• Molecules and Cells
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• 제22권3호
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• pp.323-327
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• 2006

DNA barcoding, an inventory of DNA sequences from a standardized genomic region, provides a bio-barcode for identifying and discovering species. Several recent studies suggest that the sequence diversity in a 648 bp region of the mitochondrial gene for cytochrome c oxidase I (COI) might serve as a DNA barcode for identifying animal species such as North American birds, insects and fishes. The present study tested the effectiveness of a COI barcode in discriminating Korean bird species. We determined the 5' terminus of the COI barcode for 92 species of Korean birds and found that species identification was unambiguous; the genetic differences between closely related species were, on average, 25 times higher than the differences within species. We identified only one misidentified species out of 239 specimens in a genetic resource bank, so confirming the accuracy of species identification in the banking system. We also identified two potential composite species, calling for further investigation using more samples. The finding of large COI sequence differences between species confirms the effectiveness of COI barcodes for identifying Korean bird species. To bring greater reliability to the identification of species, increased intra- and interspecies sampling, as well as supplementation of the mitochondrial barcodes with nuclear ones, is needed.

• 한국정보통신학회논문지
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• 제22권4호
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• pp.611-616
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• 2018

RFID 기술을 활용한 스마트 캐비닛은 전자파 간섭으로 인해 인식 오류가 발생할 수 있다. 본 논문에서는 생물학 실험실의 특성을 고려하여 생물학 실험에 사용되는 다양한 물품들을 효율적으로 보관하고 실시간으로 관리할 수 있는 RFID 기반 스마트 캐비닛을 설계하고 구현하였다. 효율적인 스마트 캐비닛 구현에 필요한 최적의 칸막이 거리를 실험을 통해 계산하였고 전자파 차단을 위해 철재 칸막이의 두께별 인식률과 전자파 차단 테이프를 이용했을 때의 인식률을 실험을 통해 구했다. 실험 결과 가장 효율적인 칸막이 구조는 전자파 차단 테이프를 부착한 1mm의 철판 칸막이를 사용하고 칸막이 간격은 30cm임을 보였다.

• 정보관리연구
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• 제40권1호
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• pp.157-181
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• 2009

전 세계적으로 정보기술이 발달하고 인간유전체사업이 종료됨에 따라 대용량 생명과학과 정보기술이 접목된 생명정보학(Bioinformatics, 바이오인포매틱스)이 등장하여 지속적으로 발전하고 있다. 이러한 학문의 발전과 더불어 생명정보서비스를 위한 웹사이트가 구축되어 생명과학 연구자들에게 제공되고 있다. 전 세계의 수많은 생명정보서비스 웹사이트 중에서 연구자들이 가장 많이 활용하는 대표적인 웹사이트로는 우리나라의 포항공과대학교 생물학연구전문정보센터(BRIC), 한국과학기술정보연구원 바이오인포매틱스센터(CCBB), 한국생명공학연구원 국가생물자원정보관리센터(KOBIC), 미국의 국립생명공학정보센터(NCBI), 유럽의 생물정보학연구소(EBI), 일본의 DNA데이터은행(DDBJ) 등이 있다. 본 논문에서는 위의 6개 웹사이트의 콘텐트 현황 및 기능을 조사하여 비교.분석하였다. 또한 웹사이트를 이용하는 생명과학 연구자를 대상으로 이용현황 및 요구사항에 관하여 설문조사를 실시하였다.

• 감성과학
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• 제21권3호
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• pp.151-164
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• 2018

기존의 사회인지와 정서 연구들은 주로 얼굴자극을 이용하여 초기지각단계 및 후기인지과정에의 정서 효과를 조사해 왔다. 그러나, 정서의 효과가 정보처리과정의 각 단계에서 어떤 양상으로 나타나는지와, 정서유형에 따른 효과 양상의 변화 여부는 불확실하다. 본 연구에서는 얼굴 대신 생물형운동자극을 이용해 자극에 내포된 행복, 분노, 중립정서가 지각과제와 작업기억과제 수행에 미치는 영향을 조사하였다. 참가자는 연달아(지각과제) 또는 시간차를 두고(작업기억과제) 제시되는 두 생물형운동의 동일 여부를 판단하였다. 지각과제에서는 정서가를 가진 자극 시행의 정확도가 중립정서자극에 비해 낮아 정서정보가 초기지각처리에는 부정적 영향을 미치는 것으로 보였으나, 작업기억과제에서의 기억정보유지에는 도움이 되는 것으로 나타났다. 또한, 각 과제에서 정서유형에 따라 다른 수행 양상이 관찰되었다. 분노정서는 지각단계에서 더 많은 정신적 자원을 요구하여 부하가 증가할 경우 정확도가 낮아지지만 기억유지에는 긍정적으로 작용하는 것으로 보이며. 행복정서의 경우 중립정서가 이어서 제시될 때 이를 행복정서와 유사하게 처리하려는 편향을 유도하는 것으로 보인다. 본 연구는 생물형운동자극을 이용하여 정보처리과정에서의 정서 영향을 재확인하였고, 처리단계별 및 정서 종류별로 다른 양상의 영향이 나타난다는 점을 추가로 밝혀, 정서정보의 정교한 조작 및 통제를 위한 유용한 단서를 제공한다.

• 디지털융복합연구
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• 제14권3호
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• pp.235-241
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• 2016

최근 사회적으로 부각되고 있는 이슈 중에서 건강과 관련된 분야가 가장 큰 관심을 받고 있다. 본 논문에서는 질병이 악화되어 자가 치료가 어려운 환자를 대상으로 체내에 체내삽입장치를 부착하여 질병 정보를 안전하게 관리할 수 있는 생체 정보 전달 기법을 제안한다. 제안 기법의 목적은 체내삽입장치에 부착된 생체정보를 제 3자가 불법적으로 도청 및 간섭을 못하도록 하는 것이다. 제안 기법에서는 제3자의 도청 및 간섭을 방지하기 위해서 환자의 생체정보에 각각 코드를 할당하여 환자와 병원(의사) 사이의 안전성을 향상시킨다. 또한, 제안 기법은 생체정보를 코드 분할 방식으로 환자와 병원(의사)간 생체정보를 확인할 수 있도록 인코딩에 필요한 코드를 사전에 할당받는다. 특히, 제안기법은 제3자에게 불법적으로 도청 및 간섭이 발생하지 않도록 인코딩에 사용되는 코드를 사전에 생성하여 병원 데이터베이스에 저장하여 사용함으로써 병원 진료시간 단축 및 업무 효율성이 기존 방법보다 각각 6.9%와 12.7% 향상되었다.

• 한국해양학회지:바다
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• 제10권3호
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• pp.139-144
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• 2005

금강 하구 해수의 장기적 수질 변화를 이해하기 위해 수행된 연구의 일부로서, 하구 내 고정점에서 1996년 6월부터 2004년 4월까지 매일 관측한 수질 변화 자료를 다양한 통계 분석법을 이용하여 분석하였다. 전체적으로 금강 하구 내 수질은 금강 담수의 유입에 의한 요인(요인 $1: 28.3\%$), 퇴적물의 재부유나 도시 하수의 유입에 따른 질산화과정 등을 포함하는 화학적인 요인(요인 $2: 18.6\%$), 식물플랑크톤의 일차생산으로 대표되는 생물학적인 요인(요인 $3; 13.5\%$)에 의하여 $60\%$이상이 결정되었다. 조사 기간을 평균할 때 담수의 유입에 의한 영향이 가장 크게 나타났으며, 특히, 유량이 평균치거나 혹은 보다 적을 때 금강 유량이 더욱 효과적으로 금강 하구 내 환경 인자에 영향을 주었다. 반면 요인 2와 요인 3은 계절적으로 차이를 보이는데, 이러한 원인은 생물 활동의 시기와 관계가 있을 것으로 보인다. 특히 2004년 금강 하구 내 엽록소-a의 대증식 기간에는 요인 3인 생물학적인 요인이 가장 중요한 것으로 나타났다. 생물학적 요인의 대표적인 인자인 엽록소-a에 대해 다중회귀분석을 수행한 결과, 금강 하구 내에서 엽록소-a의 농도를 결정하는 가장 중요 인자는 인산염과 N/P 비율로 나타났다. 파라서 갈수기(특히, 봄철) 동안 인산염은 금강 하구 내에서 식물플랑크톤의 성장을 제한하는 인자로 작용하고 있음을 알 수 있다.

• Genomics & Informatics
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• 제13권1호
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• pp.7-14
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• 2015

During recent years, there has been exponential growth in biological information. With the emergence of large datasets in biology, life scientists are encountering bottlenecks in handling the biological data. This study presents an integrated geographic information system (GIS)-ontology application for handling microbial genome data. The application uses a linear referencing technique as one of the GIS functionalities to represent genes as linear events on the genome layer, where users can define/change the attributes of genes in an event table and interactively see the gene events on a genome layer. Our application adopted ontology to portray and store genomic data in a semantic framework, which facilitates data-sharing among biology domains, applications, and experts. The application was developed in two steps. In the first step, the genome annotated data were prepared and stored in a MySQL database. The second step involved the connection of the database to both ArcGIS and $Prot{\acute{e}}g{\acute{e}}$ as the GIS engine and ontology platform, respectively. We have designed this application specifically to manage the genome-annotated data of rumen microbial populations. Such a GIS-ontology application offers powerful capabilities for visualizing, managing, reusing, sharing, and querying genome-related data.

• 한국과학교육학회지
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• 제12권3호
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• pp.35-47
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• 1992

The purpose of this study was to develop a data base system for the information on science education research and development. As a part of this study, a data base program was developed on the Macintosh SE using the 4th Dimension from ACI. The data base consisted of two files, dissertation and journal. The information on the 107 theses including the master's theses and the doctoral dissertations from the Department of Scince Education, Seoul National University and on the 640 papers on science education from the first issues to the 1991 issues of five selected science education journals was input into the data base. The selected five Journals were Journal of the Korean Association for Research in Science Education(published by the Korean Association for Research in Science Education, 148 papers), Teaching Physics(published by Korean Physical Society, 164 papers),Chemical Education(published by The Korean Chemical Society, 98 papers), The Korean Journal of Biological Education(published by The Korean Society of Biological Education, 148 papers), and Journal of Science Education(published by Science Education Center, College of Education, Seoul National University,82 papers).

• Interdisciplinary Bio Central
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• 제2권4호
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• pp.13.1-13.8
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• 2010

The National BioResource Project of Japan is a governmental project to promote domestic/international research activities using biological resources. The project has 27 biological resources including three cereal resources. The core center and sub-center which historically collected the cereal resources were selected for each cereal program. These resources are categorized into several different types in the project; germplasm, genetic stocks, genome resources and database information. Contents of rice resources are wild species, local varieties in East and Southwest Asia & wild relatives, MNU-induced chemical mutant lines, marker tester lines, chromosome substitution lines and other experimental lines. Contents of wheat resources are wild strains, cultivated strains, experimental lines, rye wild and cultivated strains; EST clones and full-length cDNA clones. Contents of barley resources are cultivar and experimental lines, core collection, EST/cDNA clones, BAC clones, their filters and superpool DNA. Each resource is accessible from the online database to see the contents and information about the resources. Links to the genome information and genomic tools are also important function of each database. The major contents and some examples are presented here.

• 한국재난정보학회 논문집
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• 제5권1호
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• pp.10-27
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• 2009

The fear briefly became reality in the U.S. after 9/11, as man-made anthrax spores were found in letters and in east coast post offices on a number of occasions. Anthrax attacks must be related to the terrorist attacks of September 11. These two accidents changed the situation completely. Characteristics are summarized as belows. First, it is necessary for all countries to create each own appropriate countermeasures against bioterrorism. In addition, it is urgent to consider countermeasures focusing on bioterror characteristics that terrorists may use biological agents because they can be extremely difficult to detect and do not cause illness for several hours to several days. Otherwise, those attacks will also show the panic and very real danger posed by the release of such toxins on an unsuspecting public. Second, it is crucial to manage the result thoroughly. A biological weapon is useful to a terrorist group mainly as a method of creating mass panic and disruption to a society. Because it is not easy to predict and collect information about how terrorists utilize pathogenic microbe as well as terror measures in their activities, more realistic approach should be taken to reduce damage. Third, to expand investment in research and development is necessary. Considering advances in microbiology and genetic engineering lately, it is likely that new pathogenic microbe would be created by the enemy. For that matter, it is imperative that medical countermeasures should be devised.