• 환경생물
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• 제29권1호
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• pp.52-60
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• 2011

식물과 그 식물의 근권미생물과의 협력관계는 이미 오래전부터 관심을 받아왔고 지구 기후변화에 따라 식물과 그 근권미생물의 생태 및 지구환경에 대한 적응성은 막대한 지장을 받을 것으로 생각되어 왔다. 따라서 지구온난화에 따라 식물뿌리에 서식하는 근권미생물인 토양미 생물의 우점종이 어떻게 변화하는지에 대해 규명하고자 본 실험을 실시하였다. 우선 한국 식물생태계의 대표종인 소나무 (A), 잣나무 (B), 상수리나무 (C), 오리나무 (D) 를 선발하여 각각 실온인 $27^{\circ}C$와 $29^{\circ}C$(실온$+2^{\circ}C$), $31^{\circ}C$(실온$+4^{\circ}C$), $33^{\circ}C$(실온$+6^{\circ}C$)에서 1년 이상 성장시킨 후 이들의 뿌리토양을 무균적으로 채취하여 미생물 screening법과 colony counting을 통하여 각각의 군에서 우점종을 선별한 뒤 16S rRNA 분석에 의해 이들 각각의 우점종을 동정하였다. 그 결과 소나무 $27^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus와 Enterobacter sp. CCBAU 15492, 소나무 $29^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. 210_64와 Enterobacter sp. CCBAU 15492, 소나무 $31^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. 210_64와 Enterobacter ludwigii, 소나무 $33^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. 210_64와 Enterobacter sp. CCBAU 15492, Bacillus marisflavistrain DS6이 검출되었고, 잣나무 $27^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus Q1, Pseudomonas sp. PR1-3, Arthrobacter woluwensisstrain CBU05/5295, 잣나무 $29^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. G3, Pseudomonas sp. PR1-3, Bacillus sp. 210_24, 잣나무 $31^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus Q1, Pseudomonas sp. PR1-3, 잣나무 $33^{\circ}C$에서는 Bacillus coagulans strain, Pseudomo-Dominant-species Change of Soil Microbes 59 nas sp. PR1-3, Chryseobacterium sp. COLI2, 상수리나무 $27^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus strain B1, Pseudomonas putida strain W30, Arthrobacter woluwensis strain CBU05/5295, 상수리나무 $29^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus strain CICC10185, Pseudomonas putida strain W30, 상수리나무 $31^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus strain CG-T2, Pseudomonas sp. W15Feb9B, 상수리나무 $33^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. CCBAU 51490, Arthrobacter woluwensis strain CBU05/5295, 오리나무 $27^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. B18, Pseudomonas sp. PD 16, Enterobacter sp. CCBAU 15492, 오리나무 $29^{\circ}C$에서는 Rhodococcus erythropolis PR4, 오리나무 $31^{\circ}C$에서는 Enterobacter cloacae, Pseudomonas sp. PD 16, 오리나무 $33^{\circ}C$에서는 Bacillus subtilis strain SYH15, Pseudomonas sp. PD16을 우점종으로 동정하였다. 이 중 소나무는 $33^{\circ}C$에서 Bacillus marisflavi strain DS6가 $27{\sim}31^{\circ}C$에서는 발견되지 않다가 온도가 상승함에 따라 출현한 새로운 우점종으로 나타났고 잣나무에서는 $27^{\circ}C$에서 Bacillus cereus Q1, $29^{\circ}C$에서는 Bacillus sp. G3, $31^{\circ}C$에서는 Bacillus cereus Q1 등의 Bacillus속이 주요 우점종으로 나타났으나 온도가 가장 많이 상승한 $33^{\circ}C$에서는 Chryseobacterium sp. COLI2으로 우점종이 변한 것을 확인하였다. 본 실험은 차후 더 다양한 온도에서의 토양미생물 우점종 변화에 대한 연구가 진행되어야 할 것으로 사료되며 이들 연구결과들이 연계되어 지구온난화와 미생물의 관계, 그리고 새롭게 출현한 토양미생물과 식물간의 관계를 규명하는데 도움이 되는 데이터가 도출 될 것으로 기대된다.

• Journal of Microbiology
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• 제41권2호
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• pp.89-94
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• 2003

Bacterial strain No. P08 isolated from wastewater at the Cheongju industrial complex was found to be capable of degrading 4-chlorobenzoate under aerobic condition. P08 was identified as Comamonas sp. from its cellular fatty acid composition and 16S rDNA sequence. The fcb genes, responsible for the hydrolytic dechlorination of 4-chlorobenzoate, were cloned from the plasmid pJJl of Comamonas sp. P08. The fcb gene cluster of comamonas sp. PO8 was organized in the order fcbB-fcbA-fcbTl-fcbT2-fcbT3-fcbC. This organization of the fcb genes was very similar to that of the fcb genes carried on the chromosomal DNA of pseudomonas sp. DJ-12. However, it differed from the fcbA-fcbB -fcbC ordering of Arthrobacter sp. SU. The nucleotide sequences of the fcbABC genes of strain P08 showed 98% and 53% identities to those of Pseudomonas sp. DJ-12 and Arthrobacter sp. SU, respectively. This suggests that the fcb genes might have been derived from Pseudomonas sp. DJ-12 to form plasmid pJSl in Comamonas sp. P08, or that the fcb genes in strain DJ-12 were transposed from Comamonas sp. P08 plasmid.

• 한국생물공학회:학술대회논문집
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• 한국생물공학회 2000년도 추계학술발표대회 및 bio-venture fair
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• pp.489-492
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• 2000

The eventual goal of this study is to elucidate roles of plant terpenoids (e.g., cymene, limonene and others) as natural substrates in the cometabolic biodegradation of PCBs and to develop an effective PCB bioremediation technology. The aim of this study was to examine how plant terpenoids, as natural substrates or inducers would affect the biodegradation of PCB congeners. Various PCB degraders that could grow on biphenyl and several terpenoids were tested for their PCB degradation capabilities. The PCB congener degradation activities were first monitored through resting cell assay technique that could detect degradation products of the substrate. The congener removal was also confirmed by concommitant GC analysis. The PCB degraders, Pseudononas sp. P166 and Caynebacterium sp. T104 were found to grow on both biphenyl and terpenoids ((S)-(-) limonene, p-cymene and ${\alpha}-terpinene$) whereas Arthrobacter B1B could not grow on the terpenoids as a sole carbon source. The strain B1B grown on biphenyl showed a good degradation activity for 4,4'-dichlorobiphenyl (DCBp) while strains P166 and T104 gave about 25% of B1B activity. Induction of degradation by cymene, limonene and terpine was hardly detected by the resting cell assay technique. This appeared to be due to relatively lower induction effect of these terpenoids compared with biphenyl. However, a subsequent GC analysis showed that the congener could be removed up to 30% by the resting cells of T104 grown on the terpenoids. This indicates that terpenoids, widely distributed in nature, could be utilized as both growth and/or inducer substrate for PCB biodegradation.

• 한국미생물생명공학회:학술대회논문집
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• 한국미생물생명공학회 2000년도 Proceedings of 2000 KSAM International Symposium and Spring Meeting
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• pp.100-107
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• 2000

In a recently developed strategy for in-situ treatment of polychlorinated biphenyls (PCB), bioaugmentation was used in conjunction with a surfactant, sorbitan trioleate, as a carbon source for the degrader bacteria, along with the monoterpene, carvone, and salicylic acid as inducing substrates. Two bacteria were used for soil inoculants, including Arthrobacter sp. st. B1B and Ralstonia eutrophus H850. This methodology achieved 60% degradation of PCBs in Aroclor 1242 after 18 weeks in soils receiving 34 repeated applications of the degrader bacteria. However, an obvious limitation was the requirement for soil mixing after every soil inoculation. In the research reported here, bioaugmentation and biostimulation treatment strategies were modified by using the earthworm, Pheretima hawayana, as a vector for dispersal and mixing of surface-applied PCB-degrading bacteria and soil chemical amendments. Changes in microbial biomass and microbial community structure due to earthworm effects were examined using DNA extraction and PCR-DGGE of 16S rDNA. Results showed that earthworms effectively promoted biodegradation of PCBs in bioaugmented soils to the same extent previously achieved using physical soil mixing, and had a lesser, but significant effect in promoting PCB biodegradation in biostimulated soils treated with carvone and salicylic acid. The effects of earthworms were speculated to involve many interacting factors including increased bacterial transport to lower soil depths, improved soil aeration, and enhanced microbial activity and diversity.

• 한국축산식품학회지
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• 제33권6호
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• pp.772-780
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• 2013

지방분해효소 활성이 가장 높은 균은 가을철에 집유한 B 지역의 원유로부터 분리한 Acinetobacter genomospecies 10(match %: 99.90)이었으며, 단백질분해효소 활성이 가장 높은 균은 봄철에 B 지역의 원유로부터 분리한 Serratia liquefaciens(match %: 99.39)였다. Acinetobacter genomospecies 10(match %:99.90)는 전형적인 생장곡선의 형태인 시그모이드 곡선의 형태를 나타냈으며, 배양시간별 조효소 활성은 배양시간이 증가할수록 지방분해효소 활성이 증가하다가 정지기 후반부에서부터 사멸기에 도달하기까지는 배양시간이 길수록 활성이 감소하였다. pH에 따른 지방분해효소 활성은 pH 8.5에서 가장 높았고 온도는 $45^{\circ}C$에서 가장 높은 활성을 나타내었다. Serratia liquefaciens(match %: 99.39)의 생장곡선은 전형적인 시그모이드 형태를 나타내었고, 단백질분해효소 활성은 배양 12시간 후에 가장 높았고, 18시간 후에는 다시 감소하는 양상을 나타냈다. 단백질 분해효소의 pH 영향은 2.5에서 활성이 가장 낮았고 pH 8.5에서 가장 높은 활성을 나타내었다. 또한 반응온도에 의한 효소활성은 $35^{\circ}C$에서 가장 높았다.

• 한국토양비료학회지
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• 제20권2호
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• pp.179-183
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• 1987

고추, 마늘, 화훼, 배추및 양파등(等)의 연작지(連作地) 토양(土壤)을 공시(供試)하여 세균(細菌), 사상균(絲狀菌) 및 이들 미생물(微生物)의 분포비율등(分布比率等)을 조사(調査)하기 위하여 실내시험(室內試驗)한 결과(結果)를 요약(要約)하면 다음과 같다. 1. 고추및 마늘 연작지토양(連作地土壤)의 세균(細菌) 및 사상균수(絲狀菌數)는 일반답토양(一般畓土壤)에 비(比)하여 현저(顯著)히 적었다. 2. 연작지토양중(連作地土壤中) 세균(細菌)은 당류(糖類)를 산화(酸化)하여 생육(生育)하는 당류자화성세균(糖類自化性細菌)과 질산환원(窒酸還元)을 가진 세균수(細菌數)가 많았다. 3. 마늘과 토마토 연작지토양중(連作地土壤中)에는 당(糖)의 산화작용(酸化作用)에 의한 Alkali 생성균수(生成菌數)가 많았다. 4. 작물연작지토양(作物連作地土壤)의 근권(根圈)에서는 대체(大體)로 Pseudomonas, Xanthomonas, Bacillus, Achromobacter 속(屬)의 세균(細菌)이 그리고 사상균(絲狀菌)은 Penicillium속(屬)이 가장 많았으며, 다음은 Phoma, Humicola 및 Aspergillus속(屬)의 균주(菌株)였다. 5. 전공시토양(全供試土壤)에서 식물독소생성균(植物毒素生成菌)인 Stachybotris속(屬)의 사상균(絲狀菌)이 분리(分離)되었다.