• 대한환경공학회지
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• 제31권12호
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• pp.1069-1074
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• 2009

본 연구에서는 CuO와 ZnO의 입자 크기가 옥수수의 성장과 토양 미생물 군집에 미치는 독성을 microcosm 실험을 통하여 살펴보았다. 나노 입자는 micro 입자에 비해 옥수수의 biomass를 약 30% 감소시켜 나노 입자가 옥수수의 성장을 저해하는 것으로 나타났다. 토양 미생물 활성 지표인 Dehydrogenase activity는 CuO 나노 입자에서는 낮게 나타났으나 ZnO 나노 입자에서는 높게 나타났다. Biolog test 결과, CuO 나노 입자와 ZnO micro 입자에서 토양 미생물 다양성이 감소하는 것으로 나타났다. 그러므로, metal oxide의 나노 입자가 micro 입자보다 항상 토양 미생물의 활성 및 다양성에 더 유해한 영향을 나타내는 것은 아니라고 판단된다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제34권2호
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• pp.94-100
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• 2006

식물생장 촉진 호르몬인 auxin을 생산하는 균주를 선발하기 위해 경산지역 경작지 토양에서 29종의 세균을 분리하였으며 Salkowsky test를 통해 auxin을 생산하는 14종을 선발하였다. 이 중 CAS(chrome azurol S) blue agar에서 siderophore의 생산을 확인 후 auxin과 siderohroe를 동시에 생산하는 AH18을 최종 선발하였다. AH18의 mung-bean adventitious root induction test를 통해 식물생장 촉진 능이 대조구에 비해 1.5배나 뛰어남을 알 수 있었고, 토마토 pot test에서 토마토 시들음병의 윈인균인 F. oxysporum에 대해서 길항력도 나타내었다. 선발된 AHl8 균주는 16S rDNA와 Biolog system을 통해 Bacillus subtilis 동정되었다. B. subtilis AH18은 Sucrose-asparagine-MgsO$_4$(SAM) medium (pH 6.0)에 접종하여 30$^{\circ}C$에서 3일간 배양 시 siderophore를 가장 많이 생산하는 것을 알 수 있었다.

• 유기물자원화
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• 제13권2호
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• pp.85-90
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• 2005

산불로 훼손된 토양 미생물군집의 생화학적, 유전적 다양성을 비교하기 위하여 2000년에 산불이 일어났던 강릉지역에서 자연복원지 토양(NS), 인공복원지 토양(AS), 정상토양(NS)을 표토층과 심토층에서 채집하였다. 생화학적 다양성 분석을 위해 각 시료를 BIOLOG system에 직접 적용하였으며 통계처리(SPSS)를 통해 군집분석을 수행하였다. 또한 군집의 유전적 다양성은 토양 미생물의 16S-rDNA를 증폭하여 DGGE(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis)를 이용하여 분석하였다. 자연복원지의 심토와 표토, 정상토양의 표토에서만 70% 이상의 생화학적 다양성이 나타났으나, 유전적 다양성의 경우 모든 시료에서 53%에서 68%의 범위의 상동성을 나타냈다. 이러한 결과는 토양미생물 군집의 생화학적 다양성이 반드시 유전적 다양성을 반영하지 않는다는 것을 보여준다.

• 한국토양비료학회지
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• 제30권2호
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• pp.189-195
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• 1997

본 실험은 인산염 분해균을 밀의 근권토양으로부터 분리 동정하고 인산염 분해균의 유기산 생성과 pH와의 관계를 조사하기 위해 실시하였다. 인산염 분해균은 36시간 배양후 선명한 투명대(clear zone)를 형성하였다. API 20E System과 BIOLOG$^{TM}$ analysis를 사용하여 동정한 결과 이 균주는 Entrobacter agglomerans로 동정되었다. Similarity와 distance는 각자 0.656과 4.790로 나타났다. Hydroxyapatite를 함유한 배지에서 E. agglomerans를 배양하는 동안 인산의 농도가 현저히 증가하였으며, pH와 인산의 농도와는 고도의 역상관($r^2=0.933$)을 보였다. HPLC로 분석한 결과 이 균주는 여러 가지 유기산을 생성하였으며 그 중 oxalic acid가 가장 많이 생성되었다. Acid phosphatase는 alkaline phosphatase에 비해서 10-15배의 활성을 보였으며, alkaline phosphatase는 배양 동안 거의 0에 가까운 활성을 보였다. E. agglomerans의 population은 배양 하루 동안 현저히 증가하였으나 그 후 급격히 감소하였다.

• 미생물학회지
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• 제46권4호
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• pp.346-351
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• 2010

본 연구의 목적은 원유에 오염된 지역의 토양시료로부터 분리한 생물계면활성제 생산균주의 특성을 조사하기 위하여 실시하였다. 1% 원유를 포함하는 배지에서 균주 HK-3의 배양기간 동안, 생장, 생물계면활성제의 생산, pH의 변화 등을 조사하였다. 생물계면활성제의 생산능력이 뛰어난 균주인 HK-3를 선별하여, 이 균주의 배양기간에 따른 생장 변화와 생물계면활성제의 생산량, 그리고 pH에 대하여 관찰하였다. HK-3는 배양 36시간이 경과하였을 때, 가장 많은 양의 생물계면활성제를 생산하였다. 생물계면활성제 생산에 대한 부가탄소원의 효과를 알아보기 위하여 HK-3를 다른 부가탄소원(예, glucose, dextrose, mannitol, citrate, acetate)과 함께 배지에서 배양하였다. 그 결과, 생물계면활성제의 최대생산량은 mannitol을 포함하는 BH 고체평판배지에서 관찰되었으며, 투명대의 면적은 직경은 약 7.64 cm2로 측정되었다. 분리균주의 생리학적 및 생화학적 특성을 조사하였으며, 주사전자현미경을 통하여 불규칙한 막대형의 세균으로 관찰되었다. BIOLOG 시스템과 16S rRNA 염기서열을 이용한 계통유전학적 분석을 통하여 동정하여 Pseudoalteromons 종으로 확인되어 Pseudoalteromons sp. HK-3로 명명하였으며, GenBank에 [FJ477041]로 등록하였다.

• 생명과학회지
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• 제14권2호
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• pp.229-234
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• 2004

케라틴으로 구성되어 있는 우모는 도계 공장에서 부산물로 대량 배출되는 단백질 폐기물이다. 현재, 물리화학적 처리를 통하여 우모를 가축의 사료로 재활용하기 위한 방법이 시행되고 있으나 이러한 방법은 많은 단점을 가지고 있으며, 결과적으로 keratinolytic protease의 이용은 우모의 생물 공학적 처리를 위해 반드시 필요한 과정임을 알 수 있다. 본 연구에서는 우모의 생물학적 처리를 위하여 keratinolytic protease를 생성함으로서 우모를 분해할 수 있는 세균을 자연계로부터 분리한 후, 그 분류학적 위치를 검토하였다. 퇴비화중인 볏짚, 닭 가공공장 주변의 토양 및 붕괴중인 우모로부터 keratinolytic protease생성능이 우수한 5균주를 최종 선정하였다. 그중 효소 생성능과 우모 분해능이 가장 우수한 F7-1을 실험 균주로 선정하여 형태학적, 배양적 및 생화학적 특성을 조사한 결과, Bacillus sp.로 동정되었으며, Biolog system을 이용한 동정에서도 Bacillus sp.로 조사되었다. 보다 정확한 균주 동정을 위하여 16S rDNA 염기서열 분석을 수행하였으며, 그 결과 F7-1 균주는 B. megaterium과 계통진화학적으로 가장 유연 관계가 높았다.

• Journal of Ginseng Research
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• 제40권4호
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• pp.453-461
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• 2016

Background: This study aims to describe the characterization of Paenibacillus polymyxa GBR-1 (GBR-1) with respect to its positive and negative effects on plants. Methods: The morphological characteristics of GBR-1 were identified with microscopy, and subjected to Biolog analysis for identification. Bacterial population and media optimization were determined by a growth curve. The potential for GBR-1 as a growth promoting agent, to have antagonistic activity, and to have hydrolytic activity at different temperatures was assessed. The coinoculation of GBR-1 with other microorganisms and its pathogenicity on various stored plants, including ginseng, were assessed. Results: Colony morphology, endospore-bearing cells, and cell division of GBR-1 were identified by microscopy; identification was performed by utilizing the Biolog system, gas chromatography of fatty acid methyl esters (GC-FAME). GBR-1 showed the strongest antagonistic activity against fungal and bacterial pathogens. GBR-1 cell numbers were relatively higher when the cells were cultured in brain heart infusion (BHI) medium when compared with other media. Furthermore, the starch-hydrolytic activity was influenced by GBR-1 at higher temperature compared to low temperatures. GBR-1 was pathogenic to some of the storage plants. Coinoculation of GBR-1 with other pathogens causes differences in rotting on ginseng roots. A significant growth promotion was observed in tobacco seedlings treated with GBR-1 suspensions under in vitro conditions, suggesting that its volatile organic compounds (VOCs) might play a role in growth promotion. Conclusion: The results of this study indicate that GBR-1 has both positive and negative effects on ginseng root and other stored plants as a potential biocontrol agent and eliciting in vitro growth promotion.

• 한국임상수의학회지
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• 제24권1호
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• pp.19-25
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• 2007

This study carried out to investigate the genital tract bacterial flora of Thoroughbred mare in Jeju province during March and July, 2006. The specimens were collected from vaginal ucosa and clitorial fossa using a culture swab (BBL, USA) from 100 Thoroughbred mares. Colonies were selected blood and MacConkey agar plate, and identified as standard biochemical properties using Biolog system (Thermo, USA). In this study, 470 gram-negative strains were isolated more frequently than 249 gram-positive strains. We were Isolated Escherichia coli (19.8%), Proteus mirabillis (14.9%), Enterobacter nimipressuralis (7.4%), Enterobacter mobilis (4.7%), Aeromonas encheleia (4.3%), Pseudomonas aeroginosa (3.0%), Staphylococcus aureus (14.9%), Staphylococcus epidermidis (11.2%), Coagulasenegative Staphylococcus spp. (10.0%), Enterococcus faecalis (9.2%), Enterococcus faecium (8.0%), Actinomyces viscosus (7.2%), Micoroccus diversus(6.8%), Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis(5.2%), Streptococcus equi subsp. zooepidemicus (3.2%), Other non-beta hemolytic Streptococcus spp. (2.0%) and many others from vaginal mucosa and clitorial fossa in Thoroughbred mares. No significant bacteria (Taylorella equigenitalis and Klebsiella pneumonia) were isolated from the mare genital tract. In antimicrobial agents susceptibility test, it shows a high sensibility in the antibiotics of the most which excepts the streptomycin and neomycinm, kanamycin, spectinomycin, compound sulfonamides. Especially, Staphylococcus epidermidis, Enterococcus spp. and Streptococcus spp. were visible a high sensibility in the all antibiotics. However, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Proteus spp. and E. coli were showed a high antibiotic resistance patterns. These results may provide the basic information to establish strategies for the treatment and prevention of reproductive disease in Thoroughbred mares in Korea.

• 미생물학회지
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• 제45권4호
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• pp.318-323
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• 2009

본 연구는 식중독 원인 세균인 Salmonella enteritidis JK-15를 장미추출물에 노출시켜 나타나는 살균효과를 조사하기 위하여 실시하였다. 분리세균인 S. enteritidis JK-15는 장시간 노출된 음식으로부터 농화, 분리되었다. 16S rRNA PCR을 수행하여 S. enteritidis JK-15의 유전학적 계통수를 작성하였다. BIOLOG 분석 시스템과 16S rRNA 염기서열 분석을 통하여 S. enteritidis 종(species)과 98% 유사성을 가졌으며, 이 균주를 S. enteritidis JK-15로 명명 하였다. 5~100 mg/ml 범위의 장미추출물에 노출된 S. enteritidis JK-15의 살균효과를 조사하였고, 100 mg/ml의 장미추출물에서 6시간, 그리고 50 mg/ml에서 12시간 이내에 완전히 살균되었다. 지수생장기의 S. enteritidis JK-15 균주는 노출된 장미추출물의 농도와 시간에 따라 lipopolysaccharide의 양이 변화하는 것을 SDS-PAGE와 silver staining을 통하여 관찰하였다. 또한, 주사전자현미경을 이용하여 장미추출물에 노출시킨 세균의 외부 형태를 분석한 결과, 움푹 패이고 불규칙적인 간균 형태로 관찰되었다.

• Journal of the Korean Wood Science and Technology
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• 제25권3호
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• pp.50-57
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• 1997

The presence of slime in paper mills is practically universal. Many researches have been performed for many years to resolve the problem caused by the slime in pulp and paper mill. Many papers have been published to show the bacteria is a major cause of paper mill slime. Now that the recycling of the water has been increased and the regulations of a toxic chemical dosage have become more strengthen, the importance of the control of slime in pulp and paper mill recently has been more recognized. Therefore, to produce quality products at the lowest economic and environmental costs, a through study of the microbial ecology and the indentification of troublesome slime-forming bacteria is a quite necessary. The purpose of this paper is to indentify slime~forming bacteria isolated from the papermaking process. The samples were taken from four parts of making fine paper : machine chest, head box, wire part, white water tank. Machine chest showed the most numbers of bacteria, numbering $2.55{\times}10^7$. The different colony types were taken from the 105 dilution plate. Nine bacteria were identified u sing the Biolog system and the vitek system: 6 gram-negative bacteria, 3 gram-positive bacteria. They are Pseudomonas paucimobilis B., Staphylococcus sp., Acinetobacter calcoaceticus., Pseudomonas cepacia, Actinobaci1lus capsulatus, Acidovorax sp., Flavobacterium sp., and Staphylococcus auricularis in addition to one unidentified sp., Among them. Pseudomonas paucimobillis was found in all places where the samples were taken. And, each parts had the different predominant bacteria in it : Pseudomonas paucimobilis B. in machine chest, Acinetobactor calcoaceticus. in Wire Part and Staphylococcus sp. in head box.