• 제목/요약/키워드: Allozyme variation

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Genetic Variation and Population Structure of Crepidiastrum lanceolatum (Compositae)

  • Huh, Man-Kyu;Choi, Joo-Soo
    • Journal of Life Science
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    • 제12권1호
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    • pp.9-13
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    • 2002
  • Crepidiastrum lanceolatum ($H_{OUTT}$) $N_{AKAI}$ (Compositae) is distributed in East Asia including Korea. Genetic diversity and population structure of six C. lanceolatum populations in Korea and two populations in Japan were determined using genetic variation at 19 allozyme loci. The percent of polymorphic loci within the enzymes was 42.1%. Genetic diversity at the species level and at the population level was low (Hes : 0.077; Hep : 0.068, respectively), where-as the extent of the population divergence was relatively low ($G_{ST}$ : 0.093). One of the most striking features of this study was the more significant difference within populations than among populations. An indirect estimate of the number of migrants per generation (Nm : 2.44) indicated that gene flow was moderate among eight populations of the species. In addition, analysis of fixation indices revealed a slight heterozygosity deficiency in some populations and at some loci. Narrow geographic ranges, short-lived perennial herbaceous, and small population sizes are mainly associated with the low level of genetic variation.n.

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한국 내 국부적으로 분포하는 지리사초의 알로자임 변이와 집단구조 (Allozyme Variation and Population Structure of Carex okamotoi (Cyperaceae), a Korean Endemic Species)

  • 허만규;최주수
    • 생명과학회지
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    • 제20권8호
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    • pp.1151-1158
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    • 2010
  • 한국 내 국부적으로 분포하는 지리사초(Carex okamotoi)의 14집단에 대해 유전적 다양성과 집단구조를 실시하였다. 이 식물은 세 산맥(태백산맥, 소백산맥 노령산맥)의 고지대(700~1,500 m)에 제한적으로 자생한다. 다형성을 나타내는 대립유전자좌위는 40.0%였다. 종 수준과 집단 수준에서 유전적 다양성은 낮았으며($H_{ES}$=0.106; $H_{EP}$=0.094), 집단간 분화도 낮았다($G_{ST}$=0.082). 14집단에 대한 임의 교배로부터 산출한 편차는 0.238이였다. 간접적으로 산출한 세대간 이주하는 개체들의 수는 2.78이였다(Nm=2.78). 고정지수 분석에서 이형접합체의 실질적 결핍이 일부 집단과 대립유전자좌위에서 나타났다. 집단간 유전적 동질성은 평균 0.986이였다.

붉은토끼풀의 유전적 변이와 집단구조 (Genetic Variation of Alien Invasive Red Clover (Trifolium pratense) in Korea)

  • 허만규;정경태;정영기
    • 생명과학회지
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    • 제15권2호
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    • pp.273-278
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    • 2005
  • 붉은토끼풀(Trifolium pratense)은 전세계적으로 분포하는 근연성 초본종이다. 붉은토끼풀은 유럽 또는 북미에서 약 60년전 한국으로 도입되었다. 전분 젤 전기영동을 사용하여 한국내 분포하는 붉은토끼풀의 유전적 변이와 집단구조를 분석하기 위해 사용되었다. 붉은토끼풀에서 높은 유전적 다양성이 발견되었다. 19개 대립유전좌좌위중 10개$(52.6\%)$는 다형현상을 나타내었다. 유전적 다양성은 0.220이었다. 유성생식, 높은 다산성, 집단형성화 과정이 높은 유전적 다양성을 유지하는데 기여하는 것으로 제시하였다. 한국의 붉은토끼풀의 다양도(0.220)는 북미의 붉은토끼풀 다양도(0.285)보다 낮았다. 이는 북미의 일부 집단에서 유입되었거나 창시자효과 때문일 것으로 사료된다. 간접적 평가를 통한 세대당 이주하는 수는 4.20이였고, 유전자 유동은 한국집단에서 높게 유지되고 있음을 시사한다.

한국내 삽주의 유전적 다양성과 집단구조 (Genetic diversity and population structure of Atractylodes japonica $K_{OIDZ}.$ in Korea)

  • 허만규;성정숙;박춘근;박희운;성낙술;문성기;허홍욱
    • 한국약용작물학회지
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    • 제10권1호
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    • pp.5-11
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    • 2002
  • 한국내 분포하는 다년생 초본인 삽주 집단의 유전적 다양도와 집단구조를 조사하기 위해 전분 전기영동으로 분석하였다. 15 대립유전자좌위당 9개 좌위에서 다형현상(60.0%)을 보였으며, 유전적 다양도는 종수준에서 0.144로 높은 반면 집단수준이 이보다 약간 낮았다. 삽주의 유전적 다양도는 대부분 집단내에 존재하였고 유사한 생활양식을 가진 다른 식물종에 비해 높았다. 그 이유로는 유성생식, 다년생, 다산 등에 기인한다. 집단간 분화는 약 13%였고 지리적 거리와 유전적 거리의 상관은 높았다(r=0.65). 그럼에도 불구하고 일부 격리된 집단은 유효집단크기를 가지지 못하여 이형접합체의 결여가 유의성을 보여 다양도가 높은 집단의 보존이 요망된다.

한국 특산식물 변산바람꽃(Eranthis byunsanensis)의 유전적 변이 (Genetic variation in populations of the Korean endemic Eranthis byunsanensis (Ranunculaceae))

  • 소순구;이병순;박기룡
    • 식물분류학회지
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    • 제42권4호
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    • pp.253-259
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    • 2012
  • 한국특산식물이며 희귀식물인 변산바람꽃(Eranthis byunsanensis)의 보전을 위해 5개 자생지 집단을 대상으로 9개의 allozyme marker를 이용하여 유전적 다양성과 구조를 분석하였다. 변산바람꽃 집단의 대립 유전자의 수(A)는 2.4개, 다형적 유전좌위의 비율(P)은 90.0%, 이형접합자의 평균 기대치($H_E$)는 0.311을 나타내어 분포 역이 넓은 특산식물과 유사하거나 다소 높은 수준의 유전적 다양도를 유지하는 것으로 나타났다. 유전적 구조분석 결과 집단간 $F_{IS}$는 양의 값을 나타내었고 집단간 유전적 분화도는 낮은 결과(0.131)를 보였다. 집단간 높은 유전적 변이, 낮은 유전적 분화, 이형접합자의 결여양상은 이 종이 최근 고립되어 서식지의 단편화를 경험했을 가능성을 제시하며 유전적 확산을 막아 집단의 근친교배율이 증가한 것으로 판단된다. 현재 마이산과 나로도 자생지는 집단의 작은 크기와 종의 생존을 위협하는 인간활동에 의해 매우 취약한 상태이다. 따라서 유전적 변이가 다소 높고 분화가 적은 변산바람꽃 집단의 합리적 보전을 위해서는 특정한 집단에 대한 보전의 우선권을 설정하는 것 보다 전체 집단을 지속적으로 유지하고 근친교배율을 낮추기 위한 노력이 요구된다.

각시족도리풀(Asarum misandrum)의 유전적 다양성 및 집단 구조 (Genetic variation and population structure of Asarum misandrum (Aristolochiaceae) in Korea)

  • 소순구;김무열
    • 식물분류학회지
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    • 제43권3호
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    • pp.181-187
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    • 2013
  • 한국과 일본에만 한정 분포하는 각시족도리풀(Asarum misandrum) 4개 집단의 자생지 상태와 합리적인 보전전략의 수립을 위하여 7개의 allozyme marker를 이용하여 유전적 다양성과 구조를 분석하였다. 각시족도리풀 집단의 대립 유전자의 수(A)는 2.05개, 다형적 유전좌위의 비율(P)은 71.4%, 이형접합체의 평균 기대치($H_E$)는 0.294를 나타내어 분포 역이 넓고 주로 내륙에 분포하는 특산식물과 유사하거나 다소 높은 수준의 유전적 다양도를 유지하고 있는데, 그 이유는 자가수분이 가능하지만 타가수정을 주로 하기 때문인 것으로 판단된다. 유전적 구조분석 결과 집단간 $F_{IS}$는 양의 값을 나타내었고 집단간 유전적 분화도는 매우 낮은 결과(0.112)를 보였다. 각시족도리풀의 자생지가 비록 적정 수준의 유전적 다양도을 보이고 있지만, 한국과 일본의 남쪽지방에만 한정분포하는 특징, 불연속적이고 분산되어있는 자생지의 상태, 대부분의 자생지에서 적은 개체가 나타나며 특이하고 희귀한 꽃 때문에 남획될 가능성이 높다는 점 등은 이 식물의 보전을 위한 관심을 필요로 한다. 각시족도리풀은 최근에 기록되어 현재 희귀식물로 지정된 종은 아니지만 보전적 가치가 높다고 판단되며 이 종의 보전을 위해 종 생물학적 정보를 수집하고 유전적 변이의 유지기작을 포함한 합리적인 보전전략의 수립이 요구된다.

Genetic Variation and Population Structure of Alder (Alnus hirsuta : Betulaceae) in Korea

  • Park, Joo-Soo;Huh, Man-Kyu
    • Journal of Life Science
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    • 제10권1호
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    • pp.14-19
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    • 2000
  • Variation at 25 allozyme loci in Korean wateralder (Alnus hirsuta Rupr.) from nine distinct populations was measured to estimate the amount and pattern of genetic diversity and population structure. The mean genetic diversity within population was 0.166. Korean alder populations have slightly high levels of genetic diversity compared to those present in associated temperature-zone species and two Canadian alder species. Among population s genetic differentiation accounted for an significant 9% of the total variation. High gene flow(Nm=2.63) was observed. Analysis of fixation indices, calculated for all polymorphic loci in each population, showed a substantial deficiency of heterozygotes relative to Hardy-Weinberg expectations. The mean GST value A. hirsuta in Korea (GST = 0.087) is similar to those of A. rogosa in Canada (GST = 0.052). These low values of GST in two countries. reflecting little spatial genetic differentiation, may indicate extensive gene flow (via pollen and/or seeds) and/or recent colonization. These factors reduce the effect of geographic isolation of breeding and the chance for genetic divergence. A pattern of increasing is observed with increasing rainfall per year. Regression analysis indicates that 54% (F = 4.67) of the variability observed can be explained by this relationship.

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Genetic Variation and Conservation of the Endangered Species Cotoneaster wilsonii (Rosaceae) from Ulleung Island

  • Park, Jiwon;Lee, Junsoo;So, Soonku;Kim, Muyeol
    • 식물분류학회지
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    • 제39권3호
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    • pp.125-129
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    • 2009
  • The genetic diversity plays a significant role in determining a species' survival and perseverance. Endangered species often lack genetic variation, which makes them vulnerable to numerous dangers of extinction including selection, genetic drifts and human interference. Knowing an endangered species' genetic background greatly enhances conservation efforts since it reveals why, what and how to conserve that species. Cotoneaster wilsonii is an endangered plant species endemic to Ulleung island, but not enough genetic research has been done on this taxon for its effective conservation plans. In this study, three populations of C. wilsonii in Ulleung island underwent allozyme analysis through starch gel electrophoresis. 10 loci were analyzed and F-statistics was calculated. Overall data indicated that C. wilsonii possessed low genetic diversity with intense inbreeding, heterozygote deficiency and low differentiation among populations. These results implied that C. wilsonii was recently introduced to the Ulleung island from ancestor species, and did not have much time to differentiate. Current status of C. wilsonii habitats is very fragile and vulnerable, with increasing tourism constantly threatening the species' survival. It is very likely that C. wilsonii will become extinct in near future unless organized conservation protects its populations and genetic diversity.

돌나물(돌나물과)집단의 유전적 변이: 남부지방 집단의 기원에 대한 암시 (Notes on genetic variation in Sedum sarmentosum (Crassulaceae): Implications for the origin of southern Korean populations)

  • 정미윤;;정명기
    • 식물분류학회지
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    • 제46권4호
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    • pp.371-377
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    • 2016
  • 다년생 다육식물인 돌나물은 한반도 중남부에 흔하게 자란다. 이 종은 중국 고유종이며, 아마도 식용과 약용 때문에 한반도에 도입되었을 것이라 추정된다. 만약 식물이 단일 공급원에서 한반도로 도입되었다면, 저자들은 남한집단에서 유전적 변이가 없거나 낮을 것으로 기대할 수 있다. 이 한두 곳에서 도입되었다면 알로자임 변이가 거의 없을 것으로 예상된다. 다른 한편으로 만약 식물종이 여러 곳에서부터 도입되었다면, 저자들은 이런 종이 높은 수준의 유전적다양도를 유지하고 있을 것이라고 예측된다. 어떤 가설이 더 타당한지를 검증하기 위해, 저자들은 한반도 남부지방 10곳 집단을 대상으로 알로자임 변이를 조사하였다. 저자들은 조사된 15개의 모든 알로자임 유전좌위에서 변이를 발견할 수 없었다. 그러나 두 동속종(기린초및 바위채송화)과 두 관련 종(둥근잎꿩의비름과 세잎꿩의비름)은 중간 정도 및 높은 수준의 유전적 다양성을 유지하고 있음을 알 수 있었다($H_e$ 값이 각각 0.203, 0.144, 0.201 및 0.204). 저자들은 (한국남부지방, 자생지 및 다른 귀화된 돌나물이 불염이기에) 남부지역에 생육하는 돌나물은 소수의 클론 분주체가 한번 도입된 후 무성적 번식에 의해 넓게 귀화되었을 것이라고 제안한다.