• 제목/요약/키워드: Alternative initiation codon

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돼지 5품종에 있어서 mtDNA ND2 유전자의 선택적 개시코돈의 특성과 빈도 (Characteristics and Frequencies of Alternative Initiation Codon(AIC) of mtDNA ND2 in Five Pig Breeds)

  • 한상현;조인철;최유림;이종언;고문석;김재환;서보영;이정규;전진태
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제46권6호
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    • pp.903-908
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    • 2004
  • 다양한 포유동물의 미토콘드리아 유전자들에서 선택적 개시코돈(AIC)들이 보고되었다. 본 연구는 돼지 5 품종에서 mtDNA ND2 유전자의 AIC 양상을 분석하였다. 두 종류의 AIC 서열들이 발견되었고, 품종 집단간에서 각기 다른 출현빈도를 보였다. ND2의 methionine codon으로 Large White와 Landrace는 각각 전 개체에서 ATA와 ATT 서열로 확인되었다. 다른 3 품종(Berkshire, Duroc, Hampshire)의 경우는 두 서열이 모두 발생하였으며, 91.9, 21.3, 60.0%의 빈도로 ATA를 보였다. 기존의 연구들에 의하면 중국재래돼지들이 모두 개시코돈 ATA를 갖는다고 보고되어 있다. 미토콘드리아 ND2 단백질의 합성과정에서 AIC가 어떤 영향을 미치는지는 설명할 수 없으나, 본 연구에서 나타난 AIC 다형성과 품종특이적인 분포양상은 돼지의 육종에 있어 모계추적을 위한 분자적 표지인자로서 이용될 수 있을 것을 사료된다.

약독화 Salmonella typhimurium 생백신 균주에서 Bordetella pertussis 의 filamentous hemagglutinin(F HA) (Expression of recombinant Bordetella pertussis filamentous hemagglutinin (FHA) antigen in Live Attenuated Salmonella typhimurium Vaccine Strain)

  • 강호영
    • 생명과학회지
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    • 제11권4호
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    • pp.385-391
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    • 2001
  • Filamentous hemagglutinin (FHA) is considered as an essential immunogenic component for incorporation into acellular vaccines against Bordetella pertussis, the causative agent of whooping cough. Classically, antipertussis vaccination has employed an intramuscular route. An alternative approach to stimulate mucosal and systemic immune responses is oral immunization with recombinant live vaccine carrier strains of Salmonella typhimurium. An attenuated live Salmonella vaccine sgrain($\Delta$cya $\Delta$crp) expressing recombinant FHA(rFHA) was developed. Stable expressionof rFHA was achieved by the use of balanced-lethal vector-host system. which employs an asd deletion in the host chromosome to impose in obligate requirement for diaminopimelic acid. The chromosomal $\Delta$asd mutation was complemented by a plasmid vector possessing the asd$^{+}$ gene. A 3 kb DNA fragment encoding immuno dominant regionof FHA was subcloned in-frame downstream to the ATG translation initiation codon in the multicopy Asd$^{+}$ pYA3341 vector to create pYA3457. Salmonella vaccine harboring pYA3457 expressed approximately 105kDa rFHA protein. The 100% maintenance of [YA3457 in vaccine strain was confirmed by stability examinations. Additionally, a recombinant plasmid pYA3458 was constructed to overpress His(8X)-tagged rFHA in Essherichia coli. His-tagged rFHA was purified from the E. coli strain harboring pYA3458 using Ni$^{2+}$-NTA affinity purification system.>$^{2+}$-NTA affinity purification system.

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돼지 Duroc 품종에서 미토콘드리아 유전체 서열의 특성과 집단의 유전적 다양성 (Complete Mitochondrial Genome Sequence and Genetic Diversity of Duroc Breed)

  • 조인철;한상현;최유림;고문석;이정규;이준헌;전진태
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제46권6호
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    • pp.937-946
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    • 2004
  • Duroc 품종은 돼지 사육에 있어 산육성과 육질 향상을 위해 이용되고 있다. 본 연구는 육종에 많이 이용되는 Duroc 품종의 모계 특이적인 서열의 검색과 계통유전학적 유연관계의 정립을 위하여 미토콘드리아 유전체의 전체 염기서열을 결정하고 집단 내 다형성을 조사하였다. mtDNA 전체 서열의 길이는 16,584-bp 이고, D-loop과 tRNA, rRNA 유전자 영역에서는 삽입/결실이 확인되었다. 4개의 coding gene (COⅡ, COⅢ, ND3, ND4)에서 불완전한 종결코돈을, ND4L과 ND2 유전자는 선택적 개시코돈 양상을 보였다. Duroc 집단에 대한 분석 결과 조절영역에서의 특이적인 11-bp 중복 단위가 일부 개체(15.2%)에서 발견되었고, ND2의 개시코돈과 CYTB 유전자에서도 다형현상을 보였다. 각각의 유전자 영역에서의 다형성은 서로 연관되어 있었고, 그 결과 Duroc 집단은 크게 두 가지 haplotype으로 구분되었다. 계통수에서 Duroc mtDNA 서열은 유럽계열 cluster에 위치하였으나, haplotype 분석과 기존에 연구결과들을 종합해 보면 Duroc 품종은 여러 모계선조 집단에서 기원한 것으로 보이며, 유럽과 아시아 계열 모두가 품종 형성에 이용된 것으로 사료된다된 것으로 사료된다.

대한민국내 주요 돼지 품종의 순종 식별을 위한 품종특이 DNA marker의 활용 (Application of Breed-specific DNA Markers for the use of Identifying Major Pure Pig Breeds Maintained in Korea)

  • 서보영;김재환;박응우;임현태;조인철;김병우;오성종;정일정;이정규;전진태
    • Journal of Animal Science and Technology
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    • 제46권5호
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    • pp.735-742
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    • 2004
  • 본 연구는 돼지의 품종특이 DNA marker를 이용하여 Large White, Landrace, Duroc의 순종 판별을 가능하게 하기 위해서 실시하였다 순종 판별을 위해 현재 알려져 있는 KIT과 돼지내의 모색과 밀접한 연관성이 있는 MCIR 그리고 mitrochondrial DNA상에서 종 특이적인 현상을 보이는 D-loop 지역의 11-bp 중복과 ND2 유전자의 개시 codon 변이를 이용하였다 품종간의 판별을 위해 KIT 유전자 exon17의 splicing 지역 변이를 활용하여 백색종과 유색종을 분류 하였다. MCIR 유전자의 (N121D)변이를 이용하여 유색종들로부터 Duroc 종이 분류되었다. 그러나 Duroc 이외의 유색종들 간에는 특이한 변이가 발견되지 않아 이 이상의 분류는 불가능 하였다 D-loop 지역의 11-bp 중복현상과 ND2 개시 codon의 변이에 의해 백색종인 Landrace(11-bp비중복과 ATT)종과 Large White(llbp 중복과 ATA) 종을 분류할 수 있었다. 결론적으로 본 연구에서 설정된 판별방법을 통하여 Landrace, Large White와 Duroc 종의 순종 판별이 완벽히 가능함을 입증하였다.

7, 12-dimethylbenz[a]anthracene(DMBA)로 유발된 햄스터 협낭암에서 chlorophylln의 암예방효과에 관한 실험적 연구 (AN EXPERIMENTAL STUDY ON THE CHEMOPREVENTIVE EFFECT OF CHLOROPHYLLIN IN HAMSTER CHEEK POUCH TUMOR INDUCED BY 7, 12-DIMETHYLBENZ[A]ANTHRACENE)

  • 윤규호
    • Journal of the Korean Association of Oral and Maxillofacial Surgeons
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    • 제26권2호
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    • pp.137-145
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    • 2000
  • Carcinogenesis is a multi-stage process that generally consists of at least three steps; initiation, promotion, and progression. If one of these carcinogenic steps were suppressed or delayed, the cancer could be prevented. Cancer chemoprevention is defined to be inhibition or reversal of the carcinogenic process by the specific chemical agents and is a novel approach to cancer management alternative to conventional chemotherapy. Chlorophylln(CHL), a water-soluble derivative of chlorophyll, containing sodium and copper, has been known to be strong antimutagen in several test systems, but its mechanism of antimutagenic action is unknown. In the present experiment, the possibility of CHL as chemopreventive drugs on 7,12-dimethylbenz[a]anthracene(DMBA)-induced hamster buccal pouch carcinogenesis was investigated by mutagenicity test, carcinogenicity test, and frequency or spectrum of H-ras mutations in the both of DMBA-induced and chlorophylln-pretreated-DMBA induced tumor by polymerase chain reaction and non-isotopic restriction fragment length polymorphism. The treatment of CHL reduced the yields and multiplicity of the 0.5% DMBA-induced tumor, 86% to 62.5% and $3.7{\pm}0.6$ to $1.4{\pm}0.3$, respectively. The occurrence of histidine revertant by $20{\mu}mole$ DMBA was inhibited 25.6 to 81.7% by 1 to $5{\mu}M$ CHL in a dose-dependent manner. The mutation rates of H-ras gene in DMBA-induced and CHL-pretreated-DMBA induced tumor were 96%, 94% of which the most mutations were in codon 12/13. These results suggest that CHL inhibits the carcinogenic action of DMBA by the formation of complex between CHL and DMBA or the inhibition of the activation of DMBA in vivo. But CHL did not affect the mutation rates or its spectrum in already formed tumor.

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