• 제목/요약/키워드: Agricultural Cluster

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RAPD를 이용한 용담의 유전적 유사도 분석 (Analysis Genetic Similarity of Gentiana scabra var. buergeri by Randomly Amplified Polymorphic DNA)

  • 이해경;이미경;문창식;방재욱
    • 한국약용작물학회지
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    • 제4권3호
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    • pp.224-230
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    • 1996
  • 서철재래종, 내장산 수집종, 대둔산 수집종, 거제도 수집종, 진부재래종 및 일본 도입종 등 계통의 용담을 대상으로 RAPD 분석을 통한 유사도 분석을 수행한 결과 적용한 20가지의 10-merprimer 중 8가지에서 54개의 증폭된 DNA 절편을 얻었다. 그 중 53.7%에 해당하는 29개의 band가 다형현상을 보였으며, 9.3%에 해당하는 5개의 band는 모든 계통에서 공통적으로 나타났고, 37%인 20개의 band가 특이성을 보였다. 특이성을 보이는 band들은 내장산 수집종에서 2개, 거제도 수집종에서 1개, 진부재래종에서 11개, 일본 도입종에서 6개가 관찰되었다. 유전적 유사도의 분석결과 서천재래종, 내장산 수집종, 대둔산 수집종 및 거제도 수집종이 0.76-0.87의 유사도를 보여 한 집단으로 구분되었으며, 이 집단과 진부재래종 및 일본 도입종 사이의 유사도는 0.23-0.34로 각 각 다른 집단으로 구별되었다. 또한 진부재래 종과 일본 도입 종 사이의 유사도는 0.41로 나타나 서로 구분되었다.

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Comparison of Faecal Microbial Community of Lantang, Bama, Erhualian, Meishan, Xiaomeishan, Duroc, Landrace, and Yorkshire Sows

  • Yang, Lina;Bian, Gaorui;Su, Yong;Zhu, Weiyun
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제27권6호
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    • pp.898-906
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    • 2014
  • The objective of this study was to investigate differences in the faecal microbial composition among Lantang, Bama, Erhualian, Meishan, Xiaomeishan, Duroc, Landrace, and Yorkshire sows and to explore the possible link of the pig breed with the gut microbial community. Among the sows, the Meishan, Landrace, Duroc, and Yorkshire sows were from the same breeding farm with the same feed. Fresh faeces were collected from three sows of each purebred breed for microbiota analysis and volatile fatty acid (VFA) determination. Denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE) analysis revealed that samples from Bama, Erhualian, and Xiaomeishan sows, which from different farms, were generally grouped in one cluster, with similarity higher than 67.2%, and those from Duroc, Landrace, and Yorkshire sows were grouped in another cluster. Principal component analysis of the DGGE profile showed that samples from the foreign breeds and the samples from the Chinese indigenous breeds were scattered in two different groups, irrespective of the farm origin. Faecal VFA concentrations were significantly affected by the pig breed. The proportion of acetate was higher in the Bama sows than in the other breeds. The real-time PCR analysis showed that 16S rRNA gene copies of total bacteria, Firmicutes and Bacteroidetes were significantly higher in the Bama sows compared to Xiaomeishan and Duroc sows. Both Meishan and Erhualian sows had higher numbers of total bacteria, Firmicutes, Bacteroidetes and sulphate-reducing bacteria as compared to Duroc sows. The results suggest that the pig breed affects the composition of gut microbiota. The microbial composition is different with different breeds, especially between overseas breeds (lean type) and Chinese breeds (relatively obese type).

Classification of elderly households based on diet-related style and analysis of their characteristics

  • Haewoon Oh;Uhn-Soon Gim
    • 농업과학연구
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    • 제49권4호
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    • pp.1015-1031
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    • 2022
  • The objectives of this study were to classify the types of elderly households and to compare the characteristics of their dietary lifestyle. Panel data surveyed by Korea Rural Economic Institute (KREI) for Food Purchase Attitudes over three years (2019 - 2021) were utilized for the analysis. Through a factor analysis, five common factors were extracted out of 19 basic variables related to dietary style, which indicate two kinds of consumer competency index (safe diet, traditional diet) and three kinds of purchase frequency (healthy food, meat & fish, fresh seafood). Applying the cluster analysis method, by using socioeconomic variables along the five common factors, elderly households aged 60 or older were grouped into four types. As a result, Type 1 elderly households accounted for 50.8%, Type 2 for 16.2%, Type 3 for 27.8%, and Type 4 for 5.2% out of all 870 elderly households. Type 1 is characterized as a low-income vulnerable class with a poor diet, Type 2 as a middle-income class with a healthy food-oriented diet, whereas Type 3 was classified as a middle-income class with a meat-oriented diet, and Type 4 as a high-income class with diverse dietary culture. It is necessary to expand the agri-food voucher pilot project to the entire country and also increase the monthly subsidy for the Type 1 elderly households. Implementing community kitchen projects for elderly single-person households, promoting senior internships by providing incentives to companies that employ retirees, the provision of education by local governments on a safe and balanced diet for Types 2 and 3, and the promotion of an elderly-friendly social environment are also recommended.

'캠벨얼리' 포도의 지경솎기에 따른 작업 절감 효과 및 과실 특성 (Laborsaving Effect and Fruit Characteristics of Grape ‘Campbell Early’ According to Pedicel Thinning)

  • 김수진;박서준;고상욱;정성민;허윤영;남종철;박교선
    • 한국자원식물학회지
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    • 제28권2호
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    • pp.290-295
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    • 2015
  • 포도 송이다듬기는 많은 노동력이 필요하므로 노동력을 감소시킬 수 있는 새로운 송이다듬기 기술을 개발하기 위하여 연구를 수행하였다. 포도의 송이다듬기 기술은 지경솎기가 알솎기에 비하여 작업효율성이 6.7배 높은 것으로 나타났다. 과실품질은 지경솎기 및 알솎기가 무처리구보다 과방과 과립수가 적지만 가용성 고형물은 높고, 산도는 낮게 나타났으며 압상률도 적은 것으로 나타났다. 송이다듬기에 의한 포도의 송이 품질 균일도를 조사하기 위해 송이의 기부, 중간 및 선단 부분의 가용성 고형물 함량과 산도를 측정한 결과 350~450 g의 과방중을 가진 포도송이가 송이 내위치에 따른 품질의 차이가 나타나지 않아 적합한 것으로 판단되었다.

ITS 영역의 염기서열을 이용한 먹물버섯류 및 주름버섯 유사 복균류와의 계통학적 유연관계 (Phylogenetic Relationships of Coprinoid Taxa and an Agaric-like Gastroid Taxon Based on the Sequences of Internal Transcribed Spacer (ITS) Regions)

  • 박동석;고승주;류진창
    • 한국균학회지
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    • 제27권6호
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    • pp.406-411
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    • 1999
  • 먹물버섯류 및 주름버섯 유사 균류의 계통학적 유연 관계를 분석하기 위해 계통분류학적 정보를 지니고 있는 rDNA의 ITS(17S, 5.8S, 25S일부 포함)의 염기서열을 밝히고 이들 자료를 근거로 하여 형태적 분류 체계와 비교분석을 하였다. 이번 조사된 종은 총 14종으로서 먹물버섯속 균류 8종, 눈물버섯속 균류 1종, 소똥버섯과 2종, 주름버섯과 1종, 독청버섯과 1종, 복군류 1종이 포함되었다. 종간 염기서열 상동성은 $38.7{\sim}77.2%$였다. 조사된 균류는 크게 4개의 그룹을 형성하였다. 그룹 I에 C. micaceus, C. radians, C. disseminatus, Psathyrella candolleana 등이 포함되었고, 그룹 II에는 C. cinereus, C. echinosporus, C. rhizophorus, C. atramentarius이 조사되었다. 한편, 먹물버섯속 균류의 기준종인 C. comatus는 다른 먹물버섯 그룹들과 분지의 신뢰도가 전혀 없는 것으로 조사되었고 그룹 III에서 주름버섯 유사 복균류인 Podaxis pistillaris 및 신령버섯 Agaricus blazei와의 분지 신뢰도는 87과, 57을 각각 나타내었다. 한편, 눈물버섯속 균류는 그룹 II에 포함되는 결과를 나타내어 형태적 분류체계와 상이한 결과를 도출하였고, 주름버섯 유사복균류인 Podaxis pistillaris는 다른 기타 주름버섯목 균류보다도 C. comatus와 더 밀접한 유연 관계를 나타내어 이들 주름버섯 유사 복균류(secotioid taxa)는 주름버섯목 균류에서 파생된 것임을 확인할 수 있었다. 기준 종으로 알려진 C. comatus는 발생학적 측면에서 다른 절에 있는 먹물버섯 균류와 다른 점이 있음을 이번 조사에서 확인할 수 있었으며 먹물버섯속(屬)의 기준 종은 재 설정되어 할 것으로 사료되었다. 또한 기존의 분류학자들이 주장해온 단일 진화론은 조사된 여러 결과와 비교해 볼 때 적어도 paraphyletic이 거나 polyphyletic일 가능성은 높은 것으로 확인되었다.

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토양 및 지형학적 특성에 따른 영산강유역의 소유역 분류 (Morphological Classification of Unit Basin based on Soil & Geo-morphological Characteristics in the yeongsangang Basin)

  • 손연규;현병근;정석재;허승오;정강호;서명철;하상건
    • 한국토양비료학회지
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    • 제40권4호
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    • pp.262-268
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    • 2007
  • 농업 비점오염원으로부터의 수질 보전이나 수자원 관리는 농업적 관리뿐만 아니라 수질관리 및 수자원 관리를 위해서도 유역단위 특히, 소유역의 토양특성을 포괄하는 단위로 체계적으로 분류할 필요성이 있다. 우리나라의 남서쪽에 위치한 영산강유역의 50개 소유역을 대상으로 토양도, 지형도, 하천도 및 유역도를 이용하여 만곡도, 산림의 비율, 평탄지의 비율, 다른 소유역으로부터의 유입 여부 등 토양학적으로 중요한 4개의 특성을 이용하여 군집분석을 수행하였다. 그 결과 5개의 군으로 구분할 수 있었으며, 이 구분의 적합도를 검정하기 위하여 Mantel test를 한 결과 r = 0.83으로 나타나 적합하다는 결론을 얻었다. 이와 같이 토양과 지형특성을 포괄하는 소유역의 분류 및 유사성에 따른 그룹화는 농업에서의 최적영농관리나 오염물질에 따른 수질관리, 수문모형의 적용성 확대 및 수자원 관리에 합리적 유용성을 제공할 것이며 체계적 관리의 밑바탕이 될 것이다.

Association of the Porcine Cluster of Differentiation 4 Gene with T Lymphocyte Subpopulations and Its Expression in Immune Tissues

  • Xu, Jingen;Liu, Yang;Fu, Weixuan;Wang, Jiying;Wang, Wenwen;Wang, Haifei;Liu, Jianfeng;Ding, Xiangdong;Zhang, Qin
    • Asian-Australasian Journal of Animal Sciences
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    • 제26권4호
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    • pp.463-469
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    • 2013
  • Cluster of differentiation 4 (CD4) is mainly expressed on $CD4^+$ T cells, which plays an important role in immune response. The aim of this study was to detect the association between polymorphisms of the CD4 gene and T lymphocyte subpopulations in pigs, and to investigate the effects of genetic variation on the CD4 gene expression level in immune tissues. Five missense mutations in the CD4 gene were identified using DNA pooling sequencing assays, and two main haplotypes (CCTCC and AGCTG) in strong linkage disequilibrium (with frequencies of 50.26% and 46.34%, respectively) were detected in the population of Large White pigs. Our results indicated that the five SNPs and the two haplotypes were significantly associated with the proportions of $CD4^-CD8^-$, $CD4^+CD8^+$, $CD4^+CD8^-$, $CD4^+$ and $CD4^+/CD8^+$ in peripheral blood (p<0.05). Gene expression analysis showed the mRNA level of the CD4 gene in thymus was significantly higher than that in lymph node and spleen (p<0.05). However, no significant difference was observed between animals with CCTCC/CCTCC genotype and animals with AGCTG/AGCTG genotype in the three immune tissues (p>0.05). These results indicate that the CD4 gene may influence T lymphocyte subpopulations and can be considered as a candidate gene affecting immunity in pigs.

국내 옥수수 품종에 따른 기능성 성분의 자연 변이 분석 (Natural variation of functional components between Korean maize types)

  • 정정원;김명지;;김은하;박수윤;오태영;고영삼;김문종;이상구;오선우;박현민
    • Journal of Applied Biological Chemistry
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    • 제66권
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    • pp.484-491
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    • 2023
  • 옥수수는 전세계적으로 다양한 형태로 소비되는 3대 식량작물로, 영양성분은 대부분은 전분으로 구성되어 있지만, 다량의 기능성 성분도 포함되어 있다. 옥수수는 형태적으로 찰옥수수, 단옥수수, 종실옥수수로 나뉘는데, 각 품종마다 쓰임이 다르기 때문에, 영양성분에서도 차이가 나타난다. 본 연구는 옥수수의 기능성 성분 함량을 분석하고 환경적 요인을 고려하여 자연변이 데이터를 생산하기 위해 수행하였다. 국내 3개지역(수원, 대구, 홍천)에서 재배한 옥수수 3가지 형태의(찰옥수수, 단옥수수, 종실옥수수) 시료를 수집하고, HPLC 및 GC-TOF-MS를 이용하여 성분을 분석하였다. ANOVA 및 다변량 통계분석, Pearson 상관분석을 통해, 형태별 그룹으로 비교하였을 때, 총 32개의 성분 항목 중 28개의 성분 항목이 유의적 차이를 보였으며(p<0.05), 지역별 그룹으로 비교한 결과, 15개의 성분이 유의적 차이를 보였다. 다변량 분석결과, 지역별보다 형태별로 군집 구분이 뚜렷하게 형성되었는데, 형태별 군집 형성 주요하게 기여한 성분은 α-carotene, lutein과 δ-tocopherol이었다. 본 연구에 따르면, 옥수수 기능성 성분은 환경적 요인보다 유전적 요인에 의해 영향을 더 많이 받는 것으로 사료된다. 자연변이 데이터는 옥수수 기능성 소재 연구분야 및 생명공학작물의 식품학적 안전성 평가시 기초자료로 활용될 수 있다.

Genomic Differentiation Among Oyster Mushroom Cultivars Released in Korea by URP-PCR Fingerprinting

  • Kang, Hee-Wan;Park, Dong-Suk;Park, Young-Jin;You, Chang-Hyun;Lee, Byoung-Moo;Eun, Moo-Yong;Go, Seong-Joo
    • Mycobiology
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    • 제29권2호
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    • pp.85-89
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    • 2001
  • URP primers of 20 mer derived from repetitive sequence of rice were used to assess genetic variation of oyster mushroom consisting of 10 cultivars of Pleurotus ostreatus, two cultivars of P. florida and two cultivars of P. sajor-caju which were registered in Korea. URP2F and URP38F primers produced cultivar-specific PCR polymorphic bands in the Pleurotus species. UPGMA cluster analysis using the URP-PCR data showed that 14 Pleurotus cultivars are genetically clustered into large three groups. The URP-PCR data provided important information for more efficient breeding strategies of Pleurotus cultivars.

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Ultrastructural Aspects of the Mixed Infections with Turnip mosaic virus and Ribgrass mosaic virus in Oriental Cabbage

  • Kim, Jeong-Soo;Cho, Jeom-Deog;Park, Hong-Soo;Kim, Kyung-Soo
    • The Plant Pathology Journal
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    • 제17권4호
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    • pp.201-204
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    • 2001
  • Ultrastructural observation was conducted for the cells of oriental cabbage, Brassica campestris ssp. pekinensis 'Chungawang', inoculated simultaneously with Turnip mosaic virus (TuMV-ACT2-4vq) and Ribgrass mosaic virus (RMV-Ca1dn2) which were known as major destructive viruses of oriental cabbage in Korea. In cells infected with RMV alone, the virus particles were located as bundle or scattering in cytosols and vacuoles, which were typical ultrastructures of tobamovirus. Vessels of xylem were compacted with RMV particles. The cells infected only with TuMV had the cluster of virus particles scarcely and the typical potyvirus inclusions of scrolls, pinwheels, tubes and laminated aggregates in cytosols. The TuMV particles were jammed lineally between tonoplasts. In double infection, the two unrelated viruses of TuMV-ACT2-4vq and RMV-CA1dn2 were located together in a cell, and typical properties of each virus were also observed. The potyvirus inclusions and the tobamovirus particles were mixed entirely in cytoplasm. The virus particles of RMV wre presented strikingly near and in the center of potyvirus inclusions. In vascular cells, the tobamovirus particles were located abundantly than those in single infection. The potyvirus inclusions were embedded in the cluster of RMV particles in phloem parenchyma cells and the vascular elements were degenerated severely.

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