• BMB Reports
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• 제44권2호
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• pp.113-117
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• 2011

Previous studies suggest that EphA7 plays a critical role in neural tube closure or cortical progenitor apoptosis. In this report, enhancer trap assay was used to modify various EphA7 BAC clones and screen a large genomic region spanning 570 kb downstream of the EphA7 gene. We found that the dorsal midline-specific EphA7 enhancer resides on the 457D20 EphA7 BAC clone and is localized to a 35 kb genomic region in between +345.7 kb to +379.8 kb downstream of the EphA7 transcription start site. Identification of the EphA7 BAC clone containing a long-range dorsal midline enhancer may constitute a useful tool for investigating the biological functions of EphA7 in vivo.

• 환경위생공학
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• 제17권4호
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• pp.47-52
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• 2002

This study was carried out to examine the characteristics of dual media filter with BAC and sand on a pilot scale which was installed in T Water Treatment Plant of Seoul. The conclusions drawn from experimental results are as follows : For the BAC-Sand filter, the preceded gravity sand filter did not largely affect the removal of organics and turbidity causing matters, tut the frequency of backwashing was explicitly reduced to two times with the stable growth of microorganisms. The biomass on media in case of existence of preceded sand filter was 1.4 times higher than that of nonexistence. In case of backwashing with water, the time needed to comply with below 10NTU took 22, 10, and 5 minutes respectively with the expansion ration of 1.2, 1.5 and 1.8. The higher the expansion ration was, the shorter the backwashing time was.

• 한국컴퓨터정보학회:학술대회논문집
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• 한국컴퓨터정보학회 2012년도 제45차 동계학술발표논문집 20권1호
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• pp.229-232
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• 2012

전자여권에 적용된 보안기술 중 BAC(Basic Access Control)는 전자여권의 IC칩에 내장된 여권 소지자의 신상정보를 여권을 제출한 상태에서만 확인할 수 있도록 하는 접근제어 메커니즘이다. 하지만 BAC에 사용되는 비밀키의 생성을 위해 전자여권 내의 MRZ 정보를 구성하고 있는 여권 소지자의 신상정보가 사용되기 때문에 비밀키에 대한 전수조사 공격에 취약할 수 있다. 이에 본 논문에서는 한국 전자여권의 BAC 과정에서 사용되는 비밀키의 보안성을 분석한다.

• 한국컴퓨터정보학회:학술대회논문집
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• 한국컴퓨터정보학회 2012년도 제46차 하계학술발표논문집 20권2호
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• pp.385-388
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• 2012

전자여권에 적용된 보안기술인 BAC(Basic Access Control)는 IC칩에 저장된 여권 소지자의 신상정보를 여권을 제출한 상태에서만 확인할 수 있도록 하는 접근제어 기술이다. 하지만 BAC에 사용되는 비밀키의 생성을 위해 여권 소지자의 신상정보가 사용되기 때문에 비밀키에 대한 전수조사 공격에 취약할 수 있다. 이에 본 논문에서는 한국 전자여권의 BAC 과정에서 생성되는 비밀키의 취약성을 분석하고, 전수조사 공격에 대한 보안성을 강화하기 위한 방법을 제안한다.

• 한국생물정보학회:학술대회논문집
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• 한국생물정보시스템생물학회 2002년도 제1차워크샵
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• pp.105-121
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• 2002

최근 인간 지놈(genome)의 DNA가 밝혀져서 많은 관심을 받았는데, 이를 수행하는 방법을 소개한다. Human Genome Project에서 채택한 BAC-to-BAC 방식과 Celera 회사에서 채택한 whole genome shotgun 방식을 설명한다. 또한 두 방식에서 공히 fragment assembly 프로그램을 사용하는데, 이 프로그램의 개요를 설명한다.

• Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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• 제20권11호
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• pp.1636-1650
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• 2007

As an initial step toward a better understanding of the genome structure of Korean cattle (Hanwoo breed) and initiation of the framework for genomic research in this bovine, the bacterial artificial chromosome (BAC) end sequencing of 21,024 clones was recently completed. Among these clones, BAC End Sequences (BESs) of 20,158 clones with high quality sequences (Phred score ${\geq}20$, average BES equaled 620 bp and totaled 23,585,814 bp), after editing sequencing results by eliminating vector sequences, were used initially to compare sequence homology with the known bovine chromosomal DNA sequence by using BLASTN analysis. Blast analysis of the BESs against the NCBI Genome database for Bos taurus (Build 2.1) indicated that the BESs from 13,201 clones matched bovine contig sequences with significant blast hits (E<$e^{-40}$), including 7,075 single-end hits and 6,126 paired-end hits. Finally, a total of 5,105 clones of the Korean cattle BAC clones with paired-end hits, including 4,053 clones from the primary analysis and 1,052 clones from the secondary analysis, were mapped to the bovine chromosome with very high accuracy.

• International Journal of Oral Biology
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• 제37권4호
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• pp.197-201
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• 2012

LIVE/DEAD$^{(R)}$ BacLight$^{TM}$ and alamarBlue$^{(R)}$ are fluorescent materials used for the enumeration of live and dead bacteria. LIVE/DEAD$^{(R)}$ BacLight$^{TM}$ is generally used for confocal microscopy applications to differentiate live from dead bacteria in a biofilm or planktonic state. AlamarBlue$^{(R)}$ has also been used widely to assay live and dead bacteria in a planktonic state. Whilst these materials are successfully utilized in experiments to discriminate live from dead bacteria for several species of bacteria, the application of these techniques to oral bacteria is limited to the use of LIVE/DEAD$^{(R)}$ BacLight$^{TM}$ in biofilm studies. In our present study, we assessed whether these two methods could enumerate live and dead oral bacterial species in a planktonic state. We tested the reagents on Streptococcus mutans, Streptococcus sobrinus, Porphyromonas gingivalis, Aggregatibacter actinomycetemcomitans and Enterococcus faecalis and found that only LIVE/DEAD$^{(R)}$ BacLight$^{TM}$ could differentiate live from dead cells for all five of these oral strains. AlamarBlue$^{(R)}$ was not effective in this regard for P. gingivalis or A. actinomycetemcomitans. In addition, the differentiation of live and dead bacterial cells by alamarBlue$^{(R)}$ could not be performed for concentrations lower than $2{\times}10^6$ cells/ml. Our data thus indicate that LIVE/DEAD$^{(R)}$ BacLight$^{TM}$ is a more effective reagent for this analysis.

• Journal of Trauma and Injury
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• 제33권4호
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• pp.227-235
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• 2020

Purpose: Alcohol intoxication is commonly associated with traumatic brain injury (TBI), but the influence of alcohol on the Glasgow Coma Scale (GCS) score remains unclear. This study investigates the effects of blood alcohol concentration (BAC) on the GCS score in head trauma patients with alcohol intoxication. Methods: In total, 369 head trauma patients with alcohol intoxication in a 1-year period were retrospectively analyzed. The patients underwent head computed tomography and had a BAC ≥80 mg/dL. Patients were divided into TBI and non-TBI groups. Brain injury severity was further classified using the head Abbreviated Injury Score (AIS). The effects according to 5 BAC groups were examined. Results: The TBI group consisted of 64 patients (16.2%). The mean BAC was significantly higher in the non-TBI group (293.4±87.3 mg/dL) than in the TBI group (242.8±89.9 mg/dL). The mean GCS score was significantly lower in the TBI group (10.3±4.6) than in the non-TBI group (13.0±2.5). A higher BAC showed a significant association with a lower mean GCS score in the TBI group, but not in the non-TBI group. Above ≥150 mg/dL, higher BACs showed significant odds ratios for a lower GCS score. Conclusions: The influence of alcohol in patients with head trauma depended on the presence of a brain injury. An association between a higher BAC and a lower GCS score was only observed in patients with TBI. Therefore, if a severe brain injury is suspected based on a GCS evaluation in patients with alcohol intoxication, prompt diagnosis and intensive care should be performed without delay.

• 대한바이러스학회지
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• 제27권2호
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• pp.239-255
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• 1997

전염성 췌장괴저바이러스 (Infectious pancreatic necrosis virus) DRT 주의 VP1유전자를 대 장균 발현운반체와 Baculovirus에 삽입하여 대장균과 진핵세로에서 VP1단백질의 발현을 연구하였다. 재조합체 pMal-pol 클론 [7]에서 2.7 Kb 단편인 VP1 유전자를 제한효소 XbaI으로 절단하여 Baculovirus 운반체인 pBacPAK9에 클로닝하여 pBacVP1이라 명명하였다. 이 pBacVP1에 클로닝된 VP1유전자를 제한효소 SacI과 PstI으로 절단하여 대장균 발현 운반체인 pQE-30에 클로닝하여 pQEVP1이라 명명하였다. 또한 VP1 단백질의 C-말단에 6개의 히스티딘 $6{\times}His$이 붙어 있는 단백질을 만들기 위하여, pQEVP1 클론의 His부위를 EcoRI으로 절단하고, 또한 pBacVP1을 EcoRI으로 절단하여 생긴 부위에His-EcoRI DNA 단편을 교체시켜 재클로닝하여 pBacHis-VP1을 만들었다. pBacHis-VP1 DNA와 Bsu36I로 처리된 LacZ-Hyphantria cunea nuclear polyhedrosis virus (LacZ-HcNPV)를 함께 lipofectin을 이용하여 곤충세포 (Spodoptera frugiperda cell)에 동시 감염을 시켜서 재조합 바이러스를 선발하여, VP1-HcNPV-1이라 명명하였다. pQEVP1 클론은 6개의 히스티딘 단편이 부착된 VP1단백질을 Ni-NTA resin 크로마토그래피법으로 정제하여 SDS-PAGE와 Western blot으로 확인하였고, 단백질의 활성과 구조에 영향을 주지 않는 6개의 히스티딘 단편 ($6\;{\times}\;His$)이 부착된 94 kDa의 VP1단백질을 정제할 수 있었다. 또한 재조합 바이러스에 감염된 곤충세포에서 VP1 단백질이 발현된 것을 전기영동과 Western blot으로 검색을 한 결과 95 kDa VP1 단백질이 발현이 되었음을 확인하였다.

• 대한환경공학회지
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• 제34권8호
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• pp.533-540
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• 2012

BAC 공정 운전초기부터 부착 박테리아들의 생체량이 정상상태(steady-state)에 도달한 이후까지 $BDOC_{total/rapid/slow}$ 제거율의 변화와 DGGE와 ATP 분석을 통하여 부착 박테리아들의 군집과 생체량을 평가하였다. 용존 유기물질 제거율 평가에 따른 BAC 공정의 정상상태 도달 여부 평가결과를 보면 DOC의 경우 운전 bed volume 27,500 부근에서 BAC 공정이 정상상태에 도달하였고, $BDOC_{rapid}$와 $BDOC_{total/slow}$의 경우는 각각 운전 bed volume 15,000 부근과 32,000 부근에서 정상상태에 도달하였다. BAC 공정의 운전기간 증가에 따른 HPC 및 ATP 농도 분석을 통한 부착 박테리아들의 생체량 평가결과 bed volume 22,500 이후로 거의 일정한 생체량을 유지하였으며, 이 때 HPC와 ATP 농도는 각각 $3.3{\times}10^8$ cells/g 및 $2.14{\mu}g/g$ 정도로 나타났다. DGGE를 이용하여 운전기간 증가에 따른 BAC 부착 박테리아들의 군집분석 결과 운전초기(bed volume 8,916)의 경우 분석가능한 DGGE band 개수가 5개였으나 운전기간 증가에 따라 분석가능한 DGGE band 개수는 최대 11개로 증가하였다. 또한, DGGE를 이용한 박테리아 군집분석 결과 BAC 운전기간의 증가에 따라 다양한 박테리아 그룹들이 존재하였고, Pseudomonas fluorescens, Acinetobacteria와 유사한 uncultured bacterium, uncultured Novosphingobium sp. 및 Flavobacterium frigidarium은 운전초기 단계부터 지속적으로 부착 박테리아 군집을 형성하였고, 전체적으로 Proteobacteria 그룹이 비교적 높은 비율로 우점하였다.