetation vitality. In this study, we graded the damaged degree of vegetation by forest fire in Yangyang-Gun of South Korea using the LiDAR data for physical grading and digital aerial photograph including Red, Green, Blue and Near Infra-Red bands for biological grading. The LiDAR data was classified into 2 classes, of which one was Serious Physical Damaged (SPD) and the other was Light Physical Damaged (LPD) area. The NDVI was also classified into 2 classes which are Serious Biological Damaged (SBD) and Light Biological Damaged (LBD) area respectively. With each 2 classes ofthe LiDAR data and NDVI, the damaged area by forest fire was graded into 4 degrees like damaged class 1,2,3 and 4 grade. As a result of this study, 1 graded area was the broadest and next was the 3 grade. With this result, we could know that the burned area by forest fire in Yangyang-Gun was damaged rather biologically because the NDVI in 1 and 3 grade appeared low value whereas the LiDAR data in 1 and 3 grade included light physical damage like the LPD.

• 식물병연구
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• 제21권3호
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• pp.161-179
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• 2015

식물은 다양한 병원성 미생물에 대하여 효과적인 방어 기제를 발전시켜 왔다. 최근 유전체와 다중 오믹스 기술의 발전은 우리에게 미생물 인자에 의한 식물 면역을 폭넓게 이해할 수 있는 단초를 제공해 주었다. 하지만 아직까지는 이러한 기술을 병 방제 전략에 이용한 적은 많지 않다. 그래서 본 리뷰에서 식물 면역의 기본 개념을 소개하고 최근 얻어진 결과들을 소개하였다. 덧붙여 이미 논문에서 발표된 진균, 세균, 바이러스 유래 결정인자에 의한 생물적 방제 가능한 방법에 대해 기술하였다. 특히 미생물 결정인자인 chitin, glucan, LPS/EPS, 미생물분자패턴, 항생제, 식물유사호르몬, AHLs, harpin, 비타민, 휘발성물질에 대한 결과를 자세하게 기술하였다. 이 리뷰를 통하여 많은 과학자들과 농민들이 미생물 결정인자 기반의 생물적 방제에 대한 지식이 폭넓어지고, 다양한 미생물 결정 인자가 앞으로 농업현장의 종합적인 병방제 전략의 하나로 자리매김하기를 바란다.

• 미생물학회지
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• 제42권4호
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• pp.294-298
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• 2006

Streptomyces somaliensis가 생산하는 phospholipase D (PLD)를 정제하기 위하여 펩티드 항체 결합 면역 친화 크로마토그래피용 칼럼을 개발하였다. 단백질 구조 예측 프로그램과 Streptomyces PLD X-선 결정구조를 참조하여, S. somaliensis PLD의 1차 구조로부터 항원특성이 높고. 표면에 위치하는 것으로 예상된 5종류의 펩티드들을 epitope로 선정한 뒤, 이에 대한 항체로 면역친화 크로마토그래피용 칼럼을 제작하였다. 배양 농축액을 칼럼에 통과시켜 정제한 활성 분획을 SDS-PAGE 및 Western blot 결과, 칼럼 종류에 따라 순수한 PLD또는 35 kDa의 단백질 불순물만을 포함하는 PLD 정제 분획을 보여 면역친화 칼럼의 높은 항원결합 특이성을 보여주었다. 그러나 수용액상에서 PLD 자체의 구조적 불안정성 때문에 정제 후 PLD의 특이적 활성 및 정제 수율은 낮았다.

• 생명과학회지
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• 제8권2호
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• pp.226-226
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• 1998

Molecular chaperone의 발견은 생명과학자들에게 살아있는 세포 내에서 어떻게 생체활성단백질이 만들어지고 유지되는지에 대한 자극과 함께 그것을 증명하기 위한 실험동기를 부여하였다. 초기에는 Molecular chaperone이 nucleosomes의 assembly에 관여하는 단백질을 설명하기 위하여 사용되었으나, 지금은 기본적인 세포생리기능의 하나인 단백질의 folding과 assembly를 돕는 assistant protein으로 주로 사용된다. 단백질합성 뿐만 아니라 단백질수송, oligomeric structure의 assembly와 disassembly, heat shock을 포함한 각종 내, 외부스트래스에 의해서 변성된 단백질의 세로내분화와 회복에도 Molecular chaperone이 관여하고 있다. 그러나 아직까지는 Molecular chaperone들의 3차구조와 그들간의 상호작용에 관한 정보가 부족하여 크게 진전되지 못하고 있지만, 많은 연구자에 의한 정보축적으로 인하여 빠른 시일 내에 Molecular chaperone에 세포내역할이 분명하게밝혀질 것이다.