• 제목/요약/키워드: B-F Tree

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한국산 백합속(Lilium) 내 말나리절의 분류학적 검토 (A taxonomic note of the genus Lilium section Martagon in Korea)

  • 송지희;이웅빈
    • 식물분류학회지
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    • 제47권1호
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    • pp.46-50
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    • 2017
  • 백합속(Lilium)은 백합과에 속하는 식물로 북반구의 온대지역에 100 종 이상이 분포하는 비교적 큰 분류군이다. 최근 수행된 백합속 식물에 대한 연구들을 참조하여 한국산 Martagon절의 3종(하늘말나리, 말나리, 섬말나리)에 대한 분류학적 검토를 진행하고자 하였다. 백합속에서 가용한 염기서열 중 엽록체 유전체의 4개 부위 rbcL, matK, ndhF, atpB를 선정하여 계통수를 작성하였다. 그 결과, 한국산 Martagon절 3종은 단계통군인 것으로 나타났다. 그러나 이들은 한편 측계통군인 Sinomartagon절에 속하는 것이었다. 추가적으로, 형태형질과 계통수의 분지양상에 대해 비교 분석하였고 한국산 식물들에 대한 분류학적 유연관계를 논의하였다.

한반도 미기록 선류식물 I (Four unrecorded moss species from the Korean flora)

  • 윤영준;선병윤
    • 식물분류학회지
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    • 제40권3호
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    • pp.186-191
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    • 2010
  • 우리나라 미기록 선류식물 4종을 발견하였다. 미기록속인 Meteoriaceae (누운끈이끼과)의 오름끈이끼(Barbella flagellifera (Card.) Nog.)는 주로 아열대 지방에 분포하는 것으로 알려졌으나, 제주도 서검은오름의 나무 등에 착생하여 생육하고 있었다. 미기록종인 Lembophyllaceae (호랑꼬리이끼과)의 울릉잎맥호랑꼬리이끼(Isothecium hakkodense Besch.)는 I. subdiversiforme와 유사하지만 가지 잎의 모양과 익부세포의 분화정도에 따라 구분이 가능하고, 울릉도 성인봉 부근의 바위에서 수백개체가 생육하고 있었다. Mniaceae (초롱이끼과)의 백무초롱이끼(Mnium orientale R. E. Wyatt, Odrzykoski & T. J. Kop.)는 M. heterophyllum와 유사하지만 식물체의 크기, 겹톱니의 유무, 세포의 크기면에서 구분이 가능하며, 경상남도 함양군 지리산 백무동계곡에서 채집되었다. Fissidentaceae (봉황이끼과)의 바위봉황이끼(Fissidens gardneri Mitt.)는 F. obscurirete와 유사하지만 식물체의 크기, 잎의 모양, 잎맥의 길이 등으로 구분이 가능하며, 전라남도 고흥군 팔령산 계곡의 바위 착생하여 생육하고 있었다.

국내 양양 송이 자생지 내 균환 유래 토양미생물과 송이균사체 생장촉진 효과 (Growth-promoting effect of microorganisms from a fairy ring in Yangyang, Korea on Tricholoma matsutake mycelium)

  • 최두호;이은지;이강효;안기홍
    • 한국버섯학회지
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    • 제22권1호
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    • pp.22-26
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    • 2024
  • 본 실험은 송이버섯의 인공재배에 있어 기주식물에 대한 의존성을 줄이기 위한 일환으로 송이 균환의 토양 미생물을 활용하여 진행되었다. 이를 위해 송이 자실체가 발달하는 9월을 대상으로 송이 자생지 내 균환으로부터 토양 내 균주들을 분리하였으며, 1점의 세균과 2점의 진균을 대상으로 대조구 대비 생장한 송이 균사체의 크기 퍼센트를 이용한 생장 촉진 결과를 확인하였다. 또한 확보된 균주들에 대한 동정을 위해 NCBI blast 과정과 phylogenetic tree 제작 과정을 거쳤다. 다만 본 실험에서 확보한 미생물과 동일한 동정명의 균을 이용한 동일 조건의 실험 결과와 비교하였을 때, 본 실험에서 확보한 미생물에 의한 송이 균사에 대한 생장촉진 정도가 다소 낮게 나타남을 확인하였다. 그러나 실제 자연계에서 송이와 같은 외근균성 버섯과 작용하는 미생물의 사례가 매우 다양하기 때문에 송이에 대해 균사 생장을 촉진시키는 미생물 데이터베이스 축적에 있어 그 의의가 있다고 볼 수 있다. 또한 축적된 미생물 데이터베이스를 토대로 송이 균사의 생장촉진 나아가 송이 자실체의 발달촉진에 공통적으로 작용하는 미생물 유래 분비물질 고찰에 있어서도 본 실험의 결과가 기여하는 바가 크다고 볼 수 있다. 이에 더해 미생물 군집 내 촉진균 우점도 및 송이 발생지와 미발생지 사이에 있는 미생물 우점도 차이에 대한 추가적인 분석을 통해 향후 송이 발생에 활용할 수 있는 생태모방에 활용할 가능성 또한 존재한다. 추후 지속적인 연구를 통해 균환 유래 토양 미생물에 의한 송이 작용에 대한 실험이 계속 진행되어야 할 필요가 있다.

Genetic diversity and population genetic structure of Cambodian indigenous chickens

  • Ren, Theary;Nunome, Mitsuo;Suzuki, Takayuki;Matsuda, Yoichi
    • Animal Bioscience
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    • 제35권6호
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    • pp.826-837
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    • 2022
  • Objective: Cambodia is located within the distribution range of the red junglefowl, the common ancestor of domestic chickens. Although a variety of indigenous chickens have been reared in Cambodia since ancient times, their genetic characteristics have yet to be sufficiently defined. Here, we conducted a large-scale population genetic study to investigate the genetic diversity and population genetic structure of Cambodian indigenous chickens and their phylogenetic relationships with other chicken breeds and native chickens worldwide. Methods: A Bayesian phylogenetic tree was constructed based on 625 mitochondrial DNA D-loop sequences, and Bayesian clustering analysis was performed for 666 individuals with 23 microsatellite markers, using samples collected from 28 indigenous chicken populations in 24 provinces and three commercial chicken breeds. Results: A total of 92 haplotypes of mitochondrial D-loop sequences belonging to haplogroups A to F and J were detected in Cambodian chickens; in the indigenous chickens, haplogroup D (44.4%) was the most common, and haplogroups A (21.0%) and B (13.2%) were also dominant. However, haplogroup J, which is rare in domestic chickens but abundant in Thai red junglefowl, was found at a high frequency (14.5%), whereas the frequency of haplogroup E was considerably lower (4.6%). Population genetic structure analysis based on microsatellite markers revealed the presence of three major genetic clusters in Cambodian indigenous chickens. Their genetic diversity was relatively high, which was similar to findings reported for indigenous chickens from other Southeast Asian countries. Conclusion: Cambodian indigenous chickens are characterized by mitochondrial D-loop haplotypes that are common to indigenous chickens throughout Southeast Asia, and may retain many of the haplotypes that originated from wild ancestral populations. These chickens exhibit high population genetic diversity, and the geographical distribution of three major clusters may be attributed to inter-regional trade and poultry transportation routes within Cambodia or international movement between Cambodia and other countries.

Characterization of Trichoderma spp. Associated with Green Mold of Oyster Mushroom by PCR-RFLP and Sequence Analysis of ITS Regions of rDNA

  • Park, Myung-Soo;Seo, Geon-Sik;Bae, Kyung-Sook;Yu, Seung-Hun
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제21권3호
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    • pp.229-236
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    • 2005
  • Molecular profIles of PCR-RFLP and sequence analysis of internal transcribed spacer (ITS) regions of rDNA were compared between morphologically distinguishable species of Trichoderma isolated from substrates of oyster mushroom in Korea, T. atroviride, T. citrinoviride, T. harzianum, T. longibrachiatum, T. virens, and two unidentified species, Trichoderma sp. 1 and 2. PCR­RFLP analysis divided the Trichoderma spp. into six RFLP groups, A, B, C, D, E, and F. The RFLP groups were generally agreed with described morphological species, except that the RFLP group A containing the two unidentified species. A neighbor-joining tree based on ITS sequences well supported RFLP groups observed by RFLP analysis of ITS regions of rDNA. Additionally, the two unidentified species, Trichoderma sp. 1 and 2, which could not be distinguished by PCR­RFLP analysis, were separated in sequence analysis of ITS regions of rDNA.

리기다소나무 임분에서 산림관리작업이 토양의 물리성 및 산림의 수질정화기능에 미치는 영향 (Influence of Forest Practices on Soil Physical Properties and Facility of Purifying Water Quality in Pinus rigida Stands)

  • 박재현
    • 한국환경복원기술학회지
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    • 제10권2호
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    • pp.61-70
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    • 2007
  • This study aims to clarify the effect of forest management practices(thinning and pruning) on soil physical properties and water quality to get the fundamental information on the facility of purifying water quality after forestry practices. Rainfall, throughfall, stemflow, soil and stream water were sampled at the study site which consists of Pinus rigida in Jinju National University Experimental Forest for 4 years from Mar. 1, 2002 to Nov. 30, 2006. Averaged tree height of the management site increased by 1.6m, compared to the value of the non-management site in Pinus rigida. Increment of averaged D. B. H. at the management site showed 4.2cm more in Pinus rigida compared with that at non-management sites. Mesopore ratios (pF2.7) and total porosities of A layer soil at the management site increased more than those at the non-management sites in both stands. Otherwise, soil bulk density resulted in being reversely. Water qualities of throughfall, stemflow and buffered soil water were influenced more positively by the management practice. The average electrical conductivity of stream water was $32.9{\mu}S/cm$ within the range of non-polluted stream water.

Searching for Fly-by Encounters of Galaxies in Cosmological Simulations

  • 안성호;김정환;윤기윤;김주한;윤석진
    • 천문학회보
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    • 제37권2호
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    • pp.71.2-71.2
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    • 2012
  • Fly-by interactions of galaxies are hidden drivers of galaxy evolution: The impulsive encounters are by far more frequent than and thus as important as direct mergers, yet hard to identify observationally. Here we present the key characteristics of fly-bys that are examined theoretically via cosmological N-body simulations. In particular, we use the simulations generated by a particle-mesh tree code, GOTPM, and investigate the statistics of galactic fly-by interactions, which are defined by the total energy of two halos of interest being positive and their minimum distances escaping mergers. We discuss (1) the rate of fly-by interactions (the Fly-by Rate, $R_f$) as functions of(a) redshifts, (b) halo masses and mass ratios, and (c) environments, and (2) their impact on galaxy evolution in terms of morphology and star-formation rate, in comparison to that of direct mergers.

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Assessment of Teak (Tectona grandis Linn. f.) Provenance Tests in the Bago Yoma Region, Myanmar

  • Lwin, Ohn;Hyun, Jung-Oh;Yahya, Andi Fadly
    • 한국산림과학회지
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    • 제99권5호
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    • pp.686-692
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    • 2010
  • This study described the general pattern of genetic variation among ten teak (Tectona grandis Linn. f.) provenances in Myanmar and determined the most suitable seed sources for the plantation program in Bago Yoma region. Seeds of ten provenances were collected to cover the whole teak natural distribution in Myanmar and planted at four trial sites in Bago Yoma region in 1998. Seven years after planting, variation was assessed for growth, morphological characteristics and their correlation with geoclimatic factors. Statistical analysis using ANOVA revealed that there were significant differences in most of the traits measured among provenances, trial sites and provenance ${\times}$ site interaction at five percent level. A positive significant correlation (p<0.01) was found among most of the traits. The regression analyses between all traits and geoclimatic factors indicated the existence of ecoclinal variation in teak. Most of the traits were negatively correlated with the latitude while a positive significant correlation was found between longitude and C/B ratio, crown-diameter, average branch angle and leaf-remain. There was no significant correlation between the mean temperature and any other traits in this study. Furthermore, growth traits and crown diameter were positively correlated with the mean annual rainfall while negative correlation was found between the geographical distance and growth traits. Results indicate that the latitudinal pattern of teak genetic variations in growth performance was attributed to the limit of mean annual rainfall. Comparative assessment showed that local provenances were generally the best and could be use as suitable seed sources for the plantation program in the Bago Yoma region.

Multi-pass Sieve를 이용한 한국어 상호참조해결 (Korean Coreference Resolution using the Multi-pass Sieve)

  • 박천음;최경호;이창기
    • 정보과학회 논문지
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    • 제41권11호
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    • pp.992-1005
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    • 2014
  • 상호참조해결은 문서 내에서 선행하는 명사구와 현재 등장한 명사구 간에 같은 개체를 의미하는 지를 결정하는 문제로 정보 추출, 문서분류 및 요약, 질의응답 등에 적용된다. 본 논문은 상호참조해결의 규칙기반 방법 중 가장 성능이 좋은 Stanford의 다 단계 시브(Multi-pass Sieve) 시스템을 한국어에 적용한다. 본 논문에서는 모든 명사구를 멘션(mention)으로 다루고 있으며, Stanford의 다 단계 시브 시스템과는 달리 멘션 추출을 위해 의존 구문 트리를 이용하고, 동적으로 한국어 약어 리스트를 구축한다. 또한 한국어 대명사를 참조하는데 있어 중심화 이론 중 중심의 전이적인 특성을 적용하여 가중치를 부여하는 방법을 제안한다. 실험 결과 F1 값은 MUC 59.0%, B3 59.5%, Ceafe 63.5%, CoNLL(평균) 60.7%의 성능을 보였다.

정렬되지 않은 3차원 거리 데이터로부터의 NURBS 곡면 모델 생성 기법 (On Constructing NURBS Surface Model from Scattered and Unorganized 3-D Range Data)

  • 박인규;윤일동;이상욱
    • 대한전자공학회논문지SP
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    • 제37권3호
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    • pp.17-30
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    • 2000
  • 본 논문에서는 NURBS (Non-Uniform Rational B-Splines) 곡면 근사에 기반하여 거리 데이터로부터 3차원 곡면 모델을 생성하는 기법을 제안한다 입력으로 이용되는 거리 데이터는 연결 정보가 알려지지 않고 정렬되지 않은 일반적인 3차원 점들의 집합으로 가정한다 제안하는 알고리듬은 초기 모델 추정, 계층적 모델 표현, NURBS 곡면 네트워크 생성의 3단계로 나뉘어진다 초기 모델 추정 단계에서는 K-평균 군집화 기법을 이용하여 다각형면과 삼각형으로 표현되는 근사 모델을 생성하고, 계층적 트리 구조를 이용하여 초기 모델을 표현한다. 계층적 트리 구조로 부터 생성된 사각형면 모델에 의하여 $G^1$ 연속인 NURBS 곡면 네트워크를 효율적으로 생성한다. 제안하는 알고리듬은 초기 모델의 계층적 그래프 해석을 통하여 곡면 네트워크 형성에 필요한 계산량을 감소시켰으며, 또한 정확한 NURBS 제어점 추정을 통하여 근사 오차를 감소시킨다. 모의 실험 결과 거리 데이터로 부터 초기 모델과 다양한 해상도의 NURBS 곡면 네트워크가 효과적으로 생성되었으며 생성된 NURBS 곡면 모델의 근사 오치는 무시할 수 있는 수준임이 관찰되었다.

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