• 생명과학회지
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• 제19권9호
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• pp.1289-1293
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• 2009

원암단백질로 알려진 Human cervical cancer oncogene (HCCR)은 발암억제 단백질인 p53과 작용하여 다양한 암조직에서 암의 유발을 촉진한다. 그러나, 아직 정확한 발암 유도기전이 알려져 있지 않다. 이러한 의문을 해소하기 위한 일환으로 본 연구에서는 HCCR의 발현이 어떻게 조절되는지를 조사하였다. 이를 위해 먼저 HCCR 5' 쪽의 promoter 영역을 분리하여 Luciferase assay법을 이용하여 K562, HEK293, A549 세포에서 분석하였고, Promoter의 -370에서 -406사이 36bp의 첨가로 promoter활성이 의미 있게 억제됨을 관찰하였다. 또한, 36 bp만을 포함하는 probe를 이용한 mobility shift assays (EMSA)에서 핵단백질이 결합함을 관찰하였고, 컴퓨터를 이용한 분석에서 TG-interacting factor (TGIF)에 대한 consensus sequences 존재함을 관찰하였다. TGIF 만을 포함하는 probe (TC)와 돌연변이를 유발한 probe (mTG)를 이용한 EMSA에서 이 자리에 TGIF가 결합함을 보였다. 또한, TGIF 자리에 돌연변이를 유발하면(pGL3-mTGIF) 발현의 억제가 회복됨을 관찰하였다. 본 연구에서는 HCCR promoter의 특성을 분석하였고, 이 과정에서 -390에서 -366 사이에 TGIF 전사인자가 결합하여 전사활성을 조절함을 증명하였다.

• 생명과학회지
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• 제9권1호
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• pp.50-57
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• 1999

STAT들은 다양한 cytokine이나 성장호르몬 등에 의해 활성화되어 핵으로 빠르게 이동되어 유전자 발현을 조절한다. 우리는 D-raf 유전자의 5' 발현조절영역에서 STAT결합부위 염기서열을 발견하였다. 본 연구는 D-raf 유전자발현조절에 있어서 STAT결합부위의 역할을 형질전환 초파리를 사용하여 조사하였다. STAT결합부위에 염기치환돌연변이를 도입시킨 D-raf promoter부분을 P인자 벡터의 IacZ유전자에 융합시킴으로써 리포터 플라스미드 pDraf-STATmut-lacZ를 제작하였다. 이 리포터 플라스미드를 이용하여 얻은 Draf-STATmut-lacZ형질전환 초파리의 lacZ발현을 발생단계별, 조직별로 조사한 결과, 거의 모든 발생단계에서 정상형 Draf-lacZ 형질전환 초파리의 lacZ발현에 비해 크게 감소하였다. 본 연구결과들은 STAT결합배열 부위가 D-raf유전자발현조절에 있어서 중요한 역할을 함을 개체수준에서 증명하고 있다.

• International Journal of Industrial Entomology and Biomaterials
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• 제20권2호
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• pp.107-114
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• 2010

For stable germline transformation, the promoter of Bombyx mori cytoplasmic actin gene (BmA3) has been used for ubiquitous expression of transgenes. So far, no strong promoter is available for ubiquitous expression in B. mori, excluding BmA3 promoter. To identify more powerful promoter than previously reported BmA3 promoter, we isolated 9 clones that show stronger signal compared to BmA3 by a dot blot hybridization. Among these 9 clones, we focused on one clone which has high amino acid homology (85%) with hypothetical protein 32 gene of Lonomia obliqua. This clone, named bHp32 (B. mori hypothetical protein 32) was ubiquitously expressed in all tissues and developmental stage of fifth instar B. mori larvae. As result of promoter assay using dual luciferase assay system, we found the highest transcription activity region (-1,200/+220) in the 5'-flanking region of bHp32 gene, which has 42-fold more intensive promoter activity than BmA3 promoter. Moreover, the bHp32 promoter was normally regulated in Bm5, Sf9, and S2 cells. Therefore, we suggest that bHp32 promoter may be used more powerful and effectively for transgene expression in various insects containing B. mori as a universal promoter.

• Molecules and Cells
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• 제23권2호
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• pp.161-169
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• 2007

We identified two alternatively spliced variants of the peroxisomal targeting signal 1 (PTS1) receptor protein Pex5ps in monocot (rice, wheat, and barley) but not in dicot (Arabidopsis and tobacco) plants. We characterized the molecular and functional differences between the rice (Oryza sativa) Pex5 splicing variants OsPex5pL and OsPex5pS. There is only a single-copy of OsPEX5 in the rice genome and RT-PCR analysis points to alternative splicing of the transcripts. Putative light-responsive cis-elements were identified in the 5' region flanking OsPEX5L and Northern blot analysis demonstrated that this region affected light-dependent expression of OsPEX5 transcription. Using the pex5-deficient yeast mutant Scpex5, we showed that OsPex5pL and OsPex5pS are able to restore translocation of a model PTS1 protein (GFP-SKL) into peroxisomes. OsPex5pL and OsPex5pS formed homo-complexes via specific interaction domains, and interacted with each other and OsPex14p to form hetero-complexes. Although overexpression of OsPex5pL in the Arabidopsis pex5 mutant (Atpex5) rescued the mutant phenotype, overexpression of OsPex5pS only resulted in partial recovery.

• 생명과학회지
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• 제20권9호
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• pp.1332-1338
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• 2010

사람 신경모세포종 세포주 SH-SY5Y에서 Fenretinide (FenR)에 의한 GD3합성효소(hST8Sia I)의 발현증가기작을 규명하게 위하여 hST8Sia I의 프로모터 활성을 조사해 본 결과 -1146에서 -646영역에서 FenR에 의한 활성증가를 나타내었다. 또한 부위특이적 변이의 분석은 -731에서 -722영역에 위치한 전사인자 NF-kB 결합부위가 hST8Sia I의 FenR에 의한 활성증가에 중요하게 관여하고 있음을 나타내었다. FenR에 의한 hST8Sia I 유전자의 발현유도에 포함된 신호전달기작을 전사인자 단백질의 항체를 이용하여 조사해 본 결과 FenR처리에 의해 세포질에서는 인산화된 AKT단백질 수준의 증가가 관찰되었고 핵내에서는 NF-kB의 p65단백질의 증가가 관찰되었다. 이러한 결과들은 FenR에 의한 hST8Sia I 유전자의 발현증가는 AKT신호전달경로에 의해 활성화된 NF-kB의 핵내로 이동하여 hST8Sia I 유전자의 프로모터에 결합함으로서 전사가 촉진되어 일어난다는 것을 나타낸다.

• 한국작물학회지
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• 제42권6호
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• pp.712-721
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• 1997

콩 품종 Essex와 PI 437654간 교잡 후 F$_2$유래 F$_3$ 계통들을 재료로 하여 작성된 RAPD 유전자지도상에 cyst 선충 race 5에 대한 저항성 QTLs 분석을 실시한 바 결과를 요약하면 다음과 같다. 1. 회귀분석 결과 26개의 marker들(22 RAPD, 4 RFLP)에서 cyst 선충 race 5 저항성 반응에 대한 유의성이 인정되었다. 2. MAPMAKER /QTL 분석 결과2개의 저항성 QTL들이 탐색되었는데, 이 QTL들은 2개의 linkage groups(LGC-20와 Group 2)에 위치하였다. 3. 탐색된 2개의 QTL들 중 1개는 우성유전, ？고 나머지 하나는 열성유전양상을 나타내었다. 4. 콩 cyst 선충 race 5의 저항성에 대한 유의성이 인정되는 5개의 marker들간 상호작용을 알아보기 위한 다중회귀분석 결과 총 26개의 조합들 중 4개의 marker들(E02$^3$, G$10^1$, W03, pK418C)로 구성된 조합에서 가장 높은 표리적 변이의 값(35.2%)을 나타내었다.

• 원예과학기술지
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• 제34권1호
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• pp.112-121
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• 2016

GM작물의 개발은 병 저항성, 제초제 저항성, 스트레스 저항성, 기능성 물질의 증진 등의 목적으로 기존 작물에 존재하지 않은 새로운 형질을 도입시킬 수 있게 하였다. 이렇게 개발된 GM작물의 상업화를 위해서는 형질전환 식물체에 도입된 T-DNA가 여러 세대에 걸쳐 안정적인 유전과 표현형의 발현이 요구된다. 본 연구는 암 예방 효과가 있는 PEITC 물질이 증가된 형질전환체, IGA 계통의 $T_1$ 및 $T_2$ 세대에서 도입된 T-DNA의 안정성을 확인하였다. 이를 위해 $T_1$ 세대의 IGA 1-3번 계통과 $T_2$ 세대의 IGA 1-3-5번 계통을 PCR로 선발하였으며 선발된 $T_1$ 세대의 IGA 1-3번 계통에서 도입된 T-DNA의 삽입위치를 VA-TAIL PCR로 확인한 결과 배추 게놈 내 intergenic 부위에 삽입되었음을 확인하였다. 또한, 도입 유전자의 세대별 안정성은 IGA 1-3번 계통과 IGA 1-3-5번 계통에서 T-DNA의 내부구조와 flanking 지역을 PCR 분석으로 비교함으로써 확인하였다. 결과적으로 본 연구에서 IGA1번 계통으로 도입된 T-DNA는 구조의 변이 없이 안정적으로 후대로 유전 되었으며, IGA 1번 계통의 $T_1$ 및 $T_2$ 세대의 PEITC 함량의 증가로 표현형적 형질 또한 안정적으로 유전 되는 것으로 확인하였다. 마지막으로 IGA 1번 계통의 $T_1$ 및 $T_2$ 세대에서 QR 활성을 확인하여 암 예방 효과 또한 확인하였다.

• 한국미생물·생명공학회지
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• 제31권1호
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• pp.25-31
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• 2003

아닐린을 분해할 수 있는 Deiftia acidovoran 51-A가 기존에 분리되어 아닐린 분해능이 우수함이 보고되었다. 이 균주로부터 아닐린 분해관련 유전자를 선발하기 위하여 Tn5-B20삽입 변이체들을 유도하여 영양요구형이 아니면서 아닐린을 분해할 수 없는 변이균주 D. acidovorans 10-4-2 균주를 선발하였다. Southern hybridization 결과 이 변이균주에는 Tn5-B20이 한 copy만 삽입된 것으로 나타났다 이 변이균주의 Tn5-B20삽입의 인접 유전자들을 분리하여 염기서열을 분석한 결과 아닐린 분해의 첫 단계에 해당하는 아닐린의 catechol로의 산화적 deamination에 관련되어 있는 것으로 추정하는 tdnQ, tdnT tdnAl 유전자들이 동정되었고 Tn5-B2O은 tdnAl의 바로 밑에 삽입된 것을 알 수 있었다. TdnA2 및 downstream의 유전자 기능을 상실하여 아닐린을 catechol로 전환하는 과정에 변이가 발생하고 따라서 아닐린을 탄소원으로 이용하지 못하는 표현형을 가지게 된 것으로 결론지을 수 있었다. Tn5-B20 의 일부 DNA 조각을 probe로 Southern hybridization 결과 transposon 삽입이 대형의 플라스미드에 삽입된 것으로 나타나 tdn 유전자들이 pTDN51이라고 명명한 100-kb 이상의 대형 플라스미드에 위치함을 알 수 있었다. 이상의 결과는 D. acidovorans 51-A의 pTDN51상의 tdn유전자들이 아닐린의 분해에 관여함을 보여준다.

• 한국어류학회지
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• 제23권1호
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• pp.10-20
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• 2011

한반도 고유종인 묵납자루(Acheilognathus signifer)로부터 metallothionein(MT) 유전자를 분리하고 그 유전자 구조와 발현 특징을 분석하였다. 묵납자루 MT cDNA는 20개의 시스테인(cysteines)을 포함한 60개의 아미노산을 암호화하고 있었고, 이들 시스테인 잔기들의 위치는 잉어목 어류에서 잘 보전되어 있었다. 묵납자루 MT 유전자는 3개의 exon과 2개의 intron으로 구성되어 있었으며 intron영역은 A/T조성 빈도가 높았다. 생물정보 분석법을 통해 묵납자루 MT 유전자의 프로모터 영역은 중금속 조절 빛 스트레스/면역관련 조절에 관련한 다양한 전사 조절인자들의 부착 위치들이 보유하고 있는 것으로 예측되었다. Real-time RT-PCR 분석법을 이용한 묵납자루 MT mRNA의 조직 별 발현 수준을 조사한 결과, 난소와 장 조직에서의 발현 수준이 가장 높았으며 성장과 근욕 조직에서의 발현 수준이 가장 낮은 것으로 확인되었다. 구리를 이용한 중금속 노출 실험(구리 농도 $0.5\;{\mu}M$을 이용, 48 시간 동안 침지 처리)을 통하여 간 조직에서 MT mRNA 발현이 가장 많이 유도되었고(3.5배 이상), 비장, 신장 및 아가미에서도 유의적인 발현양의 증가(1.5~2.5배)가 관찰되었다. 그러나 뇌 및 장 조직에서는 MT 발현양의 변화가 없었다. 본 연구 결과는 향후 멸종위기 고유종인 묵납자루의 중금속 관련 스트레스 연구에 유용한 기초 자료를 제공할 수 있으리라 기대된다.

• Animal cells and systems
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• 제1권2호
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• pp.351-354
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• 1997

The distributions of G to A substitution ($G^{-75}{\rightarrow}A$) mutation in the human apolipoprotein A1 (APOAI) gene promoter region and glutathione S-tran-sferase Mu1 (GSTM1) gene deletion were examined in subjects with Korean population. The $G^{-75}{\rightarrow}A$ mutation of APOA1 was genotyped by the polymerase chain reaction (PCR) and subsequent digestion of the PCR product using either Mspl or Mval (n=206). The observed numbers of GG, GA and AA genotypes were 132, 63 and 11, respectively. The allele frequencies of G and A were 0.794 and 0.206, respectively. The GSTM1 gene deletion was simply examined by the PCR amplification (n=106). The observed numbers of null type ($GSTM1^*0/GSTM1^*0$) and positive type were 55 and 51, respectively. The allele frequency of $GSTM1^*0$ was 0.720.