• 제목/요약/키워드: Bacteroides sp.

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한국인의 분변으로 부터 Bacteroides를 분리하기 위한 선택 배지 조사 (Investigation of Selective Medium for Isolation and Enumeration of Bacteroides sp. from the Feces of the Korean People)

  • 지근억;김인희;이세경
    • 한국식품과학회지
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    • 제26권3호
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    • pp.295-299
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    • 1994
  • Bacteroides는 대장의 상재균총 중 가장 많이 존재하는 균이다. 본 연구에서는 Bacteroides를 분리하여 동정하고 이들 균주들에 대하여 BL배지와 EG배지를 기본 배지로 하여 항생제 및 대사저해제에 대한 감수성 조사를 한 결과 vancomycin은 Bacteroides와 대장균 이외의 장내균들의 생육을 저해하는 것으로 나타났다. 성인에서 대장균은 Bacteroides에 비하여 숫적으로 훨씬 적게 존재하기 때문에 vancomycin이 첨가된 VA배지를 선택배지로 조제하여 한국인을 대상으로 기존의 NBGT 선택배지와 비교한 결과 선택성이 거의 동일한 것으로 나타났고 유아의 경우에는 VA배지가 NBGT보다 우수하였다.

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Genome analysis of Bacteroides sp. CACC 737 isolated from feline for its potential application

  • Kim, Jung-Ae;Jung, Min Young;Kim, Dae-Hyuk;Kim, Yangseon
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제62권6호
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    • pp.952-955
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    • 2020
  • Bacteroides sp. CACC 737 was isolated from a feline, and its potential probiotic properties were characterized using functional genome analysis. Whole-genome sequencing was performed using the PacBio RSII and Illumina HiSeq platforms. The complete genome of strain CACC 737 contained 4.6 Mb, with a guanine (G) + cytosine (C) content of 45.8%, six cryptic plasmids, and extracellular polysaccharide gene as unique features. The strain was beneficial to animal health when consumed as feed, for example, for ameliorating immunological dysfunctions and metabolic disorders. The genome information adds to the comprehensive understanding of Bacteroides sp. and suggests potential animal-related industrial applications for this strain.

건강한 한국인 분변으로부터 분리된 Bacteroides sp. KGMB 02408 균주의 유전체 염기서열 초안 (Draft genome sequence of Bacteroides sp. KGMB 02408 isolated from a healthy Korean feces)

  • 유승엽;김지선;오병섭;유승우;박승환;강세원;박잠언;최승현;한국일;이근철;엄미경;서민국;김한솔;이동호;윤혁;김병용;이제희;이정숙;이주혁
    • 미생물학회지
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    • 제55권3호
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    • pp.296-299
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    • 2019
  • Bacteroides 속 균주들은 척추동물의 분변 등에서 분리된 것으로 알려져 있다. 본 연구에서는 건강한 한국인 분변으로부터 Bacteroides sp. KGMB 02408 균주를 분리하였으며 PacBio Sequel 플랫폼을 이용하여 Bacteroides sp. KGMB 02408 균주의 유전체서열을 분석하였다. 유전체는 G + C 구성 비율이 39.5%이고, 5,005개의 유전자와 rRNA 18개 tRNA 74개로 구성되었으며, 염색체의 크기는 5,771,427 bp였다. 또한, 유전체 분석 결과를 통해 산화-환원 효소와 메나퀴논 생합성 및 그와 관련된 다양한 유전자를 발견하였다.

한우의 반추위로부터 섬유소 분해균의 탐색 및 동정 (Screening and Identification of cellulolytic bacteria in the rumen of Korean native cattle)

  • 김태일;백순용;주이석;윤용덕
    • 미생물학회지
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    • 제34권3호
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    • pp.91-95
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    • 1998
  • 한우의 반추위액에서 섬유소를 분해하는 균주 GPC-1, GPC-2, GNR-1, GNR-2, GNR-3를 선별하였다. 분리주 GPC-1과 GPC-2는 Gram 양성구균이며 편성혐기균으로서 Ruminococcus속으로 분류되었다. 분리주 GNR-1, GNR-2 및 GNR-3는 Gram 음성 간균이며 혐기균으로서 내생포자형성 유무에 따라 포자 형성균인 GNR-3는 Clostridium속으로 분류하고 포자를 형성하지 않은 균은 $H_2S$ 생성유무에 따라 Bacteroides 속과 Butyrivibrio 속으로 분류되었다. 종수준의 동정을 위하여 당분해능과 생화학적 조사를 통하여 GPC-1는 Ruminococcus albus로, GPC-2는 Ruminococcus flavefaciens로, GNR-1는 Bacteroides succinogenes로, GNR-2는 Butyrivibrio fibrisolvens로, GNR-3는 Clostridium cellobioparum로 각각 동정하였다.

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돼지분변으로부터 Inulin이용 Bacteroides속 균주의 분리 및 특성 (Isolation and Characterization of a Bacteroides Strain Utilizing Inulin from Pig Feces)

  • 김창곤;김수일;신현경
    • 한국식품과학회지
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    • 제25권6호
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    • pp.780-786
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    • 1993
  • 돼지의 분변미생물들 중 inulin 이용균주를 탐색한 결과 전체 생균수의 약 7.7%가 inulin 한천배지에서 집락주위에 inulase를 분비하여 투명환을 형성하면서 inulin을 이용하는 것으로 나타났고 이 중 inulin의 이용성이 가장 큰 균주를 선발한 다음 그 형태학적 및 생화학적 특성을 조사하여 이 균주를 Bacteroides속으로 동정하였다. 이 분리균은 탄소원으로 inulin, fructo올리고당, 포도당을 이용하여 잘 생육하였으며 solublestarch와 sucrose를 첨가한 경우의균체량은 포도당 사용시의 약 50% 정도로 감소하였다. Inulase 활성은 포도당, sucrose, soluble starch를 사용한 배지에서는 거의 나타나지 않은 반면에 inulin을 탄소원으로 사용하였을 때 0.42U/ml로 가장 높게 나타났고 fructo올리고당을 사용한 배지에서도 0.25U/ml로 나타나 이 균주가 생산하는 inulase는 inulin과 fructo올리고당에 의해 유도되는 것으로 생각된다. 또 inulin의 농도에 따른 균의 생장은 inulin의 농도가 증가함에 따라 급격히 증가하여 2%일 때 최고치에 달하였고 inulase의 활성은 inulin의 농도가 1%일 때 0.54/ml로 가장 높게 나타났다. 분리균이 생산하는 inulase는 $pH7.0{\sim}7.5$$50{\sim}50^{\circ}C$에서 가장 높은 효소활성을 나타냈으며 inulin에 대한 작용형태로 보아 exoinulase로 확인되었다.

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Clostridium difficile-associated Intestinal Disease and Probiotics

  • Yun, Bohyun;Lee, Sang Dae;Oh, Sejong
    • Journal of Dairy Science and Biotechnology
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    • 제31권1호
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    • pp.1-7
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    • 2013
  • Probiotics are traditionally defined as viable microorganisms that have a beneficial effect in the prevention and treatment of pathologic conditions when they are ingested. Although there is a relatively large volume of literature that supports the use of probiotics to prevent or treat intestinal disorders, the scientific basis behind probiotic use has only recently been established, and clinical studies on this topic are just beginning to get published. Currently, the best studied probiotics are lactic acid bacteria, particularly Lactobacillus and Bifidobacterium species. Other organisms used as probiotics in humans include Escherichia coli, Streptococcus sp., Enterococcus sp., Bacteroides sp., Bacillus sp., Propionibacterium sp., and various fungi, and some probiotic preparations contain more than one bacterial strain. Probiotic use for the prevention and treatment of antibiotic-associated diarrhea caused by Clostridium difficile induced intestinal disease as well as for other gastrointestinal disorders has been discussed in this review.

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Bifidogenic Effect of Glucooligosaccharide Prepared from Glucose by Extrusion Process

  • Ahn, Jun-Bae;Hwang, Jae-Kwan;Kim, Chong-Tai;Lee, Ke-Ho;Park, Jong-Hyun
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제7권3호
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    • pp.174-179
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    • 1997
  • In order to investigate effect of glucooligosaccharide (GOS) prepared by extrusion process as a bifidogenic factor, cultivation of Bifidobacterium sp., Bacteroides fragilis and Clostridium perfringens was done and analyzed. B. fragilis and C. perfringens were able to utilize only 16% and 11% of the oligosaccharides in GOS, respectively, whilst Bifidobacterium sp. FBD-22 could utilize 38%. Especially, many kinds of oligo saccharides in GOS were able to be utilized selectively only by Bifidobacterium sp.. In case that GOS, as a carbon source, was used in the co-cultivation by Bifidobacterium sp., B. fragilis and C. perfringens, growth of Bifidobacterium sp. was not influenced by the existence of B. fragilis and C. perfringens. Bifidobacterium sp. showed advantage on carbon source competition for GOS with B. fragilis. Acetic acid, antimicrobial agent in the intestine, was produced two times more from GOS than glucose in co-cultures of three strains. Therefore, it is suggested that GOS can be a potent bifidogenic factor which proliferates the population of Bifidobacterium sp. and may finally improve the intestinal environments of human.

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부영양 연못에서 초음파 작동에 따른 식물플랑크톤의 군집 변화 (Change of Phytoplankton Community by Ultrasonication in Eutrophic Ponds)

  • 고소라;안치용;정승현;김희식;오희목
    • 환경생물
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    • 제24권3호
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    • pp.221-229
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    • 2006
  • 초음파가 식물플랑크톤에 미치는 영향을 조사할 목적으로, 이화학적 그리고 생물학적으로 유사한 두 군데의 부영양화 연못에서 2003년 8월 18일부터 9월 30일까지 약 4일 간격으로 시료를 채취하여 실험을 실시하였다. 실험기간 동안 출현한 식물플랑크톤 군집은 규조류(Bacillariophyceae)가 거의 대부분을 차지하였으며, 남세균(Cyanophyceae)은 상대적으로 적은 비중을 차지하였다. 분자생물학적 기법중의 하나인 DGGE(denaturing gradient gel electrophoresis)를 이용하여 식물플랑크톤 군집 구조를 비교분석하였다. 16S rDNA의 DGGE profile 분석에 의하여 처리구 연못에서는 Oscillatoria acuminata를 비롯하여 CFB (Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides) group bacterium 등이 나타나는 것으로 확인되었으며, 초음파가 정지된 시기에 특이적으로 Pseudanabaena sp.가 나타나는 것을 확인하였다. 대조구 연못에서는 Synechococcus sp.와 Aphanizomenon flos-aquae가 출현하는 것을 확인하였다. 18S rDNA의 DGGE profile분석결과 처리구 연못에서는 Chlamydomonas rein. hardtii가 우점하는 것으로 확인되었으며, 초음파 처리에 크게 반응하지 않는 것으로 판단된다. 대조구 연못에서는 처리구 연못에서 나타난 C. reinhardtii를 포함하여 Pteromonas protracta가 출현하였다. 결과적으로 초음파는 진핵성 식물플랑크톤 보다는 원핵성 식물플랑크톤의 다양성에 더 큰 영향을 주는 것으로 판단되며, 일부 남세균(Pseudanabaena sp.)의 생장에 저해를 주는 것으로 판단된다.

Streptococcus LJ-22, a human intestinal bacterium, transformed glycyrrhizin to 18$\beta$-glycyrrhetinic acid monoglucuronide

  • Kim, Dong-Hyun;Lee, Seoung-Won;Park, Hae-Young;Han, Myung-Joo
    • 한국응용약물학회:학술대회논문집
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    • 한국응용약물학회 1998년도 Proceedings of UNESCO-internetwork Cooperative Regional Seminar and Workshop on Bioassay Guided Isolation of Bioactive Substances from Natural Products and Microbial Products
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    • pp.125-125
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    • 1998
  • Glycyrrhizin (18$\beta$-glycyrrhetic acid $\beta$-D-glucuronyl a-D-glucuronic acid, GL), a main component of liquore extract (Glycyrrhiza glabra), is ingested orally as a component in the oriental medicine. By human intestinal bacteria, glycyrrhizin (18$\beta$-glycyrrhetinic acid $\beta$-D-glucuronyl a-D-glucuronic acid, GL) was metabolized to glycyrrhetinic acid (GA): main pathway metabolizing GL to GA by glucuronidases of Bacteroides J-37 (Kim et al., 1997) and Eubacterium sp strain GLH (Akao et al., 1987) and minor pathway metabolizing GL to GA via 18$\beta$-glycyrrhetic acid D-glucuronic acid (GAMG) by $\beta$-glucuronidase of Streptococcus LJ-22 and glucuronidases of Bacteroides J-37 / E. coli. $\beta$-Glucuronidase from Streptococcus LJ-22 hydrolyzed GL to GAMG, not GA. $\beta$-Glucuronidase of Streptococcus LJ-22 hydrolyzed $\beta$-glucuronic acid conjugates of polysaccharides rather than aglycone-$\beta$-glucuronides Optimal pH of Streptococcus LJ-22 $\beta$-glucuronidase was 5-6 and its molecular weight was 250 kDaltons. Km for GL was 0.37mM.

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Chitinophaga soli sp. nov. and Chitinophaga terrae sp. nov., Isolated from Soil of a Ginseng Field in Pocheon Province, Korea

  • An, Dong-Shan;Im, Wan-Taek;Lee, Sung-Taik;Choi, Woo-Young;Yoon, Min-Ho
    • Journal of Microbiology and Biotechnology
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    • 제17권5호
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    • pp.705-711
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    • 2007
  • Two novel strains of the Cytophaga-Flexibacter-Bacteroides(CFB) group, designated Gsoil $219^T$ and Gsoil $238^T$, were isolated from soil of a ginseng field of Pocheon Province in Korea. Both strains were Gram-negative, aerobic, nonmotile, nonspore-forming, and rod-shaped. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences indicated that both isolates belong to the genus Chitinophaga but were clearly separated from established species of this genus. The sequence similarities between strain Gsoil $219^T$ and type strains of the established species and between strain Gsoil $238^T$ and type strains of the established species ranged from 91.4 to 94.7% and 91.6 to 94.2%, respectively. Phenotypic and chemotaxonomic data(major menaquinone, MK-7; major fatty acids, $iso-C_{15:0}\;and\;C_{16:1}\omega5c$; major hydroxy fatty acid, $iso-C_{17:0}3-OH$; major polyamine, homospermidine) supported the affiliation of both strains Gsoil $219^T$ and Gsoil $238^T$ to the genus Chitinophaga. Furthermore, the results of physiological and biochemical tests allowed genotypic and phenotypic differentiation of both strains from the other validated Chitinophaga species. Therefore, the two isolates represent two novel species, for which the name Chitinophaga soli sp. nov.(type strain, Gsoil $219^T=KCTC\;12650^T=DSM\;18093^T$) and Chitinophaga terrae sp. nov.(type strain, Gsoil $238^T=KCTC\;12651^T=DSM\;18078^T$) are proposed.