• Fisheries and Aquatic Sciences
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• 제20권6호
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• pp.10.1-10.7
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• 2017

Small GTPases are well known as one of the signal transduction factors of immune systems. The ADP-ribosylation factors (ARFs) can be classified into three groups based on the peptide sequence, protein molecular weight, gene structure, and phylogenetic analysis. ARF1 recruits coat proteins to the Golgi membranes when it is bound to GTP. The class I duplicated ARF gene was cloned and characterized from the olive flounder (Paralichthys olivaceus) for this study. PoARF1b contains the GTP-binding motif and the switch 1 and 2 regions. PoARF1b and PoARF1b mutants were transfected into a Hirame natural embryo cell to determine the distribution of its GDP/GTP-bound state; consequently, it was confirmed that PoARF1b associates with the Golgi body when it is in a GTP-binding form. The results of the qPCR-described PoARF1b were expressed for all of the P. olivaceus tissues. The authors plan to study the gene expression patterns of PoARF1b in terms of immunity challenges.

• 생명과학회지
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• 제21권4호
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• pp.613-615
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• 2011

ERp29는 endoplasmic reticulum (ER) lumen에 존재하는 단백질로 protein disulfide isomerase (PDI) family에 속한다. 비록 관련 연구 결과는 조금 있지만 정확한 생물학적인 기능은 아직 분명하지 않지만, 분비단백질과정과 단백질 folding에 관여하는 것으로 알려 지고 있다. ERp29의 기능 연구를 위하여 yeast two-hybrid screening/GST pull-down assay방법을 사용하여 ERp29-결합단백질인 ADP-ribosylation factor 5 (ARF5)를 동정하였다. 이들의 결합은 정상적인 세포생리상태에서는 결합하지만 ER stress 상태에서는 떨어졌다. 이 결과는 ERp29의 기능 연구를 위하여 하나의 실마리를 제공할 것이다.

• Journal of Microbiology and Biotechnology
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• 제13권6호
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• pp.897-905
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• 2003

Phospholipase D (PLD) and ADP-ribosylation factor (ARF) were partially purified on a series of column chromatography, and their biochemical properties were characterized to understand the regulatory mechanism of PLD activation by ARF protein in the antigen-induced immune responses in guinea pigs. Heparin Sepharose and high-Q Sepharose column chromatographies were used for the purification of PLD, and Sephadex G-25, DEAE Sephacel, Source 15 PHE (HIC), Superdex-75, and Uno-Q column chromatographies were used for the purification of ARF. The purified PLD and ARF proteins were identified with anti-rabbit PLD- or ARF-specific antibodies, showing about 64 or 85 kDa for the molecular mass of PLD and 29 or 35 kDa for the sizes of ARF. Partial cDNA of ARF3 was cloned by RT-PCR in guinea pig lung tissue and its nucleotides and amino acids were sequenced. Guinea pig ARF3 showed 92% of nucleotides sequence identity and 100% of amino acid sequence homology with human ARF3. The ARF-regulated PLD activity was measured in the oleate or ARFs-containing mixed lipid vesicles. The purified and recombinant ARF (rARF) activities were assessed with the $GTP{\gamma}S$ binding assay. The PLD activity was induced by oleate in a dose-dependent manner. The purified ARF and recombinant ARF3 increased PLD activity in guinea pig lung tissues. These data show that the activity of membrane-bound PLD can be regulated by the cytosolic ARF proteins, suggesting that ARF proteins in guinea pig lung can act as a regulatory factor in controlling the PLD activity in allergic reaction.

• 생명과학회지
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• 제34권5호
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• pp.333-338
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• 2024

키네신-1은 모터 도메인이 있는 두 개의 중쇄(KHC 또는 KIF5)와 모터 도메인이 없는 두 개의 경쇄(KLC)로 구성된 이형사량체 단백질이다. KIF5에는 KIF5A, KIF5B 및 KIF5C의 세 가지 subtype이 있으며, 카르복실(C)-말단 영역을 제외하고는 아미노산 상동성이 높다. KIF5A는 세포 내에서 화물을 운반하며, KIF5A의 C-말단 영역에 결합하는 매개 단백질은 키네신-1과 화물 사이를 연결한다. 키네신-1의 세포내 수송을 조절하는 단백질은 아직 충분히 확인되지 않았다. 본 연구는 리소좀의 세포 내 수송에 관여하는 ADP-ribosylation GTPase-activating protein 1 (ArfGAP1)과 KIF5A와의 결합을 확인하였다. KIF5A는 ArfGAP1의 C-말단 영역에 결합하고, ArfGAP1은 KIF5A의 C-말단 영역에 결합하지만 KIF5B, KIF5C, 키네신 경쇄 1 (KLC1) 또는 KIF3A와는 결합하지 않았다. ArfGAP 도메인을 가진 다른 동질형인 SMAP1과는 결합하지 않았다. 세포에서 KIF5A는 ArfGAP1과 같은 위치에서 발현하며, KIF5A, KIF5B 및 KLC1와 같이 면역 침전하였다. 그러나, KIF3B와는 같이 면역 침전하지 않았다. 이러한 결과들은 키네신-1은 세포내 화물 수송에서 ArfGAP1에 의해 조절될 수 있음을 시사한다.

• 한국수산과학회지
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• 제34권4호
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• pp.370-377
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• 2001

본 연구에서는 넙치, Pafalichthys olivaceus 뇌 조직에서 인지질가수분해효소 D (phospholipase D, PLD) 활성의 특성 규명 및 이 활성을 억제하는 단백질을 분리 정제하여 그 특성을 규명하였다. 넙치 뇌 조직에서 PLD 활성이 관찰되었으며, 이 활성은 포스파티딜 이노시톨 비스인산염 (phosphatidyl-inositol 4,5-bisphos-phate, $PIP_2$)에 대해서 의존성을 나타내었으나, ADP-rebosylation factor (ARF)에 의해서는 영향을 받지 않았다. PLD 억제물은 넙치 뇌 조직의 세포질 분획물을 사용하여 여러 종류의 칼럼을 통하여 분리 정제하였고, 그 억제물의 분자크기 및 기작의 특성을 규명하였다. 마지막 chromatography을 통하여 여섯 개의 억제를 나타내는 분획물을 얻었으며, 이 중 두 개의 분획물인 IIA IIB는 $PIP_2$-phosphatase activities를 나타내었다. 이 중 IIA 분획물은 면역화학적 분석을 통하여 inositolpolyphosphate 5-phosphatase family로 알려져 있는 신경말단 단백질인 synaptojanin으로 동정되었다. 그리고 IIB fraction은 Superose 12 gel filtration chromatography을 통하여 158-kDa의 크기로 확인되었으며, 이것은 면역화학적 분석을 통하여 synaptojanin과는 별개의 단백질로 판명되었다. 또한, IIB 분획물은 $PIP_2$ phosphatase activity 확인 실험에서 대사산물로서 phosphatidylinositol phosphate (PIP)만을 생성하였다. 이 결과는 IIB 분획물이 $PIP_2$의 4혹은 5 위치의 인산 (phosphate) 중 어느 하나만을 선택적으로 가수분해시킨다는 것을 암시한다. 이상의 연구 결과들을 종합하여 보면, 넙치 뇌 조직에는 다양한 형태의 $PIP_2$-phosphatases가 존재하며, 이들은 $PIP_2$-의존적인 PLD 활성의 억제조절과정에서 중요한 역할을 할 것으로 사료된다.