Indigenous bacterial mediation of As in contaminated sediment after biostimulation with a variety of carbon sources was investigated under aerobic and anaerobic conditions. Under the aerobic condition with lactate supply, indigenous bacteria increased the amount of total As extracted from the sediment and most dissolved As existed as As(V). Under the anaerobic, glucose-supplied condition, dissolved As diminished with time likely due to production of As sulfide(s) and subsequent precipitation, which resulted from bacterial reduction of ${SO_4}^{2-}$. The results implied that bacterial natural attenuation of As in subsurface has a potential to be practically applied.
A blue pigment-producing bacterium, Vogesella indigofera, was isolated and quantified for the relationship between its synthesis of a blue pigment and exposure concentrations of $Cr^{6+}$. The concentration of $Cr^{6+}$ and the percentage of blue colonies on agar plates was negatively correlated ($r^{2}$ =-0.8683). Critical concentrations inhibiting bacterial pigment production were found to be between 100-150 $\mu\textrm{g}$$Cr^{6+}$/ml on agar plates and 200-300 $\mu\textrm{g}$$Cr^{6+}$/ml in liquid culture. As the blue color is characteristic and easily observable, the bacterium Vogesella indigofera may have potential applications in the detection and monitoring of environmental pollution.
Ji, Sang-Chun;Kim, Doc-Kyu;Yoon, Jung-Hoon;Lee, Choong-Hwan
Journal of Microbiology and Biotechnology
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v.17
no.4
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pp.668-672
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2007
A microcosmal experiment using a metagenomic technique was designed to assess the effect of BTEX (benzene, toluene, ethylbenzene, and xylenes) on an indigenous bacterial community in a Daejeon forest soil. A compositional shift of bacterial groups in an artificial BTEX-contaminated soil was examined by the 16S rDNA PCR-DGGE method. Phylogenetic analysis of 16S rDNAs in the dominant DGGE bands showed that the number of Actinobacteria and Bacillus populations increased. To confirm these observations, we performed PCR to amplify the 23S rDNA and 16S rDNA against the sample metagenome using Actinobacteria-targeting and Bacilli-specific primer sets, respectively. The result further confirmed that a bacterial community containing Actinobacteria and Bacillus was affected by BTEX.
Kim, Ki Young;Park, Hyo Bin;Adhikari, Mahesh;Kim, Hyun Seung;Byeon, Eun Jeong;Lee, In Kyu;Lee, Youn Su
Research in Plant Disease
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v.28
no.2
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pp.69-81
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2022
This study was performed to screen the efficacy of antagonistic bacterial isolates from various sources against the bacterial fruit blotch (BFB) causing pathogen (Acidovorax citrulli) in cucurbit crops. In addition, plant growth promoting traits of these antagonistic bacterial isolates were characterized. Two thousand seven hundred ninety-four microorganisms were isolated from the collected samples. Molecular identification revealed two A. citrulli out of 2,794 isolates. In vitro antagonistic results showed that, among the 28 antagonistic bacterial isolates, 24 and 14 bacterial isolates exhibited antagonism against HPP-3-3B and HPP-9-4B, respectively. Antagonistic and growth promotion characterization of the antagonistic bacterial isolates were further studied. Results suggested that, 4 antagonistic bacteria commonly showed both antagonism and growth promotion phenotypes. Moreover, 3 isolates possessed growth promoting activities. Overall results from this study suggests that BFB causing bacterial pathogen (A. citrulli) was suppressed in in vitro antagonism assay by antagonistic bacterial isolates. Furthermore, these antagonistic bacterial isolates possessed growth promotion and antagonistic enzyme production ability. Therefore, data from this study can provide useful basic data for the in vivo experiments which ultimately helps to develop the eco-friendly agricultural materials to control fruit rot disease in cucurbit crops in near future.
Kim, Seong-Jun;Song, Hyo-Jeong;Chang, Mi-Hwa;Choi, Chang-Nam
KSBB Journal
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v.22
no.2
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pp.91-96
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2007
The saccharogenic liquid (SFW) obtained by the enzymatic saccharification of food wastes was used as a medium for production of bacterial cellulose (BC). The enzymatic saccharification of food wastes was carried out by the cultivation supernatant of Tricoderma inhamatum KSJ1 culture. Acetobacter xylinum KJ1 was employed for the BC production culture. Under the scaled-up aeration condition of 1.0 vvm, 5.64 g/L of BC was produced in 3 days cultivation in 50 L air circulation bioreactor using SFW medium with addition of 0.4% agar. The productivity was similar to that of 10 L air circulation bioreactor (5.84 g/L). This cultivation method with 50 L air circulation bioreactor decreasing shear stress and increasing oxygen transfer coefficient ($k_La$) was very useful in BC mass production. The physical properties, such as morphology, molecular weight, crystallinity, and tensile strength of BC produced by the static culture (A), the air circulation culture using 10 L bioreactor (B) and 50 L bioreactor (C) were investigated. The number average molecular weight of BCs produced under the different culture conditions (A-C) showed 2,578,000, 1,975,000, and 1,809,000, respectively. Tensile strength was 1.72 $kg/mm^2$, 1.19 $kg/mm^2$, and 1.18 $kg/mm^2$, respectively. All of the BCs had a form of cellulose I representing pure cellulose. The relative degree of crystallinity showed the range of 86.2$\sim$87.8%. BC production by the air circulation culture mode brought more favorable results in terms of the physical properties and its ease of scale-up. Therefore, it is expected that the new BC production method, the air circulation culture using SFW, would contribute greatly to BC-related manufacturing.
Bacterial biomass and its activity were measured in two kinds of granular activated carbon (GAC), the experimental and existing biofiltration system in a drinking water plant. The bacterial biomass was around 210 to 250 nmol P/g WW with phospholipid concentration at acclimation of ozonation treatment. The phospholipid biomass shows more or less a declining gradient along filter depth and no clear seasonality in its values. On the other hand, the microbial activity of [$^3H$]-thymidine and [$^{14}C$]-acetate incorporation within cells increased significantly along the filter depth, showing the difference of three fold between the upper and bottom layer. These factors support the different microbial composition or metabolic activity along the depth of GAC column. Turnover rates, the rate of bacterial biomass and production of biofilm, ranged from 0.26 /hr to 0.37 /hr, indicating a highly rapid recovery itself at amature state. In the non-ozonation treatment, the bacterial biomass was lower than in the ozonation and biological activity also declined towards the filter depth. The biomass levels during cessation of ozonation in the existing GAC filters were 68% of the actively ozonated state.
A study was made of diurnal changes in the ruminal bacteria associated with feed particles, i.e., non-associated (NAB), loosely associated (LAB), and tightly associated with particles (TAB), and the TAB concentration in different particle sizes from sheep fed orchardgrass (OG) or alfalfa (ALF) hay. Diaminopimelic acid (DAPA) was used to determine the TAB mass. Results showed that the bacterial masses in NAB and LAB were small, but comprised over 90% in TAB. The TAB mass in the ALF group sharply increased within 2 h after feeding and decreased afterward. The TAB mass showed the same trend in the OG group, increasing from 0 h to 2 h, but remained at the same level up to 14 h after feeding. The peak bacterial mass was, however, lower in the OG than the ALF group. The TAB concentration reflected the changes in total particulate tightly associated bacterial masses in both groups of hay fed sheep. Number of bacterial colonies per particle increased as the particulate size decreased in both groups. This difference, however, tended to decline as the postprandial period was prolonged. DAPA, however, tended to overestimate the TAB mass in the reticulo-rumen digesta of the hay fed sheep.
Sodium hypochlorite alkaline was tested against Pseudomonas tolaasii causing bacterial blotch on cultivated oyster mushroom (Pleurotus ostreatus). The minimum inhibitory concentration of sodium hypochlorite against P. tolaasii contained active chlorine (AC) at 1.4 mg/l on plate assay. The highest cultivation yield was obtained from the treatment of AC 5.7 mg/l. Treatment of sodium hypochlorite at the rate of higher than AC 11.4 mg/l resulted in reduced yields at the harvest. However, the population of total bacteria on the bed surface treated with AC 5.7 mg/l of sodium hypochlorite was maintained to some extent. Inhibitory concentration against total bacteria on the bed surface was over AC 22.8 mg/l. Mushroom mycelium was damaged and its growth strongly inhibited at the concentration of AC 200 mg/l. Mushroom caps showed yellowish symptom by chemical injury by treatments of AC 74.1 mg/l or higher. Sporocarps infected by P. tolaasii were irrevocable at any concentration of sodium hypochlorite. Routine watering with AC 5.7 mg/l from mushroom initiation to the end of picking resulted in reduced bacterial blotch incidence of 40% and 86% at two mushroom farms. The treatment resulted in higher quality mushroom production compared to that conventionally watered with tap water alone.
Kim, Min-Jung;Chae, Dae-Han;Cho, Gyeongjun;Kim, Da-Ran;Kwak, Youn-Sig
The Plant Pathology Journal
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v.35
no.5
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pp.473-485
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2019
Kiwifruit (Actinidia spp.) is an economically important crop and a bacterial canker disease, caused by Pseudomonas syringae pv. actinidiae (Psa), is the most destructive disease in kiwifruit production. Therefore, prevent and control of the disease is a critical issue in kiwifruit industry worldwide. Unfortunately, there is no reliable control methods have been developed. Recently, interest in disease control using microbial agents is growing. However, kiwifruit microbiota and their roles in the disease control is mainly remaining unknown. In this study, we secured bacterial libraries from kiwifruit ecospheres (rhizosphere, endospere, and phyllosphere) and screened reliable biocontrol strains against Psa. As the results, Streptomyces racemochromogenes W1SF4, Streptomyces sp. W3SF9 and S. parvulus KPB2 were selected as anti-Psa agents from the libraries. The strains showed forcible antibacterial activity as well as exceptional colonization ability on rhizosphere or phyllosphere of kiwifruit. Genome analyses of the strains suggested that the strains may produce several anti-Psa secondary metabolites. Our results will contribute to develop biocontrol strains against the kiwifruit canker pathogen and the disease management strategies.
Talipariti hamabo is a plant growing around salt marshes in the Lava Coast region of Jeju Island, Korea. In this study, the extract of T. hamabo leaves was investigated for the anti-inflammatory, anti-oxidative and anti-bacterial activities and their active constituents were identified. In the anti-inflammatory tests using lipopolysaccharide-stimulated RAW264.7 cells, the ethyl acetate (EtOAc) fraction inhibited the nitric oxide production without causing cell toxicity. Moreover, the EtOAc fraction reduced pro-inflammatory cytokines (tumor necrosis factor-α, interleukin-6) as well as prostaglandin E2. In the anti-oxidative studies with DPPH and ABTS+ radicals, potent scavenging activities were observed in the EtOAc and n-butanol fractions. Upon the anti-bacterial tests using Staphylococcus epidermidis, EtOAc and n-butanol fractions exhibited good activities. Through the phytochemical studies on EtOAc fraction, three components were isolated by repeated column chromatography; oleic acid (1), p-hydroxyphenethyl-trans-ferulate (2), nicotiflorine (3). Based on these results, the extract of T. hamabo leaves can be developed as natural resources for cosmetic applications.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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