• 한국미생물·생명공학회지
• /
• 제13권4호
• /
• pp.321-327
• /
• 1985

색소를 형성하지 못하는 Serratia sp. LW-1 균주의 균체의 protease생성조건을 검토하고 효소를 간단한 방법으로 정제하였다. 효소 생산을 위한 최적온도는 brain heart infusion배지에서 $25^{\circ}C$이었으며, 배양후 76-80시간에 최고의 균체의 효소활성을 나타냈다. Aeration효과는 5$\ell$용 flask에 배지량을 1$\ell$주입하여 180 cycles/min으로 진탕배양 하였을 때가 aeration하지 않았을 경우보다 약 8배의 균체의 효소생산을 보였다. 효소의 정 제는 ammonium sulfate침 전, ammonium sulfate분별염석 및 두번의 DEAE-cellulose column 크로마토그라피에 의하여 수행하였으며, 정제된 효소는 정제도가 약 100배, 회수율이 16%이었다. 정제된 효소는 analytical ultracentrifuge pattern에서 단일 단백질로 나타났으며 최고 활성을 나타내는 pH는 vitamin free casein을 substrate로 사용하였을 때 pH 8.5-9.5이었고 최적온도는 4$0^{\circ}C$ 근처이었다

• Bulletin of the Korean Chemical Society
• /
• 제33권6호
• /
• pp.1839-1844
• /
• 2012

We have investigated binding between wild-type and mutant Heat Shock Factor (HSF) DNA binding domains (DBDs) with 17-bp HSE containing a central 5'-NGAAN-3' element by equilibrium analytical ultracentrifugation using multi-wavelength technique. Our results indicate that R102 plays critical role in HSE recognition and the interactions are characterized by substantial negative changes of enthalpy (${\Delta}H^0_{\theta}=-9.90{\pm}1.13kcal\;mol^{-1}$) and entropy (${\Delta}S^0_{\theta}=-12.46{\pm}3.77cal\;mol^{-1}K^{-1}$) with free energy change, ${\Delta}G^0_{\theta}$ of $-6.15{\pm}0.03kcal\;mol^{-1}$. N105 plays minor role in the HSE interactions with ${\Delta}H^0_{\theta}$ of $-2.54{\pm}1.65kcal\;mol^{-1}$, ${\Delta}S^0_{\theta}$ of $19.28{\pm}5.50cal\;mol^{-1}K^{-1}$ and ${\Delta}G^0_{\theta}$ of $-8.35{\pm}0.05kcal\;mol^{-1}$, which are similar to those observed for wild-type DBD:HSE interactions (${\Delta}H^0_{\theta}=-3.31{\pm}1.86kcal\;mol^{-1}$, ${\Delta}S^0_{\theta}=17.38{\pm}6.20cal\;mol^{-1}K^{-1}$ and ${\Delta}G^0_{\theta}=-8.55{\pm}0.06kcal\;mol^{-1}$) indicating higher entropy contribution for both wild-type and N105A DBD bindings to the HSE.

• Molecules and Cells
• /
• 제21권2호
• /
• pp.229-236
• /
• 2006

Gaegurin 4 (GGN4), a novel peptide isolated from the skin of a Korean frog, Rana rugosa, has broad spectrum antimicrobial activity. A number of amphipathic peptides closely related to GGN4 undergo a coil to helix transition with concomitant oligomerization in lipid membranes or membrane-mimicking environments. Despite intensive study of their secondary structures, the oligomeric states of the peptides before and after the transition are not well understood. To clarify the structural basis of its antibiotic action, we used analytical ultracentrifugation to define the aggregation state of GGN4 in water, ethyl alcohol, and 1,1,1,3,3,3-hexafluoro-2-propanol (HFIP). The maximum size of GGN4 in 15% HFIP corresponded to a decamer, whereas it was monomeric in buffer. The oligomeric transition is accompanied by a cooperative 9 nm blue-shift of maximum fluorescence emission and a large secondary structure change from an almost random coil to an ${\alpha}$-helical structure. GGN4 induces pores in lipid membranes and, using electrophysiological methods, we estimated the diameter of the pores to be exceed $7.3{\AA}$, which suggests that the minimal oligomer structure responsible is a pentamer.

• 한국미생물·생명공학회지
• /
• 제9권4호
• /
• pp.207-212
• /
• 1981

토양에서 분리된 여러가지 곰팡이류 가운데 $\beta$-galactosidase 분비력이 강하고 중성부근에서 효소안정성이 높은 Penicillium sp. 균주를 $\beta$-galactosidase 생산균주로 선정하였다. 이 균주는 밀기울고체배지에서 3$0^{\circ}C$ 72시간 배양에서 galactosidase 분비력이 가장 높았으며 질소원 첨가배지에서 질소원의 종류에 따라 14%~85%까지 증가되었다. 고체배지에서 얻은 효소추출액을 ammonium sulfate fractionation, SP-Sephadex C-50 chromatography, ultrogel AcA44 filtration, hrdroxrapatite chromatography등에 의하여 비활성도는 101 units/mg protein으로 5050배 정제되었다. 최종적으로 정제된 galactosidase는 analytical ultracentrifuge에서 단일단백으로 Schlieren pattern을 나타냈고 Disc electrophoresis에서는 단일 band로서 전기영동되었으며 영동된 $\beta$-galactosidase 활성 band와 일치하였다.

• 분석과학
• /
• 제5권4호
• /
• pp.477-484
• /
• 1992

형질 전환된 사철느타리버섯으로부터 초원심분리 및 설탕밀도 기울기법으로 44% 층에서 미토콘드리아를 분리정제하였다. ATPase와 ATP synthase의 최적 활성조건은 각각 pH 7.4, $60^{\circ}C$ 및 pH 7.5, $57^{\circ}C$였고, km값은 11.6mM과 8.4mM였다. ATPase는 기질농도 5~6mM의 ATP에서, ATP synthase는 5~10mM ADP 농도에서 활성이 높으며, 그 이상의 농도에서는 기질 저해를 받았다. ATPase/ATP synthase 모두 $Mg^{2+}$ 의존성 효소로 $G_{418}$으로 비경쟁적인 저해를 받았다. 효소의 아미노산 분석결과 hydrophobic 아미노산 잔기는 50.5%, small 아미노산 잔기는 56.1%, hydrogen bonding 아미노산 잔기는 43.7%, helix breaking 아미노산 잔기는 55.2%였다. 인지질을 분석한 결과 phosphatidyl glycerol, phosphatidyl choline 및 phosphatidyl ethanolamine으로 구성되었고 phosphatidyl serine과 phosphatidyl inositol은 전혀 없었다. 포화 지방산은 palmitate(51.31%)와 stearate(18.32%)의 함량이 많았고, 불포화 지방산($C_{18:1}$, $C_{18:2}$ 및 $C_{16:1}$)의 함량도 많았다.