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Transition Substitution of Desired Bases in Human Pluripotent Stem Cells with Base Editors: A Step-by-Step Guide

  • Ju-Chan Park;Keun-Tae Kim;Hyeon-Ki Jang;Hyuk-Jin Cha
    • International Journal of Stem Cells
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    • 제16권2호
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    • pp.234-243
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    • 2023
  • The recent advances in human pluripotent stem cells (hPSCs) enable to precisely edit the desired bases in hPSCs to be used for the establishment of isogenic disease models and autologous ex vivo cell therapy. The knock-in approach based on the homologous directed repair with Cas9 endonuclease, causing DNA double-strand breaks (DSBs), produces not only insertion and deletion (indel) mutations but also deleterious large deletions. On the contrary, due to the lack of Cas9 endonuclease activity, base editors (BEs) such as adenine base editor (ABE) and cytosine base editor (CBE) allow precise base substitution by conjugated deaminase activity, free from DSB formation. Despite the limitation of BEs in transition substitution, precise base editing by BEs with no massive off-targets is suggested to be a prospective alternative in hPSCs for clinical applications. Considering the unique cellular characteristics of hPSCs, a few points should be considered. Herein, we describe an updated and optimized protocol for base editing in hPSCs. We also describe an improved methodology for CBE-based C to T substitutions, which are generally lower than A to G substitutions in hPSCs.

BES 기법을 이용한 육계사 내부 고온 스트레스 평가를 위한 THI 지수 모의 (Estimation of THI Index to Evaluate Thermal Stress of Animal-occupied Zone in a Broiler House Using BES Method)

  • 하태환;권경석;홍세운;최희철;이준엽;이동현;우샘이;양가영;김락우;여욱현;이상연;이인복
    • 한국농공학회논문집
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    • 제60권2호
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    • pp.75-84
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    • 2018
  • Thermal stress of livestock has been issued due to recent climate change trends and this causes reproductive disorders, decreased feed consumption, immunosuppression, and increased mortality of animals. Concept of THI has been widely used to quantitatively evaluate the degree of thermal stress for animals, however use of this concept is restricted for animals living in the enclosed facilities such as mechanically ventilated broiler houses. In this study, time-based internal energy flow and variation trends of temperature and humidity were analyzed based on BES technique. Local weather data, insulation characteristics of building materials, heat and moisture generation rate from broilers according to age, algorithm of ventilation operation were adopted for boundary condition of the model to accurately compute THI values inside the mechanically ventilated broiler house. From the BES computation, excess frequency of THI threshold in Jeju city was highest on the assumption that air conditioning equipments were not installed. When general raising density ($39kg\;m^{-2}$) was adopted, total 2,191 hours were exceeded. Excess hours of THI threshold were strongly related to the cumulative air temperature ($R^2=0.87$).

흑마늘 추출물 첨가 두부의 품질특성 (The quality and sensory characteristics of tofu with various levels of black garlic extract)

  • 심혜진;황초롱;강민정;김경민;신정혜
    • 한국식품저장유통학회지
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    • 제21권5호
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    • pp.688-693
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    • 2014
  • 영양성과 기능성이 개선된 두부의 제조 조건을 확립하고 자 시판 응고제($MgCl_2$)와 해양 암반 심층수를 각각 응고제로 사용하고 흑마늘 추출물을 0, 1, 3, 5, 7%씩 첨가하여 제조한 두부의 품질특성을 비교분석하였다. 관능평가 결과 전체적인 선호도는 해양 암반 심층수를 응고제로 사용하고 흑마늘 추출물이 첨가되지 않은 두부, 해양 암반 심층수를 응고제로 사용하고 흑마늘 추출물을 1% 첨가한 두부, 시판 응고제를 사용하고 흑마늘 추출물을 1% 첨가한 두부 순으로 높았으며 두부 제조 시 흑마늘 추출물의 첨가는 색, 향과 맛에 영향을 미쳤으며 흑마늘 추출물의 첨가량이 증가할수록 두부의 질감이 단단해지는 경향을 나타내었다. 두부의 제조 수율은 시판 응고제를 사용하고 흑마늘 추출물을 7% 첨가한 두부에서 26.66%로 가장 높았으나 타 실험군들과의 유의적인 차이는 없었다. 순물의 탁도는 시판 응고제를 사용한 두부에 비해 해양 암반 심층수를 응고제로 사용한 두부에서 유의적으로 낮았으며 흑마늘 추출물의 첨가량이 증가할수록 높았다. 두부의 pH는 5.61~6.15의 범위로 흑마늘 추출물의 첨가량이 증가할수록 감소하는 경향을 보였다. 색도에서 흑마늘 추출물의 첨가량이 증가할수록 두부의 명도는 낮아졌고 녹색도는 높아졌으며 황색도는 유의적인 차이를 보이지 않았다. 흑마늘 추출물의 첨가량 증가는 두부의 물성 중 경도, 씹힘성, 검성을 증가시키는 반면 탄력성에는 영향을 미치지 않았다. 이상의 결과를 종합하여 볼 때 시판 응고제 보다는 해양 암반 심층수의 사용하고, 1% 정도의 흑마늘 추출물을 첨가함으로써 두부의 관능적 특성과 물성을 개선할 수 있을 것으로 기대 된다.

생물전기화학시스템을 이용한 염화에틸렌의 생물학적 탈염소화 (Biological Dechlorination of Chlorinated Ethylenes by Using Bioelectrochemical System)

  • 유재철;박영현;선지윤;홍성숙;조순자;이태호
    • 대한환경공학회지
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    • 제34권5호
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    • pp.304-311
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    • 2012
  • 산업용제로 널리 이용되고 있는 PCE (Perchloroethylene)나 TCE (Trichloroethylene)와 같은 염화에틸렌화합물은 안정된 세정력을 가지고 있어 널리 이용되고 있지만 무분별한 사용과 부주의한 취급으로 인해 최근 토양 및 지하수 오염지역이 늘어나고 있다. 본 연구에서는 퇴적토, 슬러지, 토양, 지하수 등 다양한 지역에서 총 10개의 시료를 식종원으로 이용하여 생물학적 PCE 탈염소화 가능성을 평가하고, 가장 우수한 탈염소화 능력을 보인 낙동강 퇴적토 시료를 대상으로 PCE를 에틸렌까지 안정적으로 탈염소화 가능한 혼합미생물을 농화배양하였다. 농화배양된 탈염소화 미생물을 생물전기화학시스템(Bioelectrochemical System, BES)의 환원부에 식종하여 전극을 전자공급원으로 이용한 탈염소화 가능성을 평가한 결과, PCE가 TCE, cis-dichloroethylene, vinyl chloride를 거쳐 최종산물인 에틸렌으로 탈염소화됨을 확인할 수 있었다. Polymerase chain reaction-denaturing gradient gel electrophoresis (PCR-DGGE)를 이용한 미생물군집 분석결과, 농화배양액에서 구축된 탈염소 미생물 군집과 BES 환원전극부내 미생물 군집 구조는 다르게 나타났으며, 전기화학적 활성을 지닌 다양한 미생물이 존재함을 확인할 수 있었다. BES 환원전극부에서 부유성장하는 미생물과 전극에 생물막을 형성하는 미생물 군집구조에도 큰 차이가 있었으며, 이는 탈염소화 메커니즘의 차이에 기인하는 것으로 판단된다. 추가적인 연구를 통해서 자세한 생물전기화학적 탈염소화 메커니즘을 밝혀낸다면 생물전기화학적 탈염소화 기술은 염화에틸렌 오염 토양/지하수의 획기적인 생물정화기술로 자리잡게 될 것이다.

BESS-디젤발전기 연계운전의 안정도 향상기법 비교 해석 (Comparative Analysis for Stability Improvement of BESS and Diesel Generator Operation)

  • 조종민;차한주
    • 전력전자학회:학술대회논문집
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    • 전력전자학회 2016년도 전력전자학술대회 논문집
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    • pp.325-326
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    • 2016
  • 본 논문은 독립형 마이크로그리드에서 BESS와 디젤발전기 연계운전 시, LCL 필터와 상호간섭에 의해 전류제어에 영향을 미치는 디젤발전기의 동기인덕턴스를 고려한 전류제어 안정도를 해석하고, 시뮬레이션과 실험을 통해 검증하였다. BESS-계통 연계, BESS-디젤발전기 연계 및 댐핑기법이 적용된 BESS-디젤발전기 연계에 대한 3가지 운전조건에서 이산시간 영역의 근궤적법을 이용한 전류제어 안정도를 비교하고 해석하였다. 50kW BESS와 디젤발전기로 구성된 시뮬레이션 및 실험을 통해 검증하였으며, 실험결과로부터 전류 THD는 2.2%로 안정한 전류제어를 수행하였다.

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Droop Control을 적용한 BESS 병렬운전 제어 알고리즘 (A parallel control algorithm using droop control for Bess Energy Storage System(BESS))

  • 오승진;김태형;권병기
    • 전력전자학회:학술대회논문집
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    • 전력전자학회 2013년도 추계학술대회 논문집
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    • pp.131-132
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    • 2013
  • BESS를 대용량화 하기 위하여 병렬운전에 관련하여 많은 연구가 진행 중이다. 병렬운전 알고리즘의 제어 목표는 인버터 간의 순환전류를 제거하고, 부하 분담이 균등하게 하는 것에 있다. 이를 위하여 연구되었던 방법 중 전압 제어와 전류 제어의 인버터를 결합한 Master-Slave 방식은 통신을 통하여 정확한 부하분담이 가능하지만 통신지연 발생시 과도상태에 과전류가 발생 할 수 있다는 단점을 갖는다. 본 논문은 독립된 계통에서 BESS가 병렬운전 중 스텝부하 투입시 통신지연 시간 동안의 과도상태에서 과전류가 발생하지 않도록 하는 Droop Control를 적용한 제어 알고리즘을 제안한다.

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2MVA 배터리 에너지 저장 시스템 제어 알고리즘 개발 (A Development of Control Algorithm for 2MVA Battery Energy Storage System)

  • 김태형;김윤현;권병기;김광섭
    • 전력전자학회:학술대회논문집
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    • 전력전자학회 2011년도 추계학술대회
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    • pp.151-152
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    • 2011
  • 본 논문에서는 스마트 그리드에 적용되는 2MVA 배터리 에너지 저장 시스템(BESS, Battery Energy Storage System)의 제어 알고리즘을 제안하고 검증하였다. BESS는 전력변환을 위한 PCS(Power Conditioning System), 배터리 제어 및 상태확인을 위한 BCS(Battery Conditioning System)와 상위 시스템으로부터 지령을 받아 PCS와 BCS를 제어하는 PMS(Power Management System)로 구성되어 있다. BESS는 풍력안정화를 위해 EMS(Energy Management System)의 지령을 받아 운전모드를 선택하고, 운전모드에 따라서 계통측 전력을 제어하거나 배터리측 전류를 제어하고, 배터리의 완전충전을 위해 전압제어를 한다.

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Parametric inference on step-stress accelerated life testing for the extension of exponential distribution under progressive type-II censoring

  • El-Dina, M.M. Mohie;Abu-Youssef, S.E.;Ali, Nahed S.A.;Abd El-Raheem, A.M.
    • Communications for Statistical Applications and Methods
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    • 제23권4호
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    • pp.269-285
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    • 2016
  • In this paper, a simple step-stress accelerated life test (ALT) under progressive type-II censoring is considered. Progressive type-II censoring and accelerated life testing are provided to decrease the lifetime of testing and lower test expenses. The cumulative exposure model is assumed when the lifetime of test units follows an extension of the exponential distribution. Maximum likelihood estimates (MLEs) and Bayes estimates (BEs) of the model parameters are also obtained. In addition, a real dataset is analyzed to illustrate the proposed procedures. Approximate, bootstrap and credible confidence intervals (CIs) of the estimators are then derived. Finally, the accuracy of the MLEs and BEs for the model parameters is investigated through simulation studies.

다양한 C-rate을 이용한 장주기 응용을 위한 BESS 전력피크 대응 Peak Shaving 알고리즘 (Peak Shaving Algorithm For Long-term Application of BESS with Multiple C-rate)

  • 최원빈;카푸노 말론;송화창
    • 대한전기학회:학술대회논문집
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    • 대한전기학회 2015년도 제46회 하계학술대회
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    • pp.337-338
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    • 2015
  • 본 논문은 BESS 기반 전력피크 대응 peak shaving 알고리즘에 대하여 설명한다. 전력망 응용에 적용되는 BESS는 다양한 C-rate (charge rate)을 갖으며, 이를 고려한 알고리즘 개발이 요구된다. 상대적으로 높은 C-rate을 갖는 BESS의 경우 단주기 응용으로 적용될 수 있으나, 보다 효과적인 활용방안은 두 가지의 이상의 목적을 위한 운용이 요구된다. 더욱이 전력피크 예측을 위한 정교한 부하예측 방법이 필요하다. 본 논문에서는 단주기 및 장주기 응용을 모두 고려하였을 때 요구되는 peak shaving 알고리즘 설계 및 Algebraic Prediction을 이용한 부하예측에 대하여 논하고자 한다.

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다중 주문형 비디오 서버 시스템의 설계 및 구현 (Design and Implementation of a Multiple Video-on-Demand Server Systems)

  • 최우성;장영배;김성완;오승택;김호중;맹승렬;조정완
    • 한국정보과학회:학술대회논문집
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    • 한국정보과학회 2000년도 봄 학술발표논문집 Vol.27 No.1 (A)
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    • pp.660-662
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    • 2000
  • 오늘날 네트웍의 발달로 인하여 사용자가 원하는 영상매체를 실시간으로 요구하는 멀티미디어 서비스에 대한 사용자의 요구가 날로 증가하고 있다. 때문에 영상매체를 제공하는 서버는 여러 사용자들이 동시에 접속하였을 때 서비스를 제공 할 수 있는 능력을 가져야 한다. 본 논문에서는 멀티미디어 서비스를 위한 VOD(Video-On-Demand)시스템을 설계 및 구현한다. VOD 시스템은 미디어를 분석하여 BES(Back-End-Server)에 저장하는 영화 관리자(Movie Manager), 분산 저장된 데이터를 읽어 들여 사용자나 연결된 FES(Front-End Server)로 보내는 BES, 사용자에게 미디어 데이트를 전송하는 FES와 전송된 데이트를 받아서 재생하는 클라이언트(Client)를 구성된다. 또한 다수의 서버를 연결하기 위하여 SCI(Scalabel Coherent Interface)를 이용한 효율적인 메시지 전송방법을 구현한다.

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