• 제목/요약/키워드: 6S RNA

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Pb(Ⅱ) 이온을 이용한 Pseudomonas alcaligenes 5S rRNA의 고차원 구조 분석 (Analysis of Higher Order Structure of 5S rRNA from Pseudomonas alcaligenes by using Pb(Ⅱ) Ion)

  • 김상범;이영훈;박인원
    • 대한화학회지
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    • 제39권6호
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    • pp.453-458
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    • 1995
  • Pb^{2+}$을 Pseudomonas alcaligenes 5S rRNA의 구조 분석에 응용하였다. Pb^{2+}$이 5S rRNA를 절단하는 방식은 5S rRNA의 삼차구조의 조사에 이용할 수 있을 것으로 기대되는 몇 가지 특징들을 보였다. Pb^{2+}$은 안정한 나선형 줄기들에는 작용하지 않는다. 단일가닥으로된 구역들 또는 내밀린 부분들은 그들의 분자내에서의 위치에 따라 다른 민감도로 작용을 받는다. 불안정한 d 나선은 전혀 작용을 받지 않는다. 불안정한 C 줄기에서는 3'쪽의 가닥만이 작용을 받고 5'쪽의 가닥은 작용을 받지 않는다. Pb^{2+}$에 의한 절단과 Xanthomonas celebensis 5S rRNA의 구조분석의 결과들에 기초하여 우리는5S rRNA에서의 삼차상호작용에 대한 작업가설을 제안하였다.

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Effects of troxerutin on vascular inflammatory mediators and expression of microRNA-146a/NF-κB signaling pathway in aorta of healthy and diabetic rats

  • Che, Xing;Dai, Xiang;Li, Caiying
    • The Korean Journal of Physiology and Pharmacology
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    • 제24권5호
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    • pp.395-402
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    • 2020
  • This study has investigated the effect of a potent bioflavonoid, troxerutin, on diabetes-induced changes in pro-inflammatory mediators and expression of microRNA-146a and nuclear factor-kappa-B (NF-κB) signaling pathway in aortic tissue of type-I diabetic rats. Male Wistar rats were randomly divided into four groups (n = 6/each): healthy, healthy-troxerutin, diabetic, and diabetic-troxerutin. Diabetes was induced by streptozotocin injection (60 mg/kg; intraperitoneally) and lasted 10 weeks. Troxerutin (150 mg/kg/day) was administered orally for last month of experiment. Inflammatory cytokines IL-1β, IL-6, and TNF-α, as well as intercellular adhesion molecule-1 (ICAM-1), vascular cell adhesion molecule (VCAM), cyclooxygenase-II (COX-II), and inducible-nitric oxide synthase (iNOS) were measured on aortic samples by enzyme-linked immunosorbent assay. Gene expressions for transcription factor NF-κB, interleukin-1 receptor-associated kinase-1 (IRAK-1), TNF receptor-associated factor-6 (TRAF-6), and microRNA-146a were determined using real-time polymerase chain reaction. Ten-week diabetes significantly increased mRNA levels of IRAK-1, TRAF-6, NF-κB, and protein levels of cytokines IL-1β, IL-6, TNF-α, adhesion molecules ICAM-1, VCAM, and iNOS, COX-II, and decreased expression of microRNA-146a as compared with healthy rats (p < 0.05 to p < 0.01). However, one month treatment of diabetic rats with troxerutin restored glucose and insulin levels, significantly decreased expression of inflammatory genes and pro-inflammatory mediators and increased microRNA level in comparison to diabetic group (p < 0.05 to p < 0.01). In healthy rats, troxerutin had significant reducing effect only on NF-κB, TNF-α and COX-II levels (p < 0.05). Beside slight improvement of hyperglycemia, troxerutin prevented the activation of NF-κB-dependent inflammatory signaling in the aorta of diabetic rats, and this response may be regulated by microRNA-146a.

PKR인산화효소 억제인자인 이중선RNA결합단백질 (RBF)의 RNA결합특이성 (RNA Binding Specificities of Double-Stranded RNA Binding Protein (RBF) as an Inhibitor of PRK Kinase)

  • 박희성;최장원
    • 생명과학회지
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    • 제6권4호
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    • pp.234-240
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    • 1996
  • PKR인산화효소의 억제인자로서 밝혀진 이중선RNA결합단백질 (RBF)의 RNA결합특이성을 정기영도에 의한 RNA 이동변화실험과 여과막결합도실험에 의해 측정하였다. RBF는 바이러스RNA나 stem/loop구조를 지니는 합성 RNA들에 대한 다양한 친화력을 지니는 것으로 나타났으며 충분한 GC가 포함된 11염기쌍으로 이루어진 RNA stem helix RBF가 결합하기 위한 최소한의 RNA구조로 제시되고 있다. 자연적 RNA구조에 대한 RBF의 결합은 poly(I) : poly(C)의 첨가에 의해 반전되었으며 E. coli 5S RNA경우는 효과를 거의 나타내지 않았다.

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벼 세포적기에 미치는 염분 농도의 영향 (Effect of Salt on Mitotic Cycle in Root Meristem Cells of Rice)

  • 김재철;권성환;이진재;이영일
    • 한국작물학회지
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    • 제37권5호
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    • pp.397-404
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    • 1992
  • 본 연구는 내염성이 비교적 강한 Japonica형 품종인 섬진벼와 내염성이 비교적 약한 통일형 품종인 칠성벼를 염분농도에 따른 세포주기를 측정하고 각 phase의 기간 변화도 조사하였으며, 또한 DNA, RNA 및 단백질 합성량를 제출하여 세포주기와 어떠한 관련성이 있는지를 조사한 결과 다음과 같다. 1. 섬진벼와 칠성벼의 세포주기는 염분농도 0%, 0.3% 및 0.6%에 서 12시간으로 동일하였다. 2. 세포주기로부터 측정된 각 phase 별 기간은 무처리구와 처리구에서 차이를 보였다. 섬진벼가 무처리구에서 G1=3.3, S=3.8, G2=2.8, 그리고 M=2.1 시간이었고, 0.3%에서 G1=3.5, S=3.6, G2=2.8, 그리고 M=2.1 시간이었으며, 0,6%에서 G1=3.5, S=3.6, G2=2.8, 그리고 M=2.1 시간으로 무처리구에 비하여 G1 기간은 길어겼고, S 기간은 약간 짧아졌다. 칠성벼에서는 무처리구에서 G1=2.6, S=5.2, G2=2.3, 그리고 M=1.9 시간이었고, 0.3%에서 G1=2.5, S=6.2, G2=1.6 그리고 M=1.7 시간이었으며, 0.6%에서 G1=2.1, S=6.0, G2=2.0 그리고 M=1.9 시간으로 무처리구에 비하여 처리구의 G1과 G2 기간은 짧아졌고 S 기간은 길어졌으며, 이는 섬진벼의 변화와 반대 성향을 보여 주었다. 3. 섬진벼에서 처리구가 무처리구에 비하여 DNA와 RNA 합성은 감소한 반면, 단백질 합성은 증가하였으며, 칠성벼에서는 처리구가 무처리구에 비하여 DNA와 단백질 합성은 증가하였으나, RNA 합성은 섬진벼와 같이 감소하였다.

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한국산 쉬리, Coreoleuciscus splendidus (잉어과)의 종내 집단간 분자 유전 변이 (A molecular Genetic Variation among Intra-poplations of Korean shiner, Coreoleuciscus splendidus Mori (Cyprinidae))

  • 송호복;박갑만
    • 한국어류학회지
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    • 제18권2호
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    • pp.78-86
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    • 2006
  • 한국산 쉬리, Coreuleuciscus splendidus의 종내 집단간 유전자 다양성을 알기 위해 6개 주요강(북한강, 남한강, 금강, 오십천, 낙동강, 섬진강)으로부터 채집된 개체를 대상으로 16S rRNA 유전자와 미트콘드리아 cytochrome b 유전자에 근거하여 비교 분석하였다. 미트콘드리아 cytochrome b 유전자의 657 bp 길이의 염기서열 분석결과, 6개 집단간에 차이는 98.2~99.9%로 나타났으며 지리적으로 격리된 집단간에 높은 유전적 다양성을 보였다. 16S rRNA 유전자는 697 bp의 염기서열을 얻었으며, 종내 변이는 큰 차이가 없이 거의 동일하였다. 16S rRNA 유전자의 6개 집단간에는 97.7%에서 99.7%의 높은 유사성을 보였다.

육미지황탕합사백산(六味地黃湯合瀉白散)과 상백피(桑白皮)가 인간 기관지상피세포의 IL-6, IL-8, GM-CSF mRNA level에 미치는 영향 (The Inhibitory Effects of Yukmijihwang-tang-Hap-Sabaek-san and Root Cortex of Morus alba L. on the IL-6, IL-8 and GM-CSF mRNA Levels in Human Epithelial Cells)

  • 황우석;허태석;정희재;정승기;이형구;주창엽
    • 대한한방내과학회지
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    • 제22권3호
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    • pp.415-422
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    • 2001
  • Objectives: We aimed to identify the dose-dependent inhibitory effects of Yukmijihwang-tang-Hap-Sabaek-san(YMHSB) and Root cortex of Morus alba L.(RCM) on the mRNA expression of Interieukin(IL)-6, IL-S, granulocyte macrophage colony stimulating factor(GM-CSF) involved in the asthma model. Methods: In this study BEAS-2B cell lines, human epithelial cells, were used. These cells were stimulated by tumor necrosis $factor(TNF)-{\alpha},\;IL-1{\beta}$ and histamine for artificial inflammatory expression. ${\beta}-actin$ messenger RNA(mRNA) was used for the internal standard. After each 24 hours of the YMHSB and RCM treatment, total cellular RNAs were collected by treating RNA zol directly on the living cells. Then the transcriptional activities of IL-6, 8 and GM-CSF were measured by RT-PCR with electrophoresis. Results: In the YMHSB study, the mRNA expression of GM-CSF and IL-8 is significantly inhibited compared to that of control group. But the mRNA expression of IL-6 is not significantly inhibited. In the RCM study, the mRNA expression of GM-CSF and IL-S is significantly inhibited compared to that of control group. But the mRNA expression of IL-6 is not significantly inhibited. Conclusions: This study shows that YMHSB and RCM have dose-dependent inhibitory effects on the mRNA expression of IL-S and GMCSF in human epithelial cells. So these herbal medicines may inhibit the inflammatory process of asthma. Advanced studies are required to investigate the mechanisms of inhibition by herbal medicine in the asthma model.

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Effects of Natural Extracts on COX-1 and COX-2 mRNA Expression on UVB-induced Skin Inflammation in C57BL/6 Mouse

  • Ahn, Ryoung-Me
    • 한국환경보건학회지
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    • 제32권6호
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    • pp.566-570
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    • 2006
  • Exposure to ultraviolet B(UVB) radiation causes skin inflammation such as pigmentation and the induction of cyclooxygenase-2(COX-2) gene expression. In this study, we investigated the effect of natural extracts from Tea, EGb 761 and Korean red ginseng(KRG), on the pigmentation and expression of COX-1 and COX-2 mRNA in UVB-irradiated C57BL/6 mice. Before UVB irradiation, the skin color was significantly showed the lightening effect by topical application of natural compounds (p<.05). In the case of UVB irradiated mice, we observed a decrease in pigmentation by compounds (p<.05). In irradiated skin, COX-1 mRNA expression is not changed following UVB irradiation, but COX-2 gene increases. Also, natural compounds lowered mRNA levels of COX-2. Therefore, these results suggest that COX-2 mRNA increases by UVB irradiation. Also, Tea, EGb 761 and KRG as a topical application may inhibit skin pigmentation and modulate COX-2 mRNA level.

HL60 세포주에서 방사선 조사에 의한 Apoptosis와 세포 주기 관련 유전자의 발현 변화 (Expression of Cell Cycle Related Genes in HL60 Cells Undergoing Apoptosis by X-irradiation)

  • 김진희;박인규
    • Radiation Oncology Journal
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    • 제16권4호
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    • pp.377-388
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    • 1998
  • 목적 : 방사선조사에 의한 apoptosis에서 나타나는 각종 세포주기관련 유전자들의 발현 양상을 RNA와 단백 수준에서 분석하여 방사선조사에 의한 apoptosis에서의 세포주기 조절의 변화를 규명함으로서 방사선치료의 기전에 대한 분자생물학적 이해를 도모하고자 본 연구를 시행하였다. 대상 및 방법 : promyelocytic leukemia 세포주인 HL60 세포주를 배양하여 선형가속기(6MV X-선)로 세포에 8Gy의 방사선을 조사하였다. 조사후 다양한 시간 간격으로 Apoptotic DNA Fragmentation Assay법을 이용하여 apoptosis를 확인하고 동시에 세포주기관련 유전자들(cyclinA, cyclin B, cyclin C, cyclin Dl, cyclin E, cdc2, CDK2, CDK4, $p16^{INK4a}$, $p21^{WAF1}$, $p27^{KIP1}$, E2F, PCNA와 Rb)을 단백질과 RNA 수준에서 분석하기위해 western blot analysis와 반정량적 RT-PCR을 시행하였다. 결과: 8 Gy의 방사선 조사에 의해 HL60세포에서 apoptosis가 관찰 되었다. 방사선 조사군에서 cyclin A단백은 조사후 48시간까지 시간이 갈수록 증가하였으며, cyclin E, E2F, CDK2 및 Rb 단백은 증가되었다가 다시 감소를 보였다. Rb단백의 증가는 대부분 비활성형인 ppRb (phosphorylated Rb protein)의 양적변화에 의한 것이었다. cyclin Dl, PCNA, COC2, CDK4, $p16^{INK4a}$단백은 발현의 차이를 보이지 않았으며 $p21^{WAF1}$$p27^{KIP1}$ 단백은 검출되지 않았다. cyclin A, B, C mRNA는 방사선 조사 직후 감소하였다가 12시간부터 발현이 증가되었으며 cyclin Dl mRNA는 조사후 바로 증가하여 48시간에 다시 감소하였다. cyclin E mRNA는 조사 후 시간이 경과함에 따라 감소하였다. CDK2 mRNA는 3시간째는 감소하다가 6시간부터 많은 증가를 보였으며 CDK4 mRNA는 조사후 6-12시간에 급격한 발현증가를 보였다. $p16^{INK4a}$ RNA는 발현의 변화가 없었으며, $p21^{WAF1}$$p27^{KIP1}$ RNA의 발현은 관찰되지 않았다. 결론 : 이상의 결과로 미루어볼 때, 방사선 조사에 의한 HL60세포의 apoptosis와 세포의 Gl/S transition는 밀접한 관계가 있는 것으로 생각되며 Rb단백의 증가와 활성형 Rb단백의 감소 현상도 관련이 있는 것으로 사료된다. 이는 E2F의 비정상적인 과발현 및 cyclin E/CDK2의 발현 증가와 관련이 있는 것으로 추측된다. 또한 $p21^{WAF1}$$p27^{KIP1}$는 방사선에 의한 apoptosis에는 관여되지 않는 것으로 사료된다.

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목과(木瓜)가 CT105 와 ${\beta}A$로 유도(誘導)된 Alzheimer's Disease병태(病態) 모델에 미치는 영향(影響) (The Effects of Chaenomelis fructus,(CMF) Extract on the Alzheimer's Disease Model Induced by CT-105 and ${\beta}A$)

  • 김명진;정인철;이상룡
    • 동의신경정신과학회지
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    • 제16권1호
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    • pp.97-117
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    • 2005
  • This research investigates the effect of the Chaenomelis fructus(CMF) on Alzheimer's disease. Specifically, the effects of the CMF extract on (1) >$IL-1{\beta}$, IL-6, and $TNF-{\alpha}$ mRNA of PC-12 cells treated with LPS; (2) amyloid precursor proteins(APP), acetylcholinesterase(AChE), and glial fibrillary acidic protein(GFAP) mRNA of PC-12 cells treated with CT-105; (3) the AChE activity and the APP production of PC-12 cell treated with CT-105; (4) the behavior of AD mice with ${\beta}A$; (5) expression of $IL-1{\beta}$, $TNF-{\alpha}$, MDA, $IL-1{\beta}$ mRNA, $TNF-{\alpha}$ mRNA, and ROS; (6) the infarction area of the hippocampus, and brain tissue injury in Alzheimer's diseased mice induced with ${\beta}A$ were investigated. The results were summarized as follows; 1. The CMF extract suppressed the expression of $IL-1{\beta}$, IL-6 and $TNF-{\alpha}$ mRNA in THP-1 cells treated with LPS. 2. The CMF extract suppressed the expression of APP, AChE, and GFAP mRNA in PC-12 cells treated with CT-105. 3. The CMF extract suppressed the AChE activity, and the production of APP significantly in PC-12 cells treated with CT-105. 4. A significant inhibitory effect on the memory deficit was shown on the CMF extract group of the mice with Alzheimer's disease induced by ${\beta}A$ in the Morris water maze experiment, which measured stop-through latency, and distance movement-through latency. 5. The CMF extract suppressed the over-expression of $IL-1{\beta}$ protein, $TNF-{\alpha}$ protein, MDA, $IL-1{\beta}$ protein, mRNA, $TNF-{\alpha}$ mRNA, CD68/GFAP, and ROS in the mice with Alzheimer's disease induced by ${\beta}A$. 6. The CMF extract reduced the infarction area of hippocampus, and controlled the injury of brain tissue in the mice with Alzheimer’s disease induced by ${\beta}A$. These results suggest that the CMF extract may be effective for the treatment of Alzheimer’s disease. Investigation into the clinical use of the CMF extract for Alzheimer's disease is suggested for future research.

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