• Animal Systematics, Evolution and Diversity
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• 제24권1호
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• pp.25-32
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• 2008

The Gold-spotted pond frog, Rana plancyi chosenica, designated as a vulnerable species by IUCN Red list. This species is a typical example facing local population threats and extinction due to human activities in South Korea. A strategic conservation plan for this endangered species is urgently needed. In order to provide information for future conservation planning, accurate information on the genetic diversity and taxonomic status is needed for the establishment of conservation units for this species. In this study, we used a molecular genetic approach using the mitochondrial cytochrome b gene and control region sequences to find the genetic diversity of gold-spotted pond frogs within South Korea. We sequenced the mitochondrial DNA cytochrome b gene and control region of 77 individuals from 11 populations in South Korea, and one from Chongqing, China. A total of 15 cytochrome b gene haplotypes and 34 control region haplotypes were identified from Korean gold-spotted pond frogs. Mean sequence diversity among Korean gold-spotted pond frogs was 0.31% (0.0-0.8%) and 0.51% (0.0-1.0%), respectively. Most Korean populations had at least one unique haplotype for each locus. The Taean, Ansan and Cheongwon populations had no haplotypes shared with other populations. There was a sequence divergence between Korean and Chinese gold-spotted pond frogs (1.3% for cyt b; 2.9% for control region). Analysis of genetic distances and phylogenetic trees based on both cytochrome b and control region sequences indicate that the Korean gold-spotted pond frog are genetically differentiated from those in China.

• 생명과학회지
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• 제14권1호
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• pp.32-37
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• 2004

ITS2 부위를 시퀀싱하여 Pseudo-nitzschia delcatissima, P. multiseries, P. pungens, P. subfraudulenta 상호간의 유전자 다양도를 조사함과 아울러 RAPD-PCR pattern을 이용하여 유사도를 구하였다. 유전자 거리를 근거로 했을 때 P. delicatissima 종은 P. multiseries와 P. pungens와는 유전적 거리가 상당히 요원하였고, 심지어 P. subfraudenlta와도 거리를 보였다. 유사도의 경 P. multiseries와 P. pungens는 0.31로 보인 반면에, P delicatissima는 다른 세종과 0.81를 나타내었다. 따라서 P. delicatissima 종은 P. multiseries, P. pungens, P. subfraudulenta와는 유전적으로 밀접하지 않는 관계로 보였다. ITS2부위는 Pseudo-nitzschia 동정에 사용될 수 있는 유용한 도구로 보이며 형태적으로 구분할 수 없는 P. multiseries와 P. pungens을 구분할 수 있다. 또한 RAPD-PCR 방법도 단시간에 Pseudo-nitzchia을 분리시키는데 사용될 것으로 보인다.

• Animal Systematics, Evolution and Diversity
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• 제29권2호
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• pp.136-143
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• 2013

The collared scops owl that occurs in Korea is a protected species but its exact specific status has been questioned. To resolve the species status, a molecular phylogenetic analysis was conducted using two fragments of mitochondrial DNA, cytochrome b (cyt b, 891 bp) and NADH dehydrogenase subunit 2 (ND2, 627 bp) genes. Phylogenetic trees of cyt b revealed that all Korean specimens formed a monophyletic group with Japanese scops owl Otus semitorques with very low sequence divergence (d=0.008). We obtained a similar ND2 tree as well (d=0.003); however, the genetic distance between Korean individuals and O. lempiji from GenBank (AJ004026-7, EU348987, and EU601036) was very high and sufficient enough to separate them as species (cyt b, d=0.118; ND2, d=0.113). We also found that Korean species showed high differentiation from O. bakkamoena (AJ004018-20 and EU601034; cyt b, d=0.106; ND2, d=0.113) and O. lettia (EU601109 and EU601033, cyt b, d=0.110; ND2, d=0.117) as well. Therefore, we suggest that the Korean collared scops owl should be designated as Otus semitorques.

• 농업생명과학연구
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• 제43권6호
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• pp.19-27
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• 2009

본 연구는 산불 피해지에서의 임분구조 및 입지환경인자를 분석함으로서 이에 따른 산화 피해정도를 모형화하고 산화피해지의 피해목 처리에 따른 구성종의 종다양도 및 그 식생회복 형태를 구명하고자 하였다. 입지환경인자에 의한 산화피해율간의 관계를 정준상관 분석 및 로지스틱 회귀분석한 결과, 해발고 200m, 100m, 사면경사가 30도 이상인 입지의 임분밀도가 높은 소나무단순단층림이 산화 발생 피해율이 높은 것으로 추정되었다. 산화지 피해목 처리방법에 따른 식생회복 과정을 분석한 결과 피해목 존치보다는 피해목을 제거하는 것이 식생회복에 효과적이라 사료되었다. 따라서 산불피해지에 대한 식생회복을 위한 적절한 시업적 조치는 입지, 자생 수종 등을 복합적으로 고려하여야 할 것으로 사료되었다.

• Fisheries and Aquatic Sciences
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• 제27권2호
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• pp.87-99
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• 2024

Global climate change, followed by an increase in anthropogenic activities in aquatic ecosystems, and species invasions, has resulted in a decline in aquatic organism biodiversity. The Batanghari River, Sumatra's longest river, is polluted by mercury-containing illegal gold mining waste (PETI), industrial pollution, and domestic waste. Several studies have provided evidence suggesting a decline in fish biodiversity within the Batanghari River. However, a comprehensive evaluation of the present status of biodiversity in this river is currently lacking. The species under investigation were identified through various molecular-based identification methods, as well as morphological identification, which involved the use of neighbor-joining (NJ) trees. All collected specimens were initially identified using morphological techniques and subsequently confirmed with molecular barcoding analysis. Morphological and DNA barcoding identification categorized all specimens (1,692) into 36 species, 30 genera and 16 families, representing five orders. A total of 36 DNA barcodes were generated from 30 genera using a 650-bp-long fragment of the mitochondrial cytochrome oxidase subunit I (COI) gene. Based on the Kimura two-parameter model (K2P), The minimum and maximum genetic divergences based on K2P distance were 0.003 and 0.331, respectively, and the average genetic divergence within genera, families, and orders was 0.05, 0.12, 0.16 respectively. In addition, the average interspecific distance was approximately 2.17 times higher than the mean intraspecific distance. Our results showed that the COI barcode enabled accurate fish species identification in the Batanghari River. Furthermore, the present work will establish a comprehensive DNA barcode library for freshwater fishes along Batanghari River and be significantly useful in future efforts to monitor, conserve, and manage fisheries in Indonesia.

• 공업화학
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• 제21권5호
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• pp.575-580
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• 2010

우리나라는 전국토의 70%가 산림지역으로 1990년대 중반 이후 산불발생 건수가 지속적으로 증가하고 있고, 그 규모 또한 대형화되는 추세이다. 산림 내에 퇴적된 낙엽, 초본류, 침엽수 및 활엽수 등이 산불발생 시 매개체가 되며, 이들 수종별 연소 및 열분해 특성에 대한 연구는 미미한 실정이다. 본 발표에서는 국내 산림의 대표적 활엽수인 굴참나무 잎을 대상으로 TGA를 이용해 열분해반응 및 연소 특성에 대한 연구를 수행하였다. 굴참나무 잎은 $239^{\circ}C$ 부근에서 발화가 시작되며 열분해는 $250^{\circ}C$에서부터 시작되었다. TGA 분석으로부터 얻은 실험데이터는 미분법을 적용하여 전화율 변화에 따라 활성화에너지와 전지수인자를 계산하였다. 열분해반응에서 활성화에너지는 전화율 증가에 따라 증가하였으나, 연소과정에서의 활성화에너지는 감소하는 경향을 나타냈다.

• 한국전통조경학회지
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• 제37권2호
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• pp.20-29
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• 2019

본 연구는 100년 전 제작된 1918년 제주도 정밀 고지도를 바탕으로 당시 제주도의 노거수에 대한 기록정보를 확인하고 복원하여 기초정보를 구축하는데 목적이 있다. 고지도 분석을 위해 ArcGIS를 활용하여 대표지점 선정을 통한 좌표계 및 배율 일치작업을 수행하였다. 고지도에서 표기한 독립수 좌표정보를 점 추출법을 활용하여 디지타이징하였으며, 지도에서의 범례 형태 및 상대적 크기를 바탕으로 속성정보를 추출하였다. 100년 전의 고지도를 바탕으로 제주에 분포했던 노거수 현황을 파악하였으며, 당시 노거수의 특성을 분석하였다. 또한 현재 보호되고 있는 노거수 정보를 바탕으로 과거와 현재 노거수의 특성 및 제주 경관과 식생에서의 노거수 기여 가능성을 분석하였다. 연구결과 100년 전 제주도에는 1,013개체의 노거수가 섬 전역에 분포하고 있었다. 목재이용에 집약적이었던 당시 시대적 상황에도 불구하고 마을과 인접한 저지대에서도 노거수는 보호의 대상이 되었으며, 제주 고유 경관의 대표적인 구성요소로 존재해 왔다. 현재 잔존하고 있는 노거수는 총 159그루로 파악되었다. 과거와 마찬가지로 저지대 인가 주변에서 분포가 확인되고 있으며, 개체수의 감소는 섬 전역에서 확인된다. 개체 감소의 주요 요인으로는 제한수명 도달, 자연적 교란(태풍, 병해충, 건조 등)과 함께 인위적 교란(대규모 개발 사업, 목재이용 등)이 주도적으로 영향을 미친 것으로 판단된다. 그러나 405개체에 이르는 많은 수의 개체는 제주 식생의 복원과정에서 중요 종급원으로 기여하여 현재의 숲을 형성하는데 주도적인 역할을 감당한 것으로 판단된다.

• 한국균학회지
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• 제49권3호
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• pp.417-423
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• 2021

Apple decline symptoms were frequently observed on cv. Fuji apple orchards located in Gyeonggi, Gyeongbuk, and Gangwon provinces during surveys conducted from May until the end of September 2020. Three fungal strains were isolated from the margins of internal lesions of diseased apple trees, and their morphological characteristics were considered similar to Botryosphaeria sinensis. Phylogenetic analysis using internal transcribed spacer (ITS) regions, translation elongation factor 1-alpha (tef1), beta-tubulin (tub2), and the second largest subunit of RNA polymerase II (rpb2) gene sequences confirmed the closest relationship of isolates with B. sinensis at the species level. According to a pathogenicity test, the appearance of dark-brown discolorations and vascular necrosis on apple branches inoculated with the isolated strain KNUF-20-014 was observed. To the best of our knowledge, this is the first report of B. sinensis as the causal agent of apple disease in Korea.

• Mycobiology
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• 제41권1호
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• pp.59-62
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• 2013

Japanese pine sawyer beetle (Monochamus alternatus) is an economically important pest in coniferous trees. Ophiostoma ips was isolated from the beetle and identified based on analysis of morphological properties and the ${\beta}$-tubulin gene sequence. The fungus easily produced perithecia with a long neck on malt extract agar and its ascospores were rectangular shaped. This is first report of Ophiostoma species associated with the pinewood nematode vector beetle in Korea.

• Journal of Forest and Environmental Science
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• 제34권2호
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• pp.145-152
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• 2018

Quantification of Carbon stock has become in the contest of changing climate and mitigation potential of forests. Two different forest types, Dry Shiwalik Sal Forest and Moist Shiwalik Sal Forest in Barkot and Lachchiwala of Doon Valley, Western Himalaya are selected for the study. Volume equations, destructive sampling and laboratory analysis are done to estimate the carbon stock in different carbon pools like trees, shrubs, herbs and soils. Considerable variations are observed in terms of carbon stocks in different forest types. In Dry Shiwalik Sal Forest, carbon stock density varied between 129.81 and $136.00MgCha^{-1}$ while in Moist Shiwalik Sal Forest, carbon stock density ranged from 222.29 to $271.67MgCha^{-1}$. Tree species like Shorea robusta, Syzigium cumini, Miliusa velutina, Acacia catechu, and Mallotus philippensis had significant role in carbon sequestration. Shorea robusta had contributed highest in carbon stock due to highest density. Total of 2,338,280.165 Mg carbon stock was estimated in all the forest types.