• 제목/요약/키워드: Affinity chromatography

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Purification of YPTP1 with Immobilized Phosphonomethylphenylalanine-Containing Peptide as an Affinity Ligand

  • Han, Jun-Pil;Kwon, Mi-Yun;Cho, Hyeong-Jin
    • BMB Reports
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    • 제31권2호
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    • pp.135-138
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    • 1998
  • A previous study on a yeast protein tyrosine phosphatase, YPTP1, using synthetic phosphotyrosine-containing peptides with various sequences as substrates revealed that DADEpYDA exhibits high affinity ($K_m=4{\mu}M$) toward the enzyme. A modified version of this peptide, GDADEpmFDA, immobilized on a resin, was used in this study as an affinity ligand for the purification of YPTP1. Phosphonomethyl-phenylalanine (pmF) was used as a nonhydrolyzable analog of the phosphotyrosine (pY) residue, with properties similar to pY. A protected form of pmF, $Fmoc-pmF(^{t}Bu)_{2}-OH$, was chemically synthesized and introduced during solid-phase peptide sythesis. YPTP1 was onrexpressed in an E. coli strain carrying a plasmid pT7-7-ptpl. Affinity chromatography of the crude lysate afforded PTPI (39 kDa) of about 50% purity.

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Affinity column과 베타수용체 정제조건

  • 고광호;신찬영;강현삼
    • 한국응용약물학회:학술대회논문집
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    • 한국응용약물학회 1993년도 제2회 신약개발 연구발표회 초록집
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    • pp.145-145
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    • 1993
  • 일반적으로 단백질의 정제를 위한 가장 효과적인 방법은 affinity chromatography법으로 알려져 있다. 본 연구에서는 베타 수용체의 순수정제를 위한 효과적인 affinity matrix를 제조하고 이의 특징을 확인함으로써 수용체 정제를 위한 기초를 수립하고자 하였다. Bisoxirane reagent인 1,4-butanediol diglycydyl ether를 Sepharose CL-4B gel과 반응시켜 탄노원자 10개 길이의 spacer arm을 부착시켰다. 여기에 sodium persulfate, dithiothreitol을 연속적으로 사용하여 -SH기를 도입시긴 추 free radical 반응을 이용하여 베타수용체 길항제인 alprenolol을 부착시킴으로써 affinity gel을 제조하였다. alprenolol치 부착반응을 위한 최적온도는 4$0^{\circ}C$로 나타났으며, semimicro Kjeldahl 질소 분석법을 적용하여 gel을 분석한 결과 ml당 0.4-0.6 $\mu$ mol의 alprenolol이 결합하였음을 확인하였다.

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Design and Synthesis of Resin-Conjugated Tamiflu Analogs for Affinity Chromatography

  • Kimura, Yasuaki;Yamatsugu, Kenzo;Kanai, Motomu;Echigo, Noriko;Kuzuhara, Takashi;Shibasaki, Masakatsu
    • Bulletin of the Korean Chemical Society
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    • 제31권3호
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    • pp.588-594
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    • 2010
  • Two types of resin-conjugated Tamiflu analogs were synthesized by modifying our original synthetic route of oseltamivir phosphate (Tamiflu). The prepared resins bound to influenza virus neuraminidase, the main target of Tamiflu. The resins will be useful for isolating and identifying presumed endogenous vertebrate proteins that interact with Tamiflu, which might relate to the rarely observed abnormal behavior exhibited by some influenza patients treated with Tamiflu.

Evaluation of proteomic strategies for analyzing ubiquitinated proteins

  • Peng, Jun Min
    • BMB Reports
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    • 제41권3호
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    • pp.177-183
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    • 2008
  • Ubiquitin is an essential, highly-conserved small regulatory protein in eukaryotic cells. It covalently modifies a wide variety of targeted proteins in the forms of monomer and polymers, altering the conformation and binding properties of the proteins and thus regulating proteasomal delivery, protein activities and localization. Mass spectrometry has emerged as an indispensable tool for in-depth characterization of protein ubiquitination. Ubiquitinated proteins in cell lysates are usually enriched by affinity chromatography and subsequently analyzed by mass spectrometry for identification and quantification. Ubiquitin-conjugated amino acid residues can be determined by unique mass shift caused by the modification. Moreover, the complex structure of polyubiquitin chains on substrates can be dissected by bottom-up and middle-down mass spectrometric approaches, revealing potential novel functions of polyubiquitin linkages. Here I review the advances and caveats of these strategies, emphasizing caution in the validation of ubiquitinated proteins and in the interpretation of raw data.

재조합 Escherichia coli 시스템을 이용한 폐흡충 cystein proteinase의 생산 연구

  • 홍성희;이길환;전희진;황현아;박성렬;황영보;박현
    • 한국생물공학회:학술대회논문집
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    • 한국생물공학회 2000년도 추계학술발표대회 및 bio-venture fair
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    • pp.651-654
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    • 2000
  • 본 연구에서는 재조합 E. coli 시스템에 의한 재조합 cystein proteinase의 대량 생산을 위하여 4L 회분 배양 및 최적 지수 생장기에서의 IPTG- induction을 연속적으로 실시하였다. 발현된 rPwCP1 양은 진탕 배양 시스템에서의 결과와 비교해 볼때 현저하게 향상되었음을 알 수 있었으며, 더불어 metal affinity chromatography 방법으로 처리하여 전기영동을 수행한 결과, 목적 재조합 단백질만을 정제 및 농축시킬 수 있음이 확인되었다.

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자초색소의 특성분석 및 염색성(제1보) -자초색소의 성분과 특성- (Analysis of Characteristics and Dyeing Properties of Gromwell Colorants(Part I) -Components and Characteristics of Gromwell Colorants-)

  • 최희;신윤숙
    • 한국의류학회지
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    • 제24권7호
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    • pp.1081-1087
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    • 2000
  • Gromwell colorants were extracted with methanol and dried. Four fractions were obtained by silica gel adsorption column chromatography using step-wise elution method. Relative ratio of four fraction is 1.00:0.07:0.22:0.30(Fl:F2:F3:F4) and gromwell colorants mainly consist of Fl, F3 and F4. IR analysis shows that each fraction has similar structure. Main component of gromwell extracts is acetyl derivative of naphthoquinone, and the rest are isobutyl derivative and isovaleryl derivative etc., in order. Gromwell colorants exhibit relatively good affinity to protein and polyamide fibers, but low affinity to cellulose and regenerated cellulose fibers.

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Pleurotus ostreatus에서 분리된 Glyoxalase I의 특성 (Purification and Characterization of Glyoxalase I from Pleurotus ostreatus)

  • 김성태;양갑석;석영재;허원기;강사욱
    • 미생물학회지
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    • 제32권4호
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    • pp.315-321
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    • 1994
  • Pleurotus ostreatus로부터 glyoxalase I(S-lactoyl-glutathione methylglyoxal lyase, EC 4.4.1.5)이 S-hexylglutathione affinity chromatography, Sephadex G-150 gel permeation chromatography, DEA-sepharose A-50 CL-6B ion exchange chromatography를 통해 순수 분리되었다. 이 결과, 전체 활성도의 21.7% fmf 수확하였으며, 분리 배수는 2,294 배 이었다. Gel filtration chromatography로 측정한 효소의 분자량은 34 kDa이며, SDS-PAGE 결과 본 효소는 분자량 17 kDa인 동일한 소단위체 두 개로 구성된 이합체라고 생각된다. Methylglyoxal과 phenylglyoxal에 대한 $K_m$ 값은 각각 0.39 mM 과 0.22 mM 이며 L-xylosone과 hydroxypyruvaldehyde에 대해서도 강한 친화력을 보여주었고, pH 6.5~7.5, $35~45^{\circ}C$에서 활성도가 가장 높았다. 이 효소의 반응 과정을 핵자기공 명분광법으로 분석한 결과, 분자내의 양성자 전달과정이 뚜렷이 관찰되었다.

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바이오분야 분리용 막크로마토그래피 설계 방안 (How to Design Membrane Chromatography for Bioseparations: A Short Review)

  • 박인호;유승연;박호범
    • 멤브레인
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    • 제31권2호
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    • pp.145-152
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    • 2021
  • 현재 바이오 분야에서 분리에 대한 수요가 급증함에 따라, 투과율 및 결합능 측면에서 높은 성능을 띠는 막크로마토그래피가 수지 크로마토그래피의 대체 분리 공정으로 부상하고 있다. 실증을 기반으로 하여 막 소재가 결정되는 기존 분리막 공정과 달리, 막크로마토그래피의 경우 분리하고자 하는 목표 물질에 적합한 분리 메커니즘 이해 그리고 이를 기반한 공정 설계가 필요하다. 본 논문에서는 생특이성을 활용하여 선택적으로 거대 분자를 포집하는 친화성 작용, 전하를 활용하여 생분자와 결합하는 이온 교환 작용 그리고 소수성을 활용하여 생분자와 결합하는 소수성 작용과 같은 막크로마토그래피 주요 분리 메커니즘들에 대해 다루고자 한다. 또한 본 논문에서는 단계적 측면에서 또는 소재 측면에 막크로마토그래피 기술설계 시 고려해야할 변인들에 대해서 다루고자 한다.

고구마 $\beta$-아밀라제의 subunit (Subunits of Sweet Potato $\beta$-Amylase)

  • 안용근
    • 한국식품영양학회지
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    • 제1권2호
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    • pp.50-55
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    • 1988
  • B-Amylase was obtained from sweet potato extract in a crystalline state by dialysis against water after precipitated with acetone according to the method reported previously followed by DEAE Sephadex A-50 ion exchange chromatography plus gel chromatography of Sephadex G-200. The purified enzyme was homogeneous by SDS PAGE. The efforts had done to remove the miner bands in SDS PAGE by Sephadex G-200 gel chromatography, DATE Sephadex A-50 ion exchange chromatography. isoelectrophocusing, affinity chromatography, hydroxyapatite chromatography, recrystallizstion and HPLC on a column of TSK gel SW 3000 but have given any result. But, N -terminal amino acid of the enzyme was revealed mainly alanine and trace of glycine and glutamic acid. Therefore, it seems that the miner bands in SDS PAGE have a role of subunit.

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