• 제목/요약/키워드: 4-AP

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대장균의 alkaline phosphatase가 융합된 anti-DR4 single-chain Fv (ScFv) 항체의 개발 (The development of anti-DR4 single-chain Fv (ScFv) antibody fused to Escherichia coli alkaline phosphatase)

  • 한승희;김진규
    • 미생물학회지
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    • 제52권1호
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    • pp.10-17
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    • 2016
  • 항체의 특이적 결합을 분석하는 효소면역분석법은 항원의 탐지를 위해 주로 horseradish peroxidase (HRP) 또는 alkaline phosphatase (AP) 등의 효소를 사용한다. 이때 효소를 주로 화학적으로 항체에 결합시켜 사용하게 되는데 이 과정이 복잡하며 불규칙하게 일어나서 항체 및 효소의 기능을 감소시키게 된다. 또한 대부분의 효소면역분석법에서는 주로 일차 항체의 항원결합을 탐지하기위해 이차 항체를 사용하는데, 즉 이차 항체에 결합한 효소의 기질발색에 의해 일차 항체의 항원결합을 탐지하므로 이차 항체가 요구 되어질 뿐만 아니라 이차 항체의 일차 항체에 대한 반응을 위한 부가적인 배양시간이 필요하다. 더욱 더 중요한 것은 이차 항체만의 비특이적 항원 결합 역시 제거되어져야 한다. 본 연구에서는 대장균의 genomic DNA로부터 PCR을 통해 alkaline phosphatase 유전자(Sadeghi et al., 2008)를 증폭 분리한 다음 이를 TRAIL (tumor necrosis factor ${\alpha}$ related apoptosis induced ligand) receptor인 death receptor 4 (DR4)에 특이적으로 결합하는 hAY4 single-chain Fv (ScFv)에 융합시킨 재조합 ScFv-AP 형태로 대장균에서 발현시켜 정제하였다. 정제된 hAY4 ScFv-AP는 SDS-PAGE에서 단량체(monomer) 분자량인 73.8 kDa을 나타내었다. 그러나 size-exclusion chromatography(SEC)에서는 147.6 kDa을 나타내는 결과를 통해 hAY4 ScFv-AP는 AP의 자연적인 비공유결합에 의해 이량체(dimeric form)형성이 유도되어짐을 확인하였다. 또한 ELISA, Western blot 그리고 immunocytochemistry에서 이차 항체 없이 일차 항체 hAY4 ScFv에 직접 융합된 AP의 기질발색에 의해 ScFv 일차 항체의 특이적 항원결합을 나타내었다. 요약하면 hAY4 ScFv와 대장균의 alkaline phosphatase 유전자를 융합시켜 대장균에서 수용성 형태로 성공적으로 정제하였으며 정제된 ScFv-AP 융합단백질은 ELISA, Western blot 및 immunocytochemistry에서 항원결합력을 나타냈으며 또한 구매에 따른 고비용, 부가적인 배양시간 및 비특이적 결합에 의한 오류 등의 문제점을 갖는 이차 항체를 사용하지 않고 직접적인 항원결합력을 나타내었다.

식물공장형 아쿠아포닉스에서 산채 갯기름의 광합성, 생육 및 수량 특성 (Photosynthesis, Growth and Yield Characteristics of Peucedanum japonicum T. Grown under Aquaponics in a Plant Factory)

  • 이현진;최기영;장매희;최은영
    • 생물환경조절학회지
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    • 제31권1호
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    • pp.67-76
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    • 2022
  • 본 연구는 식물공장형 아쿠아포닉 시스템(AP)에서 갯기름을 재배하여 수경재배 시스템(HP)에서 재배된 갯기름과 광합성 및 생육 특성을 비교하였다. AP 재배구는 367.5L의 사육조에 비단잉어 30마리로 10.6kg·m-3 밀도로 사육하였으며 HP 재배구는 배양액을 EC 1.3dS·m-1, pH 6.5로 조성하여 같은 재식 간격으로 갯기름을 정식하였다. 전 재배기간 동안 pH는 AP의 경우 7.1-4.0, HP는 7.4-4.0 수준을 보였다. AP 처리구의 pH는 NO3-N의 증가에 따라 감소하기 시작하여 pH 5.5 이하는 15-67 DAT 기간동안 지속되었다. pH가 낮은 조건에서도 암모니아태 질소(NH4-N)는 지속적 증가를 보였다. EC는 두 재배구에서 1.3-1.5dS·m-1로 유지되었다. 수조액의 다량원소 농도는 K와 Mg을 제외하고 수경재배 양액 농도보다 높았다. 광합성 특성은 AP와 HP 처리간 유의차가 없었고 형광매개변수는 Fv/Fm, ABS/RC, TRo/RC, ETo/RC, DIo/RC는 처리간 차이가 없었으나 광계 II 광화학지수인 PIABS가 AP 재배구에서 HP에 비해 34DAT에는 30.4%, 74DAT에는 12.0% 낮았다. 정식 후 20일 간격으로 생육 특성을 측정한 결과 두 처리간 초장, 엽장, 엽폭, 엽수 SPAD는 유의적으로 차이가 없었으나 엽병 길이가 AP 재배구에서 HP에 비해 56% 길었고 지상부 및 지하부 상대생장율, 건물중이 유의차가 없었다. 다만, 엽면적율만 AP 재배구에서 HP에 비해 36.43% 높았다. 연구결과를 종합하여 볼 때, 적정 물고기 재배밀도와 pH 수준에서 갯기름 생육과 수량은 아쿠아포닉스와 수경재배 방식 간에 차이가 없는 것으로 보이고, 아쿠아포닉스는 농업 부산물의 자원순환으로 안전한 먹거리를 생산할 수 있는 지속가능한 농업기술로 판단된다.

서울시 식생부문 온실가스-대기오염 통합 흡수/배출량 인벤토리 및 환경가치분석 (GHG-AP Integrated Sink/Emission Inventories and Environmental Value Analysis in Vegetation Sector of Seoul)

  • 정재형;권오열
    • 한국대기환경학회지
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    • 제31권1호
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    • pp.72-82
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    • 2015
  • We constructed greenhouse gas (GHG) and air pollution (AP) integrated sink/emission inventories and evaluated the environmental value for the vegetation sector in Seoul during year 2010. The data of vegetation, classified into four sectors of cultivated land, forest land, park and street tree, were obtained from Statistics Korea and Seoul City. Based on the previous studies, only $CO_2$ was chosen as GHG sink by vegetation. $NO_2$ and $SO_2$ were chosen as AP sink by vegetation, while isoprene, monoterpene, other VOC (OVOC) and NH3 were chosen as AP emission from vegetation. Estimation methodology and sink/emission factors were gathered from reports and published literatures. Estimated GHG sink by vegetation during year 2010 was 12,987,173 $tonCO_{2eq}$, of which approximately 1/4 was from pure vegetation and the remaining 3/4 from vegetation soil. AP sink and emission were estimated to be 23,309 tonAP and 2,629,797 tonAP, respectively. The analysis by administrative districts in Seoul revealed that among 25 districts, Seocho-gu, Nowon-gu, Eunpyeong-gu, Gwanak-gu and Gangbuk-gu were the major districts in GHG and AP sink/emission inventories for vegetation sector. Environmental value of vegetation as a function of GHG and AP sink, was estimated as 800 billion won, corresponding to 5% of the total cost of the forest land in Korea evaluated as a public function.

Clostridioides difficile Infection Is Associated with Adverse Outcomes among Hospitalized Pediatric Patients with Acute Pancreatitis

  • Thavamani, Aravind;Umapathi, Krishna Kishore;Khatana, Jasmine;Sankararaman, Senthilkumar
    • Pediatric Gastroenterology, Hepatology & Nutrition
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    • 제25권1호
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    • pp.61-69
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    • 2022
  • Purpose: Studies in adults have shown an increasing incidence of Clostridioides difficile infection (CDI) in patients hospitalized with acute pancreatitis (AP). There is lack of epidemiological data on CDI and its impact on hospitalized pediatric patients with AP. Methods: We analyzed the National Inpatient Sample and Kids' Inpatient Database between the years 2003 and 2016 and included all patients (age <21 years) with a primary diagnosis of AP using specific International Classification of Diseases codes. We compared clinical outcomes between children with CDI and those without CDI. Our primary outcome was severe AP and secondary outcomes included length of stay and hospital charges. Results: A total of 123,240 hospitalizations related to AP were analyzed and CDI was noted in 0.6% of the hospital. The prevalence rate of CDI doubled from 0.4% (2003) to 0.8% (2016), p=0.03. AP patients with CDI had increased comorbidities, and also underwent more invasive surgical procedures, p<0.05. AP patients with CDI had a higher in-hospital mortality rate and increased prevalence of severe AP, p<0.001. Multivariate regression models showed that CDI was associated with 2.4 times (confidence interval [CI]: 1.91 to 3.01, p<0.001) increased odds of severe AP. CDI patients had 7.24 (CI: 6.81 to 7.67, p<0.001) additional hospital days while incurring $59,032 (CI: 54,050 to 64,014, p<0.001) additional hospitalization charges. Conclusion: CDI in pediatric patients with AP is associated with adverse clinical outcomes and increased healthcare resource utilization. Further studies are needed to elucidate this association to prevent the development of CDI and to improve outcomes.

표준지하수위지수(SGI)를 이용한 농촌지역 지하수계의 가뭄 영향 평가 (Assessment of Drought Effects on Groundwater System in Rural Area using Standardized Groundwater Level Index(SGI))

  • 송성호
    • 한국지하수토양환경학회지:지하수토양환경
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    • 제23권3호
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    • pp.1-9
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    • 2018
  • This study is aimed to quantitatively evaluate the effects of drought on groundwater system in rural areas. For this purpose, the standardized groundwater level index (SGI) was used for 68 groundwater monitoring wells. To determine accumulation period (AP) which represents the month with the highest correlation coefficient between SGI and SPI, correlation analysis between the two for 68 wells were peformed. The results indicated the AP values ranged in 1~3 months for most of the well, but it was 7~10 months in some wells. These results can be interpreted such that the total amount of groundwater will not decrease significantly in long-term drought situations unlikely the reservoirs with the high AP values. The nationwide maximum AP values were 4.1 and 4.0 in Chungbuk-do and Gyeongnam-do, while the minimum AP values were 1.8 and 2.0 in Gangwon-do and Chungnam-do, respectively. The maximum and minimum values of correlation coefficient were 0.623 and 0.459 in Gyeongnam-do and Chungnam-do/Chungbuk-do, respectively. Consequently, it could be concluded that the wells with low AP value tend to respond to short-term drought, but it has little effect on groundwater system when the long drought occurs.

PCP/Nitramine/AP 기반 추진제의 연소 특성 연구 (Combustion Properties of PCP/Nitramine/AP Propellants)

  • 김성준
    • 한국추진공학회지
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    • 제25권4호
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    • pp.12-18
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    • 2021
  • 본 연구에서는 추력 제어용 추진제 조성 개발을 위해 고 압력지수 추진제를 만들고자 하였다. 프리폴리머로 PCP를 사용하며 니트라민 계열의 산화제인 HMX와 HNIW 기반 추진제를 제조하여 각각의 연소특성을 비교하였다. HMX에 비해 HNIW가 추진제의 연소속도, 비추력 그리고 화염온도에 큰 영향을 준다는 것을 알았다. 또한, AP를 조 산화제로 사용할 경우, 추진제의 연소속도, 비추력 및 화염온도는 미세 AP 함량, 총 고체 함량 그리고 가소제 양이 증가할수록 병행 상승하였으나, 압력지수는 오히려 낮게 나타났다. 그리고, 여러 압력 구간에서 온도에 따른 연소특성 변화를 알아보기 위해 150 psia부터 2,500 psia사이 구간에 대해 PCP/Nitramine/AP 추진제의 연소속도에 대한 온도 민감도를 측정하였다.

사이버전 피해평가 과정에서 비인가 무선 AP 공격 식별을 위한 기계학습을 이용한 데이타 분석 (Data analysis for detection of unauthorized AP using machine learning algorithm in the process of cyber war damage assessment)

  • 김도연;김용현;김동화;신동규;신동일
    • 한국정보처리학회:학술대회논문집
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    • 한국정보처리학회 2017년도 추계학술발표대회
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    • pp.232-234
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    • 2017
  • 사이버전 피해평가에 있어서 유무선 통합 환경에 대한 공격의 탐지와 이에 대한 평가가 필요한 상황이다. 특히 회사, 정부 및 군 시설 등에서 인가되지 않은 AP를 사용하여 공격이 발생하는 경우 각종 바이러스 및 해킹 공격에 의한 피해가 발생한 가능성이 높다. 띠라서 인가된 AP와 인가되지 않은 AP를 탐지해서 찾아 내야한다. 본 논문에서는 인가된 AP와 인가 되지 않은 AP를 탐지하기 위해 RTT(Round Trip Time)값을 데이터셋으로 만들고 각 기계학습 알고리즘 SVM(Support Vector Machine), J48(C4.5), KNN(K nearest neighbors), MLP(Multilayer Perceptron)의 결과를 비교해 성능의 차이를 밝히고 이를 통하여 공격을 탐지하여 피해평가에 연결이 되도록 한다.

"ISO 10303 AP241: Generic model for lifecycle support of AEC facilities"의 시설물관련 요소의 STEP Modularization에 관한 연구 (A Study on the STEP Modularization of Civil Engineering Elements of "ISO 10303 AP241: Generic Model for Lifecycle Support of AEC Facilities")

  • 변수진;안경익;김인한
    • 한국CDE학회논문집
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    • 제12권5호
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    • pp.366-375
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    • 2007
  • Although the STEP modularization is the major development methodology for STEP Application Protocol, there have been few studies on the STEP Modularization in Korea. The necessity of STEP Modularization research has been raised continuously. In addition, the importance became larger and larger because most of newly developing APs, including AP241, are developed using modularization approach. The object of this study is to investigate the basic structure and contents of AEC facilities related Application Modules using STEP Modularization. This study examines 1) the technical analysis regarding STEP Modularization, 2) application modules development regarding civil engineering elements of AP241; Aec_faciliteis_classification", "Aec_civil_item", and "Aec_civil_componet", 3) the developed application modules verification, and 4) the implementation methodology suggestion for application modules and modular AP.

국내 일사량 추정을 위한 Angstrom-Prescott계수의 평가 (Assessment of the Angstrom-Prescott Coefficients for Estimation of Solar Radiation in Korea)

  • 현신우;김광수
    • 한국농림기상학회지
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    • 제18권4호
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    • pp.221-232
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    • 2016
  • 농업 생태계의 생산성을 예측하기 위한 모델의 필수 입력변수인 일사량은 비교적 적은 수의 기상관측소에서만 관측되고 있어, 이들 관측값을 대신하기 위해 일사량을 추정하는 모델들이 사용되고 있다. 특히, 간단한 계수를 사용하여 일조시간을 이용하는 Angstrom-Prescott(AP) 모델이 일사량 추정을 위해 가장 널리 쓰이고 있다. 국내에서 보편적으로 적용가능한 AP모델의 계수값을 탐색하기 위해 국내 20개 기상관측소의 30년간의 일단위 관측자료를 입력자료로 사용하여 경험적으로 얻어진 계수와 Frere and Popov(1979)가 제시한 계수($AP_{Frere}$)를 이용한 일사량을 추정하고, 이들의 신뢰도를 분석하였다. 또한, 전역최적화 과정을 통해 시공간적으로 신뢰도가 높은 일사량을 얻을 수 있는 AP계수의 범위를 탐색하였다. 분석을 위해 월별, 년도별, 지역별로 추정값과 측정값 사이의 일치도를 계산하였다. $AP_{Frere}$를 사용한 결과 작물 생산성 예측을 위한 조건에서 일치도가 높게 나타났다. $AP_{Frere}$를 사용하였을 때 전역최적화를 통해 추정한 AP계수($AP_{max}$)를 사용하였을 경우 보다 일치도가 낮았으나 경험적으로 얻어진 계수($AP_{Choi}$)보다는 일치도가 높은 일사량 추정이 가능하였다. 전역최적화를 통해 일사량 추정치의 신뢰도를 분석한 결과, 신뢰도가 높은 일사량을 얻을 수 있는 AP계수의 범위는 년도별로는 좁게 분포하였으나 월별, 지역별로는 넓게 분포하였다. 그 중에서도 변이가 작은 범위는 지역별 일치도가 월별 일치도보다 넓게 분포하였다. $AP_{Frere}$는 각각의 경우에 대해 일치도가 높고 변이가 작은 범위에 속해 국내 조건에서 $AP_{Frere}$를 적용할 경우, 신뢰도 높은 일사량 추정치를 얻을 수 있을 것으로 예상되었다.

신정격 및 방광정격 자침이 정상 성인의 맥파 변화에 대한 비교 연구 (The Effects of Sa-am Acupuncture on Radial Pulse in Healthy Human Subjects: A Comparative Study on Tonifications of Kidney and Urinary Bladder)

  • 곽규인;강재희;이현
    • Journal of Acupuncture Research
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    • 제32권2호
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    • pp.105-121
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    • 2015
  • Objectives : The purpose of this study is to observe the effects of Sa-am acupuncture with tonifications of kidney and urinary bladder on radial pulse in healthy subjects. Methods : Sixty healthy subjects participated in this study, and were divided into a kidney tonifying acupuncture group(KI group), urinary bladder tonifying acupuncture group(BL group) and control group. Radial pulse was measured by 3 dimensional pulse imaging system(DMP-3000) before, immediately after, 30 minutes after, and 60 minutes after acupuncture at Cun, Guan, and Chi in each time. Results : 1. BL group exhibited significantly reduced T1 / T, T4 / T, T4 / (T-T4), T5 / T and increased(T-T4) / T compared to KI group. 2. BL group showed increase of radial augmentation index / heart rate(RAI / HR) in left Cun, H5, Ad / Ap in left Chi, H1, As / Ap in right Chi compared to KI group. BL group showed decrease of As / Ap, Aw / Ap in left Chi, H1, pulse depth, Ad / Ap in right Chi compared to KI group. 3. KI group showed increase of Aw / Ap, H1, H2, H4, pulse area in right Guan, pulse depth in right Chi compared to BL group. KI group showed decrease of RAI in left Cun, applied pressure, pulse depth in left Guan, Aw / Ap in right Chi compared to BL group. Conclusions : The effects of Sa-am acupuncture with tonifications of kidney and urinary bladder in healthy humans have been observed on various parameters. The parameters analysed in this study can be used to differentiate the effects of Sa-am acupuncture with tonifications of kidney and urinary bladder on radial pulse.