This review summarizes some recent research into ways of improving the productivity of ruminal fermentation by increasing protein flow from the rumen and decreasing the breakdown of protein that results from the action of ruminal microorganisms. Proteinases derived from the plant seem to be of importance to the overall process of proteolysis in grazing animals. Thus, altering the expression of proteinases in grasses may be a way of improving their nutritive value for ruminants. Inhibiting rumen microbial activity in ammonia formation remains an important objective: new ways of inhibiting peptide and amino acid breakdown are described. Rumen protozoa cause much of the bacterial protein turnover which occurs in the rumen. The major impact of defaunation on N recycling in the sheep rumen is described. Alternatively, if the efficiency of microbial protein synthesis can be increased by judicious addition of certain individual amino acids, protein flow from ruminal fermentation may be increased. Proline may be a key amino acid for non-cellulolytic bacteria, while phenylalanine is important for cellulolytic species. Inhibiting rumen wall tissue breakdown appears to be an important mechanism by which the antibiotic, flavomycin, improves N retention in ruminants. A role for Fusobacterium necrophorum seems likely, and alternative methods for its regulation are required, since growth-promoting antibiotics will soon be banned in many countries.
To examine influence of artificial digestive juice on the antitumor activity of Ganoderma lucidum-A(GL-A), protein-bound polysaccharide from Ganoderma lucidum, we compared the digested protein-bound polysaccharide with undigested one both on immunopotentiating activity and influence of digestive juices. Protein-bound polysaccharide GL-B was obtained by digesting the antitumor component GL-A with artificial digestive Juices in vitro. When GL-A was administered orally to sarcoma 180 tumor-bearing ICR mice, the life prolonging effect was exhibited in a dose dependent manner Not only GL-A but GL-B increased the production of colony forming unit (CFU) to 10- and 8-fold of that of the control, respectively. Both of the protein-bound polysaccharides also showed the secretion of nitric oxide in RAW 264.7 cell lines to 3.5-and 3.7-fold of that of the control, respectively: GL-A activated components of the alternative complement pathway, whereas GL-B did not. In humoral immunity GL-A increased the activity of alkaline phosphatase in differentiated B cells to 3 times and GL-B to 4 times of that of the control. These results showed that the artificial digestive juices had no influence on the antitumor activity of the protein-bound polysaccharide from Ganoderma lucidum and that its immunomodulating activity retained after treatment with artificial digestive juice. And this provides a basis of the protein-bound polysaccharide of Ganoderma lucidum as an peroral anticancer drug.
This study was carried out to evaluate the use of fermented skipjack tuna viscera (FSTV) as an alternative for fish meal in juvenile olive flounder (Paralichthys olivaceus) diets. Lactobacillus bulgaricus was used as a starter for fermentation of skipjack tuna viscera. Four isonitrogenous (49% crude protein) and isocaloric (4 kcal/g DM) diets were formulated to contain graded levels (0, 5, 10, and 15%) of FSTV. Each experimental diet was fed three replicate groups (40 fish per tank) of juvenile flounder (average weight, $3.3\pm0.2$ g) for 5 weeks. At the end of feeding experiment, inclusion of FSTV up to 15% in diets did not affect survival rate (%) and weight gain of fish. Feed efficiency, protein efficiency ratio, protein and lipid retentions of fish fed the diet containing 10% FSTV were higher than those of fish fed the control diet (P<0.05). The values of fish fed the diet containing 15% FSTV were not different from those of fish fed other diets. Whole body lipid content of fish fed the diet containing 10% FSTV was higher than that of fish fed the diet containing 15% FSTV and control diet. The present results indicate that fermented skipjack tuna viscera could partially replace fish meal in juvenile flounder feed, and the inclusion of 10% FSTV may be efficient in improving the feed utilization of fish.
Kim, Nam-Ho;Sadra, Ali;Park, Hee-Young;Oh, Sung-Min;Chun, Jerold;Yoon, Jeong Kyo;Huh, Sung-Oh
Molecules and Cells
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v.42
no.2
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pp.123-134
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2019
Lysophosphatidic acid (LPA) is an endogenous lysophospholipid with signaling properties outside of the cell and it signals through specific G protein-coupled receptors, known as $LPA_{1-6}$. For one of its receptors, $LPA_1$ (gene name Lpar1), details on the cis-acting elements for transcriptional control have not been defined. Using 5'RACE analysis, we report the identification of an alternative transcription start site of mouse Lpar1 and characterize approximately 3,500 bp of non-coding flanking sequence 5' of mouse Lpar1 gene for promoter activity. Transient transfection of cells derived from mouse neocortical neuroblasts with constructs from the 5' regions of mouse Lpar1 gene revealed the region between -248 to +225 serving as the basal promoter for Lpar1. This region also lacks a TATA box. For the region between -761 to -248, a negative regulatory element affected the basal expression of Lpar1. This region has three E-box sequences and mutagenesis of these E-boxes, followed by transient expression, demonstrated that two of the E-boxes act as negative modulators of Lpar1. One of these E-box sequences bound the HeLa E-box binding protein (HEB), and modulation of HEB levels in the transfected cells regulated the transcription of the reporter gene. Based on our data, we propose that HEB may be required for a proper regulation of Lpar1 expression in the embryonic neocortical neuroblast cells and to affect its function in both normal brain development and disease settings.
Tenebrio molitor larvae, as known as edible insects, has advantages of being rich in protein, and has been recognized as a suitable alternate protein source for broiler and pig feed. Moreover, given their ability to biodegrade polystyrene, a major pollutant, Tenebrio molitor larvae has been proposed as an innovative solution to environmental problems. In the present study, we investigated the toxicity of Tenebrio molitor larvae powder (TMlp) ingested with expanded-polystyrene (W/ eps) through in vitro and in vivo experiments. The objective of this study was to determine whether TMlp W/ eps can be applied as livestock alternative protein source. For in vitro experiments, cytotoxicity test was performed to investigate the effects of TMlp-extract on the viability of estrogen-dependent MCF-7 cells. The possibility of estrogen response was investigated in two groups: Expanded-polystyrene-fed (W/ eps) TMlp group and without expanded-polystyrene-fed (W/o eps) TMlp group. For in vivo experiments, The male Sprague-Dawley rats were divided based on the dosage of TMlp administered and oral administration was performed to every day for 5 weeks. A toxicological assessments were performed, which included clinical signs, food consumption, body and organ weights, hematology, serum chemistry, and hematoxylin and eosin staining of liver and kidney. There were no specific adverse effect of TMlp W/ eps-related findings under the experimental conditions of this study, but further studies on both sexes and animal species differences should be investigated. In conclusion, TMlp W/ eps was considered non-toxic and observed to be applicable as an alternative protein source for livestock feed.
Famesyl protein transferase involved in the first step of post-translational modification of $p21^{ras}$ proteins transfers the famesyl moiety from famesyl pyrophosphate to a cysteine residue in $p21^{ras}$ proteins. The enzyme was first purified 30,000-fold from bovine testis by use of 30~50% ammonium sulfate fractionation, DEAE-Sephacel ion exchange chromatography, Sephacryl S-300 gel filtration chromatography, Sephacryl S-200 gel filtration chromatography, and hexapeptide (Lys-Lys-Cys-Val-Ile-Met) affinity chromatography. The molecular weight of the purified enzyme was estimated to be ~100 kDa by gel filtration and SDS-polyacrylamide gels showed two closely spaced bands of ~50 kDa protein. These indicate that the enzyme consists of two nonidentical subunits, a and 13, which have slightly different molecular weights. The enzyme was inhibited by hexapeptide (Lys-Lys-Cys-Val-Ile-Met), which acted as an alternative substrate that competed for famesylation. Kinetic analysis by measuring initial velocities showed that famesyl protein transferase is a very slow enzyme. EDTA-treated famesyl protein transferase showed little activity with $Mg^{2+}$ or $Zn^{2+}$ alone, but required both $Mg^{2+}$ and $Zn^{2+}$ for the catalytic activity.
Kim, Hyun-Sung;Kim, Sang-Joon;Kim, Hui-Jung;Kim, Han-Uk;Ahn, Sang-Joem;Hur, Byung-Ki
Biotechnology and Bioprocess Engineering:BBE
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v.11
no.3
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pp.215-222
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2006
The Lowry method was used in this study to measure protein in Haemophilus influenzae type b (Hib) conjugate vaccines (polyribosylibitol phosphate-tetanus toxoid; PRP-TT) using deoxycholic acid (DOC) to induce protein precipitation. Trichloroacetic acid (TCA) did not induce precipitation adequately from the Hib conjugate bulk and the freeze-dried Hib conjugate product. Its yield was approximately 50%. The matrix structure of Hib conjugate inhibits precipitation by TCA. Although the Lowry method can be carried out without precipitation in Hib conjugate bulk when no residual impurities (adipic acid dihydrazide [ADH], 1-ethyl-3-(3-dimethylamino-propyl) carbodiimide-HCI [EDAC], phenol and cyanogens bromide [CNBr], etc.) are present, it cannot be used for Hib conjugate products that contain sucrose 8.5%, because 8.5% concentration of sucrose enhanced the protein concentration. DOC- and HCl-induced precipitation is an alternative method for evaluating the protein content of the Hib conjugate bulk and the Hib conjugate product. The precipitation was optimal with a final concentrate of 0.1% for DOC at $4^{\circ}C$ and pH 2. This Lowry method, using DOC/HCI precipitation to induce protein precipitation, was confirmed a consistent, reproducible, and valid test for proteins in Hib conjugate bulk and its freeze-dried product.
SR proteins are essential splicing regulators and also modulate alternative splicing events, which function both as redundant and substrate-specific manner. The Drosophila B52/SRp55, a member of the SR protein family, is essential for the fly development in vivo, as deletion of B52 gene results in lethality of animals at the second instar larval stage. Identification of the splicing target genes of B52 thus should be crucial for the understanding of the specific developmental role of B52 in vivo. In this study, we performed whole-genome DNA microarray experiments with a B52- knock-out animal. Analysis of the microarray data not only provided the B52-dependent gene expression signature, but also revealed a larval-stage specific, alternative splicing target gene of B52. Our result thus provides a starting point to understand the essential function of B52 at the organismal level.
Yajing Hao;Ting Cai;Chang Liu;Xuan Zhang;Xiang-Dong Fu
Molecules and Cells
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v.46
no.1
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pp.57-64
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2023
In eukaryotic cells, a key RNA processing step to generate mature mRNA is the coupled reaction for cleavage and polyadenylation (CPA) at the 3' end of individual transcripts. Many transcripts are alternatively polyadenylated (APA) to produce mRNAs with different 3' ends that may either alter protein coding sequence (CDS-APA) or create different lengths of 3'UTR (tandem-APA). As the CPA reaction is intimately associated with transcriptional termination, it has been widely assumed that APA is regulated cotranscriptionally. Isoforms terminated at different regions may have distinct RNA stability under different conditions, thus altering the ratio of APA isoforms. Such differential impacts on different isoforms have been considered as post-transcriptional APA, but strictly speaking, this can only be considered "apparent" APA, as the choice is not made during the CPA reaction. Interestingly, a recent study reveals sequential APA as a new mechanism for post-transcriptional APA. This minireview will focus on this new mechanism to provide insights into various documented regulatory paradigms.
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[게시일 2004년 10월 1일]
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