• 제목/요약/키워드: Bayesian p-value

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On a Bayesian P-value with the Coherence Property

  • Hwang, Hyungtae
    • Communications for Statistical Applications and Methods
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    • 제10권3호
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    • pp.731-740
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    • 2003
  • Schervish(1996) and Lavine and Schervish(1999) have shown that the classical P-values and the Bayes factors fail to achieve the so-called coherence property, respectively. In this paper, we propose a new type of Bayesian P-value, namely the type LR Bayesian P-value, satisfying the coherence property. The proposed Bayesian P-values are very easy to use with since they are simple functions of likelihood ratio. Their performances are discussed and compared with those of other methods under several situations.

베이지안 로지스틱 회귀모형에서의 추론에 대한 연구 (Inferential Problems in Bayesian Logistic Regression Models)

  • 황진수;강성찬
    • 응용통계연구
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    • 제24권6호
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    • pp.1149-1160
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    • 2011
  • 기존의 frequentist 추론에 비해 Bayesian 추론에서의 가설 검정 및 모형 선택 문제는 학자들 간에 일치된 견해를 보이지 못하고 있으며 아직도 논란이 되는 것들이 많다. Bayesian 추론에서 가설 검정 및 모형 선택의 기준으로 널리 쓰이는 Bayes factor는 이해하기 쉬우나 여러 경우에 구하기 어려운 단점이 존재한다. 그 외에 다른 기준으로 Spiegelhalter 등 (2002)가 제시한 DIC(Deviance Information Criterion)과 frequentist 추론에서의 P-value에 대비되는 Bayesian P-value가 있다. 본 논문에서는 Swiss banknote 자료를 Bayesian 로지스틱 회귀모형으로 분석하고 관련 기준들을 구하여 각 기준들이 일관성 있는 결론을 보이는지 확인하고자 한다.

A Study on Bayesian p-values

  • Hwnag, Hyungtae;Oh, Heejung
    • Communications for Statistical Applications and Methods
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    • 제9권3호
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    • pp.725-732
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    • 2002
  • P-values are often perceived as measurements of degree of compatibility between the current data and the hypothesized model. In this paper, a new concept of Bayesian p-values is proposed and studied under the non-informative prior distributions, which can be thought as the Bayesian counterparts of the classical p-values in the sense of using the concept of significance level. The performances of the proposed Bayesian p-values are compared with those of the classical p-values through several examples.

치의학 연구에서 귀무가설 유의성 검정의 문제점과 대안에 관한 고찰 (Review on Problems with Null Hypothesis Significance Testing in Dental Research and Its Alternatives)

  • 이광희
    • 대한소아치과학회지
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    • 제40권3호
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    • pp.223-232
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    • 2013
  • 치의학 연구에서 사용되는 귀무가설 유의성 검정에서 p값을 기준으로 연구의 결과를 평가하는 것은 많은 문제점을 내포하고 있다. 귀무가설이 기각되지 않은 경우에 귀무가설이 옳다는 결론을 내리는 것은 논리적 오류이다. p값에 대한 중대한 오해가 많이 있으며 연구자는 논문을 작성할 때 p값의 해석에 신중해야 한다. 귀무가설검정을 보완하거나 대체할 수 있는 대안으로서, 효과 크기, 신뢰구간, 베이지안 통계 등이 있다.

Distance between the Distributions of the P-value and the Lower Bound of the Posterior Probability

  • Oh, Hyun-Sook
    • Communications for Statistical Applications and Methods
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    • 제6권1호
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    • pp.237-249
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    • 1999
  • It has been issued that the irreconcilability of the classical test for a point null and standard Bayesian formulation for testing such a point null. The infimum of the posterior probability of the null hypothesis is used as measure of evidence against the null hypothesis in Bayesian approach; here the infimum is over the family of priors on the alternative hypotheses which includes all density that are a priori reasonable. For iid observations from a multivariate normal distribution in $\textit{p}$ dimensions with an unknown mean and a covariance matrix propotional to the Identity we consider the difference and the Wolfowitz distance of the distributions of the P-value and the lower bound of the posterior probability over the family of all normal priors. The Wolfowitz distance is interpreted as the average difference of the quantiles of the two distrbutions.

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게임으로 만들어진 슬롯화된 ALOHA를 위한 Bayes 풍의 예측 (Bayesian Prediction for Game-structured Slotted ALOHA)

  • 최천원
    • 대한전자공학회논문지TC
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    • 제49권1호
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    • pp.53-58
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    • 2012
  • 게임 이론적 시각으로 p-persistence 슬롯화된 ALOHA를 비협력 게임으로 구성하고, 이 게임에서 Nash equilibrium을 구해 찾아 패킷 전달을 시도할 확률 값을 마련한다. Nash equilibrium의 수학적 표현에는 반드시 활성 변방국의 수가 포함되지만, 많은 실제 응용에서 이러한 수를 거의 알 수가 없다. 따라서 본 논문에서는 패킷의 전달을 시도할 지 결정하기에 앞서 활성 변방국의 수를 예측하는 Bayes 풍의 방식을 제안한다. 제안하는 Bayes 풍의 방식은 변방국이 스스로 자연스럽게 구할 수 있는 최소 정보만을 필요로 하지만 상당량의 정보에 의존하는 방식에 비해 경쟁력 있는 예측 성능을 보여 준다.

SVD와 Bayesian 알고리즘을 이용한 뇌경색 부피 측정에 관한 연구 (Study on Volume Measurement of Cerebral Infarct using SVD and the Bayesian Algorithm)

  • 김도훈;이효영
    • 한국방사선학회논문지
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    • 제15권5호
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    • pp.591-602
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    • 2021
  • 급성 허혈성 뇌졸중(Acute ischemic stroke; AIS) 환자는 증상발현 수 시간 이내 영상의학 검사를 통해 뇌경색(Infarction)을 조기 진단하여야 한다. 본 연구에서 SVD와 Bayesian 알고리즘을 이용한 뇌경색의 부피측정을 관류 전산화단층촬영(Computed tomography perfusion; CTP)과 확산 강조 자기공명영상(Magnetic resonance diffusion weighted image; MR DWI)을 비교하여 임상적 유용성을 알고자 하였다. 2017년 9월부터 2020년 9월까지 급성 허혈성 뇌졸중 증상으로 응급실을 내원한 환자 중 50명(남 : 여 = 33 : 17)의 영상의학 검사 정보를 후향적으로 이용하였다. SVD와 Bayesian 알고리즘으로 측정된 뇌경색 부피는 윌콕슨 부호순위검정(Wilcoxon signed rank test) 통계분석을 하여 중앙값(Median)과 사분위수(Iter quartile range; IQR) 25 - 75% 범위로 나타내었다. CTP 검사로 측정한 core volume(단위 : cc)은 SVD가 18.07 (7.76 - 33.98), Bayesian은 47.3 (23.76 - 79.11)으로 측정되었고 penumbra volume은 SVD가 140.24 (117.8 - 176.89), Bayesian은 105.05 (72.52 - 141.98)로 측정되었다. Mismatch ratio (%)는 SVD가 7.56 (4.36 - 15.26), Bayesian은 2.08 (1.68 - 2.77)로 측정되었으며 모든 측정값은 통계적으로 유의미한 차이가 있었다(p < 0.05). 스피어만 상관 분석(Spearman's correlation analysis) 결과는 CT Bayesian과 MR로 측정한 뇌경색 부피의 상관계수(r = 0.915)가 CT SVD와 MR의 상관계수(r = 0.763)보다 더욱 높은 양의 상관관계를 보였다(p < 0.01). 블랜드 알트만 산점도(Bland altman plot) 분석 결과는 CT Bayesian과 MR로 측정한 뇌경색 부피의 산점도 기울기(y = - 0.065)가 CT SVD와 MR의 산점도 기울기(y = - 0.749)보다 완만하게 측정되어 Bayesian이 더 높은 신뢰성을 나타내었다. 따라서 뇌경색 부피의 측정에서 Bayesian 알고리즘이 SVD보다 높은 정확도를 보였으므로 임상에서 유용하게 사용될 것으로 사료된다.

Bayesian Hypothesis Testing in Multivariate Growth Curve Model.

  • Kim, Hea-Jung;Lee, Seung-Joo
    • Journal of the Korean Statistical Society
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    • 제25권1호
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    • pp.81-94
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    • 1996
  • This paper suggests a new criterion for testing the general linear hypothesis about coefficients in multivariate growth curve model. It is developed from a Bayesian point of view using the highest posterior density region methodology. Likelihood ratio test criterion(LRTC) by Khatri(1966) results as an approximate special case. It is shown that under the simple case of vague prior distribution for the multivariate normal parameters a LRTC-like criterion results; but the degrees of freedom are lower, so the suggested test criterion yields more conservative test than is warranted by the classical LRTC, a result analogous to that of Berger and Sellke(1987). Moreover, more general(non-vague) prior distributions will generate a richer class of tests than were previously available.

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Bayesian curve-fitting with radial basis functions under functional measurement error model

  • Hwang, Jinseub;Kim, Dal Ho
    • Journal of the Korean Data and Information Science Society
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    • 제26권3호
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    • pp.749-754
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    • 2015
  • This article presents Bayesian approach to regression splines with knots on a grid of equally spaced sample quantiles of the independent variables under functional measurement error model.We consider small area model by using penalized splines of non-linear pattern. Specifically, in a basis functions of the regression spline, we use radial basis functions. To fit the model and estimate parameters we suggest a hierarchical Bayesian framework using Markov Chain Monte Carlo methodology. Furthermore, we illustrate the method in an application data. We check the convergence by a potential scale reduction factor and we use the posterior predictive p-value and the mean logarithmic conditional predictive ordinate to compar models.

Bayesian estimates of genetic parameters of non-return rate and success in first insemination in Japanese Black cattle

  • Setiaji, Asep;Arakaki, Daichi;Oikawa, Takuro
    • Animal Bioscience
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    • 제34권7호
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    • pp.1100-1104
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    • 2021
  • Objective: The objective of present study was to estimate heritability of non-return rate (NRR) and success of first insemination (SFI) by using the Bayesian approach with Gibbs sampling. Methods: Heifer Traits were denoted as NRR-h and SFI-h, and cow traits as NRR-c and SFI-c. The variance covariance components were estimated using threshold model under Bayesian procedures THRGIBBS1F90. Results: The SFI was more relevant to evaluating success of insemination because a high percentage of animals that demonstrated no return did not successfully conceive in NRR. Estimated heritability of NRR and SFI in heifers were 0.032 and 0.039 and the corresponding estimates for cows were 0.020 and 0.027. The model showed low values of Geweke (p-value ranging between 0.012 and 0.018) and a low Monte Carlo chain error, indicating that the amount of a posteriori for the heritability estimate was valid for binary traits. Genetic correlation between the same traits among heifers and cows by using the two-trait threshold model were low, 0.485 and 0.591 for NRR and SFI, respectively. High genetic correlations were observed between NRR-h and SFI-h (0.922) and between NRR-c and SFI-c (0.954). Conclusion: SFI showed slightly higher heritability than NRR but the two traits are genetically correlated. Based on this result, both two could be used for early indicator for evaluate the capacity of cows to conceive.