• 환경생물
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• 제29권3호
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• pp.154-161
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• 2011

제주도 숨은물벵뒤 습지에서 Betaproteobacteria의 종다양성을 조사하였고, 신분류군 후보 22균주를 확보하였다. 분리주의 16S rRNA 유전자 염기서열을 분석한 결과Burkholderiaceae (3균주), Comamonadaceae (8균주), Oxalobacteraceae (5균주) 및 Neisseriaceae (5균주) 등 4개 과에 속한 15속, 그리고 소속 미상의 Burkholderiales 소속1속(1균주)으로 동정되었다. Chromobacterium 속에 속한 3종의 신분류군 후보를 확보하였고, Burkholderia, Comamonas, Pelomonas 및 Herbaspirillum의 4속에는 각각 2종씩, 그리고 나머지 속은 각각 1종씩의 신분류군 후보를 확보할 수 있었다. 이들 신분류군 후보에 대해 형태 및 배양학적 특징의 분석과 더불어 막지방산 및 API 20NE 분석을 실시하여 22종의 신분류군 후보에 대한 특징을 기술하였다.

• 한국어병학회지
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• 제32권2호
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• pp.81-89
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• 2019

As an epidemiological survey, mortality of marbled rockfish, Sebastiscus tertius observed from a fish farm in Gyeongnam province of South Korea. The major macroscopic sign of the diseased fish was severe multifocal dermal ulceration. Histological observation revealed inflammation, necrosis and colonization of bacteria in various tissues (gill, liver, spleen and kidney). Bacteria was isolated from spleen and kidney in moribund and mortality fish. Seven bacterial isolates from the diseased fish were identified as Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida using API 20E and 20NE, API 50CH API ZYM system. Under light microscopy, infected marbled rockfish showed the lifting of the lamella epidermal layer, edematous changes and hypertrophy of epithelial cell in the gill filament. The atrophy of the mucosal fold, erythema in the intestine, and the necrosis of hematopoietic tissue and renal tubule cells with karyolysis were observed in the kidney. In this study was demonstrated the histological reaction of red marbled rockfish infected by Aeromonas salmonicida. Furthermore, this is the first account of extensive dermatitis in Sebastiscus tertius due to atypical A. salmonicida infection, which has high potential in aquaculture among native fish species.

• 한국어병학회지
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• 제11권2호
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• pp.143-150
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• 1998

바지락 조직과 주변 환경에 있는 세균의 특성과 분포를 여러 배지와 온도 그리고 생화학적 동정 kit를 사용하여 비교 분석하였다. 장내, 갯벌, 아가미 그리고 외부체액에 있는 미생물의 집락수는 사용한 BHIA, STA 그리고 SNA 배지에 영향을 받지 않는 것으로 나타났다. 그리고 $15^{\circ}C$ 배양조건에서의 증식속도는 $25^{\circ}C$와 $35^{\circ}C$의 조건에 비해 느린 것으로 나타났으나 총 세균 집락수는 $15^{\circ}C$에서의 것이 가장 높게 나타났다. 영양배지에서 자란 세균집락을 무작위적으로 선택배지에 옮기면 조직 시료를 직접 도말 한 경우에 비해 높은 비율로 집락형성을 하는 것을 보여 주었다. API 20E와 API 20NE를 사용하여 각 장기 또는 외부에 있는 세균의 종류를 동정한 결과 바지락 조직간에는 서로 유사한 종의 분포를 보이나 주위 환경이 되는 갯벌이나 외부체액에 있는 미생물군의 종류와는 다르게 나타났다. 바지락 주위의 갯벌이나 외부체액의 미생물군은 Pseudomonas 가 주종을 이루고 있는 조직내의 미생물군에 비해서 훨씬 높은 다양성을 보여 주었다. 이러한 결과는 바지락 조직이 주위 환경중의 세균에 대한 선택적 친화력이 있음을 의미한다고 할 수 있다.

• 한국환경과학회지
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• 제33권3호
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• pp.205-215
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• 2024

Antibiotics are substances produced by microorganisms that kill or inhibit and are essential for infectious diseases management. This study aimed to provide basic data for overcoming antibiotic resistance in the marine bacterium LJ-18. The API 20NE and API 50CH kits were used to identify this microorganism. Morphological, physiological, and biochemical properties were investigated using MacFaddin's manuals. Subsequently, isolated LJ-18 was found to belong to a genus of Streptomyces that forms mycelia. LJ-18 also grew well at 28-32℃ on modified Bennett's agar. To isolate and purify the antibacterial compound, LJ-18 culture was divided into ethyl acetate and distilled water fractions. Considerable antimicrobial activity against various pathogenic microorganisms, including methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), was confirmed in the C₁₈ ODS open column fractions. Peak 2 compound was obtained using reversed-phase HPLC. As a result, this compound had a significant antimicrobial activity against various pathogenic microorganisms. In particular, it showed strong activity against MRSA, Mycobacterium smegmatis, Bacillus subtilis, Bacillus cereus, and Staphylococcus aureus.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제39권2호
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• pp.119-125
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• 2011

전국 경작지 토양에서 분리한 저 영양 세균 3,800주를 대상으로 암 억제유전자의 작동과 관여하는 전사인자인 Egr-1의 promoter 활성화를 유도하는 세 균주(SSG5, SSG6, SSG10)가 Egr-1 reporter assay와 western blotting 분석으로 최종 선발되었다. 이들 선발 균주들은 16S rDNA와 상업용 생화학적 키트(API 20NE, API ZYM, ID 32GN) 분석에 의해 모두 Pseudomonas koreensis인 것으로 최종 동정되었다. 이들 균주들은 Egr-1 발현을 유도하는 물질뿐만 아니라 다양한 세균의(B. subtilis, S. aureus, and L. monocytogenes) 성장을 저해하는 항균물질도 생산하는 것을 확인하였다.

• 미생물학회지
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• 제50권3호
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• pp.245-248
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• 2014

Pseudomonas syringae pv. actinidiae는 참다래 속(genus Actinidia) 식물에 궤양병을 일으키는 원인세균이다. 7개의 필수 유전자와 11개의 타입 III 효과기 유전자에 대한 다중염기서열 분석을 통해 전 세계 여러 곳에서 분리된 병원성 균주들은 세 그룹으로 나눌 수 있었고 각각 Psa1-Psa3 그룹으로 명명되었다. 본 연구에서는 3개의 Psa1, 3개의 Psa2 및 우리나라와 이탈리아에서 분리된 3개씩의 Psa3 균주 등 총 12 균주를 대상으로 그룹별 표현형을 비교하였다. 그 결과 모든 그룹의 균주가 $22^{\circ}C$ 이하에서 최대의 성장을 보였으며, Psa3 균주들은 $30^{\circ}C$ 이상의 온도에서 성장이 정지되었다. 또한 우리나라의 Psa3 균주의 지연기가 이탈리아 Psa3 균주 보다 긴 특징을 보였다. API 20NE 시험에서 Psa2 균주는 potassium gluconate, capric acid 및 trisodium citrate를 이용하지 못하는 점에서 Psa1과 Psa3 균주와 구별되었다. 다른 그룹과 달리 우리나라 Psa3 균주는 esculin을 가수분해할 수 있었다. API ZYM 시험에서는 Psa3에 속하는 균주들에서만 ${\beta}$-glucosidase 활성이 있는 것으로 나타났다. Psa 그룹에 따라 ampicillin, novobiocin 및 oleandomycin 등의 항생물질에 대한 민감성 양상이 서로 달랐다.

• 미생물학회지
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• 제46권4호
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• pp.359-365
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• 2010

조릿대 근권토양으로부터 분리한 방선균 50균주를 대상으로 고추 세균성 점무늬병원균(Xanthomonas axonopodis pv. vesicatoria)의 항균활성 12균주를 선발하였다. 이들 항균활성 12균주의 계통학적 위치를 검토한 결과, 모두 Streptomyces 속의 Cluster II에 속하는 특징을 나타내었다. JR-24 균주는 최소저해 농도(MIC) 10 ${\mu}l$/disc를 나타내었으며, 배양액 5 ${\mu}l$/ml를 처리 하여 12시간 배양한 결과 Xanthomonas axonopodis pv. vesicatoria에 강한 생육저해효과를 나타내어 최우수 균주로 선발되었다. 항균활성 균주 JR-24의 16S rRNA 유전자 염기서열을 검토한 결과, Streptomyces galbus $DSM40089^T$ (X79852)와 98.1%, Streptomyces longwoodensis $LMG20096^T$ (AJ781356)와 98% 그리고 Streptomyces capoamus $JCM4734^T$ (AB045877)와 97.8%의 상동성을 나타내었다. API 20NE와 API 50CHE를 이용하여 JR-24 균주의 생리 생화학적 특성을 확인한 결과, L-arabinose, D-fructose, D-glucose, D-galactose을 이용하며 gelatin, protein, starch에 대하여 분해능이 있는 것으로 확인되었다. 주요지방산으로는 iso-$C_{14:0}$ (25.93%), iso-$C_{15:0}$ (10.13%), anteiso-$C_{15:0}$ (19.29%) 그리고 iso-$C_{16:0}$ (20.35%) 등을 함유하였으며, 퀴논종은 MK-9 ($H_4$) 4.37%, MK-9 ($H_6$) 51.22% 그리고 MK-9 ($H_8$) 49.47%로 동정되었다. Streptomyces sp. JR-24 균주의 계통학적 특성을 근연종인 Streptomyces galbus $DSM40089^T$와 비교한 결과, 다수의 표현형적 및 계통학적 차이를 나타내었다. 본 연구에서 분리된 Streptomyces sp. JR-24는 친환경 미생물제제 개발을 위한 유전자원 확보에 있어서 매우 큰의의가 있을 것으로 사료 된다.

• 한국임상수의학회지
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• 제27권3호
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• pp.289-294
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• 2010

경남 산청지방에서 쏘가리를 양식하던 어장에서 대량폐사가 발생하였다. 주요 증상으로 전신 피부에서 궤양이 진행되었고 조직학적으로는 주요 실질 장기에서 세균의 집락과 주변부위로 염증 및 괴사가 관찰되었다. 분리된 세균을 API 20E 및 API 20NE를 이용하여 생화학적 검사를 실시한 결과 Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida (typical A. salmonicida)로 진단할 수 있었다. 그러나 atypical A. salmonicida와 typical A. salmonicida로 구분할 수 있는 PCR 기법을 실시한 결과, 본 세균은 atypical A. salmonicida임을 확인할 수 있었다. 본 연구는 우리나라 쏘가리에서 A. salmonicida로 인한 발병의 최초 보고임과 동시에, A. salmonicida의 정확한 진단을 위해선 생화학적 검사가 아닌 PCR 검사를 이용한 진단을 실시해야 함을 제시하였다.

• Fisheries and Aquatic Sciences
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• 제15권1호
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• pp.83-89
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• 2012

Flavobacterium johnsoniae was isolated from farmed rainbow trout Oncorhynchus mykiss in Korea, and its biochemical and molecular characterization was determined. Yellow-pigmented bacterial colonies were isolated from 18 of 64 fish samples (28.1%) on trypticase soy agar plates, and their biochemical profiles were characterized by API 20E and API 20NE test kits. F. johnsoniae was identified by biochemical phenotyping of factors including rapid gliding motility, Gram-negative condition, oxidase- and catalase-positive status, Congo red absorption, nitrate reduction, ${\beta}$-galactosidase production, acid production from glucose, and gelatin and casein hydrolysis. PCR and subsequent sequencing of 16S rRNA confirmed that the yellow-pigmented colonies were most similar to F. johnsoniae. The alignment analysis of 16S rRNA sequences also showed that all 18 rainbow trout isolates had highly similar homologies (97-99% identity). One isolate was selected and named FjRt09. This isolate showed 98% homology with previously reported F. johnsoniae isolates, and in phylogenetic analysis was more closely grouped with F. johnsoniae than with F. psychrophilum, F. columnare, or F. branchiophilum. This is the first report on the occurrence and biochemical characterization of F. johnsoniae isolated from rainbow trout in Korea.

• 한국임상수의학회지
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• 제21권2호
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• pp.133-139
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• 2004

Bacterial pathogens were isolated from 36 dogs with respiratory signs, that were submitted to Veterinary Clinics in Jeju, including Veterinary Medical Teaching Hospital in Cheju National University. Of 36 isolates, 16 (44.4%) bacterial pathogens were Gram-positive and 20 (55.6%) were Gram-negative. Gram-positive bacteria identified with API Staph were 12 S. intermedius (33.3%), 2 S. aureus (5.6%), 1 S. haemolyticum (2.8%), and 1 S. xylosus (2.8%). Gram-negative organisms identified with API 20E or API NE included 8 Bordetella bronchiseptica (22.2%), 6 Escherichia coli (16.7%), 4 Pasteurella spp. (11.1%), 1 Enterobacter intermedius (2.8%), and 1 Oligella ureolytica (2.8%). Both Staphylococcus spp. isolates and Gram-negative pathogens were resistant to one or more antibiotics, including ampicillin (AM), amoxicillin/clavulanic acid (AMC), chloramphenicol (C), cefazolin (CZ), erythromycin (E), gentamicin (GM), kanamycin (K), lincomycin (L), oxacillin (OX), trimethoprim/sulfamethoxazole (SXT), and tetracycline (TE). All Staphylococcus spp. were susceptible to AMC, OX and VA, while many isolates were highly resistant to L (87.5%), E (68.8%), P (62.5%), and AM (56.3%). Antibiotic-resistant patterns of staphylococcal isolates were shown ranges from single to 9-resistant patterns. Resistant rates to antibiotics of Gram-negative bacteria were usually higher than those of Staphylococcus spp. in this study. Most Gram-negative bacteria were highly resistant to L (90.0%), AM (85.0%), E (85.0%), P (85.0%), OX (80.0%), and CZ (75.0%). B. bronchiseptica isolates showed 5 to 8 antibiotics-resistant patterns and Pasteurella spp., 2 to 8-resistant patterns. In particular, all 6 E. coli isolates were resistant to more than 9 different kinds of antibiotics, including one strain resistant to all antibiotics tested.