The aim of this study was to examine how plant terpenoids, as natural growth substrates or inducers, would affect the biodegradation of PCB congeners. Various PCB degraders that could grow on biphenyl and several terpenoids were tested for their PCB degradation capabilities. Degradation activities of the PCB congeners, 4,4-dichlorobiphenyl (4,4-DCBp) and 2,2-dichlorobiphenyl (2,2-DCBp), were initially monitored through a resting cell assay technique that could detect their degradation products. The PCB degraders, Pseudomonas ((S)-(-) limonene, p-cymene and $\alpha$-terpinene) whereas Arthrobacter sp. B1B could not grow on the terpenoids as a sole carbon source. The B1B strain grown on biphenyl exhibited good degradation activity for 4,4-DCBp and 2,2-DCBp, while the activity of strains P166 and T104 was about 25% that of the B1B strain, respectively. Concomitant GC analysis, however, demonstrated that strain T104, grown on (S)-(-) limonene, p-cymene and $\alpha$-terpinene, could degrade 4,4-DCBp up to 30%, equivalent to 50% of the biphenyl induction level. Moreover, strain T104 grown on (S)-(-) limonene, could also degrade 2,2-DCBp up to 30%. This indicates that terpenoids, widely distributed in nature, could be utilized as both growth and/or inducer substrate(s) for PCB biodegradation in the environment.
For the effective production of functional oligosaccharides(DP 3-5) from inulin in chicory extracts, the acid hydrolysis and enzymatic endo-inulinase reaction were compared. Acid hydrolysis was unfavorable ; the content of oligosacharides in total sugar increased to 26.0% for 12 min at $55^{\circ}C$ and 24.6% at 6 min at $65^{\circ}C$ and showed little change for 30 min. The content of high DP(DP 6) decreased from 83.5 to 49.5% and 23.0% for 30 min, repectively. Glucose, fructose and sucrose increased to 24.6% and 50.3%, respectively. Hydrolysis of chicory extracts with purified endo-inulinase from Arthrobacter sp. S37 was carried out at $40^{\circ}C$ and pH 7.5 for 44 hrs. The content of high DP($DP{\geq}6$) in total sugar decreased from 83.5 to 23.0% and that of inulobiose(F2) and DP 3-5 increased to 66.1%. Glucose, fructose and sucrose were not produced. The hydrolysis of chicory extracts without DP 1 and DP 2 with crude or with purified enzyme were also carried out. In contrast to the hydrolysate of crude enzyme, that of purified endo-inulinase did not contain glucose, fructose, sucrose, F2 and 1-kestose(GF2). The content of oligosaccharides in the hydrolysate of the purified endo-inulinase were 79.2%, composed mainly of inulotriose(F3), inulotetraose(F4) and inulopentaose(F5), which shows that the enzymatic hydrolysis using purified endo-inulinase from Arthrobacter sp. S37 is the best method for oligosaccharides production from inulin in chicory extracts.
A semi-pilot biofilter inoculated with the microbes consortium of Bacillus cereus DAH-1056 and Arthrobacter sp. KDE-0311 was operated under various operating conditions in order to treat malodorous waste air containing both hydrogen sulfide and ammonia. When both hydrogen sulfide and ammonia contained in malodorous waste air were treated simultaneously by semi-pilot biofilter inoculated with Thiobacillus sp. IW and return-sludge, the removal efficiencies of hydrogen sulfide and ammonia were ca. 80% and ca. 50%, respectively. On the other hand, in this study, the removal efficiencies of hydrogen sulfide and ammonia were ca. 90% and ca. 60%, respectively. Therefore, the removal efficiencies of hydrogen sulfide and ammonia were enhanced by ca. 13% and 20%, respectively, compared to the semipilot biofilter inoculated with Thiobacillus sp. IW and return-sludge. In addition, in this study, the maximum elimination capacities of hydrogen sulfide and ammonia were enhanced by ca. 15% ($8g/m^3/h$) and 10~17% ($3{\sim}5g/m^3/h$), respectively. In this study, it was observed either that in case of even a same inlet load of hydrogen sulfide, a higher concentration of hydrogen sulfide causes more difficulties in treating ammonia containing in waste air than a lower one, or that in case of even a same inlet load of ammonia, a lower concentration of ammonia results in higher removal efficienciy and elimination capacity than a higher one. Even though hydrogen sulfide and ammonia were treated simultaneously by a biofilter in this study, the maximum elimination capacity of hydrogen sulfide in this study exceeded or was similar to that in previous study of biofilter treating only hydrogen sulfide. In addition, this study showed the higher maximum elimination capacity of ammonia than other previous investigation of biofilter treating hydrogen sulfide and ammonia simultaneously.
Lee Yoo Kyung;Kim Hyo Won;Kang Sung-Ho;Lee Hong Kum
Proceedings of the Microbiological Society of Korea Conference
/
2003.05a
/
pp.26-33
/
2003
We isolated and identifed culturable Arctic bacteria that have inhabited around Korean Arctic Research Station Dasan located at Ny-Alsund, Svalbard, Norway $(79^{\circ}N,\;12^{\circ}E)$. The pure colonies were inoculated into nutrient liquid media, genomic DNA was extracted, and phylogenetic analysis was performed on the basis of 16S rDNA sequences. Out of total 227 strains, 198 strains were overlapped or unidentified, and 43 bacteria were finally identified: 31 strains belonged to Pseudomonas, 7 strains Arthrobacter, two Flavobacterium sp., an Achromobacter sp., a Pedobacter sp., and a Psychrobacter sp. For isolation of diverse bacteria, we need more effective transport method than 3M petri-films, which were used for convenience of transportation that was restricted by volume. We also need to use other culture media than nutrient media. We expect these Arctic bacteria can be used for screening to develop new antibiotics or industrial enzymes that are active at low temperature.
There is a possibility that carvone, a monoterpene from spearmint (Mentha spicata), could induce the bph degradative pathway and genes in Alcaligenes eutrophus H850, which is a known Gram-negative PCB degrader with a broad substrate specificity that was thoroughly investigated with Arthrobacter sp. BIB, a Gram-positive PCB degrader. The strains BIB and H850 were unable to utilize and grow on the plant terpene [(R)-(-)-carvone] (50ppm) to be recognized as a sole carbon source. Nevertheless, the carvone did induce 2,3-dihydroxybiphenyl 1,2-dioxygenase (encoded by bphC) in the strain B lB, as observed by a resting cell assay that monitors accumulation of a yellow meta ring fission product from 4,4'-dichlorobiphenyl (DCBp). The monoterpene, however, did not appear to induce the meta cleavage pathway in the strain H850. Instead, an assumption was made that the strain might be using an alternative pathway, probably the ortho-cleavage pathway. A reverse transcription (RT)-PCR system, utilizing primers designed from a conserved region of the bphC gene of Arthrobacter sp. M5, was employed to verify the occurrence of the alternative pathway. A successful amplification (182bp) of mRNA transcribed from the N-terminal region of the bphC gene was accomplished in H850 cells induced by carvone (50ppm) as well as in biphenyl-growth cells. It is, therefore, likely that H850 possesses a specific PCB degradation pathway and hence a different substrate specificity compared with B1B. This study will contribute to an elucidation of the dynamic aspects of PCB bioremediation in terms of roles played by PCB degraders and plant terpenes as natural inducer substrates that are ubiquitous and environmentally compatible.
Interactions between microalgae and heterotrophic bacteria are common in natural environments. This study investigated the effect of heterotrophic bacteria on the activity of the photosynthetic eukaryotic alga Chlorella sp. MF1907 when cocultured. A total of 31 heterotrophic bacterial isolates belonging to different genera were cocultured with MF1907. Interactions of the alga with Agromyces, Rhodococcus, Sphingomonas, Hyphomicrobium, Rhizobium, and Pseudomonas were positive, while those with Burkholderia, Paraburkholderia, Micrococcus, Arthrobacter, Mycobacterium, Streptomyces, Pedobacter, Mucilaginibacter, Fictibacillus, Tumebacillus, Sphingopyxis, and Erythrobacter were negative (p < 0.05). A turnover experiment demonstrating a switch from heterotrophic to autotrophic activity of MF1907 was performed using 16 isolates exhibiting apparent effects (positive, negative, or neutral). Compared with the results of the coculture experiment, eight isolates exhibited the same outcomes, while the others did not. Consistently, Pseudomonas and Agromyces showed a remarkable positive effect on MF1907 activity, and Burkholderia, Streptomyces, and Erythrobacter had a marked negative effect. Our results suggest that it may be possible to use the isolates for controlling populations of microalgae in natural and engineered environments.
Batch experiments using indigenous and commercialized adventive microorganisms were performed to investigate the feasibility of the biodegradation process for the diesel contaminated soil, which was taken in US Military Camp 'Hialeah', Korea. TPH concentration of the soil was determined as 3,819 mg/kg. Four indigenous microorganisms having high TPH degradation activity were isolated from the soil and by 16S rRNA gene sequence analysis, they were identified as Arthrobacter sp., Burkholderia sp., Cupriavidus sp. and Bacillus sp.. Two kinds of commercialized solutions cultured with adventive microorganisms were also used for the experiments. Various biodegradation conditions such as the amount of microorganism, water content and the temperature were applied to decide the optimal bioavailability condition in the experiments. In the case of soils without additional microorganisms (on the natural attenuation condition), 35% of initial TPH was removed from the soil by inhabitant microorganisms in soil for 30 days. When the commercialized microorganism cultured solutions were added into the soil, their average TPH removal efficiencies were 64%, and 54%, respectively, which were higher than that without additional microorganisms. When indigenous microorganisms isolated from the contaminated soil were added into the soil, TPH removal efficiency increased up to 95% (for Bacillus sp.). According to the calculation of the average biodegradation rates for Bacillus sp., the remediation goal (87% of the removal efficiency: 500 mg/kg) for the soil would reach within 24 days. Results suggested that TPH removal efficiency of biodegradation by injecting indigenous microorganisms is better than those by injecting commercialized adventive microorganisms and only by using the natural attenuation.
Pseudomonas sp. strain DJ-12 is a bacterial isolate capable of degrading 4-chlorobiphenyl (4CBP) as a carbon and energy source. The catabolic degradation of 4CBP by the strain DJ-12 was studied along with the genetic organization of the genes responsible for the crucial steps of the catabolic degradation. The catabolic pathway was characterized as being conducted by consecutive reactions of the meta-cleavage of 4CBP, hydrolytic dechlorination of 4-chlorobenzoate (4CBA), hydroxylation of 4-hydroxybenzoate, and meta-cleavage of protocatechuate. The pcbC gene responsible for the meta-cleavage of 4CBP only showed a 30 to 40% homology in its deduced amino acid sequence compared to those of the corresponding genes from other strains. The amino acid sequence of 4CBA-CoA dechlorinase showed an 86% homology with that of Pseudomonas sp. CBS3, yet only a 50% homology with that of Arthrobacter spp. However, the fcb genes for the hydrolytic dechlorination of 4CBA in Pseudomonas sp. DJ-12 showed an uniquely different organization from those of CBS3 and other reported strains. Accordingly, these results indicate that strain DJ-12 can degrade 4CBA completely via meta-cleavage and hydrolytic dechlorination using enzymes that are uniquely different in their amino acid sequences from those of other bacterial strains with the same degradation activities.
Recent studies have described various microorganisms that can degrade PAH, however, there are currently limited methods available to screen for PAH-degrading microorganisms. To screen for PAH-degrading microorganisms, a sublimation method (Alley, Jeremy F. and Lewis R. Brown. 2000. Appl. Environ. Microbiol. 66, 439-442) was modified to produce a simple screening system. In our results, there were several bacterial species capable of pyrene degradation including genera, Coryenbacterium, Gordonia, Rhodococcus, and Streptomyces, which have been screened from 350 bacterial isolates of commercial gasoline and oil-spilled sediment by the sublimation method. The main advantage of this method is that it (i) safely deposits an even, thin and visible layer of PAH onto the agar surface without the use of solvents and (ii) the quantity of PAH sublimed onto the agar can be easily controlled. Overall, this sublimation method may be an effective and simple technique to screen for PAH-degrading microorganisms.
본 웹사이트에 게시된 이메일 주소가 전자우편 수집 프로그램이나
그 밖의 기술적 장치를 이용하여 무단으로 수집되는 것을 거부하며,
이를 위반시 정보통신망법에 의해 형사 처벌됨을 유념하시기 바랍니다.
[게시일 2004년 10월 1일]
이용약관
제 1 장 총칙
제 1 조 (목적)
이 이용약관은 KoreaScience 홈페이지(이하 “당 사이트”)에서 제공하는 인터넷 서비스(이하 '서비스')의 가입조건 및 이용에 관한 제반 사항과 기타 필요한 사항을 구체적으로 규정함을 목적으로 합니다.
제 2 조 (용어의 정의)
① "이용자"라 함은 당 사이트에 접속하여 이 약관에 따라 당 사이트가 제공하는 서비스를 받는 회원 및 비회원을
말합니다.
② "회원"이라 함은 서비스를 이용하기 위하여 당 사이트에 개인정보를 제공하여 아이디(ID)와 비밀번호를 부여
받은 자를 말합니다.
③ "회원 아이디(ID)"라 함은 회원의 식별 및 서비스 이용을 위하여 자신이 선정한 문자 및 숫자의 조합을
말합니다.
④ "비밀번호(패스워드)"라 함은 회원이 자신의 비밀보호를 위하여 선정한 문자 및 숫자의 조합을 말합니다.
제 3 조 (이용약관의 효력 및 변경)
① 이 약관은 당 사이트에 게시하거나 기타의 방법으로 회원에게 공지함으로써 효력이 발생합니다.
② 당 사이트는 이 약관을 개정할 경우에 적용일자 및 개정사유를 명시하여 현행 약관과 함께 당 사이트의
초기화면에 그 적용일자 7일 이전부터 적용일자 전일까지 공지합니다. 다만, 회원에게 불리하게 약관내용을
변경하는 경우에는 최소한 30일 이상의 사전 유예기간을 두고 공지합니다. 이 경우 당 사이트는 개정 전
내용과 개정 후 내용을 명확하게 비교하여 이용자가 알기 쉽도록 표시합니다.
제 4 조(약관 외 준칙)
① 이 약관은 당 사이트가 제공하는 서비스에 관한 이용안내와 함께 적용됩니다.
② 이 약관에 명시되지 아니한 사항은 관계법령의 규정이 적용됩니다.
제 2 장 이용계약의 체결
제 5 조 (이용계약의 성립 등)
① 이용계약은 이용고객이 당 사이트가 정한 약관에 「동의합니다」를 선택하고, 당 사이트가 정한
온라인신청양식을 작성하여 서비스 이용을 신청한 후, 당 사이트가 이를 승낙함으로써 성립합니다.
② 제1항의 승낙은 당 사이트가 제공하는 과학기술정보검색, 맞춤정보, 서지정보 등 다른 서비스의 이용승낙을
포함합니다.
제 6 조 (회원가입)
서비스를 이용하고자 하는 고객은 당 사이트에서 정한 회원가입양식에 개인정보를 기재하여 가입을 하여야 합니다.
제 7 조 (개인정보의 보호 및 사용)
당 사이트는 관계법령이 정하는 바에 따라 회원 등록정보를 포함한 회원의 개인정보를 보호하기 위해 노력합니다. 회원 개인정보의 보호 및 사용에 대해서는 관련법령 및 당 사이트의 개인정보 보호정책이 적용됩니다.
제 8 조 (이용 신청의 승낙과 제한)
① 당 사이트는 제6조의 규정에 의한 이용신청고객에 대하여 서비스 이용을 승낙합니다.
② 당 사이트는 아래사항에 해당하는 경우에 대해서 승낙하지 아니 합니다.
- 이용계약 신청서의 내용을 허위로 기재한 경우
- 기타 규정한 제반사항을 위반하며 신청하는 경우
제 9 조 (회원 ID 부여 및 변경 등)
① 당 사이트는 이용고객에 대하여 약관에 정하는 바에 따라 자신이 선정한 회원 ID를 부여합니다.
② 회원 ID는 원칙적으로 변경이 불가하며 부득이한 사유로 인하여 변경 하고자 하는 경우에는 해당 ID를
해지하고 재가입해야 합니다.
③ 기타 회원 개인정보 관리 및 변경 등에 관한 사항은 서비스별 안내에 정하는 바에 의합니다.
제 3 장 계약 당사자의 의무
제 10 조 (KISTI의 의무)
① 당 사이트는 이용고객이 희망한 서비스 제공 개시일에 특별한 사정이 없는 한 서비스를 이용할 수 있도록
하여야 합니다.
② 당 사이트는 개인정보 보호를 위해 보안시스템을 구축하며 개인정보 보호정책을 공시하고 준수합니다.
③ 당 사이트는 회원으로부터 제기되는 의견이나 불만이 정당하다고 객관적으로 인정될 경우에는 적절한 절차를
거쳐 즉시 처리하여야 합니다. 다만, 즉시 처리가 곤란한 경우는 회원에게 그 사유와 처리일정을 통보하여야
합니다.
제 11 조 (회원의 의무)
① 이용자는 회원가입 신청 또는 회원정보 변경 시 실명으로 모든 사항을 사실에 근거하여 작성하여야 하며,
허위 또는 타인의 정보를 등록할 경우 일체의 권리를 주장할 수 없습니다.
② 당 사이트가 관계법령 및 개인정보 보호정책에 의거하여 그 책임을 지는 경우를 제외하고 회원에게 부여된
ID의 비밀번호 관리소홀, 부정사용에 의하여 발생하는 모든 결과에 대한 책임은 회원에게 있습니다.
③ 회원은 당 사이트 및 제 3자의 지적 재산권을 침해해서는 안 됩니다.
제 4 장 서비스의 이용
제 12 조 (서비스 이용 시간)
① 서비스 이용은 당 사이트의 업무상 또는 기술상 특별한 지장이 없는 한 연중무휴, 1일 24시간 운영을
원칙으로 합니다. 단, 당 사이트는 시스템 정기점검, 증설 및 교체를 위해 당 사이트가 정한 날이나 시간에
서비스를 일시 중단할 수 있으며, 예정되어 있는 작업으로 인한 서비스 일시중단은 당 사이트 홈페이지를
통해 사전에 공지합니다.
② 당 사이트는 서비스를 특정범위로 분할하여 각 범위별로 이용가능시간을 별도로 지정할 수 있습니다. 다만
이 경우 그 내용을 공지합니다.
제 13 조 (홈페이지 저작권)
① NDSL에서 제공하는 모든 저작물의 저작권은 원저작자에게 있으며, KISTI는 복제/배포/전송권을 확보하고
있습니다.
② NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 상업적 및 기타 영리목적으로 복제/배포/전송할 경우 사전에 KISTI의 허락을
받아야 합니다.
③ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 보도, 비평, 교육, 연구 등을 위하여 정당한 범위 안에서 공정한 관행에
합치되게 인용할 수 있습니다.
④ NDSL에서 제공하는 콘텐츠를 무단 복제, 전송, 배포 기타 저작권법에 위반되는 방법으로 이용할 경우
저작권법 제136조에 따라 5년 이하의 징역 또는 5천만 원 이하의 벌금에 처해질 수 있습니다.
제 14 조 (유료서비스)
① 당 사이트 및 협력기관이 정한 유료서비스(원문복사 등)는 별도로 정해진 바에 따르며, 변경사항은 시행 전에
당 사이트 홈페이지를 통하여 회원에게 공지합니다.
② 유료서비스를 이용하려는 회원은 정해진 요금체계에 따라 요금을 납부해야 합니다.
제 5 장 계약 해지 및 이용 제한
제 15 조 (계약 해지)
회원이 이용계약을 해지하고자 하는 때에는 [가입해지] 메뉴를 이용해 직접 해지해야 합니다.
제 16 조 (서비스 이용제한)
① 당 사이트는 회원이 서비스 이용내용에 있어서 본 약관 제 11조 내용을 위반하거나, 다음 각 호에 해당하는
경우 서비스 이용을 제한할 수 있습니다.
- 2년 이상 서비스를 이용한 적이 없는 경우
- 기타 정상적인 서비스 운영에 방해가 될 경우
② 상기 이용제한 규정에 따라 서비스를 이용하는 회원에게 서비스 이용에 대하여 별도 공지 없이 서비스 이용의
일시정지, 이용계약 해지 할 수 있습니다.
제 17 조 (전자우편주소 수집 금지)
회원은 전자우편주소 추출기 등을 이용하여 전자우편주소를 수집 또는 제3자에게 제공할 수 없습니다.
제 6 장 손해배상 및 기타사항
제 18 조 (손해배상)
당 사이트는 무료로 제공되는 서비스와 관련하여 회원에게 어떠한 손해가 발생하더라도 당 사이트가 고의 또는 과실로 인한 손해발생을 제외하고는 이에 대하여 책임을 부담하지 아니합니다.
제 19 조 (관할 법원)
서비스 이용으로 발생한 분쟁에 대해 소송이 제기되는 경우 민사 소송법상의 관할 법원에 제기합니다.
[부 칙]
1. (시행일) 이 약관은 2016년 9월 5일부터 적용되며, 종전 약관은 본 약관으로 대체되며, 개정된 약관의 적용일 이전 가입자도 개정된 약관의 적용을 받습니다.